MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012633	ATA	2	6	432733	432738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_012633	TTG	2	6	432742	432747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_012633	TAATT	2	10	432752	432761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_012633	CTC	2	6	432799	432804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11005	NC_012633	AAGCT	2	10	432808	432817	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11006	NC_012633	A	6	6	432865	432870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_012633	TCC	2	6	432928	432933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_012633	TGC	2	6	432955	432960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_012633	TAC	2	6	432975	432980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_012633	GTA	2	6	433011	433016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_012633	ATT	2	6	433088	433093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_012633	A	7	7	433131	433137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_012633	TAT	2	6	433175	433180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_012633	CAG	2	6	433207	433212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_012633	AGC	2	6	433308	433313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_012633	TAT	2	6	433413	433418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_012633	GATTT	2	10	433424	433433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_012633	GAA	2	6	433495	433500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_012633	AT	3	6	433506	433511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_012633	GTT	2	6	433599	433604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_012633	TATGC	2	10	433612	433621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11022	NC_012633	TGAA	2	8	433646	433653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_012633	GCG	2	6	433654	433659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_012633	TGCG	2	8	433679	433686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11025	NC_012633	GCAC	2	8	433708	433715	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_012633	ATA	2	6	433796	433801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_012633	T	6	6	433939	433944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_012633	AT	3	6	433948	433953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_012633	GAT	2	6	433958	433963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_012633	TAA	2	6	433989	433994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_012633	TTA	2	6	434018	434023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_012633	ATTT	2	8	434056	434063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_012633	TAAAA	2	10	434098	434107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_012633	TAA	2	6	434130	434135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_012633	GAA	2	6	434185	434190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_012633	AT	3	6	434199	434204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_012633	TAG	2	6	434262	434267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_012633	ATT	2	6	434300	434305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_012633	CTA	2	6	434306	434311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_012633	A	7	7	434313	434319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_012633	ATA	2	6	434353	434358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586583
11042	NC_012633	A	6	6	434406	434411	100 %	0 %	0 %	0 %	229586583
11043	NC_012633	TA	3	6	434461	434466	50 %	50 %	0 %	0 %	229586583
11044	NC_012633	TGT	2	6	434483	434488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586583
11045	NC_012633	ATT	2	6	434501	434506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586583
11046	NC_012633	ATG	2	6	434509	434514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586583
11047	NC_012633	GTA	2	6	434547	434552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586583
11048	NC_012633	AAGA	2	8	434568	434575	75 %	0 %	25 %	0 %	229586583
11049	NC_012633	AT	3	6	434588	434593	50 %	50 %	0 %	0 %	229586583
11050	NC_012633	GAA	2	6	434594	434599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586583
11051	NC_012633	AAT	2	6	434645	434650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586583
11052	NC_012633	TA	3	6	434691	434696	50 %	50 %	0 %	0 %	229586583
11053	NC_012633	CTG	2	6	434701	434706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586583
11054	NC_012633	AGG	2	6	434746	434751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586583
11055	NC_012633	GGA	2	6	434752	434757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586583
11056	NC_012633	A	6	6	434757	434762	100 %	0 %	0 %	0 %	229586583
11057	NC_012633	AAG	2	6	434770	434775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586583
11058	NC_012633	CAA	2	6	434803	434808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586583
11059	NC_012633	A	8	8	434820	434827	100 %	0 %	0 %	0 %	229586583
11060	NC_012633	A	6	6	434836	434841	100 %	0 %	0 %	0 %	229586583
11061	NC_012633	A	6	6	434907	434912	100 %	0 %	0 %	0 %	229586583
11062	NC_012633	GGT	2	6	434973	434978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586584
11063	NC_012633	GCA	2	6	434987	434992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586584
11064	NC_012633	A	6	6	434996	435001	100 %	0 %	0 %	0 %	229586584
11065	NC_012633	TGTTGG	2	12	435062	435073	0 %	50 %	50 %	0 %	229586584
11066	NC_012633	AT	3	6	435080	435085	50 %	50 %	0 %	0 %	229586584
11067	NC_012633	GGA	2	6	435086	435091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586584
11068	NC_012633	A	6	6	435177	435182	100 %	0 %	0 %	0 %	229586584
11069	NC_012633	GGA	2	6	435200	435205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586584
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11072	NC_012633	TAC	2	6	435394	435399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586584
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11074	NC_012633	ATGAGA	2	12	435517	435528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	229586584
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11076	NC_012633	GTA	2	6	435550	435555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586584
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11082	NC_012633	ATT	2	6	435706	435711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586584
11083	NC_012633	GA	3	6	435723	435728	50 %	0 %	50 %	0 %	229586584
11084	NC_012633	AGC	2	6	435791	435796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586584
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11089	NC_012633	TAA	2	6	435959	435964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586584
11090	NC_012633	TTA	2	6	435975	435980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586584
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11092	NC_012633	GCA	2	6	436031	436036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586584
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11095	NC_012633	GCA	2	6	436203	436208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586584
11096	NC_012633	ATT	2	6	436209	436214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586584
11097	NC_012633	GTT	2	6	436244	436249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586584
11098	NC_012633	GGT	2	6	436277	436282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586585
11099	NC_012633	TAA	2	6	436303	436308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586585
11100	NC_012633	ATTAAT	2	12	436311	436322	50 %	50 %	0 %	0 %	229586585
11101	NC_012633	ATA	2	6	436323	436328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586585
11102	NC_012633	AT	3	6	436334	436339	50 %	50 %	0 %	0 %	229586585
11103	NC_012633	T	6	6	436347	436352	0 %	100 %	0 %	0 %	229586585
11104	NC_012633	T	7	7	436399	436405	0 %	100 %	0 %	0 %	229586585
11105	NC_012633	TTG	2	6	436432	436437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586585
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11107	NC_012633	ATA	2	6	436533	436538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586585
11108	NC_012633	TA	3	6	436537	436542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_012633	T	6	6	436607	436612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_012633	TAA	2	6	436618	436623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_012633	TTA	2	6	436681	436686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_012633	ATTG	2	8	436735	436742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_012633	TA	3	6	436756	436761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_012633	AGTT	2	8	436779	436786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_012633	A	6	6	436814	436819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_012633	ATT	2	6	436835	436840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_012633	ATA	2	6	436869	436874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_012633	TTA	2	6	436876	436881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586586
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11121	NC_012633	TATT	2	8	436936	436943	25 %	75 %	0 %	0 %	229586586
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11125	NC_012633	TAGT	2	8	437239	437246	25 %	50 %	25 %	0 %	229586586
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11255	NC_012633	TTTCT	2	10	442386	442395	0 %	80 %	0 %	20 %	229586592
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