MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011369	CGAG	2	8	414537	414544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10002	NC_011369	GCA	2	6	414662	414667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548010
10003	NC_011369	TTGT	2	8	414703	414710	0 %	75 %	25 %	0 %	209548010
10004	NC_011369	C	6	6	414715	414720	0 %	0 %	0 %	100 %	209548010
10005	NC_011369	GC	3	6	414765	414770	0 %	0 %	50 %	50 %	209548010
10006	NC_011369	CAT	2	6	414786	414791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548010
10007	NC_011369	GCG	2	6	414878	414883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548010
10008	NC_011369	A	7	7	414900	414906	100 %	0 %	0 %	0 %	209548010
10009	NC_011369	AGC	2	6	414986	414991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548010
10010	NC_011369	GCC	2	6	415018	415023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548010
10011	NC_011369	GCT	2	6	415041	415046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548010
10012	NC_011369	ATC	2	6	415056	415061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548010
10013	NC_011369	AAG	2	6	415069	415074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548010
10014	NC_011369	GAT	2	6	415077	415082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548010
10015	NC_011369	CGC	2	6	415085	415090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548010
10016	NC_011369	CCGTC	2	10	415132	415141	0 %	20 %	20 %	60 %	209548010
10017	NC_011369	CCG	2	6	415163	415168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548010
10018	NC_011369	ATG	2	6	415180	415185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548010
10019	NC_011369	ATG	3	9	415216	415224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548010
10020	NC_011369	TGA	2	6	415304	415309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548010
10021	NC_011369	GGCG	2	8	415321	415328	0 %	0 %	75 %	25 %	209548010
10022	NC_011369	TGA	2	6	415465	415470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_011369	TGCAT	2	10	415500	415509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10024	NC_011369	CGAT	2	8	415512	415519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10025	NC_011369	TCA	2	6	415552	415557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_011369	GC	3	6	415573	415578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10027	NC_011369	AGG	2	6	415594	415599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_011369	GAA	2	6	415612	415617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548011
10029	NC_011369	GAT	2	6	415720	415725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548011
10030	NC_011369	CTA	2	6	415726	415731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548011
10031	NC_011369	CGC	2	6	415785	415790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548011
10032	NC_011369	CGC	2	6	415797	415802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548011
10033	NC_011369	CGGA	2	8	415872	415879	25 %	0 %	50 %	25 %	209548011
10034	NC_011369	CCT	2	6	415966	415971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548011
10035	NC_011369	CGA	2	6	416013	416018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548011
10036	NC_011369	GGA	2	6	416095	416100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548011
10037	NC_011369	TGC	2	6	416173	416178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548011
10038	NC_011369	CGC	2	6	416193	416198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548011
10039	NC_011369	ATT	2	6	416232	416237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548011
10040	NC_011369	CGGC	2	8	416241	416248	0 %	0 %	50 %	50 %	209548011
10041	NC_011369	GCAC	2	8	416298	416305	25 %	0 %	25 %	50 %	209548011
10042	NC_011369	CAGT	2	8	416323	416330	25 %	25 %	25 %	25 %	209548011
10043	NC_011369	CCA	2	6	416337	416342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548011
10044	NC_011369	GCG	2	6	416347	416352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548011
10045	NC_011369	TGCC	2	8	416368	416375	0 %	25 %	25 %	50 %	209548011
10046	NC_011369	GAA	2	6	416378	416383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548011
10047	NC_011369	GGC	2	6	416431	416436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548011
10048	NC_011369	TCA	2	6	416469	416474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548011
10049	NC_011369	GACG	2	8	416579	416586	25 %	0 %	50 %	25 %	209548012
10050	NC_011369	GC	3	6	416589	416594	0 %	0 %	50 %	50 %	209548012
10051	NC_011369	GTC	2	6	416627	416632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548012
10052	NC_011369	TCA	2	6	416683	416688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548012
10053	NC_011369	TGG	2	6	416706	416711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548012
10054	NC_011369	TGA	2	6	416727	416732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548012
10055	NC_011369	GTC	2	6	416773	416778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548012
10056	NC_011369	CTG	2	6	416792	416797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548012
10057	NC_011369	GAT	2	6	416879	416884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548012
10058	NC_011369	GAT	2	6	416915	416920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548013
10059	NC_011369	CG	3	6	416949	416954	0 %	0 %	50 %	50 %	209548013
10060	NC_011369	GGT	2	6	417001	417006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548013
10061	NC_011369	CGC	2	6	417047	417052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548013
10062	NC_011369	TCGA	2	8	417111	417118	25 %	25 %	25 %	25 %	209548013
10063	NC_011369	TGG	2	6	417151	417156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548013
10064	NC_011369	TA	3	6	417168	417173	50 %	50 %	0 %	0 %	209548013
10065	NC_011369	TTC	2	6	417190	417195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548013
10066	NC_011369	TGG	2	6	417217	417222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548013
10067	NC_011369	GCG	2	6	417267	417272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548013
10068	NC_011369	GCAA	2	8	417287	417294	50 %	0 %	25 %	25 %	209548013
10069	NC_011369	TG	3	6	417297	417302	0 %	50 %	50 %	0 %	209548013
10070	NC_011369	CGC	2	6	417341	417346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548013
10071	NC_011369	GC	3	6	417385	417390	0 %	0 %	50 %	50 %	209548013
10072	NC_011369	GC	4	8	417400	417407	0 %	0 %	50 %	50 %	209548013
10073	NC_011369	GCT	2	6	417445	417450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548013
10074	NC_011369	GAT	2	6	417510	417515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548013
10075	NC_011369	GAA	3	9	417560	417568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548013
10076	NC_011369	TGA	2	6	417605	417610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548013
10077	NC_011369	GGC	2	6	417617	417622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548013
10078	NC_011369	TGGC	2	8	417711	417718	0 %	25 %	50 %	25 %	209548013
10079	NC_011369	TCG	2	6	417728	417733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548013
10080	NC_011369	CGA	2	6	417785	417790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548013
10081	NC_011369	GCT	2	6	417803	417808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548013
10082	NC_011369	CGC	2	6	417847	417852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548013
10083	NC_011369	GCCT	2	8	417928	417935	0 %	25 %	25 %	50 %	209548013
10084	NC_011369	CCG	2	6	417940	417945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548013
10085	NC_011369	CTT	2	6	417981	417986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548013
10086	NC_011369	GCG	2	6	417987	417992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548013
10087	NC_011369	GGC	2	6	418013	418018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548013
10088	NC_011369	CAT	2	6	418207	418212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548014
10089	NC_011369	TAT	2	6	418238	418243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548014
10090	NC_011369	ATC	2	6	418316	418321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548014
10091	NC_011369	TGC	2	6	418333	418338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548014
10092	NC_011369	TCT	2	6	418362	418367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548014
10093	NC_011369	GAA	2	6	418369	418374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548014
10094	NC_011369	CTG	2	6	418466	418471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548014
10095	NC_011369	TTG	2	6	418472	418477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209548014
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10097	NC_011369	TGC	2	6	418554	418559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548014
10098	NC_011369	GAC	2	6	418741	418746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548014
10099	NC_011369	T	6	6	418857	418862	0 %	100 %	0 %	0 %	209548014
10100	NC_011369	TGA	2	6	418895	418900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548014
10101	NC_011369	GAGCA	2	10	418916	418925	40 %	0 %	40 %	20 %	209548015
10102	NC_011369	ATCA	2	8	418954	418961	50 %	25 %	0 %	25 %	209548015
10103	NC_011369	TGG	2	6	418990	418995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548015
10104	NC_011369	GAT	2	6	419098	419103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548015
10105	NC_011369	CCGG	2	8	419282	419289	0 %	0 %	50 %	50 %	209548015
10106	NC_011369	AGGTC	2	10	419336	419345	20 %	20 %	40 %	20 %	209548015
10107	NC_011369	TCG	2	6	419360	419365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548015
10108	NC_011369	ATGT	2	8	419422	419429	25 %	50 %	25 %	0 %	209548015
10109	NC_011369	CTG	2	6	419473	419478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548015
10110	NC_011369	CGA	2	6	419481	419486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548015
10111	NC_011369	AGG	2	6	419540	419545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548015
10112	NC_011369	GGCC	2	8	419553	419560	0 %	0 %	50 %	50 %	209548015
10113	NC_011369	CGG	2	6	419700	419705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548015
10114	NC_011369	AAGGC	2	10	419741	419750	40 %	0 %	40 %	20 %	209548015
10115	NC_011369	GTCGAG	2	12	419827	419838	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209548015
10116	NC_011369	TC	3	6	419865	419870	0 %	50 %	0 %	50 %	209548015
10117	NC_011369	ATG	2	6	419887	419892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548015
10118	NC_011369	ACC	2	6	419905	419910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548015
10119	NC_011369	TTA	2	6	419970	419975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209548015
10120	NC_011369	TCT	2	6	420003	420008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548015
10121	NC_011369	AT	3	6	420058	420063	50 %	50 %	0 %	0 %	209548015
10122	NC_011369	GGA	2	6	420093	420098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548015
10123	NC_011369	GT	3	6	420203	420208	0 %	50 %	50 %	0 %	209548015
10124	NC_011369	GAA	2	6	420215	420220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548015
10125	NC_011369	TCG	2	6	420262	420267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548016
10126	NC_011369	GGCT	2	8	420333	420340	0 %	25 %	50 %	25 %	209548016
10127	NC_011369	TTC	2	6	420526	420531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548016
10128	NC_011369	CGA	2	6	420574	420579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548016
10129	NC_011369	GCG	2	6	420934	420939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548016
10130	NC_011369	ATCG	2	8	420944	420951	25 %	25 %	25 %	25 %	209548016
10131	NC_011369	ATC	2	6	420978	420983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548016
10132	NC_011369	CGA	2	6	421007	421012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548016
10133	NC_011369	CTGTG	2	10	421050	421059	0 %	40 %	40 %	20 %	209548016
10134	NC_011369	CGA	2	6	421126	421131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548016
10135	NC_011369	CGT	2	6	421245	421250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548017
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10142	NC_011369	GCT	2	6	421635	421640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548017
10143	NC_011369	TCT	2	6	421767	421772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548017
10144	NC_011369	CGA	2	6	421836	421841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548017
10145	NC_011369	GGC	2	6	421919	421924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548018
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10147	NC_011369	GCC	2	6	422111	422116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548018
10148	NC_011369	GCAT	2	8	422134	422141	25 %	25 %	25 %	25 %	209548018
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10151	NC_011369	TGC	2	6	422296	422301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548018
10152	NC_011369	CA	3	6	422302	422307	50 %	0 %	0 %	50 %	209548018
10153	NC_011369	GGT	3	9	422320	422328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548018
10154	NC_011369	AT	4	8	422343	422350	50 %	50 %	0 %	0 %	209548018
10155	NC_011369	CGG	2	6	422441	422446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548018
10156	NC_011369	ATC	2	6	422558	422563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548018
10157	NC_011369	GCA	2	6	422572	422577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548018
10158	NC_011369	CGGC	2	8	422580	422587	0 %	0 %	50 %	50 %	209548018
10159	NC_011369	AGT	2	6	422599	422604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548018
10160	NC_011369	GTC	2	6	422605	422610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548018
10161	NC_011369	CGG	2	6	422621	422626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548018
10162	NC_011369	GGC	2	6	422682	422687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548018
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10178	NC_011369	TCG	2	6	423436	423441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548019
10179	NC_011369	TGA	2	6	423553	423558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548019
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10182	NC_011369	CCGT	2	8	423649	423656	0 %	25 %	25 %	50 %	209548019
10183	NC_011369	GA	4	8	423719	423726	50 %	0 %	50 %	0 %	209548019
10184	NC_011369	ACG	2	6	423730	423735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548019
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10186	NC_011369	CCA	2	6	423851	423856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10187	NC_011369	GCT	2	6	423927	423932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548020
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10189	NC_011369	ACG	2	6	423962	423967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548020
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10201	NC_011369	CGA	2	6	424719	424724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548020
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10203	NC_011369	CGT	2	6	424747	424752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548020
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10206	NC_011369	ATC	3	9	424927	424935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548021
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10208	NC_011369	TCG	3	9	425051	425059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548021
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10214	NC_011369	ACGC	2	8	425284	425291	25 %	0 %	25 %	50 %	209548021
10215	NC_011369	TGAA	2	8	425393	425400	50 %	25 %	25 %	0 %	209548021
10216	NC_011369	TC	3	6	425462	425467	0 %	50 %	0 %	50 %	209548021
10217	NC_011369	CGCAG	2	10	425523	425532	20 %	0 %	40 %	40 %	209548021
10218	NC_011369	GCGG	2	8	425533	425540	0 %	0 %	75 %	25 %	209548021
10219	NC_011369	TCT	2	6	425581	425586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548021
10220	NC_011369	AG	3	6	425591	425596	50 %	0 %	50 %	0 %	209548021
10221	NC_011369	CG	3	6	425659	425664	0 %	0 %	50 %	50 %	209548022
10222	NC_011369	ATC	2	6	425692	425697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548022
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10224	NC_011369	GAG	2	6	425772	425777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548022
10225	NC_011369	TCG	2	6	425782	425787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548022
10226	NC_011369	TGA	2	6	425891	425896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548022
10227	NC_011369	CTT	2	6	425940	425945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548022
10228	NC_011369	GGA	2	6	425957	425962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548022
10229	NC_011369	GA	3	6	426021	426026	50 %	0 %	50 %	0 %	209548022
10230	NC_011369	AGC	2	6	426120	426125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548022
10231	NC_011369	GTC	2	6	426189	426194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548022
10232	NC_011369	GCT	2	6	426221	426226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548022
10233	NC_011369	CGG	2	6	426281	426286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548022
10234	NC_011369	CGGC	2	8	426313	426320	0 %	0 %	50 %	50 %	209548022
10235	NC_011369	CGTG	2	8	426325	426332	0 %	25 %	50 %	25 %	209548022
10236	NC_011369	CGG	2	6	426549	426554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548023
10237	NC_011369	TCA	2	6	426559	426564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548023
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10239	NC_011369	GGT	2	6	426833	426838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548023
10240	NC_011369	GCT	2	6	427000	427005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548023
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10242	NC_011369	GATCGA	2	12	427099	427110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209548023
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10480	NC_011369	GAC	2	6	438823	438828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548034
10481	NC_011369	CGA	3	9	438895	438903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548034
10482	NC_011369	GCC	2	6	438953	438958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548034
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10484	NC_011369	ATG	2	6	439094	439099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548034
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