MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_011369	GGC	2	6	1037388	1037393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548620
25003	NC_011369	ATT	2	6	1037499	1037504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548621
25004	NC_011369	GCC	2	6	1037514	1037519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548621
25005	NC_011369	CGG	2	6	1037531	1037536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548621
25006	NC_011369	TGG	2	6	1037580	1037585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548621
25007	NC_011369	CGAG	2	8	1037641	1037648	25 %	0 %	50 %	25 %	209548621
25008	NC_011369	GCC	2	6	1037649	1037654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548621
25009	NC_011369	GGC	2	6	1037676	1037681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548621
25010	NC_011369	CGC	2	6	1037690	1037695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548621
25011	NC_011369	GCTCTG	2	12	1037702	1037713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548621
25012	NC_011369	TCG	2	6	1037716	1037721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548621
25013	NC_011369	TG	3	6	1037853	1037858	0 %	50 %	50 %	0 %	209548622
25014	NC_011369	GC	3	6	1037933	1037938	0 %	0 %	50 %	50 %	209548622
25015	NC_011369	ACA	2	6	1037940	1037945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548622
25016	NC_011369	TCG	2	6	1037967	1037972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548622
25017	NC_011369	GCA	2	6	1038000	1038005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548622
25018	NC_011369	CCT	2	6	1038123	1038128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548622
25019	NC_011369	GGC	2	6	1038133	1038138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548622
25020	NC_011369	CGC	2	6	1038149	1038154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548622
25021	NC_011369	AAAG	2	8	1038200	1038207	75 %	0 %	25 %	0 %	209548622
25022	NC_011369	GTC	2	6	1038254	1038259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548622
25023	NC_011369	ACA	2	6	1038329	1038334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548622
25024	NC_011369	GCTG	2	8	1038405	1038412	0 %	25 %	50 %	25 %	209548622
25025	NC_011369	CG	3	6	1038432	1038437	0 %	0 %	50 %	50 %	209548622
25026	NC_011369	T	6	6	1038472	1038477	0 %	100 %	0 %	0 %	209548622
25027	NC_011369	CAA	2	6	1038505	1038510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548622
25028	NC_011369	GCA	2	6	1038535	1038540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548622
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25031	NC_011369	TCT	2	6	1038609	1038614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548622
25032	NC_011369	GGC	2	6	1038740	1038745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548623
25033	NC_011369	CTG	2	6	1038764	1038769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548623
25034	NC_011369	CGC	2	6	1038772	1038777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548623
25035	NC_011369	CTT	2	6	1038785	1038790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548623
25036	NC_011369	TTC	2	6	1038818	1038823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25037	NC_011369	TACT	2	8	1038945	1038952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25038	NC_011369	GC	3	6	1039002	1039007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25039	NC_011369	AG	3	6	1039037	1039042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25040	NC_011369	GCGTC	2	10	1039064	1039073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25041	NC_011369	GTC	3	9	1039204	1039212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548624
25042	NC_011369	GGC	2	6	1039294	1039299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548624
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25045	NC_011369	CAT	2	6	1039366	1039371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548624
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25050	NC_011369	CGA	2	6	1039471	1039476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548624
25051	NC_011369	GCA	3	9	1039530	1039538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548624
25052	NC_011369	GCCG	2	8	1039549	1039556	0 %	0 %	50 %	50 %	209548624
25053	NC_011369	CGA	2	6	1039569	1039574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548624
25054	NC_011369	CGG	2	6	1039644	1039649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548624
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25056	NC_011369	CGAG	2	8	1039680	1039687	25 %	0 %	50 %	25 %	209548624
25057	NC_011369	GAC	2	6	1039714	1039719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548624
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25059	NC_011369	TCA	2	6	1039794	1039799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548624
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25070	NC_011369	CGG	2	6	1040259	1040264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548625
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25088	NC_011369	GTC	2	6	1041024	1041029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548626
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25101	NC_011369	GCT	2	6	1041353	1041358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548626
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25106	NC_011369	TGT	2	6	1041503	1041508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209548626
25107	NC_011369	CGC	2	6	1041617	1041622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548626
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25109	NC_011369	CGA	2	6	1041686	1041691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548626
25110	NC_011369	GCCG	2	8	1041705	1041712	0 %	0 %	50 %	50 %	209548626
25111	NC_011369	CGGG	2	8	1041745	1041752	0 %	0 %	75 %	25 %	209548626
25112	NC_011369	CAG	2	6	1041849	1041854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548626
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25114	NC_011369	GCA	3	9	1041938	1041946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548626
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25233	NC_011369	CCG	2	6	1046350	1046355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548629
25234	NC_011369	TGT	2	6	1046361	1046366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209548629
25235	NC_011369	AGC	2	6	1046379	1046384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548629
25236	NC_011369	GTC	2	6	1046407	1046412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548629
25237	NC_011369	GCG	2	6	1046489	1046494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548629
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25239	NC_011369	TGCG	2	8	1046597	1046604	0 %	25 %	50 %	25 %	209548629
25240	NC_011369	AGCGC	2	10	1046634	1046643	20 %	0 %	40 %	40 %	209548629
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25251	NC_011369	CTT	2	6	1047559	1047564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548630
25252	NC_011369	CTG	2	6	1047602	1047607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548630
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25255	NC_011369	GGT	2	6	1047831	1047836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548630
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25263	NC_011369	TGC	2	6	1048298	1048303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548631
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25269	NC_011369	AG	3	6	1048542	1048547	50 %	0 %	50 %	0 %	209548631
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25272	NC_011369	CG	3	6	1048638	1048643	0 %	0 %	50 %	50 %	209548631
25273	NC_011369	TGC	2	6	1048648	1048653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548631
25274	NC_011369	GACGTC	2	12	1048671	1048682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209548631
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25277	NC_011369	GCCG	2	8	1048901	1048908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25278	NC_011369	CG	3	6	1048907	1048912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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25323	NC_011369	TGA	2	6	1051055	1051060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25324	NC_011369	GAG	2	6	1051241	1051246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548634
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25332	NC_011369	GAAC	2	8	1051504	1051511	50 %	0 %	25 %	25 %	209548634
25333	NC_011369	GGCG	2	8	1051576	1051583	0 %	0 %	75 %	25 %	209548634
25334	NC_011369	GGC	2	6	1051591	1051596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548634
25335	NC_011369	CGG	2	6	1051619	1051624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25336	NC_011369	ATT	2	6	1051630	1051635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548635
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25339	NC_011369	GAT	2	6	1051718	1051723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548635
25340	NC_011369	CCA	2	6	1051745	1051750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548635
25341	NC_011369	GCC	2	6	1051797	1051802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548635
25342	NC_011369	GCC	2	6	1051805	1051810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548635
25343	NC_011369	TCG	2	6	1051848	1051853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548635
25344	NC_011369	TCGGCA	2	12	1051917	1051928	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209548635
25345	NC_011369	ACC	2	6	1051965	1051970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548635
25346	NC_011369	GCG	2	6	1052009	1052014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548635
25347	NC_011369	ATC	2	6	1052019	1052024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548635
25348	NC_011369	GAA	2	6	1052045	1052050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548635
25349	NC_011369	GTGCG	2	10	1052070	1052079	0 %	20 %	60 %	20 %	209548635
25350	NC_011369	CGAT	2	8	1052122	1052129	25 %	25 %	25 %	25 %	209548635
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25353	NC_011369	TGA	2	6	1052212	1052217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548635
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25355	NC_011369	CGG	2	6	1052276	1052281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548635
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25371	NC_011369	CGA	2	6	1053037	1053042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548635
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25378	NC_011369	TG	3	6	1053271	1053276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25379	NC_011369	CG	4	8	1053319	1053326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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25450	NC_011369	TGACG	2	10	1056141	1056150	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25451	NC_011369	GCG	3	9	1056153	1056161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25452	NC_011369	C	6	6	1056165	1056170	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25453	NC_011369	CTGCC	2	10	1056172	1056181	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25454	NC_011369	GC	3	6	1056265	1056270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25455	NC_011369	C	6	6	1056309	1056314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25456	NC_011369	GGCAG	2	10	1056332	1056341	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25457	NC_011369	G	6	6	1056343	1056348	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25458	NC_011369	GTC	2	6	1056391	1056396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548641
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25463	NC_011369	GCA	2	6	1056572	1056577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548641
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25466	NC_011369	GTGC	2	8	1056647	1056654	0 %	25 %	50 %	25 %	209548641
25467	NC_011369	CCG	2	6	1056665	1056670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548641
25468	NC_011369	ATCG	2	8	1056795	1056802	25 %	25 %	25 %	25 %	209548641
25469	NC_011369	TCA	2	6	1056818	1056823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548641
25470	NC_011369	GCA	2	6	1056836	1056841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548641
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25472	NC_011369	GCA	2	6	1056881	1056886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548641
25473	NC_011369	ATG	2	6	1057023	1057028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548641
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25482	NC_011369	GAT	2	6	1057496	1057501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548641
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25484	NC_011369	CGGG	2	8	1057620	1057627	0 %	0 %	75 %	25 %	209548641
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25486	NC_011369	GATC	2	8	1057691	1057698	25 %	25 %	25 %	25 %	209548641
25487	NC_011369	TTC	2	6	1057713	1057718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548641
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25490	NC_011369	AAT	2	6	1057875	1057880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25491	NC_011369	CGG	2	6	1057969	1057974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25492	NC_011369	CCG	2	6	1058106	1058111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548642
25493	NC_011369	GCTTC	2	10	1058137	1058146	0 %	40 %	20 %	40 %	209548642
25494	NC_011369	ATCC	2	8	1058151	1058158	25 %	25 %	0 %	50 %	209548642
25495	NC_011369	GC	3	6	1058314	1058319	0 %	0 %	50 %	50 %	209548642
25496	NC_011369	T	6	6	1058353	1058358	0 %	100 %	0 %	0 %	209548642
25497	NC_011369	GCC	2	6	1058367	1058372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548642
25498	NC_011369	AGC	2	6	1058415	1058420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548642
25499	NC_011369	TCG	2	6	1058454	1058459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548642
25500	NC_011369	CAA	2	6	1058467	1058472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548642

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