MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011369	CTCG	2	8	562618	562625	0 %	25 %	25 %	50 %	209548149
13502	NC_011369	GC	3	6	562704	562709	0 %	0 %	50 %	50 %	209548149
13503	NC_011369	TGGGC	2	10	562713	562722	0 %	20 %	60 %	20 %	209548149
13504	NC_011369	GGC	2	6	562733	562738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548149
13505	NC_011369	CGC	2	6	562747	562752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548149
13506	NC_011369	GCC	2	6	562766	562771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548149
13507	NC_011369	AGG	2	6	562821	562826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548149
13508	NC_011369	ACG	2	6	562827	562832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548149
13509	NC_011369	CGTT	2	8	562843	562850	0 %	50 %	25 %	25 %	209548149
13510	NC_011369	CG	3	6	562855	562860	0 %	0 %	50 %	50 %	209548149
13511	NC_011369	GCC	2	6	562982	562987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548149
13512	NC_011369	ATG	2	6	563025	563030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548149
13513	NC_011369	ATC	2	6	563078	563083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548149
13514	NC_011369	TTC	2	6	563084	563089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548149
13515	NC_011369	GCT	2	6	563104	563109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548149
13516	NC_011369	TG	3	6	563176	563181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_011369	GAT	2	6	563219	563224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548150
13518	NC_011369	GCCG	2	8	563257	563264	0 %	0 %	50 %	50 %	209548150
13519	NC_011369	GCGG	2	8	563287	563294	0 %	0 %	75 %	25 %	209548150
13520	NC_011369	GGC	3	9	563314	563322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548150
13521	NC_011369	GCC	2	6	563348	563353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548150
13522	NC_011369	CGG	2	6	563440	563445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548150
13523	NC_011369	CGA	2	6	563467	563472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548150
13524	NC_011369	ATG	2	6	563501	563506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548150
13525	NC_011369	GCGG	2	8	563552	563559	0 %	0 %	75 %	25 %	209548150
13526	NC_011369	GGAGG	2	10	563612	563621	20 %	0 %	80 %	0 %	209548150
13527	NC_011369	CCGCG	2	10	563635	563644	0 %	0 %	40 %	60 %	209548150
13528	NC_011369	ATGG	2	8	563681	563688	25 %	25 %	50 %	0 %	209548150
13529	NC_011369	CTG	2	6	563699	563704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548150
13530	NC_011369	CGT	2	6	563732	563737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548150
13531	NC_011369	TCT	2	6	563813	563818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_011369	CAG	2	6	564026	564031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13533	NC_011369	TGA	2	6	564069	564074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548151
13534	NC_011369	AAG	2	6	564155	564160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548151
13535	NC_011369	TAC	2	6	564170	564175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548151
13536	NC_011369	CAA	2	6	564187	564192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548151
13537	NC_011369	CGA	2	6	564205	564210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13538	NC_011369	GAA	2	6	564292	564297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548151
13539	NC_011369	CAA	2	6	564337	564342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548151
13540	NC_011369	TTCAAT	2	12	564380	564391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	209548151
13541	NC_011369	GACG	2	8	564412	564419	25 %	0 %	50 %	25 %	209548151
13542	NC_011369	AGG	2	6	564423	564428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548151
13543	NC_011369	CGA	2	6	564477	564482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13544	NC_011369	TTA	2	6	564496	564501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548151
13545	NC_011369	CAA	2	6	564505	564510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548151
13546	NC_011369	GAC	2	6	564523	564528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13547	NC_011369	CGA	2	6	564532	564537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13548	NC_011369	CAA	2	6	564544	564549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548151
13549	NC_011369	CGT	2	6	564658	564663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13550	NC_011369	GCC	2	6	564698	564703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13551	NC_011369	TCA	2	6	564804	564809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548151
13552	NC_011369	TCGG	2	8	564818	564825	0 %	25 %	50 %	25 %	209548151
13553	NC_011369	CAA	2	6	564844	564849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548151
13554	NC_011369	CCG	3	9	564852	564860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13555	NC_011369	TAT	2	6	564875	564880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548151
13556	NC_011369	CGA	2	6	564910	564915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13557	NC_011369	CCT	2	6	564939	564944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548151
13558	NC_011369	GCA	2	6	564986	564991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13559	NC_011369	GACC	2	8	565006	565013	25 %	0 %	25 %	50 %	209548151
13560	NC_011369	CTTCAA	2	12	565057	565068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548151
13561	NC_011369	GTC	2	6	565129	565134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13562	NC_011369	ACT	2	6	565155	565160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548151
13563	NC_011369	AGC	2	6	565181	565186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13564	NC_011369	GC	3	6	565226	565231	0 %	0 %	50 %	50 %	209548151
13565	NC_011369	GAA	2	6	565282	565287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548151
13566	NC_011369	GCC	2	6	565310	565315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13567	NC_011369	GGAT	2	8	565360	565367	25 %	25 %	50 %	0 %	209548151
13568	NC_011369	ACC	2	6	565412	565417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548151
13569	NC_011369	CGG	2	6	565425	565430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548151
13570	NC_011369	CGA	2	6	565477	565482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13571	NC_011369	CAT	2	6	565483	565488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548151
13572	NC_011369	TCG	2	6	565572	565577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13573	NC_011369	CGC	3	9	565582	565590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13574	NC_011369	CAAG	2	8	565698	565705	50 %	0 %	25 %	25 %	209548151
13575	NC_011369	CAA	2	6	565786	565791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548151
13576	NC_011369	CGGCAC	2	12	565867	565878	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209548151
13577	NC_011369	CGC	3	9	565891	565899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13578	NC_011369	CT	3	6	565921	565926	0 %	50 %	0 %	50 %	209548151
13579	NC_011369	GGC	2	6	565939	565944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548151
13580	NC_011369	GCC	2	6	565979	565984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13581	NC_011369	GC	3	6	565988	565993	0 %	0 %	50 %	50 %	209548151
13582	NC_011369	CGA	2	6	565996	566001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13583	NC_011369	CGA	2	6	566019	566024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13584	NC_011369	CGA	2	6	566035	566040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13585	NC_011369	GCC	2	6	566153	566158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13586	NC_011369	CGC	2	6	566191	566196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13587	NC_011369	GTC	2	6	566213	566218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13588	NC_011369	CGG	2	6	566232	566237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548151
13589	NC_011369	ACC	2	6	566249	566254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548151
13590	NC_011369	GAC	2	6	566279	566284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13591	NC_011369	CGA	2	6	566302	566307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13592	NC_011369	ACT	2	6	566319	566324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548151
13593	NC_011369	ATG	2	6	566330	566335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548151
13594	NC_011369	AAG	2	6	566417	566422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548151
13595	NC_011369	GAT	2	6	566500	566505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548151
13596	NC_011369	GGC	2	6	566617	566622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548151
13597	NC_011369	TGC	2	6	566694	566699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13598	NC_011369	GGCC	2	8	566704	566711	0 %	0 %	50 %	50 %	209548151
13599	NC_011369	CGA	2	6	566739	566744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13600	NC_011369	ATT	2	6	566754	566759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548151
13601	NC_011369	CGA	2	6	566791	566796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13602	NC_011369	CGA	2	6	566803	566808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13603	NC_011369	GCC	2	6	566811	566816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548151
13604	NC_011369	CAA	2	6	566839	566844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548151
13605	NC_011369	GAA	2	6	566878	566883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548151
13606	NC_011369	CGA	2	6	566902	566907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13607	NC_011369	AAG	2	6	566909	566914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548151
13608	NC_011369	GC	3	6	566939	566944	0 %	0 %	50 %	50 %	209548151
13609	NC_011369	TCG	2	6	566955	566960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13610	NC_011369	GGC	2	6	567025	567030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548151
13611	NC_011369	CAG	2	6	567059	567064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13612	NC_011369	CAG	2	6	567077	567082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13613	NC_011369	GTC	2	6	567185	567190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548151
13614	NC_011369	CCT	2	6	567250	567255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548151
13615	NC_011369	GAA	2	6	567292	567297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548151
13616	NC_011369	ACG	2	6	567333	567338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548151
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13618	NC_011369	GTC	2	6	567397	567402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548151
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13739	NC_011369	TCG	2	6	572219	572224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548155
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13887	NC_011369	CGG	2	6	578621	578626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548162
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13939	NC_011369	CGG	2	6	581322	581327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13957	NC_011369	TCG	2	6	581994	581999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548166
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13960	NC_011369	CGA	2	6	582142	582147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548166
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13962	NC_011369	GC	3	6	582200	582205	0 %	0 %	50 %	50 %	209548166
13963	NC_011369	GGCCG	2	10	582234	582243	0 %	0 %	60 %	40 %	209548166
13964	NC_011369	TGC	2	6	582339	582344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548166
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13970	NC_011369	CGG	2	6	582705	582710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548167
13971	NC_011369	GGA	2	6	582715	582720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548167
13972	NC_011369	CGG	2	6	582879	582884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548167
13973	NC_011369	GGCG	2	8	582912	582919	0 %	0 %	75 %	25 %	209548167
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13978	NC_011369	CGC	2	6	583123	583128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548167
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