MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_012633	A	6	6	997626	997631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25502	NC_012633	GAA	2	6	997638	997643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25503	NC_012633	GTT	2	6	997707	997712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25504	NC_012633	TGG	2	6	997714	997719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25505	NC_012633	TTATT	2	10	997753	997762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25506	NC_012633	ACA	2	6	997783	997788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25507	NC_012633	TGA	2	6	997807	997812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25508	NC_012633	ATT	2	6	997826	997831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25509	NC_012633	GGAA	2	8	997846	997853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25510	NC_012633	CA	3	6	997859	997864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25511	NC_012633	TTA	2	6	997865	997870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25512	NC_012633	CTTG	2	8	997909	997916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25513	NC_012633	AGA	2	6	997922	997927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25514	NC_012633	TAA	2	6	997949	997954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25515	NC_012633	AGC	2	6	997980	997985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25516	NC_012633	A	6	6	998065	998070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25517	NC_012633	CAA	2	6	998110	998115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25518	NC_012633	T	6	6	998169	998174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25519	NC_012633	TAA	2	6	998183	998188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25520	NC_012633	ATT	2	6	998224	998229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25521	NC_012633	ATG	2	6	998246	998251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25522	NC_012633	GCT	2	6	998318	998323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25523	NC_012633	ATT	2	6	998332	998337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25524	NC_012633	CTA	2	6	998347	998352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25525	NC_012633	ATAAA	2	10	998363	998372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25526	NC_012633	TTA	2	6	998395	998400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25527	NC_012633	CTA	2	6	998416	998421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25528	NC_012633	TTAC	2	8	998491	998498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25529	NC_012633	ATAA	2	8	998525	998532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25530	NC_012633	ATT	2	6	998562	998567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25531	NC_012633	T	9	9	998594	998602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25532	NC_012633	TGG	2	6	998606	998611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587050
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25536	NC_012633	ATT	2	6	998745	998750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587050
25537	NC_012633	GTT	2	6	998799	998804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587050
25538	NC_012633	TGG	2	6	998811	998816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587050
25539	NC_012633	ATT	2	6	998896	998901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587050
25540	NC_012633	CCTA	2	8	998913	998920	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25541	NC_012633	TAT	2	6	998947	998952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25542	NC_012633	T	7	7	998952	998958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25543	NC_012633	GTT	2	6	999042	999047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25544	NC_012633	ACCC	2	8	999056	999063	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25545	NC_012633	TTG	2	6	999087	999092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25546	NC_012633	AAT	2	6	999142	999147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25547	NC_012633	AAT	2	6	999168	999173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587051
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25550	NC_012633	GA	3	6	999204	999209	50 %	0 %	50 %	0 %	229587051
25551	NC_012633	T	7	7	999267	999273	0 %	100 %	0 %	0 %	229587051
25552	NC_012633	AAT	2	6	999386	999391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587051
25553	NC_012633	CAT	2	6	999407	999412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587051
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25559	NC_012633	TTG	2	6	999738	999743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587051
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25562	NC_012633	TTCC	2	8	999785	999792	0 %	50 %	0 %	50 %	229587051
25563	NC_012633	CTG	2	6	999810	999815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587051
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25596	NC_012633	TA	3	6	1000992	1000997	50 %	50 %	0 %	0 %	229587052
25597	NC_012633	AT	3	6	1001015	1001020	50 %	50 %	0 %	0 %	229587052
25598	NC_012633	ACTA	2	8	1001021	1001028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25599	NC_012633	TATAA	2	10	1001037	1001046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25604	NC_012633	TTA	3	9	1001144	1001152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25605	NC_012633	TA	3	6	1001163	1001168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25606	NC_012633	ATT	2	6	1001203	1001208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587053
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25609	NC_012633	ATT	2	6	1001333	1001338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587053
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25612	NC_012633	TA	3	6	1001437	1001442	50 %	50 %	0 %	0 %	229587053
25613	NC_012633	GAC	2	6	1001448	1001453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587053
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25620	NC_012633	T	6	6	1001724	1001729	0 %	100 %	0 %	0 %	229587053
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25987	NC_012633	T	6	6	1014933	1014938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25988	NC_012633	TCATA	2	10	1014950	1014959	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25989	NC_012633	TAA	2	6	1014969	1014974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25990	NC_012633	ATT	2	6	1015002	1015007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25991	NC_012633	AAAT	2	8	1015044	1015051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25992	NC_012633	TTC	2	6	1015100	1015105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25993	NC_012633	AAT	2	6	1015138	1015143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25994	NC_012633	ATA	2	6	1015155	1015160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25995	NC_012633	TA	3	6	1015159	1015164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25996	NC_012633	CTA	2	6	1015184	1015189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25997	NC_012633	TTGA	2	8	1015194	1015201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25998	NC_012633	CAT	2	6	1015212	1015217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25999	NC_012633	T	7	7	1015225	1015231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26000	NC_012633	CTT	2	6	1015235	1015240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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