MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum centenum SW chromosome

Total Repeats: 125138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011420	CGCC	2	8	537881	537888	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15002	NC_011420	CTC	3	9	537943	537951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209963843
15003	NC_011420	CG	3	6	537953	537958	0 %	0 %	50 %	50 %	209963843
15004	NC_011420	CGT	2	6	537978	537983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963843
15005	NC_011420	TGT	2	6	538011	538016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209963843
15006	NC_011420	CTT	2	6	538018	538023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963843
15007	NC_011420	GGA	2	6	538044	538049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963843
15008	NC_011420	GCT	2	6	538062	538067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963843
15009	NC_011420	CAGG	2	8	538075	538082	25 %	0 %	50 %	25 %	209963843
15010	NC_011420	CTG	2	6	538087	538092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963843
15011	NC_011420	GGCC	2	8	538104	538111	0 %	0 %	50 %	50 %	209963843
15012	NC_011420	CG	3	6	538115	538120	0 %	0 %	50 %	50 %	209963843
15013	NC_011420	GC	3	6	538344	538349	0 %	0 %	50 %	50 %	209963843
15014	NC_011420	GAT	2	6	538378	538383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209963843
15015	NC_011420	GCT	2	6	538461	538466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963843
15016	NC_011420	CGG	2	6	538544	538549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963843
15017	NC_011420	CCT	2	6	538584	538589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15018	NC_011420	CGGCC	2	10	538668	538677	0 %	0 %	40 %	60 %	209963844
15019	NC_011420	GGTCGG	2	12	538701	538712	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209963844
15020	NC_011420	CGG	2	6	538719	538724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963844
15021	NC_011420	CGGC	2	8	538727	538734	0 %	0 %	50 %	50 %	209963844
15022	NC_011420	TCC	2	6	538745	538750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209963844
15023	NC_011420	GGCC	2	8	538798	538805	0 %	0 %	50 %	50 %	209963844
15024	NC_011420	CAC	2	6	538828	538833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963844
15025	NC_011420	CG	3	6	538834	538839	0 %	0 %	50 %	50 %	209963844
15026	NC_011420	GAA	2	6	538846	538851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209963844
15027	NC_011420	AGC	3	9	538892	538900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963844
15028	NC_011420	GCA	2	6	538926	538931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963844
15029	NC_011420	TCG	2	6	538937	538942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963844
15030	NC_011420	TGGTC	2	10	538977	538986	0 %	40 %	40 %	20 %	209963844
15031	NC_011420	TGG	2	6	539007	539012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963844
15032	NC_011420	CAG	2	6	539023	539028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963844
15033	NC_011420	TGG	2	6	539073	539078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963844
15034	NC_011420	GTC	2	6	539085	539090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963844
15035	NC_011420	GCC	2	6	539156	539161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963845
15036	NC_011420	GCC	2	6	539202	539207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963845
15037	NC_011420	G	6	6	539214	539219	0 %	0 %	100 %	0 %	209963845
15038	NC_011420	GCT	2	6	539224	539229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963845
15039	NC_011420	ACCGCC	2	12	539241	539252	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	209963845
15040	NC_011420	GC	3	6	539266	539271	0 %	0 %	50 %	50 %	209963845
15041	NC_011420	TGC	2	6	539322	539327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963845
15042	NC_011420	GAC	2	6	539332	539337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963845
15043	NC_011420	CGC	2	6	539401	539406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963845
15044	NC_011420	CGA	2	6	539416	539421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963845
15045	NC_011420	TGC	2	6	539424	539429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963845
15046	NC_011420	CTA	2	6	539449	539454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963845
15047	NC_011420	GC	3	6	539462	539467	0 %	0 %	50 %	50 %	209963845
15048	NC_011420	GGCG	2	8	539507	539514	0 %	0 %	75 %	25 %	209963845
15049	NC_011420	CGGCCG	2	12	539568	539579	0 %	0 %	50 %	50 %	209963845
15050	NC_011420	CGC	2	6	539581	539586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963845
15051	NC_011420	CGG	3	9	539604	539612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963845
15052	NC_011420	GGA	2	6	539659	539664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963845
15053	NC_011420	GC	3	6	539692	539697	0 %	0 %	50 %	50 %	209963845
15054	NC_011420	GCGG	2	8	539725	539732	0 %	0 %	75 %	25 %	209963845
15055	NC_011420	CGC	2	6	539778	539783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963845
15056	NC_011420	GGC	2	6	539784	539789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963845
15057	NC_011420	GCC	2	6	539825	539830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963845
15058	NC_011420	CCG	3	9	539832	539840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963845
15059	NC_011420	AGG	2	6	539847	539852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963845
15060	NC_011420	GGC	2	6	539866	539871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963845
15061	NC_011420	CGG	2	6	539891	539896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963845
15062	NC_011420	GCGACG	2	12	539916	539927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209963845
15063	NC_011420	TGC	3	9	539934	539942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963845
15064	NC_011420	GCC	2	6	539943	539948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963845
15065	NC_011420	CGG	2	6	539968	539973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963845
15066	NC_011420	ATG	2	6	539975	539980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209963845
15067	NC_011420	GCG	2	6	540038	540043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963845
15068	NC_011420	CCGT	2	8	540152	540159	0 %	25 %	25 %	50 %	209963845
15069	NC_011420	CGGG	2	8	540182	540189	0 %	0 %	75 %	25 %	209963845
15070	NC_011420	GGAGGC	2	12	540193	540204	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	209963845
15071	NC_011420	TGC	2	6	540228	540233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963845
15072	NC_011420	GGC	2	6	540244	540249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963845
15073	NC_011420	GACGGA	2	12	540266	540277	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	209963845
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15075	NC_011420	GCT	2	6	540366	540371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963846
15076	NC_011420	GCT	2	6	540393	540398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963846
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15078	NC_011420	GC	3	6	540458	540463	0 %	0 %	50 %	50 %	209963846
15079	NC_011420	GCC	2	6	540547	540552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963846
15080	NC_011420	CGC	3	9	540573	540581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963846
15081	NC_011420	GGC	2	6	540592	540597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963846
15082	NC_011420	GGC	2	6	540665	540670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963846
15083	NC_011420	GCC	2	6	540682	540687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963846
15084	NC_011420	GCA	2	6	540743	540748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963846
15085	NC_011420	GCC	2	6	540772	540777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963846
15086	NC_011420	GC	4	8	540792	540799	0 %	0 %	50 %	50 %	209963846
15087	NC_011420	CG	3	6	540810	540815	0 %	0 %	50 %	50 %	209963846
15088	NC_011420	CAA	2	6	540846	540851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209963846
15089	NC_011420	GATC	2	8	540858	540865	25 %	25 %	25 %	25 %	209963846
15090	NC_011420	GCGCCC	2	12	540872	540883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963846
15091	NC_011420	CGC	2	6	540885	540890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963846
15092	NC_011420	GGC	2	6	540891	540896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963846
15093	NC_011420	CTGG	2	8	540939	540946	0 %	25 %	50 %	25 %	209963846
15094	NC_011420	CCG	3	9	540998	541006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963846
15095	NC_011420	GAC	2	6	541012	541017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963846
15096	NC_011420	CGC	3	9	541020	541028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963846
15097	NC_011420	ATTG	2	8	541279	541286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_011420	GTC	2	6	541315	541320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_011420	AGG	2	6	541357	541362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_011420	GCT	2	6	541387	541392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963847
15101	NC_011420	CT	3	6	541400	541405	0 %	50 %	0 %	50 %	209963847
15102	NC_011420	GCC	2	6	541408	541413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963847
15103	NC_011420	TGC	2	6	541457	541462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963847
15104	NC_011420	GCC	2	6	541480	541485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963847
15105	NC_011420	CGGC	2	8	541498	541505	0 %	0 %	50 %	50 %	209963847
15106	NC_011420	GC	4	8	541528	541535	0 %	0 %	50 %	50 %	209963847
15107	NC_011420	CGC	2	6	541542	541547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963847
15108	NC_011420	GCC	2	6	541580	541585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963847
15109	NC_011420	GGA	2	6	541617	541622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963847
15110	NC_011420	CG	4	8	541631	541638	0 %	0 %	50 %	50 %	209963847
15111	NC_011420	CCG	2	6	541646	541651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963847
15112	NC_011420	CGG	2	6	541655	541660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963847
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15114	NC_011420	CGG	2	6	541755	541760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963848
15115	NC_011420	CCG	2	6	541766	541771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963848
15116	NC_011420	TCT	2	6	541780	541785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963848
15117	NC_011420	GAGG	2	8	541844	541851	25 %	0 %	75 %	0 %	209963848
15118	NC_011420	CTG	2	6	541914	541919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963848
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15120	NC_011420	GCA	2	6	541957	541962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_011420	CGT	2	6	541972	541977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15123	NC_011420	CGG	2	6	542024	542029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963849
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15360	NC_011420	CGG	2	6	551730	551735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963854
15361	NC_011420	GTC	2	6	551738	551743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963854
15362	NC_011420	CGT	2	6	551770	551775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963854
15363	NC_011420	CCG	2	6	551778	551783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963854
15364	NC_011420	CCGGC	2	10	551821	551830	0 %	0 %	40 %	60 %	209963854
15365	NC_011420	GTT	2	6	551840	551845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209963854
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15367	NC_011420	CGT	2	6	551941	551946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963854
15368	NC_011420	GTGCC	3	15	551952	551966	0 %	20 %	40 %	40 %	209963854
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15370	NC_011420	GCC	2	6	552018	552023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963854
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15372	NC_011420	TGCGAG	2	12	552051	552062	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209963854
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15375	NC_011420	CCA	2	6	552244	552249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963854
15376	NC_011420	CGGC	2	8	552267	552274	0 %	0 %	50 %	50 %	209963854
15377	NC_011420	CTT	2	6	552281	552286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963854
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15379	NC_011420	GCCC	2	8	552374	552381	0 %	0 %	25 %	75 %	209963854
15380	NC_011420	GCC	2	6	552423	552428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963854
15381	NC_011420	ACC	2	6	552450	552455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963854
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15397	NC_011420	CCCT	2	8	552906	552913	0 %	25 %	0 %	75 %	209963854
15398	NC_011420	GGGC	2	8	552919	552926	0 %	0 %	75 %	25 %	209963854
15399	NC_011420	CGG	2	6	553035	553040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963854
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15401	NC_011420	GCA	2	6	553066	553071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963854
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15415	NC_011420	GCA	2	6	553729	553734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963854
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15421	NC_011420	GTC	3	9	553962	553970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963854
15422	NC_011420	CGGG	2	8	553979	553986	0 %	0 %	75 %	25 %	209963854
15423	NC_011420	CGG	2	6	554004	554009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963854
15424	NC_011420	GGC	2	6	554030	554035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15425	NC_011420	GGCG	2	8	554052	554059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15426	NC_011420	TGGC	2	8	554094	554101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15427	NC_011420	GGGGC	2	10	554156	554165	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15428	NC_011420	CGGC	2	8	554198	554205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15429	NC_011420	GCCGGC	2	12	554235	554246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15430	NC_011420	GGA	2	6	554268	554273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15431	NC_011420	AGGA	2	8	554288	554295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15432	NC_011420	CGG	2	6	554484	554489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963855
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15435	NC_011420	CG	3	6	554532	554537	0 %	0 %	50 %	50 %	209963855
15436	NC_011420	CGA	2	6	554572	554577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963855
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15449	NC_011420	CCG	2	6	555153	555158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15450	NC_011420	GCG	2	6	555178	555183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15451	NC_011420	GCGG	2	8	555214	555221	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15452	NC_011420	GCC	2	6	555224	555229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15453	NC_011420	CTT	2	6	555240	555245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963856
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15460	NC_011420	CGCT	2	8	555361	555368	0 %	25 %	25 %	50 %	209963856
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15467	NC_011420	GCG	2	6	555746	555751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963856
15468	NC_011420	CGG	5	15	555759	555773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963856
15469	NC_011420	CGG	3	9	555788	555796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963856
15470	NC_011420	ACGCC	2	10	555854	555863	20 %	0 %	20 %	60 %	209963856
15471	NC_011420	GCA	2	6	555872	555877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963856
15472	NC_011420	CG	4	8	555908	555915	0 %	0 %	50 %	50 %	209963856
15473	NC_011420	TCT	2	6	555919	555924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963856
15474	NC_011420	CGA	2	6	555959	555964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963856
15475	NC_011420	G	6	6	556029	556034	0 %	0 %	100 %	0 %	209963856
15476	NC_011420	GC	3	6	556049	556054	0 %	0 %	50 %	50 %	209963856
15477	NC_011420	ATC	2	6	556057	556062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963856
15478	NC_011420	TCT	2	6	556070	556075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963856
15479	NC_011420	GATCAG	2	12	556095	556106	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209963856
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15481	NC_011420	TCT	2	6	556202	556207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963856
15482	NC_011420	CGG	2	6	556209	556214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963856
15483	NC_011420	GC	3	6	556225	556230	0 %	0 %	50 %	50 %	209963856
15484	NC_011420	TGGGCC	2	12	556231	556242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209963856
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15486	NC_011420	GCT	3	9	556259	556267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963856
15487	NC_011420	GCT	2	6	556289	556294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963856
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