MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011369	CGG	2	6	584063	584068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548168
14002	NC_011369	GCA	2	6	584171	584176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548168
14003	NC_011369	TCA	2	6	584314	584319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548168
14004	NC_011369	GCA	2	6	584329	584334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548168
14005	NC_011369	CGA	2	6	584353	584358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548168
14006	NC_011369	CATCCT	2	12	584405	584416	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	209548168
14007	NC_011369	CCG	2	6	584421	584426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548168
14008	NC_011369	GCG	2	6	584485	584490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_011369	GTCC	2	8	584545	584552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14010	NC_011369	CGC	2	6	584650	584655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14011	NC_011369	GTC	2	6	584663	584668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_011369	TCG	2	6	584751	584756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14013	NC_011369	GCC	3	9	584795	584803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14014	NC_011369	CCG	2	6	584805	584810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14015	NC_011369	GCT	2	6	584827	584832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14016	NC_011369	CGA	2	6	584845	584850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14017	NC_011369	GCC	3	9	584966	584974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14018	NC_011369	CGG	2	6	584982	584987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548169
14019	NC_011369	GAT	2	6	585010	585015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548169
14020	NC_011369	GCC	2	6	585032	585037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14021	NC_011369	CGT	2	6	585109	585114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14022	NC_011369	CCA	2	6	585132	585137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548169
14023	NC_011369	GAC	2	6	585247	585252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14024	NC_011369	GCT	2	6	585253	585258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14025	NC_011369	CGG	2	6	585262	585267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548169
14026	NC_011369	TCG	2	6	585270	585275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14027	NC_011369	GCC	3	9	585284	585292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14028	NC_011369	TCG	2	6	585333	585338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14029	NC_011369	CGG	2	6	585367	585372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548169
14030	NC_011369	CGA	2	6	585409	585414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14031	NC_011369	GGC	2	6	585454	585459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548169
14032	NC_011369	GACC	2	8	585487	585494	25 %	0 %	25 %	50 %	209548169
14033	NC_011369	GCG	2	6	585501	585506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548169
14034	NC_011369	CGA	2	6	585532	585537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14035	NC_011369	GCCAT	2	10	585567	585576	20 %	20 %	20 %	40 %	209548169
14036	NC_011369	TGGC	2	8	585585	585592	0 %	25 %	50 %	25 %	209548169
14037	NC_011369	GGCC	2	8	585622	585629	0 %	0 %	50 %	50 %	209548169
14038	NC_011369	CGC	2	6	585648	585653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14039	NC_011369	GCAG	2	8	585700	585707	25 %	0 %	50 %	25 %	209548169
14040	NC_011369	TCGG	2	8	585716	585723	0 %	25 %	50 %	25 %	209548169
14041	NC_011369	GCC	2	6	585770	585775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14042	NC_011369	CACCG	2	10	585788	585797	20 %	0 %	20 %	60 %	209548169
14043	NC_011369	AGC	2	6	585798	585803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14044	NC_011369	GCC	3	9	585806	585814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14045	NC_011369	CCG	2	6	585825	585830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14046	NC_011369	GAC	3	9	585847	585855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14047	NC_011369	GC	3	6	585874	585879	0 %	0 %	50 %	50 %	209548169
14048	NC_011369	TCG	2	6	585897	585902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14049	NC_011369	GTC	2	6	585938	585943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14050	NC_011369	GCA	2	6	585964	585969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14051	NC_011369	TCC	2	6	585980	585985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548169
14052	NC_011369	CGA	2	6	586015	586020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14053	NC_011369	CCT	2	6	586039	586044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548169
14054	NC_011369	CGT	2	6	586102	586107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14055	NC_011369	GGC	2	6	586147	586152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548169
14056	NC_011369	CAC	2	6	586174	586179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548169
14057	NC_011369	TCG	2	6	586245	586250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14058	NC_011369	ACC	2	6	586269	586274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548169
14059	NC_011369	CCG	2	6	586335	586340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14060	NC_011369	CAA	2	6	586342	586347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548169
14061	NC_011369	CAG	2	6	586364	586369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14062	NC_011369	GAG	2	6	586385	586390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548169
14063	NC_011369	AGG	2	6	586419	586424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548169
14064	NC_011369	TGC	2	6	586443	586448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548169
14065	NC_011369	CG	3	6	586488	586493	0 %	0 %	50 %	50 %	209548169
14066	NC_011369	CCG	2	6	586494	586499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548169
14067	NC_011369	CGCC	2	8	586507	586514	0 %	0 %	25 %	75 %	209548169
14068	NC_011369	CAA	2	6	586543	586548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548169
14069	NC_011369	CGG	2	6	586564	586569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548169
14070	NC_011369	AGG	2	6	586599	586604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548169
14071	NC_011369	GCG	2	6	586654	586659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_011369	T	6	6	586677	586682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_011369	TGG	2	6	586813	586818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_011369	GGGTG	2	10	586859	586868	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_011369	GCT	2	6	586869	586874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_011369	GCG	2	6	586894	586899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14077	NC_011369	CCG	2	6	586961	586966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14078	NC_011369	CGGT	2	8	587054	587061	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14079	NC_011369	TCCA	2	8	587221	587228	25 %	25 %	0 %	50 %	209548170
14080	NC_011369	GA	3	6	587287	587292	50 %	0 %	50 %	0 %	209548170
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14085	NC_011369	CGG	2	6	587453	587458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548170
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14087	NC_011369	CCTT	2	8	587512	587519	0 %	50 %	0 %	50 %	209548170
14088	NC_011369	CGC	2	6	587552	587557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548170
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14090	NC_011369	CGG	2	6	587630	587635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548170
14091	NC_011369	TCG	2	6	587662	587667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548170
14092	NC_011369	GCC	3	9	587668	587676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548170
14093	NC_011369	CAC	2	6	587679	587684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548170
14094	NC_011369	GTG	2	6	587698	587703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548170
14095	NC_011369	CGA	2	6	587750	587755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548170
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14100	NC_011369	TGC	2	6	587908	587913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548170
14101	NC_011369	GGC	2	6	587988	587993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548170
14102	NC_011369	CGA	2	6	588002	588007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548170
14103	NC_011369	GTC	2	6	588012	588017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548170
14104	NC_011369	CCTGG	2	10	588084	588093	0 %	20 %	40 %	40 %	209548170
14105	NC_011369	TGA	2	6	588101	588106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548170
14106	NC_011369	TTG	2	6	588115	588120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209548170
14107	NC_011369	CGG	3	9	588137	588145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548170
14108	NC_011369	CGGC	2	8	588149	588156	0 %	0 %	50 %	50 %	209548170
14109	NC_011369	GCA	2	6	588227	588232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548170
14110	NC_011369	GCA	2	6	588236	588241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548170
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14113	NC_011369	CGAGG	2	10	588426	588435	20 %	0 %	60 %	20 %	209548170
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14115	NC_011369	TGTCGT	2	12	588482	588493	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	209548170
14116	NC_011369	GC	3	6	588510	588515	0 %	0 %	50 %	50 %	209548170
14117	NC_011369	GC	3	6	588521	588526	0 %	0 %	50 %	50 %	209548170
14118	NC_011369	GCCG	2	8	588555	588562	0 %	0 %	50 %	50 %	209548170
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14120	NC_011369	GGCC	2	8	588638	588645	0 %	0 %	50 %	50 %	209548170
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14478	NC_011369	TGA	2	6	603084	603089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_011369	GCA	2	6	603115	603120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14480	NC_011369	CGC	2	6	603125	603130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14481	NC_011369	TGT	2	6	603162	603167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209548184
14482	NC_011369	GCC	2	6	603238	603243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548184
14483	NC_011369	CGCCGA	2	12	603285	603296	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209548184
14484	NC_011369	GGT	2	6	603363	603368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548184
14485	NC_011369	GCA	2	6	603378	603383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548184
14486	NC_011369	TCA	2	6	603437	603442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548184
14487	NC_011369	CAG	2	6	603448	603453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548184
14488	NC_011369	CGA	2	6	603480	603485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548184
14489	NC_011369	GTT	2	6	603626	603631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14490	NC_011369	CG	3	6	603663	603668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14491	NC_011369	TGG	2	6	603734	603739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14492	NC_011369	GCC	2	6	603786	603791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548185
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14498	NC_011369	TCGCG	2	10	604082	604091	0 %	20 %	40 %	40 %	209548185
14499	NC_011369	CTGG	2	8	604092	604099	0 %	25 %	50 %	25 %	209548185
14500	NC_011369	GA	3	6	604121	604126	50 %	0 %	50 %	0 %	209548185

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