MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 chromosome 2

Total Repeats: 33512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011958	GTC	2	6	17	22	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011958	CGGT	2	8	63	70	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011958	CG	3	6	73	78	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011958	GGA	2	6	99	104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011958	GAG	2	6	132	137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221368939
6	NC_011958	TCG	2	6	148	153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368939
7	NC_011958	TGC	2	6	161	166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368939
8	NC_011958	GGC	2	6	210	215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368939
9	NC_011958	TTG	2	6	226	231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221368939
10	NC_011958	GCTC	2	8	254	261	0 %	25 %	25 %	50 %	221368939
11	NC_011958	CGA	2	6	329	334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368939
12	NC_011958	GTC	2	6	345	350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368939
13	NC_011958	ACG	2	6	487	492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368939
14	NC_011958	GGC	2	6	632	637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368939
15	NC_011958	GGT	2	6	642	647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221368939
16	NC_011958	GTT	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221368939
17	NC_011958	CCAT	2	8	736	743	25 %	25 %	0 %	50 %	221368939
18	NC_011958	CGA	2	6	813	818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368939
19	NC_011958	GAA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221368939
20	NC_011958	CGTGTC	2	12	876	887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368939
21	NC_011958	GTT	2	6	900	905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221368939
22	NC_011958	CGC	2	6	957	962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368939
23	NC_011958	GTT	2	6	1002	1007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221368939
24	NC_011958	CGG	2	6	1028	1033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368939
25	NC_011958	GAAG	2	8	1052	1059	50 %	0 %	50 %	0 %	221368939
26	NC_011958	GCG	2	6	1063	1068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368939
27	NC_011958	AGC	2	6	1069	1074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368939
28	NC_011958	CGA	2	6	1091	1096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368939
29	NC_011958	TCC	2	6	1124	1129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368939
30	NC_011958	GC	3	6	1140	1145	0 %	0 %	50 %	50 %	221368939
31	NC_011958	TCC	2	6	1155	1160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368939
32	NC_011958	GA	3	6	1241	1246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011958	ATA	2	6	1254	1259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011958	TTG	2	6	1260	1265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011958	TAT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011958	GTT	2	6	1308	1313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011958	CAG	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011958	GATG	2	8	1328	1335	25 %	25 %	50 %	0 %	221368940
39	NC_011958	TCC	2	6	1338	1343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368940
40	NC_011958	GCG	3	9	1365	1373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368940
41	NC_011958	GCG	2	6	1430	1435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368940
42	NC_011958	AGC	2	6	1447	1452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368940
43	NC_011958	CG	3	6	1457	1462	0 %	0 %	50 %	50 %	221368940
44	NC_011958	GCT	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368940
45	NC_011958	CGGG	2	8	1485	1492	0 %	0 %	75 %	25 %	221368940
46	NC_011958	CTT	2	6	1640	1645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221368940
47	NC_011958	CTG	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368940
48	NC_011958	TTCG	2	8	1705	1712	0 %	50 %	25 %	25 %	221368940
49	NC_011958	CGC	2	6	1751	1756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368940
50	NC_011958	GCCA	2	8	1833	1840	25 %	0 %	25 %	50 %	221368940
51	NC_011958	TGC	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368940
52	NC_011958	CCA	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221368940
53	NC_011958	ACG	2	6	2020	2025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368940
54	NC_011958	GC	3	6	2079	2084	0 %	0 %	50 %	50 %	221368940
55	NC_011958	GGC	2	6	2087	2092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368940
56	NC_011958	CCCG	2	8	2120	2127	0 %	0 %	25 %	75 %	221368940
57	NC_011958	AGG	2	6	2140	2145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221368940
58	NC_011958	CCGG	2	8	2155	2162	0 %	0 %	50 %	50 %	221368940
59	NC_011958	GAG	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221368940
60	NC_011958	GCA	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368940
61	NC_011958	CGC	2	6	2234	2239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368941
62	NC_011958	CCGGA	2	10	2242	2251	20 %	0 %	40 %	40 %	221368941
63	NC_011958	GCG	2	6	2279	2284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368941
64	NC_011958	TGC	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368941
65	NC_011958	GCG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368941
66	NC_011958	CACG	2	8	2420	2427	25 %	0 %	25 %	50 %	221368941
67	NC_011958	GC	3	6	2519	2524	0 %	0 %	50 %	50 %	221368941
68	NC_011958	ACGGC	2	10	2561	2570	20 %	0 %	40 %	40 %	221368941
69	NC_011958	GGGC	2	8	2574	2581	0 %	0 %	75 %	25 %	221368941
70	NC_011958	TGC	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368941
71	NC_011958	GGCG	2	8	2703	2710	0 %	0 %	75 %	25 %	221368941
72	NC_011958	TCG	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368941
73	NC_011958	CGC	2	6	2784	2789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368941
74	NC_011958	GCA	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368941
75	NC_011958	GC	4	8	2843	2850	0 %	0 %	50 %	50 %	221368941
76	NC_011958	CGA	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368941
77	NC_011958	CGG	2	6	2913	2918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368941
78	NC_011958	CGC	2	6	2922	2927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368941
79	NC_011958	GGC	2	6	2929	2934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368941
80	NC_011958	CGGC	2	8	2988	2995	0 %	0 %	50 %	50 %	221368941
81	NC_011958	GCC	2	6	3055	3060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368941
82	NC_011958	AGG	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221368941
83	NC_011958	CGC	2	6	3147	3152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368942
84	NC_011958	CCG	2	6	3233	3238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368942
85	NC_011958	GCGCC	2	10	3360	3369	0 %	0 %	40 %	60 %	221368942
86	NC_011958	CGG	2	6	3390	3395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368942
87	NC_011958	CCA	2	6	3426	3431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221368942
88	NC_011958	GGC	2	6	3507	3512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368942
89	NC_011958	TCA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221368942
90	NC_011958	CGG	2	6	3615	3620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368942
91	NC_011958	CGG	2	6	3651	3656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368942
92	NC_011958	TCA	2	6	3716	3721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221368942
93	NC_011958	GCCG	2	8	3779	3786	0 %	0 %	50 %	50 %	221368942
94	NC_011958	GCTGGC	2	12	3807	3818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221368942
95	NC_011958	TGG	2	6	3827	3832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221368942
96	NC_011958	GGC	2	6	3839	3844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368942
97	NC_011958	GCCGC	2	10	3943	3952	0 %	0 %	40 %	60 %	221368942
98	NC_011958	GCCG	2	8	3963	3970	0 %	0 %	50 %	50 %	221368942
99	NC_011958	GC	3	6	3988	3993	0 %	0 %	50 %	50 %	221368942
100	NC_011958	AGC	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368942
101	NC_011958	GCG	2	6	4118	4123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368942
102	NC_011958	CGC	2	6	4163	4168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368942
103	NC_011958	CG	3	6	4215	4220	0 %	0 %	50 %	50 %	221368942
104	NC_011958	TGC	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368942
105	NC_011958	CGGGG	2	10	4263	4272	0 %	0 %	80 %	20 %	221368942
106	NC_011958	ACG	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368942
107	NC_011958	GC	3	6	4286	4291	0 %	0 %	50 %	50 %	221368942
108	NC_011958	GGGC	2	8	4325	4332	0 %	0 %	75 %	25 %	221368942
109	NC_011958	ACC	2	6	4343	4348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221368942
110	NC_011958	ATC	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221368942
111	NC_011958	TGC	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368942
112	NC_011958	CAC	2	6	4461	4466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221368942
113	NC_011958	AGG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221368942
114	NC_011958	GCC	2	6	4536	4541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368942
115	NC_011958	GC	3	6	4552	4557	0 %	0 %	50 %	50 %	221368942
116	NC_011958	CGA	2	6	4626	4631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368942
117	NC_011958	TC	3	6	4737	4742	0 %	50 %	0 %	50 %	221368942
118	NC_011958	GGC	2	6	4749	4754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368942
119	NC_011958	GTG	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221368942
120	NC_011958	TCT	2	6	4832	4837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221368942
121	NC_011958	CCT	2	6	4850	4855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368942
122	NC_011958	GC	3	6	4913	4918	0 %	0 %	50 %	50 %	221368942
123	NC_011958	CGGG	2	8	4920	4927	0 %	0 %	75 %	25 %	221368942
124	NC_011958	TGC	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368942
125	NC_011958	CAGC	2	8	4977	4984	25 %	0 %	25 %	50 %	221368942
126	NC_011958	GAC	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368942
127	NC_011958	GTG	2	6	5086	5091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221368942
128	NC_011958	GTG	2	6	5158	5163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221368942
129	NC_011958	CCT	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368942
130	NC_011958	CGCT	2	8	5258	5265	0 %	25 %	25 %	50 %	221368942
131	NC_011958	GCG	2	6	5275	5280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368942
132	NC_011958	TCG	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368942
133	NC_011958	CCGG	2	8	5343	5350	0 %	0 %	50 %	50 %	221368942
134	NC_011958	GGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011958	CCGG	2	8	5385	5392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011958	CGT	2	6	5537	5542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011958	CCG	2	6	5570	5575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011958	TGG	2	6	5654	5659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221368943
139	NC_011958	ACG	2	6	5669	5674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368943
140	NC_011958	GGCG	2	8	5709	5716	0 %	0 %	75 %	25 %	221368943
141	NC_011958	GTTC	2	8	5805	5812	0 %	50 %	25 %	25 %	221368943
142	NC_011958	GCG	2	6	5828	5833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368943
143	NC_011958	TTCGA	2	10	5863	5872	20 %	40 %	20 %	20 %	221368943
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145	NC_011958	CAT	2	6	5961	5966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221368943
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149	NC_011958	GC	3	6	6108	6113	0 %	0 %	50 %	50 %	221368943
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158	NC_011958	GAC	2	6	6460	6465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011958	GTCC	2	8	6495	6502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_011958	GCCC	2	8	6535	6542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
161	NC_011958	GAGG	2	8	6651	6658	25 %	0 %	75 %	0 %	221368944
162	NC_011958	CGG	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368944
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164	NC_011958	TCATCC	2	12	6734	6745	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	221368944
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168	NC_011958	TCGG	2	8	6846	6853	0 %	25 %	50 %	25 %	221368945
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197	NC_011958	GCG	2	6	7825	7830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_011958	CGC	3	9	7855	7863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
199	NC_011958	AGG	2	6	7879	7884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_011958	GC	3	6	10485	10490	0 %	0 %	50 %	50 %	221368948
268	NC_011958	TCC	2	6	10491	10496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368948
269	NC_011958	TGC	2	6	10530	10535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368948
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271	NC_011958	GGC	2	6	10628	10633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368948
272	NC_011958	CTC	2	6	10655	10660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368948
273	NC_011958	CTT	2	6	10723	10728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221368948
274	NC_011958	TGC	2	6	10758	10763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368948
275	NC_011958	TCTGG	2	10	10801	10810	0 %	40 %	40 %	20 %	221368948
276	NC_011958	CTGC	2	8	10831	10838	0 %	25 %	25 %	50 %	221368948
277	NC_011958	CGC	2	6	10854	10859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368948
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281	NC_011958	ATC	2	6	11203	11208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221368949
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283	NC_011958	TGC	2	6	11280	11285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221368950
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286	NC_011958	GGA	2	6	11392	11397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221368950
287	NC_011958	GGT	2	6	11398	11403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221368950
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394	NC_011958	CGG	2	6	15808	15813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368954
395	NC_011958	GC	3	6	15814	15819	0 %	0 %	50 %	50 %	221368954
396	NC_011958	CGC	3	9	15831	15839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368954
397	NC_011958	TTC	2	6	15898	15903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221368954
398	NC_011958	GGC	2	6	16011	16016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368954
399	NC_011958	CG	3	6	16020	16025	0 %	0 %	50 %	50 %	221368954
400	NC_011958	CGC	2	6	16078	16083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368955
401	NC_011958	GCC	2	6	16139	16144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368955
402	NC_011958	GC	3	6	16153	16158	0 %	0 %	50 %	50 %	221368955
403	NC_011958	GC	4	8	16185	16192	0 %	0 %	50 %	50 %	221368955
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410	NC_011958	GGT	2	6	16432	16437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221368955
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412	NC_011958	CCT	2	6	16524	16529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368955
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416	NC_011958	GCCG	2	8	16631	16638	0 %	0 %	50 %	50 %	221368955
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427	NC_011958	CG	3	6	16963	16968	0 %	0 %	50 %	50 %	221368955
428	NC_011958	CG	3	6	16990	16995	0 %	0 %	50 %	50 %	221368955
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435	NC_011958	GCC	2	6	17416	17421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368956
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439	NC_011958	GC	3	6	17494	17499	0 %	0 %	50 %	50 %	221368956
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443	NC_011958	AGG	2	6	17616	17621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221368956
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445	NC_011958	CCGGCG	2	12	17729	17740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
446	NC_011958	GGC	2	6	17838	17843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368957
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450	NC_011958	GCA	2	6	17948	17953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368957
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464	NC_011958	TCC	2	6	18697	18702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221368957
465	NC_011958	GAG	2	6	18710	18715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_011958	GGC	2	6	18788	18793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221368958
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472	NC_011958	GGCCAT	2	12	18884	18895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	221368958
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491	NC_011958	CGG	2	6	19795	19800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
492	NC_011958	CGC	2	6	19843	19848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221368959
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499	NC_011958	CGA	2	6	20161	20166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221368959
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