MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 28465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011368	GACG	2	8	111	118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011368	TGAA	2	8	122	129	50 %	25 %	25 %	0 %	209546451
3	NC_011368	CGA	3	9	145	153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
4	NC_011368	GAC	2	6	163	168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
5	NC_011368	GAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546451
6	NC_011368	CGT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546451
7	NC_011368	CGC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546451
8	NC_011368	TGCCGC	2	12	238	249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209546451
9	NC_011368	ATC	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546451
10	NC_011368	CAT	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546451
11	NC_011368	CGA	2	6	409	414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
12	NC_011368	GGC	2	6	448	453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546451
13	NC_011368	GC	3	6	460	465	0 %	0 %	50 %	50 %	209546451
14	NC_011368	GCGCC	2	10	472	481	0 %	0 %	40 %	60 %	209546451
15	NC_011368	CGG	2	6	489	494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546451
16	NC_011368	CGAC	2	8	504	511	25 %	0 %	25 %	50 %	209546451
17	NC_011368	CAGGG	2	10	517	526	20 %	0 %	60 %	20 %	209546451
18	NC_011368	GCA	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
19	NC_011368	GCG	2	6	567	572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546451
20	NC_011368	CAG	2	6	718	723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546451
21	NC_011368	GGAC	2	8	751	758	25 %	0 %	50 %	25 %	209546451
22	NC_011368	GTCC	2	8	772	779	0 %	25 %	25 %	50 %	209546451
23	NC_011368	TTC	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546452
24	NC_011368	ATC	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546452
25	NC_011368	TCA	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546452
26	NC_011368	GCG	2	6	939	944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546452
27	NC_011368	GGT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546452
28	NC_011368	CGC	2	6	996	1001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546452
29	NC_011368	CGAG	2	8	1019	1026	25 %	0 %	50 %	25 %	209546452
30	NC_011368	GAA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546452
31	NC_011368	ACC	2	6	1099	1104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546452
32	NC_011368	CGGC	2	8	1226	1233	0 %	0 %	50 %	50 %	209546452
33	NC_011368	CGT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546452
34	NC_011368	GC	3	6	1286	1291	0 %	0 %	50 %	50 %	209546452
35	NC_011368	TGGC	2	8	1331	1338	0 %	25 %	50 %	25 %	209546452
36	NC_011368	GCC	2	6	1384	1389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546452
37	NC_011368	GCA	2	6	1413	1418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546452
38	NC_011368	ACG	2	6	1430	1435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546452
39	NC_011368	CGG	2	6	1595	1600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546452
40	NC_011368	CCGG	2	8	1604	1611	0 %	0 %	50 %	50 %	209546452
41	NC_011368	GCT	2	6	1644	1649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546452
42	NC_011368	ACG	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546452
43	NC_011368	CGT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546452
44	NC_011368	GGCG	2	8	1999	2006	0 %	0 %	75 %	25 %	209546452
45	NC_011368	CGG	2	6	2031	2036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546452
46	NC_011368	GGC	2	6	2063	2068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546452
47	NC_011368	CGGC	2	8	2084	2091	0 %	0 %	50 %	50 %	209546452
48	NC_011368	ATC	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546453
49	NC_011368	CGC	2	6	2260	2265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546453
50	NC_011368	CTG	2	6	2282	2287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
51	NC_011368	GAA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546453
52	NC_011368	GTG	2	6	2392	2397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546453
53	NC_011368	TGG	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546453
54	NC_011368	GCCGGC	2	12	2513	2524	0 %	0 %	50 %	50 %	209546453
55	NC_011368	CA	3	6	2555	2560	50 %	0 %	0 %	50 %	209546453
56	NC_011368	CAC	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546453
57	NC_011368	CAC	2	6	2599	2604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546453
58	NC_011368	ACG	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
59	NC_011368	GCT	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
60	NC_011368	TTC	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546453
61	NC_011368	TCG	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
62	NC_011368	GCC	2	6	2699	2704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546453
63	NC_011368	TCG	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
64	NC_011368	GCAA	2	8	2800	2807	50 %	0 %	25 %	25 %	209546453
65	NC_011368	CAG	2	6	2822	2827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
66	NC_011368	GCT	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
67	NC_011368	CGA	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
68	NC_011368	GCT	2	6	2974	2979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
69	NC_011368	GC	3	6	3052	3057	0 %	0 %	50 %	50 %	209546453
70	NC_011368	GGC	2	6	3118	3123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546453
71	NC_011368	ATC	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546453
72	NC_011368	CGG	2	6	3280	3285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546453
73	NC_011368	GC	3	6	3292	3297	0 %	0 %	50 %	50 %	209546453
74	NC_011368	TCG	2	6	3497	3502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546453
75	NC_011368	GCC	2	6	3557	3562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546453
76	NC_011368	CAG	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
77	NC_011368	GCA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546453
78	NC_011368	GGC	2	6	3777	3782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
79	NC_011368	GGC	3	9	3786	3794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
80	NC_011368	GGAT	2	8	3865	3872	25 %	25 %	50 %	0 %	209546454
81	NC_011368	CAT	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546454
82	NC_011368	GCCG	2	8	3899	3906	0 %	0 %	50 %	50 %	209546454
83	NC_011368	CGGC	2	8	3907	3914	0 %	0 %	50 %	50 %	209546454
84	NC_011368	CGG	3	9	3974	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
85	NC_011368	GAGC	2	8	4002	4009	25 %	0 %	50 %	25 %	209546454
86	NC_011368	GGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
87	NC_011368	CG	3	6	4051	4056	0 %	0 %	50 %	50 %	209546454
88	NC_011368	GTC	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546454
89	NC_011368	GCG	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
90	NC_011368	GCA	2	6	4247	4252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546454
91	NC_011368	GGC	2	6	4281	4286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
92	NC_011368	CGG	2	6	4346	4351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546454
93	NC_011368	CG	3	6	4382	4387	0 %	0 %	50 %	50 %	209546454
94	NC_011368	CCGG	2	8	4475	4482	0 %	0 %	50 %	50 %	209546454
95	NC_011368	AGC	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546454
96	NC_011368	GCG	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546455
97	NC_011368	GAAGGT	2	12	4775	4786	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	209546455
98	NC_011368	GAC	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546455
99	NC_011368	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546455
100	NC_011368	TCG	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546455
101	NC_011368	CGGC	2	8	4956	4963	0 %	0 %	50 %	50 %	209546455
102	NC_011368	CTC	2	6	4969	4974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546456
103	NC_011368	CGA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546456
104	NC_011368	CAG	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546456
105	NC_011368	TC	4	8	5214	5221	0 %	50 %	0 %	50 %	209546456
106	NC_011368	TCG	2	6	5276	5281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546456
107	NC_011368	GC	3	6	5313	5318	0 %	0 %	50 %	50 %	209546456
108	NC_011368	GCGCAC	2	12	5344	5355	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209546456
109	NC_011368	TCG	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546456
110	NC_011368	CGA	2	6	5448	5453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546456
111	NC_011368	CG	3	6	5519	5524	0 %	0 %	50 %	50 %	209546456
112	NC_011368	GGC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
113	NC_011368	ATC	2	6	5666	5671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546456
114	NC_011368	CGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546456
115	NC_011368	GCCG	2	8	5754	5761	0 %	0 %	50 %	50 %	209546456
116	NC_011368	CGG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
117	NC_011368	CGC	2	6	5862	5867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546456
118	NC_011368	CCT	2	6	6108	6113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546456
119	NC_011368	GTC	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546456
120	NC_011368	AGG	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546456
121	NC_011368	CGG	2	6	6275	6280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
122	NC_011368	AGG	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546456
123	NC_011368	GAG	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546456
124	NC_011368	GC	3	6	6309	6314	0 %	0 %	50 %	50 %	209546456
125	NC_011368	GCC	4	12	6337	6348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546456
126	NC_011368	TGA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546456
127	NC_011368	GCCG	2	8	6451	6458	0 %	0 %	50 %	50 %	209546456
128	NC_011368	GGC	2	6	6475	6480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
129	NC_011368	GC	3	6	6516	6521	0 %	0 %	50 %	50 %	209546456
130	NC_011368	GATG	2	8	6594	6601	25 %	25 %	50 %	0 %	209546456
131	NC_011368	GGC	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
132	NC_011368	AG	3	6	6646	6651	50 %	0 %	50 %	0 %	209546456
133	NC_011368	CGGG	2	8	6662	6669	0 %	0 %	75 %	25 %	209546456
134	NC_011368	CGG	2	6	6670	6675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
135	NC_011368	TGCGG	2	10	6769	6778	0 %	20 %	60 %	20 %	209546456
136	NC_011368	GCG	2	6	6784	6789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546456
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219	NC_011368	GCTGT	2	10	9681	9690	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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221	NC_011368	ATT	2	6	9739	9744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_011368	GAA	2	6	10895	10900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546461
249	NC_011368	CGA	2	6	10945	10950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546461
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251	NC_011368	CCAG	2	8	10975	10982	25 %	0 %	25 %	50 %	209546461
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256	NC_011368	TCG	2	6	11103	11108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546461
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258	NC_011368	GCGCA	2	10	11138	11147	20 %	0 %	40 %	40 %	209546461
259	NC_011368	GCA	2	6	11167	11172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546461
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262	NC_011368	GAA	2	6	11228	11233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546461
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264	NC_011368	CGG	2	6	11248	11253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546461
265	NC_011368	GC	3	6	11269	11274	0 %	0 %	50 %	50 %	209546461
266	NC_011368	GGC	2	6	11310	11315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546461
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272	NC_011368	GAG	2	6	11529	11534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011368	CGG	2	6	11543	11548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_011368	GGA	2	6	11549	11554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
275	NC_011368	CGG	3	9	11595	11603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546462
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294	NC_011368	GCC	2	6	12333	12338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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352	NC_011368	GAAA	2	8	14733	14740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_011368	GGC	2	6	16187	16192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546466
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