MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011369	GCCGAC	2	12	624654	624665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209548205
15002	NC_011369	GCC	2	6	624678	624683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15003	NC_011369	ATC	2	6	624730	624735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548205
15004	NC_011369	GCC	3	9	624870	624878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15005	NC_011369	CTT	2	6	624900	624905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548205
15006	NC_011369	GAT	2	6	624915	624920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548205
15007	NC_011369	CGC	2	6	624938	624943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15008	NC_011369	GGC	3	9	624995	625003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548205
15009	NC_011369	CGA	2	6	625061	625066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548205
15010	NC_011369	TCG	3	9	625111	625119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548205
15011	NC_011369	CGT	2	6	625154	625159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548205
15012	NC_011369	CGA	2	6	625160	625165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548205
15013	NC_011369	GCG	2	6	625180	625185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548205
15014	NC_011369	TCT	2	6	625220	625225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548205
15015	NC_011369	GCA	2	6	625268	625273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548205
15016	NC_011369	ACG	2	6	625300	625305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548205
15017	NC_011369	CCG	2	6	625316	625321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15018	NC_011369	TCG	2	6	625366	625371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548205
15019	NC_011369	CCG	2	6	625423	625428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15020	NC_011369	GC	3	6	625528	625533	0 %	0 %	50 %	50 %	209548205
15021	NC_011369	CGA	2	6	625541	625546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548205
15022	NC_011369	CGC	2	6	625557	625562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15023	NC_011369	GACCTT	2	12	625629	625640	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209548205
15024	NC_011369	TGGC	2	8	625653	625660	0 %	25 %	50 %	25 %	209548205
15025	NC_011369	TTG	2	6	625690	625695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209548205
15026	NC_011369	GGC	2	6	625707	625712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548205
15027	NC_011369	CG	3	6	625733	625738	0 %	0 %	50 %	50 %	209548205
15028	NC_011369	CCG	2	6	625757	625762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15029	NC_011369	CG	3	6	625761	625766	0 %	0 %	50 %	50 %	209548205
15030	NC_011369	GCC	2	6	625774	625779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15031	NC_011369	GCC	2	6	625863	625868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548205
15032	NC_011369	GGT	2	6	626010	626015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548205
15033	NC_011369	ATT	2	6	626106	626111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_011369	TCC	2	6	626147	626152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15035	NC_011369	CGA	2	6	626191	626196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_011369	ATG	2	6	626237	626242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_011369	CTT	2	6	626273	626278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_011369	CGA	2	6	626376	626381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548206
15039	NC_011369	TGG	2	6	626390	626395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548206
15040	NC_011369	GGGCG	2	10	626469	626478	0 %	0 %	80 %	20 %	209548206
15041	NC_011369	CGC	3	9	626616	626624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548206
15042	NC_011369	GCC	2	6	626975	626980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15043	NC_011369	GATGCC	2	12	627037	627048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15044	NC_011369	TTC	2	6	627049	627054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548207
15045	NC_011369	CAG	2	6	627106	627111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15046	NC_011369	AGC	2	6	627153	627158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15047	NC_011369	GAGGCC	2	12	627199	627210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209548207
15048	NC_011369	GCA	3	9	627216	627224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15049	NC_011369	GAC	3	9	627280	627288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15050	NC_011369	GC	3	6	627336	627341	0 %	0 %	50 %	50 %	209548207
15051	NC_011369	GCA	2	6	627353	627358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15052	NC_011369	CCGG	2	8	627359	627366	0 %	0 %	50 %	50 %	209548207
15053	NC_011369	GAC	2	6	627376	627381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15054	NC_011369	GCT	2	6	627474	627479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15055	NC_011369	GCG	2	6	627480	627485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548207
15056	NC_011369	GCAGGG	2	12	627497	627508	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	209548207
15057	NC_011369	CGG	2	6	627517	627522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548207
15058	NC_011369	CGGCGT	2	12	627529	627540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209548207
15059	NC_011369	TGC	2	6	627545	627550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15060	NC_011369	CGT	2	6	627565	627570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548207
15061	NC_011369	CGC	2	6	627571	627576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548207
15062	NC_011369	TTG	2	6	627663	627668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_011369	CCA	2	6	627676	627681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15064	NC_011369	GCG	2	6	627719	627724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15065	NC_011369	GCG	2	6	627751	627756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_011369	CG	3	6	627755	627760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15067	NC_011369	TGA	2	6	627791	627796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_011369	GCCT	2	8	627823	627830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15069	NC_011369	TGA	2	6	627969	627974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548208
15070	NC_011369	GTCT	2	8	628004	628011	0 %	50 %	25 %	25 %	209548208
15071	NC_011369	GGCA	2	8	628053	628060	25 %	0 %	50 %	25 %	209548208
15072	NC_011369	CGG	2	6	628071	628076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548208
15073	NC_011369	GTC	2	6	628169	628174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548208
15074	NC_011369	TGC	2	6	628269	628274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548208
15075	NC_011369	TTC	2	6	628275	628280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548208
15076	NC_011369	CTG	2	6	628301	628306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548208
15077	NC_011369	CAGTGG	2	12	628364	628375	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209548208
15078	NC_011369	GCC	2	6	628451	628456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548208
15079	NC_011369	CCTG	2	8	628513	628520	0 %	25 %	25 %	50 %	209548208
15080	NC_011369	CAA	2	6	628522	628527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548208
15081	NC_011369	CGAC	2	8	628557	628564	25 %	0 %	25 %	50 %	209548208
15082	NC_011369	TGCCG	2	10	628609	628618	0 %	20 %	40 %	40 %	209548208
15083	NC_011369	GCC	2	6	628620	628625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548208
15084	NC_011369	CGT	2	6	628726	628731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548208
15085	NC_011369	GAC	2	6	628759	628764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548208
15086	NC_011369	GCC	2	6	628766	628771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548208
15087	NC_011369	ACG	2	6	628892	628897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548209
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15089	NC_011369	ACCA	2	8	628990	628997	50 %	0 %	0 %	50 %	209548209
15090	NC_011369	CAT	2	6	629043	629048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548209
15091	NC_011369	CGG	2	6	629049	629054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548209
15092	NC_011369	GGCCT	2	10	629113	629122	0 %	20 %	40 %	40 %	209548209
15093	NC_011369	TCT	2	6	629213	629218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548209
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15097	NC_011369	AAC	2	6	629308	629313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548209
15098	NC_011369	GCT	2	6	629346	629351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548209
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15100	NC_011369	TCG	2	6	629366	629371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548209
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15102	NC_011369	CCG	2	6	629419	629424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548209
15103	NC_011369	TCG	2	6	629494	629499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548209
15104	NC_011369	TCA	2	6	629519	629524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548209
15105	NC_011369	GC	3	6	629541	629546	0 %	0 %	50 %	50 %	209548209
15106	NC_011369	CTG	4	12	629608	629619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548209
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15109	NC_011369	ACCG	2	8	629659	629666	25 %	0 %	25 %	50 %	209548209
15110	NC_011369	CCT	2	6	629678	629683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548209
15111	NC_011369	TCT	2	6	629684	629689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548209
15112	NC_011369	GGC	3	9	629698	629706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548209
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15114	NC_011369	CATCCT	2	12	629760	629771	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	209548209
15115	NC_011369	ATC	2	6	629797	629802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548209
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15119	NC_011369	CGA	2	6	629948	629953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548209
15120	NC_011369	TCT	2	6	629984	629989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548209
15121	NC_011369	CGA	2	6	629999	630004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548209
15122	NC_011369	GGC	2	6	630010	630015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548209
15123	NC_011369	CGG	2	6	630075	630080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548209
15124	NC_011369	CGT	2	6	630141	630146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548209
15125	NC_011369	TAC	2	6	630205	630210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548209
15126	NC_011369	TTC	2	6	630298	630303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548209
15127	NC_011369	GCA	2	6	630306	630311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548209
15128	NC_011369	AAG	2	6	630457	630462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548209
15129	NC_011369	CGA	2	6	630497	630502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548209
15130	NC_011369	CGC	3	9	630524	630532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548209
15131	NC_011369	CGC	2	6	630588	630593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15132	NC_011369	ATG	2	6	630634	630639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548210
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15134	NC_011369	ATT	2	6	630704	630709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548210
15135	NC_011369	CATC	2	8	630786	630793	25 %	25 %	0 %	50 %	209548210
15136	NC_011369	CGGCGC	2	12	630831	630842	0 %	0 %	50 %	50 %	209548210
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15138	NC_011369	ACG	2	6	630866	630871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548210
15139	NC_011369	CAT	2	6	630885	630890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548210
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15143	NC_011369	TCT	3	9	631037	631045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548210
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15152	NC_011369	TGG	2	6	631391	631396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548210
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15166	NC_011369	CCG	2	6	632034	632039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548212
15167	NC_011369	GGCG	2	8	632098	632105	0 %	0 %	75 %	25 %	209548212
15168	NC_011369	GGT	2	6	632179	632184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548212
15169	NC_011369	GAAG	2	8	632368	632375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15170	NC_011369	TCA	2	6	632405	632410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548213
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15173	NC_011369	CTCG	2	8	632462	632469	0 %	25 %	25 %	50 %	209548213
15174	NC_011369	TCA	2	6	632476	632481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548213
15175	NC_011369	CGG	2	6	632489	632494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548213
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15178	NC_011369	GAAG	2	8	632627	632634	50 %	0 %	50 %	0 %	209548213
15179	NC_011369	CGT	2	6	632657	632662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548213
15180	NC_011369	TTC	2	6	632715	632720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548213
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15182	NC_011369	GCC	2	6	632810	632815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548213
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15184	NC_011369	CTG	3	9	632871	632879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548213
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15189	NC_011369	TCT	2	6	632977	632982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548213
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15191	NC_011369	CTG	2	6	633105	633110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548213
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15199	NC_011369	CGGC	2	8	633262	633269	0 %	0 %	50 %	50 %	209548213
15200	NC_011369	T	6	6	633314	633319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15201	NC_011369	GT	3	6	633320	633325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15202	NC_011369	TCT	2	6	633379	633384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15203	NC_011369	CAC	2	6	633432	633437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15204	NC_011369	C	6	6	633494	633499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15205	NC_011369	GA	3	6	633582	633587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15206	NC_011369	CCGC	2	8	633629	633636	0 %	0 %	25 %	75 %	209548214
15207	NC_011369	CCGG	2	8	633754	633761	0 %	0 %	50 %	50 %	209548214
15208	NC_011369	TACA	2	8	633821	633828	50 %	25 %	0 %	25 %	209548214
15209	NC_011369	CGC	2	6	633858	633863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548214
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15211	NC_011369	CCA	2	6	633988	633993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548214
15212	NC_011369	ATGG	2	8	634013	634020	25 %	25 %	50 %	0 %	209548214
15213	NC_011369	CGAT	2	8	634021	634028	25 %	25 %	25 %	25 %	209548214
15214	NC_011369	CGC	2	6	634081	634086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548214
15215	NC_011369	AAT	2	6	634232	634237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209548214
15216	NC_011369	TCT	4	12	634271	634282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15217	NC_011369	C	6	6	634424	634429	0 %	0 %	0 %	100 %	209548215
15218	NC_011369	GCT	2	6	634458	634463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548215
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15221	NC_011369	GCCG	2	8	634567	634574	0 %	0 %	50 %	50 %	209548215
15222	NC_011369	TCG	2	6	634590	634595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548215
15223	NC_011369	TCATCG	2	12	634599	634610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209548215
15224	NC_011369	GCC	2	6	634642	634647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548215
15225	NC_011369	CAT	2	6	634684	634689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548215
15226	NC_011369	CGCTG	2	10	634704	634713	0 %	20 %	40 %	40 %	209548215
15227	NC_011369	CATGC	2	10	634788	634797	20 %	20 %	20 %	40 %	209548216
15228	NC_011369	CGC	2	6	634800	634805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548216
15229	NC_011369	CGC	2	6	634919	634924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548216
15230	NC_011369	GGCA	2	8	634927	634934	25 %	0 %	50 %	25 %	209548216
15231	NC_011369	GGC	2	6	634970	634975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548216
15232	NC_011369	CGG	2	6	634979	634984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548216
15233	NC_011369	CAA	3	9	635027	635035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548216
15234	NC_011369	CTT	2	6	635045	635050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548216
15235	NC_011369	ACA	2	6	635149	635154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548216
15236	NC_011369	CAG	2	6	635193	635198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548216
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15360	NC_011369	TCG	2	6	640108	640113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548221
15361	NC_011369	CG	3	6	640112	640117	0 %	0 %	50 %	50 %	209548221
15362	NC_011369	GCAT	2	8	640126	640133	25 %	25 %	25 %	25 %	209548221
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15364	NC_011369	GAC	2	6	640200	640205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548221
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15366	NC_011369	TGCC	2	8	640276	640283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15367	NC_011369	GCA	2	6	640295	640300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15478	NC_011369	CGG	2	6	644805	644810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548228
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15481	NC_011369	TGA	2	6	644906	644911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548228
15482	NC_011369	TGC	2	6	644912	644917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548228
15483	NC_011369	TGA	2	6	644957	644962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548228
15484	NC_011369	GCT	2	6	644971	644976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548228
15485	NC_011369	GCC	3	9	644983	644991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548228
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