MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31003	NC_012633	GCTT	2	8	1212573	1212580	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31004	NC_012633	T	6	6	1212579	1212584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_012633	AT	3	6	1212588	1212593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_012633	AGT	2	6	1212601	1212606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31007	NC_012633	TGTT	2	8	1212636	1212643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31008	NC_012633	TAG	2	6	1212646	1212651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31009	NC_012633	GTTT	2	8	1212669	1212676	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31010	NC_012633	TTA	2	6	1212684	1212689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31011	NC_012633	CTT	2	6	1212722	1212727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31012	NC_012633	T	6	6	1212735	1212740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31013	NC_012633	CTT	2	6	1212746	1212751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31014	NC_012633	T	6	6	1212828	1212833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_012633	AT	3	6	1212851	1212856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_012633	T	6	6	1212873	1212878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_012633	T	6	6	1212897	1212902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_012633	TTCC	2	8	1212915	1212922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31019	NC_012633	TAA	2	6	1212938	1212943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_012633	TTA	2	6	1212976	1212981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31021	NC_012633	TGA	2	6	1213017	1213022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31022	NC_012633	TAA	2	6	1213040	1213045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31023	NC_012633	TCT	2	6	1213051	1213056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31024	NC_012633	ATT	2	6	1213065	1213070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31025	NC_012633	ATT	2	6	1213133	1213138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31026	NC_012633	TAAT	2	8	1213172	1213179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31031	NC_012633	T	7	7	1213498	1213504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31032	NC_012633	ATA	2	6	1213512	1213517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31048	NC_012633	TTA	2	6	1213984	1213989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31247	NC_012633	CCA	2	6	1221260	1221265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587210
31248	NC_012633	CAC	2	6	1221267	1221272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587210
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31250	NC_012633	GCC	2	6	1221328	1221333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587210
31251	NC_012633	TA	4	8	1221346	1221353	50 %	50 %	0 %	0 %	229587210
31252	NC_012633	TCA	2	6	1221362	1221367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587210
31253	NC_012633	TCA	2	6	1221429	1221434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587210
31254	NC_012633	TCGC	2	8	1221465	1221472	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31255	NC_012633	CT	3	6	1221511	1221516	0 %	50 %	0 %	50 %	229587211
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31287	NC_012633	TAA	2	6	1222970	1222975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31288	NC_012633	ATA	2	6	1223014	1223019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31303	NC_012633	ATT	2	6	1223446	1223451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31351	NC_012633	TAA	2	6	1225495	1225500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31356	NC_012633	AGA	2	6	1225691	1225696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31358	NC_012633	AAG	2	6	1225723	1225728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31359	NC_012633	TAAA	2	8	1225735	1225742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31360	NC_012633	TGCA	2	8	1225754	1225761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31361	NC_012633	AAG	2	6	1225762	1225767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31362	NC_012633	ATA	2	6	1225780	1225785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31363	NC_012633	AT	3	6	1225796	1225801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31364	NC_012633	ACA	2	6	1225865	1225870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31365	NC_012633	TA	3	6	1225885	1225890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31366	NC_012633	AAG	2	6	1225897	1225902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31490	NC_012633	AAG	2	6	1231416	1231421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587217
31491	NC_012633	TCA	2	6	1231490	1231495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587217
31492	NC_012633	TC	3	6	1231528	1231533	0 %	50 %	0 %	50 %	229587217
31493	NC_012633	CT	3	6	1231681	1231686	0 %	50 %	0 %	50 %	229587217
31494	NC_012633	TCA	2	6	1231691	1231696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587217
31495	NC_012633	AT	3	6	1231706	1231711	50 %	50 %	0 %	0 %	229587217
31496	NC_012633	AAGC	2	8	1231713	1231720	50 %	0 %	25 %	25 %	229587217
31497	NC_012633	ACC	2	6	1231768	1231773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587217
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31499	NC_012633	GCA	2	6	1231841	1231846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587217
31500	NC_012633	ATC	2	6	1231867	1231872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587217

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