MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_012633	TACAT	2	10	1015284	1015293	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26003	NC_012633	TCA	2	6	1015318	1015323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26004	NC_012633	ACC	2	6	1015401	1015406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26005	NC_012633	GCA	2	6	1015424	1015429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26006	NC_012633	ATT	2	6	1015447	1015452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26007	NC_012633	AATTTA	2	12	1015463	1015474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26008	NC_012633	T	7	7	1015510	1015516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26009	NC_012633	TA	3	6	1015521	1015526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26010	NC_012633	GAA	2	6	1015532	1015537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26011	NC_012633	TAA	2	6	1015552	1015557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26012	NC_012633	TA	3	6	1015577	1015582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26013	NC_012633	T	6	6	1015606	1015611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26014	NC_012633	TAAT	2	8	1015613	1015620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26015	NC_012633	ATTT	2	8	1015733	1015740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26016	NC_012633	T	6	6	1015747	1015752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26017	NC_012633	CAT	2	6	1015754	1015759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26018	NC_012633	ATC	3	9	1015833	1015841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26019	NC_012633	TAA	2	6	1015872	1015877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26020	NC_012633	ATT	2	6	1015896	1015901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26021	NC_012633	TTA	2	6	1016105	1016110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26022	NC_012633	AT	3	6	1016132	1016137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26023	NC_012633	TTG	2	6	1016138	1016143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26024	NC_012633	ATA	2	6	1016195	1016200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26025	NC_012633	ATA	2	6	1016224	1016229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26026	NC_012633	TAA	2	6	1016249	1016254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26027	NC_012633	CTTA	2	8	1016316	1016323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26028	NC_012633	TCTT	2	8	1016341	1016348	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26029	NC_012633	TCT	2	6	1016362	1016367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26030	NC_012633	CAAT	2	8	1016443	1016450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26031	NC_012633	CTA	2	6	1016531	1016536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26032	NC_012633	TATT	2	8	1016551	1016558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26033	NC_012633	TTA	2	6	1016660	1016665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26034	NC_012633	ATA	2	6	1016671	1016676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26035	NC_012633	AT	4	8	1016684	1016691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26036	NC_012633	T	7	7	1016691	1016697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26037	NC_012633	ATA	2	6	1016699	1016704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26038	NC_012633	TTA	2	6	1016706	1016711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26039	NC_012633	GTT	2	6	1016834	1016839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26041	NC_012633	CAA	2	6	1016988	1016993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26043	NC_012633	AACA	2	8	1017015	1017022	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26044	NC_012633	T	6	6	1017031	1017036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26045	NC_012633	T	6	6	1017047	1017052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26046	NC_012633	GGCT	2	8	1017239	1017246	0 %	25 %	50 %	25 %	229587063
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26052	NC_012633	TTGCA	2	10	1017520	1017529	20 %	40 %	20 %	20 %	229587063
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26056	NC_012633	GAA	2	6	1017622	1017627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587063
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26487	NC_012633	ATAA	2	8	1035139	1035146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26488	NC_012633	GAAA	2	8	1035177	1035184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26489	NC_012633	A	6	6	1035249	1035254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26490	NC_012633	CTA	2	6	1035288	1035293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26491	NC_012633	TAT	2	6	1035340	1035345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26492	NC_012633	TGC	2	6	1035429	1035434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26493	NC_012633	ACTAT	2	10	1035444	1035453	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26494	NC_012633	ATC	2	6	1035482	1035487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26495	NC_012633	ATTA	2	8	1035580	1035587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26496	NC_012633	A	6	6	1035591	1035596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26497	NC_012633	ATT	2	6	1035619	1035624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26498	NC_012633	AGC	2	6	1035650	1035655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26499	NC_012633	AAG	2	6	1035699	1035704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26500	NC_012633	GTT	2	6	1035711	1035716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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