MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204

Total Repeats: 5980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011371	GC	4	8	237961	237968	0 %	0 %	50 %	50 %	209552399
5502	NC_011371	GCCGC	2	10	237974	237983	0 %	0 %	40 %	60 %	209552399
5503	NC_011371	ATC	2	6	238000	238005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552399
5504	NC_011371	ATCG	2	8	238026	238033	25 %	25 %	25 %	25 %	209552399
5505	NC_011371	CGA	2	6	238049	238054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552399
5506	NC_011371	GC	3	6	238076	238081	0 %	0 %	50 %	50 %	209552399
5507	NC_011371	CGG	2	6	238103	238108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552399
5508	NC_011371	TGCGA	2	10	238109	238118	20 %	20 %	40 %	20 %	209552399
5509	NC_011371	TA	3	6	238119	238124	50 %	50 %	0 %	0 %	209552399
5510	NC_011371	GGC	3	9	238172	238180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552399
5511	NC_011371	TCG	2	6	238210	238215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552399
5512	NC_011371	GCA	2	6	238324	238329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552399
5513	NC_011371	GCG	2	6	238345	238350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552399
5514	NC_011371	CGG	2	6	238351	238356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552399
5515	NC_011371	GC	3	6	238363	238368	0 %	0 %	50 %	50 %	209552399
5516	NC_011371	GAA	2	6	238374	238379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552399
5517	NC_011371	TGC	2	6	238385	238390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552399
5518	NC_011371	GCG	2	6	238508	238513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552399
5519	NC_011371	GGC	2	6	238520	238525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552399
5520	NC_011371	CGC	2	6	238541	238546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552399
5521	NC_011371	CGC	2	6	238628	238633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552399
5522	NC_011371	TCGA	2	8	238636	238643	25 %	25 %	25 %	25 %	209552399
5523	NC_011371	CTA	2	6	238852	238857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_011371	TAA	2	6	238877	238882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011371	GAC	2	6	238911	238916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_011371	TTG	2	6	238922	238927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011371	CGA	2	6	238940	238945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552400
5528	NC_011371	GCC	2	6	238975	238980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552400
5529	NC_011371	TTCATT	2	12	238990	239001	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	209552400
5530	NC_011371	GCG	2	6	239054	239059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552400
5531	NC_011371	CGGC	2	8	239087	239094	0 %	0 %	50 %	50 %	209552400
5532	NC_011371	TTC	2	6	239098	239103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552400
5533	NC_011371	GGCG	2	8	239115	239122	0 %	0 %	75 %	25 %	209552400
5534	NC_011371	AGC	2	6	239189	239194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552400
5535	NC_011371	GCA	2	6	239280	239285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552400
5536	NC_011371	GTC	2	6	239308	239313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552400
5537	NC_011371	CAA	2	6	239331	239336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209552400
5538	NC_011371	GGT	2	6	239397	239402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552400
5539	NC_011371	CGC	2	6	239467	239472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552400
5540	NC_011371	CGT	2	6	239511	239516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552400
5541	NC_011371	ACC	2	6	239548	239553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209552400
5542	NC_011371	GGT	2	6	239610	239615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552400
5543	NC_011371	CGC	2	6	239655	239660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552400
5544	NC_011371	GAA	2	6	239679	239684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552400
5545	NC_011371	CCA	2	6	239768	239773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209552400
5546	NC_011371	CGT	2	6	239781	239786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552400
5547	NC_011371	CGC	3	9	239805	239813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552400
5548	NC_011371	GCT	2	6	239865	239870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552400
5549	NC_011371	GC	3	6	239886	239891	0 %	0 %	50 %	50 %	209552400
5550	NC_011371	AGA	2	6	239924	239929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552400
5551	NC_011371	GCG	2	6	239953	239958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552400
5552	NC_011371	CGG	2	6	240013	240018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_011371	ATC	2	6	240038	240043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_011371	GTC	2	6	240084	240089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552401
5555	NC_011371	GAG	2	6	240138	240143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552401
5556	NC_011371	GC	3	6	240164	240169	0 %	0 %	50 %	50 %	209552401
5557	NC_011371	CGCC	2	8	240192	240199	0 %	0 %	25 %	75 %	209552401
5558	NC_011371	GAA	2	6	240221	240226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552401
5559	NC_011371	CGG	4	12	240263	240274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552401
5560	NC_011371	GC	4	8	240396	240403	0 %	0 %	50 %	50 %	209552401
5561	NC_011371	G	6	6	240445	240450	0 %	0 %	100 %	0 %	209552401
5562	NC_011371	CGC	2	6	240489	240494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552401
5563	NC_011371	CGG	2	6	240535	240540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552401
5564	NC_011371	CAATGC	2	12	240560	240571	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209552401
5565	NC_011371	CGA	2	6	240578	240583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552401
5566	NC_011371	TGCCG	2	10	240599	240608	0 %	20 %	40 %	40 %	209552401
5567	NC_011371	GAC	2	6	240636	240641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552401
5568	NC_011371	GAG	2	6	240708	240713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552401
5569	NC_011371	TCG	2	6	240718	240723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552401
5570	NC_011371	GCC	2	6	240749	240754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552401
5571	NC_011371	CCG	2	6	240817	240822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552401
5572	NC_011371	GC	3	6	240826	240831	0 %	0 %	50 %	50 %	209552401
5573	NC_011371	GCAG	2	8	240833	240840	25 %	0 %	50 %	25 %	209552401
5574	NC_011371	ACG	2	6	240861	240866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552401
5575	NC_011371	CGA	2	6	240902	240907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552401
5576	NC_011371	GCG	2	6	240978	240983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552401
5577	NC_011371	GCC	2	6	240984	240989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552401
5578	NC_011371	GGCC	2	8	240995	241002	0 %	0 %	50 %	50 %	209552401
5579	NC_011371	GC	3	6	241026	241031	0 %	0 %	50 %	50 %	209552401
5580	NC_011371	GGC	3	9	241043	241051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552401
5581	NC_011371	GC	4	8	241126	241133	0 %	0 %	50 %	50 %	209552401
5582	NC_011371	CGG	2	6	241138	241143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552401
5583	NC_011371	TCT	2	6	241204	241209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552401
5584	NC_011371	GC	3	6	241361	241366	0 %	0 %	50 %	50 %	209552402
5585	NC_011371	TTC	2	6	241369	241374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552402
5586	NC_011371	GGC	2	6	241375	241380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552402
5587	NC_011371	GAT	2	6	241394	241399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552402
5588	NC_011371	CGA	2	6	241406	241411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552402
5589	NC_011371	GT	3	6	241442	241447	0 %	50 %	50 %	0 %	209552402
5590	NC_011371	CGA	2	6	241497	241502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552402
5591	NC_011371	CGT	2	6	241551	241556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552402
5592	NC_011371	GGC	3	9	241566	241574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552402
5593	NC_011371	CGT	2	6	241608	241613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552402
5594	NC_011371	GC	3	6	241645	241650	0 %	0 %	50 %	50 %	209552402
5595	NC_011371	TCG	2	6	241717	241722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552402
5596	NC_011371	ATCC	2	8	241743	241750	25 %	25 %	0 %	50 %	209552402
5597	NC_011371	CG	3	6	241797	241802	0 %	0 %	50 %	50 %	209552402
5598	NC_011371	GAT	2	6	241830	241835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552402
5599	NC_011371	GAC	2	6	241887	241892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552402
5600	NC_011371	GGT	2	6	241941	241946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552402
5601	NC_011371	GTC	2	6	241968	241973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552402
5602	NC_011371	CTC	2	6	242025	242030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552402
5603	NC_011371	TGT	2	6	242135	242140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209552402
5604	NC_011371	GAA	2	6	242211	242216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552402
5605	NC_011371	GCT	3	9	242222	242230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552402
5606	NC_011371	AGA	2	6	242389	242394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552402
5607	NC_011371	CG	3	6	242401	242406	0 %	0 %	50 %	50 %	209552402
5608	NC_011371	GC	4	8	242458	242465	0 %	0 %	50 %	50 %	209552402
5609	NC_011371	GCC	2	6	242476	242481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552402
5610	NC_011371	CCT	2	6	242504	242509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552402
5611	NC_011371	GATCT	2	10	242541	242550	20 %	40 %	20 %	20 %	209552402
5612	NC_011371	GAAA	2	8	242605	242612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_011371	CG	3	6	242717	242722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_011371	AGA	2	6	242776	242781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_011371	CG	3	6	242817	242822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5616	NC_011371	CAA	2	6	242929	242934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209552403
5617	NC_011371	GC	4	8	242954	242961	0 %	0 %	50 %	50 %	209552403
5618	NC_011371	CCGG	2	8	242962	242969	0 %	0 %	50 %	50 %	209552403
5619	NC_011371	GCT	2	6	242998	243003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552403
5620	NC_011371	GACC	2	8	243070	243077	25 %	0 %	25 %	50 %	209552403
5621	NC_011371	GCG	2	6	243148	243153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552404
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5623	NC_011371	GCCTT	2	10	243217	243226	0 %	40 %	20 %	40 %	209552404
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5746	NC_011371	CAT	2	6	249064	249069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552409
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5750	NC_011371	TCG	2	6	249143	249148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552409
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5834	NC_011371	GCA	2	6	252250	252255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552413
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5853	NC_011371	CGT	2	6	252926	252931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552413
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5859	NC_011371	GCC	2	6	253169	253174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552413
5860	NC_011371	GCCGGA	2	12	253199	253210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209552413
5861	NC_011371	CAGA	2	8	253220	253227	50 %	0 %	25 %	25 %	209552413
5862	NC_011371	TCGCCG	2	12	253233	253244	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209552413
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