MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum centenum SW chromosome

Total Repeats: 125138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011420	AGGT	2	8	17198	17205	25 %	25 %	50 %	0 %	209963376
502	NC_011420	GTA	2	6	17206	17211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209963376
503	NC_011420	CGT	2	6	17256	17261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
504	NC_011420	GTCG	2	8	17299	17306	0 %	25 %	50 %	25 %	209963376
505	NC_011420	CTT	2	6	17308	17313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963376
506	NC_011420	GTC	2	6	17359	17364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
507	NC_011420	CGA	2	6	17412	17417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963376
508	NC_011420	GGC	3	9	17428	17436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963376
509	NC_011420	TCG	2	6	17448	17453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
510	NC_011420	CGA	2	6	17490	17495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963376
511	NC_011420	CGAG	2	8	17505	17512	25 %	0 %	50 %	25 %	209963376
512	NC_011420	CAG	2	6	17518	17523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963376
513	NC_011420	GTC	2	6	17527	17532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
514	NC_011420	CCAGC	2	10	17587	17596	20 %	0 %	20 %	60 %	209963376
515	NC_011420	GGC	2	6	17638	17643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963376
516	NC_011420	CGT	2	6	17656	17661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
517	NC_011420	TGG	2	6	17676	17681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963376
518	NC_011420	AGG	2	6	17715	17720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963376
519	NC_011420	CGCTG	2	10	17799	17808	0 %	20 %	40 %	40 %	209963376
520	NC_011420	CCG	2	6	17858	17863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963376
521	NC_011420	TGTCG	2	10	17912	17921	0 %	40 %	40 %	20 %	209963376
522	NC_011420	TGG	2	6	17922	17927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963376
523	NC_011420	GCTGC	2	10	17980	17989	0 %	20 %	40 %	40 %	209963376
524	NC_011420	GCC	2	6	17993	17998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963376
525	NC_011420	GCC	2	6	18052	18057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963376
526	NC_011420	GGT	2	6	18130	18135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963376
527	NC_011420	GCC	3	9	18151	18159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963376
528	NC_011420	CA	3	6	18185	18190	50 %	0 %	0 %	50 %	209963376
529	NC_011420	TGC	2	6	18240	18245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
530	NC_011420	CGG	2	6	18294	18299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963376
531	NC_011420	CGT	2	6	18300	18305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
532	NC_011420	CGT	2	6	18312	18317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
533	NC_011420	CGG	2	6	18351	18356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963376
534	NC_011420	CGC	2	6	18384	18389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963376
535	NC_011420	GTT	2	6	18391	18396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209963376
536	NC_011420	ATC	2	6	18470	18475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963376
537	NC_011420	CTG	3	9	18577	18585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963376
538	NC_011420	GCG	2	6	18691	18696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963376
539	NC_011420	CGCC	2	8	18708	18715	0 %	0 %	25 %	75 %	209963376
540	NC_011420	CCT	2	6	18738	18743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209963376
541	NC_011420	CG	3	6	18753	18758	0 %	0 %	50 %	50 %	209963376
542	NC_011420	GCC	2	6	18775	18780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963376
543	NC_011420	TGG	2	6	18789	18794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963376
544	NC_011420	GCCC	2	8	18811	18818	0 %	0 %	25 %	75 %	209963376
545	NC_011420	CGA	2	6	18825	18830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963376
546	NC_011420	CTGGTT	2	12	18937	18948	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	209963376
547	NC_011420	GC	3	6	18967	18972	0 %	0 %	50 %	50 %	209963376
548	NC_011420	CTGGGC	2	12	19165	19176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209963376
549	NC_011420	ACGATG	2	12	19234	19245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209963376
550	NC_011420	GTG	2	6	19288	19293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011420	GA	3	6	19362	19367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011420	CA	3	6	19470	19475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_011420	GGA	2	6	19486	19491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011420	GA	3	6	19530	19535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011420	CCG	2	6	19629	19634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963377
556	NC_011420	GGC	2	6	19642	19647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963377
557	NC_011420	GGCC	2	8	19668	19675	0 %	0 %	50 %	50 %	209963377
558	NC_011420	CGC	2	6	19678	19683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963377
559	NC_011420	CAC	2	6	19702	19707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963377
560	NC_011420	CGT	2	6	19708	19713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963377
561	NC_011420	ACC	2	6	19725	19730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963377
562	NC_011420	GACG	2	8	19754	19761	25 %	0 %	50 %	25 %	209963377
563	NC_011420	CTG	2	6	19763	19768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963377
564	NC_011420	CCGG	2	8	19782	19789	0 %	0 %	50 %	50 %	209963377
565	NC_011420	AGG	2	6	19803	19808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963377
566	NC_011420	CTG	2	6	19814	19819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963377
567	NC_011420	GGCC	2	8	19831	19838	0 %	0 %	50 %	50 %	209963377
568	NC_011420	GCC	2	6	19840	19845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963377
569	NC_011420	GAG	2	6	19850	19855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963377
570	NC_011420	CTG	2	6	19871	19876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963377
571	NC_011420	GC	3	6	19901	19906	0 %	0 %	50 %	50 %	209963377
572	NC_011420	CACCG	2	10	19958	19967	20 %	0 %	20 %	60 %	209963377
573	NC_011420	ACGGCA	2	12	19986	19997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963377
574	NC_011420	CGG	2	6	19998	20003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963377
575	NC_011420	CCA	2	6	20047	20052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963377
576	NC_011420	ACGG	2	8	20078	20085	25 %	0 %	50 %	25 %	209963377
577	NC_011420	GCA	2	6	20154	20159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963377
578	NC_011420	GCA	2	6	20181	20186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963377
579	NC_011420	TCG	2	6	20205	20210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963377
580	NC_011420	CAT	2	6	20338	20343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963377
581	NC_011420	TCA	2	6	20373	20378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963377
582	NC_011420	CGGCCT	2	12	20395	20406	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209963377
583	NC_011420	TCG	2	6	20535	20540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963377
584	NC_011420	CTG	2	6	20543	20548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963377
585	NC_011420	GGC	2	6	20549	20554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963377
586	NC_011420	GAC	2	6	20579	20584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963377
587	NC_011420	CGC	2	6	20593	20598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963377
588	NC_011420	CTG	2	6	20606	20611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963377
589	NC_011420	GAG	3	9	20612	20620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963377
590	NC_011420	TGG	2	6	20673	20678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963377
591	NC_011420	CGG	2	6	20692	20697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963377
592	NC_011420	GC	3	6	20734	20739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_011420	GGC	2	6	20750	20755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011420	G	6	6	20773	20778	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011420	CGC	2	6	20790	20795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_011420	TCG	2	6	21013	21018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963378
597	NC_011420	TCA	2	6	21046	21051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963378
598	NC_011420	GGGGCT	2	12	21083	21094	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	209963378
599	NC_011420	ACT	2	6	21136	21141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963378
600	NC_011420	CAG	2	6	21183	21188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963378
601	NC_011420	GTC	2	6	21192	21197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963378
602	NC_011420	GGA	2	6	21386	21391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963378
603	NC_011420	GGC	2	6	21392	21397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963378
604	NC_011420	CGGA	2	8	21525	21532	25 %	0 %	50 %	25 %	209963378
605	NC_011420	GAA	2	6	21536	21541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209963378
606	NC_011420	GCA	2	6	21563	21568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963378
607	NC_011420	GCG	2	6	21613	21618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963378
608	NC_011420	GGT	2	6	21623	21628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963378
609	NC_011420	AGG	3	9	21685	21693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963378
610	NC_011420	CTG	2	6	21726	21731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963378
611	NC_011420	GAC	2	6	21792	21797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963378
612	NC_011420	AAG	2	6	21798	21803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209963378
613	NC_011420	ATG	2	6	21838	21843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209963378
614	NC_011420	GC	3	6	21863	21868	0 %	0 %	50 %	50 %	209963378
615	NC_011420	GCC	2	6	21918	21923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963378
616	NC_011420	GC	3	6	21949	21954	0 %	0 %	50 %	50 %	209963378
617	NC_011420	CAA	2	6	21956	21961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209963378
618	NC_011420	CCGG	2	8	21964	21971	0 %	0 %	50 %	50 %	209963378
619	NC_011420	CGG	2	6	21994	21999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963378
620	NC_011420	GGGC	2	8	22007	22014	0 %	0 %	75 %	25 %	209963378
621	NC_011420	GATC	2	8	22016	22023	25 %	25 %	25 %	25 %	209963378
622	NC_011420	TCG	2	6	22108	22113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963378
623	NC_011420	AGA	2	6	22114	22119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209963378
624	NC_011420	CGA	2	6	22166	22171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963378
625	NC_011420	CTT	2	6	22235	22240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963378
626	NC_011420	GC	3	6	22256	22261	0 %	0 %	50 %	50 %	209963378
627	NC_011420	CCA	2	6	22306	22311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963378
628	NC_011420	GCGG	2	8	22332	22339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
629	NC_011420	CCGC	2	8	22342	22349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
630	NC_011420	CCCG	2	8	22375	22382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
631	NC_011420	CGGG	2	8	22391	22398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
632	NC_011420	TCG	2	6	22401	22406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_011420	CGG	2	6	22424	22429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011420	GCC	2	6	22446	22451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963379
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652	NC_011420	CGG	2	6	23182	23187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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658	NC_011420	GTC	2	6	23379	23384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
659	NC_011420	GC	3	6	23431	23436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
660	NC_011420	AGG	2	6	23441	23446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
661	NC_011420	ATCCC	2	10	23516	23525	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
662	NC_011420	GACCA	2	10	23547	23556	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
663	NC_011420	T	6	6	23575	23580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_011420	CGTCTC	2	12	23659	23670	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
665	NC_011420	CCGG	2	8	23683	23690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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671	NC_011420	GTGG	2	8	23890	23897	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
672	NC_011420	TTC	2	6	23907	23912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209963380
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