MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_012633	GATG	2	8	606807	606814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_012633	GAA	2	6	606822	606827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_012633	TAAT	2	8	606847	606854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_012633	AGG	2	6	606878	606883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_012633	AGAA	2	8	606934	606941	75 %	0 %	25 %	0 %	229586730
15506	NC_012633	TTA	3	9	606998	607006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586730
15507	NC_012633	TGA	2	6	607008	607013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586730
15508	NC_012633	ATA	2	6	607025	607030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586730
15509	NC_012633	TAG	2	6	607037	607042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586730
15510	NC_012633	GAT	2	6	607168	607173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586730
15511	NC_012633	A	6	6	607199	607204	100 %	0 %	0 %	0 %	229586730
15512	NC_012633	TA	3	6	607244	607249	50 %	50 %	0 %	0 %	229586730
15513	NC_012633	CCT	2	6	607306	607311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586730
15514	NC_012633	TA	3	6	607352	607357	50 %	50 %	0 %	0 %	229586730
15515	NC_012633	GCAAG	2	10	607369	607378	40 %	0 %	40 %	20 %	229586730
15516	NC_012633	GAT	2	6	607411	607416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586730
15517	NC_012633	ATT	2	6	607557	607562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586730
15518	NC_012633	AT	3	6	607572	607577	50 %	50 %	0 %	0 %	229586730
15519	NC_012633	CTG	2	6	607583	607588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586730
15520	NC_012633	TA	3	6	607610	607615	50 %	50 %	0 %	0 %	229586730
15521	NC_012633	ATT	2	6	607669	607674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586730
15522	NC_012633	TAT	2	6	607701	607706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586730
15523	NC_012633	AAG	2	6	607716	607721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586730
15524	NC_012633	TAG	2	6	607776	607781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_012633	ACA	2	6	607791	607796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_012633	AAAT	2	8	607803	607810	75 %	25 %	0 %	0 %	229586731
15527	NC_012633	CATA	2	8	607826	607833	50 %	25 %	0 %	25 %	229586731
15528	NC_012633	TTC	2	6	607861	607866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586731
15529	NC_012633	TTGC	2	8	607887	607894	0 %	50 %	25 %	25 %	229586731
15530	NC_012633	ATT	2	6	607944	607949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586731
15531	NC_012633	CCTCA	2	10	607963	607972	20 %	20 %	0 %	60 %	229586731
15532	NC_012633	TAA	2	6	607997	608002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586731
15533	NC_012633	GCT	2	6	608004	608009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586731
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15535	NC_012633	ATA	2	6	608131	608136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586731
15536	NC_012633	TAT	2	6	608144	608149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586731
15537	NC_012633	ATG	2	6	608155	608160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586731
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15539	NC_012633	ATT	2	6	608267	608272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586731
15540	NC_012633	AACTA	2	10	608276	608285	60 %	20 %	0 %	20 %	229586731
15541	NC_012633	GAA	2	6	608337	608342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586731
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15544	NC_012633	AT	3	6	608459	608464	50 %	50 %	0 %	0 %	229586731
15545	NC_012633	TGA	2	6	608471	608476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586731
15546	NC_012633	TA	3	6	608530	608535	50 %	50 %	0 %	0 %	229586731
15547	NC_012633	GAT	3	9	608556	608564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586731
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15557	NC_012633	AAG	2	6	608897	608902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586731
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15565	NC_012633	AGA	3	9	609575	609583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586731
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15568	NC_012633	TGA	2	6	609710	609715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586731
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15570	NC_012633	TAAT	2	8	609768	609775	50 %	50 %	0 %	0 %	229586731
15571	NC_012633	TCAT	2	8	609778	609785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15574	NC_012633	A	6	6	609927	609932	100 %	0 %	0 %	0 %	229586732
15575	NC_012633	AG	3	6	609950	609955	50 %	0 %	50 %	0 %	229586732
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15586	NC_012633	TAG	2	6	610446	610451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15589	NC_012633	A	6	6	610512	610517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_012633	A	6	6	610540	610545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_012633	GAA	2	6	610553	610558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15592	NC_012633	TCT	2	6	610625	610630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_012633	TAA	2	6	610663	610668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_012633	AG	4	8	610673	610680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15595	NC_012633	AGTA	2	8	610700	610707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_012633	ATA	2	6	610720	610725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_012633	TAA	2	6	610779	610784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_012633	TAT	2	6	610789	610794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_012633	A	8	8	610831	610838	100 %	0 %	0 %	0 %	229586733
15600	NC_012633	A	6	6	610890	610895	100 %	0 %	0 %	0 %	229586733
15601	NC_012633	CAA	2	6	610951	610956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586733
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15604	NC_012633	TAG	2	6	611051	611056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586733
15605	NC_012633	AGC	2	6	611142	611147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586733
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15607	NC_012633	GGA	2	6	611179	611184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586733
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15614	NC_012633	A	7	7	611537	611543	100 %	0 %	0 %	0 %	229586733
15615	NC_012633	TAA	2	6	611544	611549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586733
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15622	NC_012633	AT	3	6	611787	611792	50 %	50 %	0 %	0 %	229586733
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15624	NC_012633	TGC	2	6	611868	611873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586733
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15723	NC_012633	AGTAA	2	10	615826	615835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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15725	NC_012633	TAT	3	9	615902	615910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15731	NC_012633	TGC	2	6	616084	616089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15734	NC_012633	GTA	2	6	616127	616132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15742	NC_012633	TATTAA	2	12	616451	616462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15745	NC_012633	CAA	2	6	616547	616552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15746	NC_012633	AGG	2	6	616599	616604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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