MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103501	NC_011369	CGC	2	6	4357556	4357561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103502	NC_011369	GGC	2	6	4357577	4357582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103503	NC_011369	TGC	2	6	4357601	4357606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103504	NC_011369	CAG	2	6	4357637	4357642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551753
103505	NC_011369	CGT	2	6	4357933	4357938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551753
103506	NC_011369	CGAC	2	8	4357965	4357972	25 %	0 %	25 %	50 %	209551753
103507	NC_011369	GC	3	6	4357986	4357991	0 %	0 %	50 %	50 %	209551753
103508	NC_011369	TGC	2	6	4358006	4358011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551753
103509	NC_011369	GAC	2	6	4358017	4358022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551753
103510	NC_011369	GCG	2	6	4358039	4358044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551753
103511	NC_011369	ATG	2	6	4358105	4358110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551753
103512	NC_011369	GCC	2	6	4358169	4358174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551753
103513	NC_011369	CGA	2	6	4358252	4358257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551754
103514	NC_011369	ATA	2	6	4358262	4358267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209551754
103515	NC_011369	TCG	2	6	4358297	4358302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551754
103516	NC_011369	TGA	2	6	4358327	4358332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551754
103517	NC_011369	GTA	2	6	4358343	4358348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551754
103518	NC_011369	GCC	2	6	4358376	4358381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551754
103519	NC_011369	GTC	2	6	4358446	4358451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551754
103520	NC_011369	AGC	2	6	4358525	4358530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551754
103521	NC_011369	CTC	2	6	4358667	4358672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209551754
103522	NC_011369	GCA	2	6	4358674	4358679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551754
103523	NC_011369	CGA	2	6	4358684	4358689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551754
103524	NC_011369	CGC	2	6	4358751	4358756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551754
103525	NC_011369	CG	3	6	4358765	4358770	0 %	0 %	50 %	50 %	209551754
103526	NC_011369	CGTT	2	8	4358896	4358903	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103527	NC_011369	CGA	2	6	4358926	4358931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103528	NC_011369	AAG	2	6	4358948	4358953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103529	NC_011369	GGT	2	6	4358975	4358980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551755
103530	NC_011369	CGC	2	6	4358987	4358992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551755
103531	NC_011369	CTG	2	6	4358993	4358998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551755
103532	NC_011369	TGC	2	6	4359003	4359008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551755
103533	NC_011369	ATCG	2	8	4359077	4359084	25 %	25 %	25 %	25 %	209551755
103534	NC_011369	TCG	2	6	4359099	4359104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551755
103535	NC_011369	AGC	2	6	4359129	4359134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551755
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103537	NC_011369	CGA	2	6	4359220	4359225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551755
103538	NC_011369	CG	4	8	4359259	4359266	0 %	0 %	50 %	50 %	209551755
103539	NC_011369	GCA	2	6	4359283	4359288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551755
103540	NC_011369	CTGCGG	2	12	4359298	4359309	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209551755
103541	NC_011369	A	7	7	4359421	4359427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103542	NC_011369	TGA	2	6	4359474	4359479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103543	NC_011369	TAT	2	6	4359527	4359532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103544	NC_011369	TACT	2	8	4359605	4359612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103545	NC_011369	TGT	2	6	4359624	4359629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103546	NC_011369	TCA	2	6	4359847	4359852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551756
103547	NC_011369	CGG	2	6	4359869	4359874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551756
103548	NC_011369	CGG	2	6	4359928	4359933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551756
103549	NC_011369	CTT	2	6	4360180	4360185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209551757
103550	NC_011369	GCAT	2	8	4360227	4360234	25 %	25 %	25 %	25 %	209551757
103551	NC_011369	GCA	2	6	4360238	4360243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551757
103552	NC_011369	GCC	2	6	4360244	4360249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551757
103553	NC_011369	GGC	2	6	4360298	4360303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551757
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103555	NC_011369	TGA	2	6	4360365	4360370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551757
103556	NC_011369	CAT	2	6	4360381	4360386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551757
103557	NC_011369	CGG	2	6	4360387	4360392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551757
103558	NC_011369	TCA	2	6	4360395	4360400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551757
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103560	NC_011369	CGC	2	6	4360542	4360547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551757
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103564	NC_011369	CGG	2	6	4360776	4360781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551758
103565	NC_011369	GTC	2	6	4360783	4360788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551758
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103568	NC_011369	GAC	2	6	4360873	4360878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551758
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103571	NC_011369	GCCG	2	8	4361064	4361071	0 %	0 %	50 %	50 %	209551758
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103573	NC_011369	CGG	2	6	4361115	4361120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551758
103574	NC_011369	TCA	2	6	4361150	4361155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551758
103575	NC_011369	TCA	2	6	4361186	4361191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551758
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103577	NC_011369	GAC	2	6	4361251	4361256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551758
103578	NC_011369	CAG	2	6	4361332	4361337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551758
103579	NC_011369	GCGCT	2	10	4361359	4361368	0 %	20 %	40 %	40 %	209551758
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103581	NC_011369	CTG	2	6	4361413	4361418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551758
103582	NC_011369	GCG	2	6	4361420	4361425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551758
103583	NC_011369	ATC	2	6	4361440	4361445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551758
103584	NC_011369	TCA	2	6	4361450	4361455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551758
103585	NC_011369	CAGCG	2	10	4361481	4361490	20 %	0 %	40 %	40 %	209551758
103586	NC_011369	GC	3	6	4361535	4361540	0 %	0 %	50 %	50 %	209551759
103587	NC_011369	T	6	6	4361559	4361564	0 %	100 %	0 %	0 %	209551759
103588	NC_011369	CGGT	2	8	4361573	4361580	0 %	25 %	50 %	25 %	209551759
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103599	NC_011369	CGC	2	6	4362005	4362010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551759
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103602	NC_011369	CGG	2	6	4362096	4362101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551759
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103604	NC_011369	GTC	2	6	4362148	4362153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551759
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103606	NC_011369	TCG	2	6	4362213	4362218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551759
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103609	NC_011369	CGT	2	6	4362318	4362323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551759
103610	NC_011369	GGC	2	6	4362336	4362341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551759
103611	NC_011369	ACCT	2	8	4362379	4362386	25 %	25 %	0 %	50 %	209551759
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103613	NC_011369	GCCGA	2	10	4362424	4362433	20 %	0 %	40 %	40 %	209551759
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103710	NC_011369	TGC	2	6	4365948	4365953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551762
103711	NC_011369	ATC	2	6	4365956	4365961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551762
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103717	NC_011369	CTGCAG	2	12	4366088	4366099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209551762
103718	NC_011369	CGCC	2	8	4366127	4366134	0 %	0 %	25 %	75 %	209551762
103719	NC_011369	GGCGAG	2	12	4366145	4366156	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	209551762
103720	NC_011369	CTGC	2	8	4366183	4366190	0 %	25 %	25 %	50 %	209551762
103721	NC_011369	CAT	2	6	4366207	4366212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551762
103722	NC_011369	ACG	2	6	4366272	4366277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551762
103723	NC_011369	CGC	2	6	4366305	4366310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551762
103724	NC_011369	ATCGA	2	10	4366328	4366337	40 %	20 %	20 %	20 %	209551762
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103726	NC_011369	ATC	2	6	4366409	4366414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551762
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103785	NC_011369	AAT	2	6	4368723	4368728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103830	NC_011369	CCG	2	6	4370681	4370686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551767
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