MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_012633	TAT	2	6	1111522	1111527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587139
28503	NC_012633	TAA	2	6	1111576	1111581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587139
28504	NC_012633	A	8	8	1111630	1111637	100 %	0 %	0 %	0 %	229587139
28505	NC_012633	TTAC	2	8	1111638	1111645	25 %	50 %	0 %	25 %	229587139
28506	NC_012633	AGA	2	6	1111702	1111707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587139
28507	NC_012633	CTG	2	6	1111734	1111739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587139
28508	NC_012633	ATTT	2	8	1111755	1111762	25 %	75 %	0 %	0 %	229587139
28509	NC_012633	AAG	2	6	1111764	1111769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587139
28510	NC_012633	TAA	2	6	1111821	1111826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587139
28511	NC_012633	ACA	2	6	1111869	1111874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587139
28512	NC_012633	TTTTA	2	10	1111915	1111924	20 %	80 %	0 %	0 %	229587139
28513	NC_012633	GAA	3	9	1112012	1112020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587139
28514	NC_012633	A	6	6	1112088	1112093	100 %	0 %	0 %	0 %	229587139
28515	NC_012633	AAGC	2	8	1112124	1112131	50 %	0 %	25 %	25 %	229587139
28516	NC_012633	ATA	2	6	1112181	1112186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587139
28517	NC_012633	TTA	2	6	1112198	1112203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587139
28518	NC_012633	AGAT	2	8	1112259	1112266	50 %	25 %	25 %	0 %	229587139
28519	NC_012633	AATCA	2	10	1112378	1112387	60 %	20 %	0 %	20 %	229587139
28520	NC_012633	GAA	2	6	1112405	1112410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587139
28521	NC_012633	ATT	2	6	1112433	1112438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587139
28522	NC_012633	AACT	2	8	1112562	1112569	50 %	25 %	0 %	25 %	229587139
28523	NC_012633	AT	3	6	1112677	1112682	50 %	50 %	0 %	0 %	229587139
28524	NC_012633	AT	3	6	1112719	1112724	50 %	50 %	0 %	0 %	229587139
28525	NC_012633	CAAA	2	8	1112729	1112736	75 %	0 %	0 %	25 %	229587139
28526	NC_012633	ATG	2	6	1112955	1112960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587139
28527	NC_012633	TGA	2	6	1112983	1112988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587139
28528	NC_012633	TAT	2	6	1113007	1113012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587139
28529	NC_012633	A	7	7	1113014	1113020	100 %	0 %	0 %	0 %	229587139
28530	NC_012633	CTA	2	6	1113033	1113038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587139
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28532	NC_012633	TGGA	2	8	1113083	1113090	25 %	25 %	50 %	0 %	229587139
28533	NC_012633	GGC	2	6	1113123	1113128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28534	NC_012633	ATA	2	6	1113191	1113196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28535	NC_012633	CATA	2	8	1113200	1113207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28536	NC_012633	A	6	6	1113227	1113232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28537	NC_012633	AT	3	6	1113235	1113240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28538	NC_012633	GAA	2	6	1113254	1113259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28539	NC_012633	GGTAC	2	10	1113352	1113361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28540	NC_012633	TGA	2	6	1113363	1113368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28541	NC_012633	AAC	2	6	1113417	1113422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28542	NC_012633	TCTAGT	2	12	1113426	1113437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28543	NC_012633	TAA	2	6	1113503	1113508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28544	NC_012633	TGT	2	6	1113534	1113539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28545	NC_012633	TAC	2	6	1113686	1113691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28546	NC_012633	TTA	2	6	1113698	1113703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28547	NC_012633	TCTTG	2	10	1113738	1113747	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28548	NC_012633	ACA	2	6	1113792	1113797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28549	NC_012633	AGT	2	6	1113817	1113822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28550	NC_012633	CAT	2	6	1113836	1113841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28551	NC_012633	ACA	2	6	1113850	1113855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28552	NC_012633	GAA	2	6	1113881	1113886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28553	NC_012633	ATT	2	6	1113887	1113892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28554	NC_012633	TAAT	2	8	1113939	1113946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28555	NC_012633	GGA	2	6	1114025	1114030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28556	NC_012633	CAA	2	6	1114071	1114076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28557	NC_012633	ATAG	2	8	1114079	1114086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28558	NC_012633	GCT	2	6	1114091	1114096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28559	NC_012633	TAG	2	6	1114125	1114130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28560	NC_012633	GCT	2	6	1114184	1114189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28561	NC_012633	ATT	2	6	1114289	1114294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28563	NC_012633	CTT	2	6	1114335	1114340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28564	NC_012633	AT	3	6	1114398	1114403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28565	NC_012633	ATT	2	6	1114415	1114420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28566	NC_012633	ATT	2	6	1114442	1114447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28568	NC_012633	ATA	3	9	1114495	1114503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28570	NC_012633	GCTCA	2	10	1114717	1114726	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28571	NC_012633	A	6	6	1114778	1114783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28572	NC_012633	ATGG	2	8	1114796	1114803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28573	NC_012633	ACC	2	6	1114861	1114866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28574	NC_012633	A	7	7	1114879	1114885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28575	NC_012633	A	6	6	1114893	1114898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28576	NC_012633	AT	3	6	1114910	1114915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28577	NC_012633	A	6	6	1114926	1114931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28581	NC_012633	TA	5	10	1115029	1115038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28584	NC_012633	AAG	2	6	1115128	1115133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28587	NC_012633	AAAT	2	8	1115189	1115196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28590	NC_012633	TTAA	2	8	1115265	1115272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28591	NC_012633	AAG	2	6	1115308	1115313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28592	NC_012633	AT	3	6	1115348	1115353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28593	NC_012633	ATA	2	6	1115365	1115370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28594	NC_012633	ATA	2	6	1115374	1115379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28595	NC_012633	A	7	7	1115397	1115403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28596	NC_012633	TGC	2	6	1115495	1115500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28597	NC_012633	T	6	6	1115529	1115534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28598	NC_012633	TTA	2	6	1115588	1115593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28602	NC_012633	CAA	2	6	1115693	1115698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28603	NC_012633	T	6	6	1115786	1115791	0 %	100 %	0 %	0 %	229587140
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28606	NC_012633	TTC	2	6	1115884	1115889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587140
28607	NC_012633	TAT	2	6	1115925	1115930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587140
28608	NC_012633	TGA	2	6	1115947	1115952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587140
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28610	NC_012633	ACCT	2	8	1116120	1116127	25 %	25 %	0 %	50 %	229587140
28611	NC_012633	T	7	7	1116149	1116155	0 %	100 %	0 %	0 %	229587140
28612	NC_012633	TTA	2	6	1116200	1116205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587140
28613	NC_012633	GAT	2	6	1116267	1116272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587140
28614	NC_012633	ATAA	2	8	1116278	1116285	75 %	25 %	0 %	0 %	229587140
28615	NC_012633	TTAA	2	8	1116374	1116381	50 %	50 %	0 %	0 %	229587140
28616	NC_012633	AAT	2	6	1116452	1116457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587140
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28620	NC_012633	ATATTA	2	12	1116800	1116811	50 %	50 %	0 %	0 %	229587140
28621	NC_012633	AAT	2	6	1116817	1116822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587140
28622	NC_012633	CTT	2	6	1116843	1116848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587140
28623	NC_012633	AAAT	2	8	1116853	1116860	75 %	25 %	0 %	0 %	229587140
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