MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_011369	GCC	2	6	4336082	4336087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551728
103002	NC_011369	TTG	2	6	4336095	4336100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551728
103003	NC_011369	CGA	2	6	4336108	4336113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551728
103004	NC_011369	GCC	2	6	4336136	4336141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551728
103005	NC_011369	GCG	2	6	4336162	4336167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551728
103006	NC_011369	CGA	2	6	4336189	4336194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551728
103007	NC_011369	CGC	2	6	4336210	4336215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551728
103008	NC_011369	GCT	2	6	4336216	4336221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551728
103009	NC_011369	TCG	2	6	4336263	4336268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551728
103010	NC_011369	CGT	2	6	4336277	4336282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551728
103011	NC_011369	GAT	2	6	4336294	4336299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551728
103012	NC_011369	GAT	2	6	4336328	4336333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551728
103013	NC_011369	GCG	2	6	4336342	4336347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551728
103014	NC_011369	GCC	2	6	4336407	4336412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551728
103015	NC_011369	GCG	2	6	4336429	4336434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551728
103016	NC_011369	TGC	2	6	4336445	4336450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551728
103017	NC_011369	CAG	2	6	4336465	4336470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551728
103018	NC_011369	CGG	2	6	4336471	4336476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551728
103019	NC_011369	GCG	2	6	4336479	4336484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551728
103020	NC_011369	CGG	2	6	4336520	4336525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551728
103021	NC_011369	TGC	2	6	4336538	4336543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551728
103022	NC_011369	CAT	2	6	4336559	4336564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551728
103023	NC_011369	GC	3	6	4336609	4336614	0 %	0 %	50 %	50 %	209551729
103024	NC_011369	CGC	2	6	4336643	4336648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551729
103025	NC_011369	GC	3	6	4336650	4336655	0 %	0 %	50 %	50 %	209551729
103026	NC_011369	CCG	2	6	4336662	4336667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551729
103027	NC_011369	GCC	2	6	4336675	4336680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551729
103028	NC_011369	GCA	2	6	4336694	4336699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551729
103029	NC_011369	TCG	2	6	4336735	4336740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551729
103030	NC_011369	ATC	2	6	4336825	4336830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551729
103031	NC_011369	GCA	2	6	4336841	4336846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551729
103032	NC_011369	GTC	2	6	4336906	4336911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551729
103033	NC_011369	GCG	2	6	4336966	4336971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551729
103034	NC_011369	CGG	2	6	4337076	4337081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551730
103035	NC_011369	GTC	3	9	4337198	4337206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551730
103036	NC_011369	TGC	2	6	4337312	4337317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551730
103037	NC_011369	CGATGC	2	12	4337366	4337377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209551730
103038	NC_011369	ACG	2	6	4337413	4337418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551730
103039	NC_011369	CT	3	6	4337525	4337530	0 %	50 %	0 %	50 %	209551730
103040	NC_011369	GCC	2	6	4337531	4337536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551730
103041	NC_011369	CGT	2	6	4337548	4337553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551730
103042	NC_011369	CG	3	6	4337614	4337619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103043	NC_011369	GCC	2	6	4337626	4337631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103044	NC_011369	CGG	2	6	4337720	4337725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103045	NC_011369	CAGA	2	8	4337794	4337801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103046	NC_011369	ACAT	2	8	4337868	4337875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103047	NC_011369	ACC	2	6	4337898	4337903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103048	NC_011369	TCG	2	6	4337919	4337924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103049	NC_011369	AAACC	2	10	4337925	4337934	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103050	NC_011369	CTA	3	9	4337954	4337962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551731
103051	NC_011369	CTT	2	6	4338130	4338135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209551731
103052	NC_011369	CA	3	6	4338205	4338210	50 %	0 %	0 %	50 %	209551731
103053	NC_011369	AAGG	2	8	4338225	4338232	50 %	0 %	50 %	0 %	209551731
103054	NC_011369	TAA	2	6	4338295	4338300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103055	NC_011369	CAC	2	6	4338354	4338359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103056	NC_011369	AAT	2	6	4338377	4338382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209551732
103057	NC_011369	AC	3	6	4338385	4338390	50 %	0 %	0 %	50 %	209551732
103058	NC_011369	TGC	2	6	4338544	4338549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551732
103059	NC_011369	GAT	2	6	4338615	4338620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551732
103060	NC_011369	GATC	2	8	4338641	4338648	25 %	25 %	25 %	25 %	209551732
103061	NC_011369	CGA	2	6	4338682	4338687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551732
103062	NC_011369	CCA	2	6	4338689	4338694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209551732
103063	NC_011369	GTAT	2	8	4338724	4338731	25 %	50 %	25 %	0 %	209551732
103064	NC_011369	GAT	2	6	4338746	4338751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551732
103065	NC_011369	GCT	2	6	4338765	4338770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551732
103066	NC_011369	CGGT	2	8	4338839	4338846	0 %	25 %	50 %	25 %	209551732
103067	NC_011369	CAT	2	6	4338923	4338928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551732
103068	NC_011369	GCA	2	6	4338930	4338935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551732
103069	NC_011369	GCT	2	6	4338940	4338945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551732
103070	NC_011369	GCG	2	6	4338971	4338976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551732
103071	NC_011369	GGGC	2	8	4338988	4338995	0 %	0 %	75 %	25 %	209551732
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103074	NC_011369	A	6	6	4339050	4339055	100 %	0 %	0 %	0 %	209551733
103075	NC_011369	GCC	2	6	4339098	4339103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551733
103076	NC_011369	TGA	2	6	4339107	4339112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551733
103077	NC_011369	CGA	2	6	4339114	4339119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551733
103078	NC_011369	CTG	2	6	4339127	4339132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551733
103079	NC_011369	CG	3	6	4339157	4339162	0 %	0 %	50 %	50 %	209551733
103080	NC_011369	GGCT	2	8	4339224	4339231	0 %	25 %	50 %	25 %	209551733
103081	NC_011369	GC	4	8	4339246	4339253	0 %	0 %	50 %	50 %	209551733
103082	NC_011369	AAG	2	6	4339265	4339270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551733
103083	NC_011369	TAGGA	2	10	4339283	4339292	40 %	20 %	40 %	0 %	209551733
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103088	NC_011369	GC	3	6	4339458	4339463	0 %	0 %	50 %	50 %	209551734
103089	NC_011369	GATT	2	8	4339512	4339519	25 %	50 %	25 %	0 %	209551734
103090	NC_011369	GCAAC	2	10	4339539	4339548	40 %	0 %	20 %	40 %	209551734
103091	NC_011369	CG	3	6	4339560	4339565	0 %	0 %	50 %	50 %	209551734
103092	NC_011369	TGC	2	6	4339568	4339573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551734
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103098	NC_011369	TCA	2	6	4339839	4339844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551735
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103102	NC_011369	CTTGGC	2	12	4340045	4340056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551735
103103	NC_011369	GGC	2	6	4340081	4340086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551735
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103105	NC_011369	CGG	2	6	4340128	4340133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551735
103106	NC_011369	CGC	2	6	4340201	4340206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103107	NC_011369	AG	3	6	4340251	4340256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103108	NC_011369	CGC	2	6	4340354	4340359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103109	NC_011369	T	8	8	4340428	4340435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103110	NC_011369	CAT	2	6	4340554	4340559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551736
103111	NC_011369	TTTGC	2	10	4340609	4340618	0 %	60 %	20 %	20 %	209551736
103112	NC_011369	CTT	2	6	4340622	4340627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209551736
103113	NC_011369	CCG	2	6	4340711	4340716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551736
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103233	NC_011369	GGT	2	6	4346081	4346086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551741
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103236	NC_011369	GGT	2	6	4346195	4346200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551741
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103244	NC_011369	CGG	2	6	4346648	4346653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551741
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103250	NC_011369	CGA	2	6	4346844	4346849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103251	NC_011369	CAA	2	6	4346976	4346981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551742
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103257	NC_011369	GGC	2	6	4347235	4347240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551742
103258	NC_011369	TGC	2	6	4347242	4347247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551742
103259	NC_011369	CGGT	2	8	4347344	4347351	0 %	25 %	50 %	25 %	209551742
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103261	NC_011369	GATCCT	2	12	4347399	4347410	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209551742
103262	NC_011369	CGA	2	6	4347411	4347416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551742
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103266	NC_011369	ATC	2	6	4347496	4347501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551742
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103290	NC_011369	TCG	2	6	4348524	4348529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551743
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103325	NC_011369	CCGG	2	8	4349491	4349498	0 %	0 %	50 %	50 %	209551743
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103340	NC_011369	TGG	2	6	4350060	4350065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551744
103341	NC_011369	GCCTGC	2	12	4350088	4350099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209551744
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103343	NC_011369	CGG	2	6	4350133	4350138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551744
103344	NC_011369	CCG	2	6	4350229	4350234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551744
103345	NC_011369	TCA	2	6	4350238	4350243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551744
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103454	NC_011369	ATG	2	6	4355182	4355187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551750
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103456	NC_011369	GAT	2	6	4355210	4355215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551750
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