MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011369	CGG	2	6	522669	522674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548113
12502	NC_011369	CAG	2	6	522677	522682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548113
12503	NC_011369	CT	3	6	522711	522716	0 %	50 %	0 %	50 %	209548113
12504	NC_011369	CG	3	6	522717	522722	0 %	0 %	50 %	50 %	209548113
12505	NC_011369	GCC	2	6	522746	522751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548113
12506	NC_011369	ATC	2	6	522821	522826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548113
12507	NC_011369	GGT	2	6	522847	522852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548113
12508	NC_011369	GCC	2	6	522859	522864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548113
12509	NC_011369	T	6	6	522976	522981	0 %	100 %	0 %	0 %	209548113
12510	NC_011369	GGCT	2	8	522998	523005	0 %	25 %	50 %	25 %	209548113
12511	NC_011369	GAG	2	6	523008	523013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548113
12512	NC_011369	AG	3	6	523036	523041	50 %	0 %	50 %	0 %	209548114
12513	NC_011369	CGAA	2	8	523047	523054	50 %	0 %	25 %	25 %	209548114
12514	NC_011369	GAA	2	6	523069	523074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548114
12515	NC_011369	CGT	2	6	523105	523110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12516	NC_011369	TCA	2	6	523197	523202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548114
12517	NC_011369	TGA	2	6	523215	523220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548114
12518	NC_011369	ATC	2	6	523235	523240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548114
12519	NC_011369	CTG	2	6	523265	523270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12520	NC_011369	GGC	2	6	523292	523297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548114
12521	NC_011369	GCT	2	6	523306	523311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12522	NC_011369	TGA	2	6	523320	523325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548114
12523	NC_011369	TGC	2	6	523356	523361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12524	NC_011369	GCGAT	2	10	523392	523401	20 %	20 %	40 %	20 %	209548114
12525	NC_011369	AT	3	6	523471	523476	50 %	50 %	0 %	0 %	209548114
12526	NC_011369	GGT	2	6	523489	523494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548114
12527	NC_011369	GCT	2	6	523504	523509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12528	NC_011369	TCG	2	6	523512	523517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12529	NC_011369	CG	3	6	523524	523529	0 %	0 %	50 %	50 %	209548114
12530	NC_011369	TTC	2	6	523550	523555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548114
12531	NC_011369	GCC	3	9	523589	523597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548114
12532	NC_011369	CGA	2	6	523615	523620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12533	NC_011369	GCC	2	6	523634	523639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548114
12534	NC_011369	TAT	2	6	523649	523654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548114
12535	NC_011369	CTG	2	6	523667	523672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12536	NC_011369	CGT	3	9	523690	523698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12537	NC_011369	CGGC	2	8	523762	523769	0 %	0 %	50 %	50 %	209548114
12538	NC_011369	GCT	2	6	523903	523908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12539	NC_011369	GTC	2	6	523913	523918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12540	NC_011369	CCG	2	6	523929	523934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548114
12541	NC_011369	CGA	2	6	523935	523940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12542	NC_011369	GCCA	2	8	523946	523953	25 %	0 %	25 %	50 %	209548114
12543	NC_011369	TCA	2	6	523959	523964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548114
12544	NC_011369	GTC	2	6	524174	524179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12545	NC_011369	TTCG	2	8	524201	524208	0 %	50 %	25 %	25 %	209548114
12546	NC_011369	TCGCGC	2	12	524244	524255	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209548114
12547	NC_011369	ACG	2	6	524307	524312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12548	NC_011369	TCA	2	6	524352	524357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548114
12549	NC_011369	CCT	2	6	524424	524429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548114
12550	NC_011369	TCGA	2	8	524438	524445	25 %	25 %	25 %	25 %	209548114
12551	NC_011369	GCC	2	6	524522	524527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548114
12552	NC_011369	CTG	2	6	524528	524533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548114
12553	NC_011369	CAA	2	6	524596	524601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548114
12554	NC_011369	CG	3	6	524604	524609	0 %	0 %	50 %	50 %	209548114
12555	NC_011369	CAT	2	6	524746	524751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548114
12556	NC_011369	CCT	2	6	524757	524762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548114
12557	NC_011369	GCC	2	6	524772	524777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548114
12558	NC_011369	CGC	3	9	524848	524856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548114
12559	NC_011369	ACT	2	6	524868	524873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548114
12560	NC_011369	GTG	2	6	524894	524899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548114
12561	NC_011369	TTA	2	6	524916	524921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548114
12562	NC_011369	TCC	2	6	524987	524992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12563	NC_011369	CTG	2	6	525014	525019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_011369	CAG	2	6	525090	525095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548115
12565	NC_011369	GC	3	6	525127	525132	0 %	0 %	50 %	50 %	209548115
12566	NC_011369	GGCG	2	8	525137	525144	0 %	0 %	75 %	25 %	209548115
12567	NC_011369	CTGGT	2	10	525166	525175	0 %	40 %	40 %	20 %	209548115
12568	NC_011369	GCA	3	9	525191	525199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548115
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12572	NC_011369	GCG	2	6	525331	525336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548115
12573	NC_011369	CCGG	2	8	525419	525426	0 %	0 %	50 %	50 %	209548115
12574	NC_011369	GCG	2	6	525438	525443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548115
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12579	NC_011369	GCCT	2	8	525636	525643	0 %	25 %	25 %	50 %	209548115
12580	NC_011369	GAC	2	6	525732	525737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548115
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12582	NC_011369	TAGA	2	8	525822	525829	50 %	25 %	25 %	0 %	209548115
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12588	NC_011369	CTC	2	6	526189	526194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12589	NC_011369	CCA	2	6	526259	526264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12590	NC_011369	CACC	2	8	526310	526317	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12591	NC_011369	GA	3	6	526463	526468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12593	NC_011369	GGCT	2	8	526592	526599	0 %	25 %	50 %	25 %	209548116
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12599	NC_011369	CTT	2	6	527031	527036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548116
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12602	NC_011369	CGG	2	6	527139	527144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548116
12603	NC_011369	CG	3	6	527226	527231	0 %	0 %	50 %	50 %	209548116
12604	NC_011369	GCC	2	6	527243	527248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548116
12605	NC_011369	AGC	2	6	527283	527288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548116
12606	NC_011369	TGCCT	2	10	527291	527300	0 %	40 %	20 %	40 %	209548116
12607	NC_011369	ATTT	2	8	527306	527313	25 %	75 %	0 %	0 %	209548116
12608	NC_011369	CGAGG	2	10	527314	527323	20 %	0 %	60 %	20 %	209548116
12609	NC_011369	GGC	2	6	527344	527349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548116
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12611	NC_011369	TCT	2	6	527649	527654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548116
12612	NC_011369	GGC	3	9	527666	527674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548116
12613	NC_011369	TTTGA	2	10	527774	527783	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_011369	ATT	2	6	527788	527793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_011369	GC	3	6	527851	527856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12616	NC_011369	GAG	2	6	527943	527948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_011369	GC	3	6	528023	528028	0 %	0 %	50 %	50 %	209548117
12618	NC_011369	ATC	2	6	528126	528131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548117
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12620	NC_011369	GAT	2	6	528188	528193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548117
12621	NC_011369	TTC	2	6	528196	528201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548117
12622	NC_011369	TGC	2	6	528235	528240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548117
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12980	NC_011369	TCG	2	6	542066	542071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548133
12981	NC_011369	GCG	2	6	542103	542108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548133
12982	NC_011369	AGA	2	6	542117	542122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548133
12983	NC_011369	TCG	2	6	542135	542140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548133
12984	NC_011369	CCG	2	6	542141	542146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548133
12985	NC_011369	GCC	2	6	542162	542167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548133
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12990	NC_011369	TCCTGG	2	12	542315	542326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548134
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