MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 107703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
98001	NC_011369	A	6	6	4118934	4118939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98002	NC_011369	GATCA	2	10	4118992	4119001	40 %	20 %	20 %	20 %	209551535
98003	NC_011369	GC	3	6	4119110	4119115	0 %	0 %	50 %	50 %	209551535
98004	NC_011369	TGGT	2	8	4119204	4119211	0 %	50 %	50 %	0 %	209551535
98005	NC_011369	AGG	2	6	4119214	4119219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551535
98006	NC_011369	GGC	2	6	4119268	4119273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551535
98007	NC_011369	AAG	2	6	4119281	4119286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551535
98008	NC_011369	GCG	2	6	4119363	4119368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551535
98009	NC_011369	CGA	2	6	4119403	4119408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551535
98010	NC_011369	TTG	2	6	4119456	4119461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551535
98011	NC_011369	GGT	3	9	4119464	4119472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551535
98012	NC_011369	ACG	2	6	4119495	4119500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551535
98013	NC_011369	AGC	2	6	4119507	4119512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551535
98014	NC_011369	GGC	2	6	4119533	4119538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551535
98015	NC_011369	GATCG	2	10	4119551	4119560	20 %	20 %	40 %	20 %	209551535
98016	NC_011369	GCGCCG	2	12	4119582	4119593	0 %	0 %	50 %	50 %	209551535
98017	NC_011369	GAC	2	6	4119638	4119643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551535
98018	NC_011369	CAT	2	6	4119659	4119664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551535
98019	NC_011369	CGG	2	6	4119678	4119683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551535
98020	NC_011369	CGTTGA	2	12	4119748	4119759	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209551535
98021	NC_011369	GCA	2	6	4119772	4119777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551535
98022	NC_011369	GTC	2	6	4119816	4119821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551535
98023	NC_011369	TCGCG	2	10	4119844	4119853	0 %	20 %	40 %	40 %	209551535
98024	NC_011369	CCAG	2	8	4119866	4119873	25 %	0 %	25 %	50 %	209551535
98025	NC_011369	GCG	2	6	4119879	4119884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551535
98026	NC_011369	CTT	2	6	4119890	4119895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209551535
98027	NC_011369	TTCCTC	2	12	4119914	4119925	0 %	50 %	0 %	50 %	209551535
98028	NC_011369	TGG	2	6	4119988	4119993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551535
98029	NC_011369	CGC	2	6	4119997	4120002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551535
98030	NC_011369	GCC	2	6	4120028	4120033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551535
98031	NC_011369	CGG	3	9	4120114	4120122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551535
98032	NC_011369	GCG	2	6	4120134	4120139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551535
98033	NC_011369	GC	4	8	4120253	4120260	0 %	0 %	50 %	50 %	209551535
98034	NC_011369	TTTCGG	2	12	4120315	4120326	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	209551535
98035	NC_011369	CGA	2	6	4120372	4120377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551535
98036	NC_011369	CG	3	6	4120453	4120458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98037	NC_011369	TG	3	6	4120494	4120499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98038	NC_011369	GAC	2	6	4120515	4120520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98039	NC_011369	A	6	6	4120527	4120532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98040	NC_011369	CCG	2	6	4120594	4120599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98041	NC_011369	AAG	2	6	4120637	4120642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98042	NC_011369	CGG	2	6	4120729	4120734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551536
98043	NC_011369	GAC	3	9	4120754	4120762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551536
98044	NC_011369	GCC	2	6	4120779	4120784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551536
98045	NC_011369	CAT	2	6	4120787	4120792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551536
98046	NC_011369	ATG	2	6	4120800	4120805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551536
98047	NC_011369	GCC	2	6	4120811	4120816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551536
98048	NC_011369	GGC	2	6	4120847	4120852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551536
98049	NC_011369	GCGT	2	8	4120892	4120899	0 %	25 %	50 %	25 %	209551536
98050	NC_011369	TTG	2	6	4120911	4120916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551536
98051	NC_011369	ATG	2	6	4120917	4120922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551536
98052	NC_011369	AT	3	6	4120992	4120997	50 %	50 %	0 %	0 %	209551537
98053	NC_011369	CCA	2	6	4121020	4121025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209551537
98054	NC_011369	TGT	2	6	4121038	4121043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551537
98055	NC_011369	CACG	2	8	4121050	4121057	25 %	0 %	25 %	50 %	209551537
98056	NC_011369	GCT	2	6	4121114	4121119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551537
98057	NC_011369	CCG	2	6	4121151	4121156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551537
98058	NC_011369	GAC	2	6	4121174	4121179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551537
98059	NC_011369	GTC	2	6	4121240	4121245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551537
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98061	NC_011369	CAGC	2	8	4121320	4121327	25 %	0 %	25 %	50 %	209551537
98062	NC_011369	GCA	2	6	4121407	4121412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98063	NC_011369	AT	3	6	4121477	4121482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98064	NC_011369	AGC	2	6	4121571	4121576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551538
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98070	NC_011369	GTC	2	6	4121801	4121806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551538
98071	NC_011369	GC	3	6	4121837	4121842	0 %	0 %	50 %	50 %	209551538
98072	NC_011369	CGA	3	9	4121917	4121925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551538
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98077	NC_011369	CCGG	2	8	4122123	4122130	0 %	0 %	50 %	50 %	209551539
98078	NC_011369	GTG	2	6	4122200	4122205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551539
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98088	NC_011369	GGC	3	9	4122802	4122810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551539
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98101	NC_011369	CAG	3	9	4123255	4123263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551539
98102	NC_011369	GGCATC	2	12	4123267	4123278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209551539
98103	NC_011369	GC	3	6	4123289	4123294	0 %	0 %	50 %	50 %	209551539
98104	NC_011369	GA	3	6	4123305	4123310	50 %	0 %	50 %	0 %	209551539
98105	NC_011369	GCA	2	6	4123320	4123325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551539
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98108	NC_011369	GGCC	2	8	4123395	4123402	0 %	0 %	50 %	50 %	209551539
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98234	NC_011369	CGG	2	6	4128816	4128821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551545
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98495	NC_011369	GATC	2	8	4139957	4139964	25 %	25 %	25 %	25 %	209551557
98496	NC_011369	GCC	2	6	4139974	4139979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551557
98497	NC_011369	AGC	2	6	4140005	4140010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551557
98498	NC_011369	CGC	3	9	4140040	4140048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551557
98499	NC_011369	GCC	2	6	4140103	4140108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98500	NC_011369	GAC	2	6	4140111	4140116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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