MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_012633	GCT	2	6	1173219	1173224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30002	NC_012633	TTA	2	6	1173306	1173311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30003	NC_012633	ACC	2	6	1173350	1173355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30004	NC_012633	TGT	2	6	1173376	1173381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30005	NC_012633	TAT	2	6	1173508	1173513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30006	NC_012633	ATT	2	6	1173551	1173556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30007	NC_012633	A	7	7	1173627	1173633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30008	NC_012633	TTA	2	6	1173704	1173709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30009	NC_012633	TTA	2	6	1173775	1173780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30010	NC_012633	AAC	2	6	1173849	1173854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30011	NC_012633	GCTA	2	8	1173897	1173904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30012	NC_012633	AGT	2	6	1173906	1173911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30013	NC_012633	AAGT	2	8	1174052	1174059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30014	NC_012633	CAG	2	6	1174082	1174087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30015	NC_012633	CAA	2	6	1174151	1174156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30016	NC_012633	ATT	2	6	1174248	1174253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30017	NC_012633	TAC	2	6	1174274	1174279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30018	NC_012633	TTG	2	6	1174338	1174343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30019	NC_012633	TAG	2	6	1174352	1174357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30020	NC_012633	TAT	2	6	1174379	1174384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30021	NC_012633	AGT	2	6	1174512	1174517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30022	NC_012633	GTA	2	6	1174522	1174527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30023	NC_012633	AAG	2	6	1174680	1174685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30024	NC_012633	T	6	6	1174698	1174703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30025	NC_012633	TTA	2	6	1174718	1174723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30026	NC_012633	ATT	2	6	1174753	1174758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30027	NC_012633	CCT	2	6	1174781	1174786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30028	NC_012633	ACT	2	6	1174798	1174803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30029	NC_012633	TGC	2	6	1174810	1174815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30030	NC_012633	ACT	2	6	1174816	1174821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30031	NC_012633	CTG	2	6	1174827	1174832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30032	NC_012633	TAA	2	6	1174896	1174901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30033	NC_012633	TGT	2	6	1174903	1174908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30034	NC_012633	TGTTCC	2	12	1174963	1174974	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30035	NC_012633	GTA	2	6	1174991	1174996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30036	NC_012633	TGT	2	6	1174999	1175004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30037	NC_012633	ACC	2	6	1175041	1175046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30038	NC_012633	ATT	2	6	1175071	1175076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30039	NC_012633	AGT	2	6	1175086	1175091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30040	NC_012633	CCGC	2	8	1175238	1175245	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30041	NC_012633	ATT	2	6	1175267	1175272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30042	NC_012633	AT	3	6	1175287	1175292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30043	NC_012633	CCT	3	9	1175353	1175361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30044	NC_012633	TAT	2	6	1175366	1175371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_012633	ACC	2	6	1175379	1175384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30046	NC_012633	CCA	2	6	1175392	1175397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30047	NC_012633	TCC	2	6	1175508	1175513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30048	NC_012633	ATCCA	2	10	1175523	1175532	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30049	NC_012633	CCT	2	6	1175682	1175687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587176
30050	NC_012633	TACCTG	2	12	1175709	1175720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229587176
30051	NC_012633	CAT	2	6	1175778	1175783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587176
30052	NC_012633	GCA	2	6	1175819	1175824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587176
30053	NC_012633	TTAC	2	8	1175837	1175844	25 %	50 %	0 %	25 %	229587176
30054	NC_012633	GCC	2	6	1175863	1175868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229587176
30055	NC_012633	TTA	2	6	1175963	1175968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587176
30056	NC_012633	TGTAA	2	10	1176035	1176044	40 %	40 %	20 %	0 %	229587176
30057	NC_012633	TACTA	2	10	1176070	1176079	40 %	40 %	0 %	20 %	229587176
30058	NC_012633	TAT	2	6	1176105	1176110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587176
30059	NC_012633	AGTA	2	8	1176189	1176196	50 %	25 %	25 %	0 %	229587176
30060	NC_012633	TCCTGG	2	12	1176211	1176222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587176
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30062	NC_012633	ACT	2	6	1176236	1176241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587176
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30065	NC_012633	ATT	2	6	1176388	1176393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587176
30066	NC_012633	AT	3	6	1176406	1176411	50 %	50 %	0 %	0 %	229587176
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30070	NC_012633	AGCA	2	8	1176575	1176582	50 %	0 %	25 %	25 %	229587176
30071	NC_012633	T	7	7	1176611	1176617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30072	NC_012633	T	6	6	1176624	1176629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30073	NC_012633	TTGAC	2	10	1176634	1176643	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30074	NC_012633	ATA	2	6	1176644	1176649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30075	NC_012633	TA	3	6	1176692	1176697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30076	NC_012633	ATTA	2	8	1176726	1176733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30077	NC_012633	A	6	6	1176751	1176756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30078	NC_012633	AAG	2	6	1176765	1176770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30079	NC_012633	TA	3	6	1176779	1176784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30080	NC_012633	AAAT	2	8	1176817	1176824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30081	NC_012633	TA	3	6	1176863	1176868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30082	NC_012633	CTAT	2	8	1176895	1176902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30083	NC_012633	CTT	2	6	1176908	1176913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30087	NC_012633	TA	3	6	1177197	1177202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30088	NC_012633	AAT	2	6	1177222	1177227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30089	NC_012633	TA	3	6	1177232	1177237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30090	NC_012633	TAAT	2	8	1177247	1177254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30091	NC_012633	TC	3	6	1177318	1177323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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30096	NC_012633	ATT	2	6	1177675	1177680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587178
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30103	NC_012633	A	6	6	1177961	1177966	100 %	0 %	0 %	0 %	229587178
30104	NC_012633	A	6	6	1177990	1177995	100 %	0 %	0 %	0 %	229587178
30105	NC_012633	TGA	2	6	1178001	1178006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587178
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30120	NC_012633	AT	3	6	1178881	1178886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30121	NC_012633	ATA	2	6	1178908	1178913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30123	NC_012633	AAG	2	6	1178933	1178938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30125	NC_012633	T	6	6	1178962	1178967	0 %	100 %	0 %	0 %	229587180
30126	NC_012633	GTA	2	6	1178981	1178986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587180
30127	NC_012633	TA	3	6	1178985	1178990	50 %	50 %	0 %	0 %	229587180
30128	NC_012633	GTA	2	6	1179032	1179037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587180
30129	NC_012633	AG	3	6	1179068	1179073	50 %	0 %	50 %	0 %	229587180
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30149	NC_012633	ATT	2	6	1179921	1179926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30236	NC_012633	T	9	9	1183236	1183244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30237	NC_012633	AGC	2	6	1183280	1183285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30238	NC_012633	TACT	2	8	1183388	1183395	25 %	50 %	0 %	25 %	229587184
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30241	NC_012633	T	7	7	1183484	1183490	0 %	100 %	0 %	0 %	229587184
30242	NC_012633	TCA	2	6	1183562	1183567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587184
30243	NC_012633	GTA	2	6	1183601	1183606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587184
30244	NC_012633	ATA	3	9	1183617	1183625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587184
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30246	NC_012633	TTTA	2	8	1183801	1183808	25 %	75 %	0 %	0 %	229587184
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30479	NC_012633	GCT	2	6	1193246	1193251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587186
30480	NC_012633	TTG	2	6	1193303	1193308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587186
30481	NC_012633	CTA	2	6	1193348	1193353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587186
30482	NC_012633	CTG	2	6	1193372	1193377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587186
30483	NC_012633	ACC	2	6	1193401	1193406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587186
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30485	NC_012633	ATTA	2	8	1193421	1193428	50 %	50 %	0 %	0 %	229587186
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