MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_011369	GGC	2	6	439727	439732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548035
10503	NC_011369	GCT	2	6	439744	439749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548035
10504	NC_011369	GTC	2	6	439778	439783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548035
10505	NC_011369	GAT	2	6	439905	439910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_011369	CTG	2	6	439930	439935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_011369	CTT	2	6	439944	439949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548036
10508	NC_011369	ATG	2	6	439996	440001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548036
10509	NC_011369	TGC	2	6	440005	440010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548036
10510	NC_011369	CGC	2	6	440025	440030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548036
10511	NC_011369	ATT	2	6	440035	440040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548036
10512	NC_011369	GTG	2	6	440094	440099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548036
10513	NC_011369	CGTC	2	8	440170	440177	0 %	25 %	25 %	50 %	209548036
10514	NC_011369	GGC	2	6	440208	440213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548036
10515	NC_011369	CGGGC	2	10	440225	440234	0 %	0 %	60 %	40 %	209548036
10516	NC_011369	GCC	2	6	440262	440267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548036
10517	NC_011369	CAA	2	6	440288	440293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548036
10518	NC_011369	CT	3	6	440295	440300	0 %	50 %	0 %	50 %	209548036
10519	NC_011369	GC	3	6	440345	440350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10520	NC_011369	GCA	2	6	440361	440366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_011369	CAC	2	6	440381	440386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548037
10522	NC_011369	GCT	2	6	440389	440394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548037
10523	NC_011369	CAC	2	6	440417	440422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548037
10524	NC_011369	CG	3	6	440426	440431	0 %	0 %	50 %	50 %	209548037
10525	NC_011369	TGG	2	6	440482	440487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548037
10526	NC_011369	GAT	2	6	440507	440512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548037
10527	NC_011369	CGC	2	6	440582	440587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548037
10528	NC_011369	CTG	2	6	440618	440623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548037
10529	NC_011369	TCG	2	6	440664	440669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548037
10530	NC_011369	GCC	2	6	440723	440728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548037
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10532	NC_011369	GAT	2	6	440744	440749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548037
10533	NC_011369	GCG	2	6	440758	440763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548037
10534	NC_011369	GTC	2	6	440802	440807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548037
10535	NC_011369	GGC	2	6	440813	440818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548037
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10545	NC_011369	TCG	2	6	441271	441276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548037
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10547	NC_011369	GAT	2	6	441290	441295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548037
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10550	NC_011369	GCG	2	6	441361	441366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548037
10551	NC_011369	AGC	2	6	441402	441407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548037
10552	NC_011369	TCG	2	6	441436	441441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548037
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10555	NC_011369	CCCA	2	8	441482	441489	25 %	0 %	0 %	75 %	209548037
10556	NC_011369	CGA	2	6	441520	441525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548037
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10562	NC_011369	CGC	2	6	441984	441989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10563	NC_011369	A	6	6	441996	442001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_011369	CGG	2	6	442004	442009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_011369	GC	3	6	442023	442028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10566	NC_011369	AC	3	6	442033	442038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10567	NC_011369	AGGGA	2	10	442050	442059	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_011369	GCA	2	6	442102	442107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548038
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10572	NC_011369	ATCA	2	8	442207	442214	50 %	25 %	0 %	25 %	209548038
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10579	NC_011369	CAAA	2	8	442622	442629	75 %	0 %	0 %	25 %	209548038
10580	NC_011369	CG	3	6	442631	442636	0 %	0 %	50 %	50 %	209548038
10581	NC_011369	GCCG	2	8	442644	442651	0 %	0 %	50 %	50 %	209548038
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10590	NC_011369	CGG	2	6	443209	443214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_011369	CCGG	2	8	443216	443223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_011369	TCCT	2	8	443237	443244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10593	NC_011369	CCG	2	6	443296	443301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10594	NC_011369	CGA	2	6	443406	443411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548039
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10605	NC_011369	TGA	2	6	443828	443833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548039
10606	NC_011369	CAG	2	6	443872	443877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548039
10607	NC_011369	CTG	2	6	443890	443895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548039
10608	NC_011369	GCT	2	6	443916	443921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548039
10609	NC_011369	GTC	2	6	443923	443928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548039
10610	NC_011369	TCA	2	6	443954	443959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548039
10611	NC_011369	GCAGG	2	10	444012	444021	20 %	0 %	60 %	20 %	209548039
10612	NC_011369	CGC	3	9	444027	444035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548039
10613	NC_011369	GC	3	6	444066	444071	0 %	0 %	50 %	50 %	209548039
10614	NC_011369	GTC	2	6	444106	444111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548039
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10620	NC_011369	GCC	2	6	444325	444330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548039
10621	NC_011369	CGG	2	6	444338	444343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548039
10622	NC_011369	GGC	2	6	444385	444390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548039
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10655	NC_011369	CAGC	2	8	445993	446000	25 %	0 %	25 %	50 %	209548041
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10976	NC_011369	GATG	2	8	459338	459345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10979	NC_011369	GCA	2	6	459409	459414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548055
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10998	NC_011369	CGG	2	6	460206	460211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10999	NC_011369	TTAG	2	8	460263	460270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11000	NC_011369	GCA	2	6	460413	460418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548056

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