MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011369	CAG	2	6	21337	21342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547635
502	NC_011369	CGG	2	6	21378	21383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547635
503	NC_011369	CGG	2	6	21561	21566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547635
504	NC_011369	GC	3	6	21693	21698	0 %	0 %	50 %	50 %	209547635
505	NC_011369	CGA	2	6	21702	21707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547635
506	NC_011369	CGG	2	6	21789	21794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547635
507	NC_011369	GCA	2	6	21968	21973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547636
508	NC_011369	CGC	2	6	22082	22087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547636
509	NC_011369	CGG	2	6	22100	22105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547636
510	NC_011369	A	6	6	22167	22172	100 %	0 %	0 %	0 %	209547636
511	NC_011369	TCG	2	6	22174	22179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547636
512	NC_011369	TGC	2	6	22279	22284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547636
513	NC_011369	GAAAT	2	10	22309	22318	60 %	20 %	20 %	0 %	209547636
514	NC_011369	GCCGT	2	10	22411	22420	0 %	20 %	40 %	40 %	209547636
515	NC_011369	CAC	2	6	22428	22433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547636
516	NC_011369	TGAA	2	8	22483	22490	50 %	25 %	25 %	0 %	209547636
517	NC_011369	CGGC	2	8	22507	22514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_011369	AGA	2	6	22545	22550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011369	CAG	2	6	22599	22604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547637
520	NC_011369	GCA	2	6	22639	22644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547637
521	NC_011369	CGC	3	9	22664	22672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547637
522	NC_011369	CGGC	2	8	22674	22681	0 %	0 %	50 %	50 %	209547637
523	NC_011369	CGA	2	6	22685	22690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547637
524	NC_011369	CCT	2	6	22708	22713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547637
525	NC_011369	GTC	2	6	22754	22759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547637
526	NC_011369	GCC	2	6	22785	22790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547637
527	NC_011369	CCT	2	6	22873	22878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547637
528	NC_011369	AGC	2	6	22950	22955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547637
529	NC_011369	TTC	2	6	22974	22979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547637
530	NC_011369	GC	3	6	22980	22985	0 %	0 %	50 %	50 %	209547637
531	NC_011369	CGGC	2	8	22986	22993	0 %	0 %	50 %	50 %	209547637
532	NC_011369	GC	3	6	23004	23009	0 %	0 %	50 %	50 %	209547637
533	NC_011369	GCG	2	6	23048	23053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547637
534	NC_011369	C	6	6	23146	23151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
535	NC_011369	TTCTC	2	10	23161	23170	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
536	NC_011369	GAA	2	6	23183	23188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011369	TAG	2	6	23200	23205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547638
538	NC_011369	GC	4	8	23248	23255	0 %	0 %	50 %	50 %	209547638
539	NC_011369	CGC	2	6	23267	23272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547638
540	NC_011369	ATGG	2	8	23349	23356	25 %	25 %	50 %	0 %	209547638
541	NC_011369	GCC	2	6	23397	23402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547638
542	NC_011369	CCA	2	6	23456	23461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547638
543	NC_011369	CCGG	2	8	23474	23481	0 %	0 %	50 %	50 %	209547638
544	NC_011369	CTCG	2	8	23499	23506	0 %	25 %	25 %	50 %	209547638
545	NC_011369	TCT	2	6	23540	23545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547638
546	NC_011369	TCG	2	6	23560	23565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547638
547	NC_011369	CCG	2	6	23656	23661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547638
548	NC_011369	TGC	2	6	23800	23805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547638
549	NC_011369	ACCG	2	8	23817	23824	25 %	0 %	25 %	50 %	209547638
550	NC_011369	CGG	2	6	23855	23860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547638
551	NC_011369	CGAG	2	8	23888	23895	25 %	0 %	50 %	25 %	209547638
552	NC_011369	TGC	2	6	23995	24000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547638
553	NC_011369	CGG	2	6	24047	24052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547638
554	NC_011369	GGC	3	9	24060	24068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547638
555	NC_011369	GCAT	2	8	24121	24128	25 %	25 %	25 %	25 %	209547638
556	NC_011369	CGA	2	6	24131	24136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547638
557	NC_011369	CCT	2	6	24158	24163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547638
558	NC_011369	GCG	2	6	24177	24182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547638
559	NC_011369	GTC	2	6	24264	24269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011369	TGG	2	6	24280	24285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011369	TGC	2	6	24305	24310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011369	GCA	2	6	24314	24319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011369	GTT	2	6	24322	24327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011369	CGC	2	6	24343	24348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_011369	ATC	2	6	24526	24531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547639
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568	NC_011369	CGC	2	6	24577	24582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547639
569	NC_011369	CAG	2	6	24610	24615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547639
570	NC_011369	CTC	2	6	24633	24638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547639
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572	NC_011369	CGGCTG	2	12	24670	24681	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209547639
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574	NC_011369	GAC	2	6	24745	24750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547639
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576	NC_011369	CTTA	2	8	24862	24869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
577	NC_011369	GCC	2	6	24943	24948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_011369	AGG	2	6	24961	24966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_011369	AGG	2	6	25077	25082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547640
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598	NC_011369	GGC	3	9	25696	25704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
599	NC_011369	CAG	2	6	25732	25737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
600	NC_011369	GCG	2	6	25764	25769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
601	NC_011369	GCC	2	6	25817	25822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
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609	NC_011369	TGG	2	6	26010	26015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547641
610	NC_011369	CCG	2	6	26025	26030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
611	NC_011369	CGA	2	6	26139	26144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
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613	NC_011369	GAT	2	6	26191	26196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547641
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615	NC_011369	GGC	2	6	26224	26229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
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617	NC_011369	GCC	2	6	26296	26301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
618	NC_011369	GCA	3	9	26325	26333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
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628	NC_011369	C	6	6	26610	26615	0 %	0 %	0 %	100 %	209547641
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751	NC_011369	TGT	3	9	31748	31756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547644
752	NC_011369	TTGCAG	2	12	31797	31808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209547644
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