MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_011369	TCG	2	6	667371	667376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548248
16003	NC_011369	TGA	2	6	667413	667418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548248
16004	NC_011369	CGA	2	6	667480	667485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548248
16005	NC_011369	CGG	2	6	667488	667493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548248
16006	NC_011369	ACG	2	6	667494	667499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548248
16007	NC_011369	AGG	2	6	667503	667508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548248
16008	NC_011369	CGG	2	6	667512	667517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548248
16009	NC_011369	CGA	2	6	667537	667542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548248
16010	NC_011369	GGT	3	9	667570	667578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548248
16011	NC_011369	CGT	2	6	667620	667625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548248
16012	NC_011369	CGC	2	6	667734	667739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16013	NC_011369	GCCG	2	8	667746	667753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16014	NC_011369	CAG	2	6	667761	667766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548249
16015	NC_011369	CGG	2	6	667777	667782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548249
16016	NC_011369	CTT	2	6	667787	667792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548249
16017	NC_011369	GC	3	6	667804	667809	0 %	0 %	50 %	50 %	209548249
16018	NC_011369	CTT	2	6	667814	667819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548249
16019	NC_011369	GTC	2	6	667826	667831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548249
16020	NC_011369	TGC	2	6	667870	667875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548249
16021	NC_011369	CCG	2	6	667956	667961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548249
16022	NC_011369	CCGA	2	8	667965	667972	25 %	0 %	25 %	50 %	209548249
16023	NC_011369	GCT	2	6	667973	667978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548249
16024	NC_011369	GCC	3	9	667985	667993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548249
16025	NC_011369	CGA	2	6	667997	668002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548249
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16027	NC_011369	GCC	2	6	668060	668065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548249
16028	NC_011369	TGC	2	6	668077	668082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548249
16029	NC_011369	GCC	2	6	668090	668095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548249
16030	NC_011369	CGA	2	6	668102	668107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548249
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16032	NC_011369	GTTG	2	8	668147	668154	0 %	50 %	50 %	0 %	209548249
16033	NC_011369	CGG	2	6	668158	668163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548249
16034	NC_011369	CCA	2	6	668187	668192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548249
16035	NC_011369	TGC	2	6	668203	668208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548249
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16037	NC_011369	CGA	2	6	668228	668233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548249
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16039	NC_011369	TCA	2	6	668326	668331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548249
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16041	NC_011369	GTTT	2	8	668345	668352	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_011369	TCC	2	6	668419	668424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16043	NC_011369	CCG	2	6	668502	668507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16044	NC_011369	GCAAG	2	10	668575	668584	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16045	NC_011369	CGG	2	6	668622	668627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548250
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16053	NC_011369	GCT	2	6	668802	668807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548250
16054	NC_011369	CCG	2	6	669018	669023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16055	NC_011369	AGAGG	2	10	669033	669042	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_011369	GAA	2	6	669052	669057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_011369	TCA	2	6	669145	669150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548251
16058	NC_011369	CCGG	2	8	669176	669183	0 %	0 %	50 %	50 %	209548251
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16061	NC_011369	ACG	2	6	669274	669279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548251
16062	NC_011369	CCGG	2	8	669311	669318	0 %	0 %	50 %	50 %	209548251
16063	NC_011369	GC	3	6	669370	669375	0 %	0 %	50 %	50 %	209548251
16064	NC_011369	CGC	2	6	669431	669436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548251
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16067	NC_011369	ATCG	2	8	669546	669553	25 %	25 %	25 %	25 %	209548252
16068	NC_011369	GCGCC	2	10	669618	669627	0 %	0 %	40 %	60 %	209548252
16069	NC_011369	GC	3	6	669685	669690	0 %	0 %	50 %	50 %	209548252
16070	NC_011369	GCGG	2	8	669722	669729	0 %	0 %	75 %	25 %	209548252
16071	NC_011369	GAT	2	6	669733	669738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548252
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16074	NC_011369	TGG	2	6	669931	669936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548252
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16082	NC_011369	GCC	2	6	670153	670158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548252
16083	NC_011369	GCGG	2	8	670170	670177	0 %	0 %	75 %	25 %	209548252
16084	NC_011369	GC	3	6	670190	670195	0 %	0 %	50 %	50 %	209548252
16085	NC_011369	CCTT	2	8	670216	670223	0 %	50 %	0 %	50 %	209548252
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16101	NC_011369	CGA	2	6	670928	670933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548254
16102	NC_011369	GGA	2	6	670940	670945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548254
16103	NC_011369	GCG	2	6	670965	670970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548254
16104	NC_011369	GAG	2	6	670972	670977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548254
16105	NC_011369	GCG	2	6	670983	670988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_011369	ACC	2	6	671018	671023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_011369	TGAG	2	8	671083	671090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_011369	CCGG	2	8	671151	671158	0 %	0 %	50 %	50 %	209548255
16109	NC_011369	ATC	2	6	671176	671181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548255
16110	NC_011369	CCCA	2	8	671215	671222	25 %	0 %	0 %	75 %	209548255
16111	NC_011369	CCG	2	6	671248	671253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548255
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16115	NC_011369	CGG	2	6	671386	671391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548255
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16120	NC_011369	CGATG	2	10	671613	671622	20 %	20 %	40 %	20 %	209548255
16121	NC_011369	GCC	2	6	671626	671631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548255
16122	NC_011369	GAC	2	6	671635	671640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548255
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16125	NC_011369	CTT	2	6	671799	671804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548255
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16132	NC_011369	GGC	2	6	672082	672087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548255
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16140	NC_011369	CTT	2	6	672328	672333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16141	NC_011369	TCC	2	6	672340	672345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16142	NC_011369	GAA	2	6	672353	672358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16143	NC_011369	CTT	2	6	672456	672461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548256
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16208	NC_011369	TCAC	2	8	675557	675564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16216	NC_011369	CCT	2	6	676164	676169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548261
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16228	NC_011369	GCC	3	9	676663	676671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548261
16229	NC_011369	GAT	2	6	676672	676677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548261
16230	NC_011369	GCCGC	2	10	676679	676688	0 %	0 %	40 %	60 %	209548261
16231	NC_011369	CTG	2	6	676690	676695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548261
16232	NC_011369	ACGCC	2	10	676814	676823	20 %	0 %	20 %	60 %	209548261
16233	NC_011369	TCA	2	6	676832	676837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548261
16234	NC_011369	ACG	2	6	676922	676927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16235	NC_011369	T	7	7	676953	676959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16236	NC_011369	GCT	2	6	676963	676968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16237	NC_011369	AAG	2	6	676976	676981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16238	NC_011369	CCGC	2	8	676986	676993	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16239	NC_011369	CAA	2	6	677019	677024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548262
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16241	NC_011369	TCA	2	6	677069	677074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548262
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