MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 12155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011366	CGA	2	6	208890	208895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5002	NC_011366	CTG	2	6	208921	208926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5003	NC_011366	TGC	2	6	208967	208972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5004	NC_011366	ATC	2	6	208976	208981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546182
5005	NC_011366	CCCG	2	8	208987	208994	0 %	0 %	25 %	75 %	209546182
5006	NC_011366	CGC	2	6	209034	209039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546182
5007	NC_011366	CGT	2	6	209094	209099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5008	NC_011366	CGCC	2	8	209157	209164	0 %	0 %	25 %	75 %	209546182
5009	NC_011366	CAGCGA	2	12	209166	209177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5010	NC_011366	TCA	2	6	209207	209212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546182
5011	NC_011366	CAGG	2	8	209232	209239	25 %	0 %	50 %	25 %	209546182
5012	NC_011366	GC	3	6	209273	209278	0 %	0 %	50 %	50 %	209546182
5013	NC_011366	AGC	2	6	209279	209284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5014	NC_011366	CG	3	6	209315	209320	0 %	0 %	50 %	50 %	209546182
5015	NC_011366	CCG	2	6	209321	209326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546182
5016	NC_011366	AGC	2	6	209354	209359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5017	NC_011366	CTGC	2	8	209379	209386	0 %	25 %	25 %	50 %	209546182
5018	NC_011366	ATC	2	6	209398	209403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546182
5019	NC_011366	CGGA	2	8	209408	209415	25 %	0 %	50 %	25 %	209546182
5020	NC_011366	TGC	2	6	209420	209425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5021	NC_011366	GCC	2	6	209440	209445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546182
5022	NC_011366	GTC	2	6	209446	209451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5023	NC_011366	CCAG	2	8	209468	209475	25 %	0 %	25 %	50 %	209546182
5024	NC_011366	AAC	2	6	209536	209541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546182
5025	NC_011366	TGC	2	6	209556	209561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5026	NC_011366	CGG	2	6	209589	209594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546182
5027	NC_011366	GCG	2	6	209630	209635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546182
5028	NC_011366	CGT	2	6	209706	209711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5029	NC_011366	CCG	2	6	209730	209735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546182
5030	NC_011366	CGG	2	6	209742	209747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546182
5031	NC_011366	CGG	3	9	209766	209774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546182
5032	NC_011366	GCA	2	6	209813	209818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5033	NC_011366	TC	3	6	209820	209825	0 %	50 %	0 %	50 %	209546182
5034	NC_011366	TCGCA	2	10	209827	209836	20 %	20 %	20 %	40 %	209546182
5035	NC_011366	TCG	2	6	209948	209953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5036	NC_011366	ACG	2	6	209974	209979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546182
5037	NC_011366	CGG	3	9	209985	209993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546182
5038	NC_011366	CCA	2	6	210025	210030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546183
5039	NC_011366	CGGC	2	8	210104	210111	0 %	0 %	50 %	50 %	209546183
5040	NC_011366	TGGCC	2	10	210112	210121	0 %	20 %	40 %	40 %	209546183
5041	NC_011366	GCG	2	6	210185	210190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546183
5042	NC_011366	CGG	2	6	210257	210262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546183
5043	NC_011366	GTC	2	6	210286	210291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546183
5044	NC_011366	AGC	2	6	210301	210306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546183
5045	NC_011366	TGA	2	6	210344	210349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546183
5046	NC_011366	GCC	2	6	210379	210384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546183
5047	NC_011366	CTC	3	9	210435	210443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546183
5048	NC_011366	TCG	2	6	210451	210456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546183
5049	NC_011366	TTG	2	6	210487	210492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546183
5050	NC_011366	CCG	2	6	210508	210513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546183
5051	NC_011366	CTC	2	6	210516	210521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546183
5052	NC_011366	CCG	2	6	210524	210529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546183
5053	NC_011366	CGA	2	6	210533	210538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546183
5054	NC_011366	CGC	2	6	210569	210574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546183
5055	NC_011366	CGGC	2	8	210592	210599	0 %	0 %	50 %	50 %	209546183
5056	NC_011366	CTC	2	6	210600	210605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546183
5057	NC_011366	TCGTC	2	10	210617	210626	0 %	40 %	20 %	40 %	209546183
5058	NC_011366	CATCCT	2	12	210629	210640	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	209546183
5059	NC_011366	CGC	2	6	210716	210721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546183
5060	NC_011366	TGA	2	6	210725	210730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546183
5061	NC_011366	T	6	6	210770	210775	0 %	100 %	0 %	0 %	209546183
5062	NC_011366	TGGGA	2	10	210832	210841	20 %	20 %	60 %	0 %	209546183
5063	NC_011366	CGG	2	6	210843	210848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546183
5064	NC_011366	TCA	2	6	210863	210868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546183
5065	NC_011366	CCT	2	6	210872	210877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_011366	TGT	2	6	210907	210912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011366	CAT	2	6	210972	210977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546184
5068	NC_011366	GGA	2	6	210993	210998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546184
5069	NC_011366	CGAT	2	8	211115	211122	25 %	25 %	25 %	25 %	209546184
5070	NC_011366	GCC	2	6	211158	211163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546184
5071	NC_011366	TCG	2	6	211241	211246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_011366	TGG	3	9	211251	211259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011366	TTTC	2	8	211281	211288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_011366	CCA	2	6	211321	211326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5075	NC_011366	CAG	2	6	211452	211457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546185
5076	NC_011366	CGA	2	6	211483	211488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546185
5077	NC_011366	GCC	2	6	211490	211495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546185
5078	NC_011366	GC	4	8	211503	211510	0 %	0 %	50 %	50 %	209546185
5079	NC_011366	CG	5	10	211511	211520	0 %	0 %	50 %	50 %	209546185
5080	NC_011366	GATC	2	8	211549	211556	25 %	25 %	25 %	25 %	209546185
5081	NC_011366	CGCC	2	8	211575	211582	0 %	0 %	25 %	75 %	209546185
5082	NC_011366	TCG	2	6	211638	211643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546185
5083	NC_011366	GAA	2	6	211657	211662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546185
5084	NC_011366	GCC	2	6	211785	211790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546185
5085	NC_011366	GCC	2	6	211926	211931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546185
5086	NC_011366	TCG	2	6	211935	211940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546185
5087	NC_011366	CTC	2	6	211990	211995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546185
5088	NC_011366	ACCG	2	8	211996	212003	25 %	0 %	25 %	50 %	209546185
5089	NC_011366	GATC	2	8	212014	212021	25 %	25 %	25 %	25 %	209546185
5090	NC_011366	CGGC	2	8	212040	212047	0 %	0 %	50 %	50 %	209546185
5091	NC_011366	TCGCC	2	10	212109	212118	0 %	20 %	20 %	60 %	209546185
5092	NC_011366	CCA	2	6	212148	212153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546185
5093	NC_011366	TGC	2	6	212163	212168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546185
5094	NC_011366	CGA	2	6	212188	212193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546185
5095	NC_011366	CGG	2	6	212223	212228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546185
5096	NC_011366	CGG	2	6	212280	212285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_011366	CGA	2	6	212453	212458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546186
5098	NC_011366	GC	3	6	212483	212488	0 %	0 %	50 %	50 %	209546186
5099	NC_011366	TGA	2	6	212519	212524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546186
5100	NC_011366	ACC	2	6	212554	212559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546186
5101	NC_011366	AGC	2	6	212584	212589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546186
5102	NC_011366	TCG	3	9	212597	212605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546186
5103	NC_011366	GGTC	2	8	212645	212652	0 %	25 %	50 %	25 %	209546186
5104	NC_011366	GCA	2	6	212666	212671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546186
5105	NC_011366	CG	3	6	212675	212680	0 %	0 %	50 %	50 %	209546186
5106	NC_011366	AGG	2	6	212711	212716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546186
5107	NC_011366	CGC	2	6	212717	212722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546186
5108	NC_011366	TCC	2	6	212788	212793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546186
5109	NC_011366	ATG	2	6	212794	212799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546186
5110	NC_011366	GAC	2	6	212832	212837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546186
5111	NC_011366	CGG	2	6	212880	212885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546186
5112	NC_011366	CAT	2	6	212901	212906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546186
5113	NC_011366	TCT	2	6	212930	212935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546186
5114	NC_011366	TGGC	2	8	212980	212987	0 %	25 %	50 %	25 %	209546186
5115	NC_011366	GC	3	6	212986	212991	0 %	0 %	50 %	50 %	209546186
5116	NC_011366	CGA	2	6	213002	213007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546186
5117	NC_011366	CGA	2	6	213095	213100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546186
5118	NC_011366	GAT	2	6	213153	213158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546186
5119	NC_011366	AT	3	6	213157	213162	50 %	50 %	0 %	0 %	209546186
5120	NC_011366	TCGCC	2	10	213182	213191	0 %	20 %	20 %	60 %	209546186
5121	NC_011366	GTG	2	6	213214	213219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546186
5122	NC_011366	CGC	2	6	213221	213226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546186
5123	NC_011366	CGA	2	6	213398	213403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546186
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5126	NC_011366	GGC	2	6	213591	213596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5128	NC_011366	GC	3	6	213631	213636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5129	NC_011366	TCG	2	6	213657	213662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_011366	CGA	2	6	213749	213754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546187
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5154	NC_011366	CCT	2	6	214424	214429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546187
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5159	NC_011366	CCGG	2	8	214587	214594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5160	NC_011366	CGG	2	6	214606	214611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5161	NC_011366	TCG	2	6	214613	214618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_011366	GA	3	6	214672	214677	50 %	0 %	50 %	0 %	209546188
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5201	NC_011366	A	6	6	216675	216680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_011366	GC	3	6	217892	217897	0 %	0 %	50 %	50 %	209546190
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5235	NC_011366	GGCGC	2	10	218022	218031	0 %	0 %	60 %	40 %	209546190
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5238	NC_011366	CAT	2	6	218153	218158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546190
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5240	NC_011366	CAGC	2	8	218271	218278	25 %	0 %	25 %	50 %	209546190
5241	NC_011366	CTG	2	6	218298	218303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546190
5242	NC_011366	TTC	2	6	218320	218325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546190
5243	NC_011366	GGC	2	6	218328	218333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546190
5244	NC_011366	GAT	2	6	218340	218345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546190
5245	NC_011366	GCG	2	6	218396	218401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546190
5246	NC_011366	TCGA	2	8	218404	218411	25 %	25 %	25 %	25 %	209546190
5247	NC_011366	GGC	2	6	218412	218417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546190
5248	NC_011366	CGC	2	6	218561	218566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546190
5249	NC_011366	GCC	2	6	218598	218603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546190
5250	NC_011366	GCC	3	9	218643	218651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546190
5251	NC_011366	AGC	2	6	218698	218703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546190
5252	NC_011366	CAT	2	6	218735	218740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546190
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5254	NC_011366	ATC	2	6	218778	218783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5255	NC_011366	GC	3	6	218816	218821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5256	NC_011366	TGC	2	6	218887	218892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_011366	AAAT	2	8	218947	218954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_011366	AGG	2	6	218963	218968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_011366	CGAACG	2	12	218980	218991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546191
5260	NC_011366	CAT	2	6	218998	219003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546191
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5264	NC_011366	GCCG	2	8	219176	219183	0 %	0 %	50 %	50 %	209546191
5265	NC_011366	A	6	6	219218	219223	100 %	0 %	0 %	0 %	209546191
5266	NC_011366	CAT	3	9	219271	219279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546191
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5272	NC_011366	GCG	2	6	219481	219486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546191
5273	NC_011366	CAT	2	6	219523	219528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546191
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5282	NC_011366	GGA	2	6	219822	219827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_011366	ATG	2	6	219882	219887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546192
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5363	NC_011366	ATC	2	6	222601	222606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546194
5364	NC_011366	CTGGCG	2	12	222607	222618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209546194
5365	NC_011366	ATCG	2	8	222642	222649	25 %	25 %	25 %	25 %	209546194
5366	NC_011366	GTCG	2	8	222654	222661	0 %	25 %	50 %	25 %	209546194
5367	NC_011366	GAT	2	6	222696	222701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546194
5368	NC_011366	TCG	2	6	222728	222733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546194
5369	NC_011366	TCG	2	6	222818	222823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546194
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5372	NC_011366	CAT	3	9	222969	222977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546194
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5375	NC_011366	GCT	2	6	222996	223001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546194
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5380	NC_011366	CGG	2	6	223221	223226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546194
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5382	NC_011366	GC	3	6	223274	223279	0 %	0 %	50 %	50 %	209546194
5383	NC_011366	TCA	2	6	223292	223297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546194
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5393	NC_011366	TCGGCA	2	12	223765	223776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209546195
5394	NC_011366	ATCGGC	2	12	223794	223805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209546195
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5400	NC_011366	CGC	2	6	224099	224104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546195
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5420	NC_011366	TCG	2	6	224799	224804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546197
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5428	NC_011366	CTCG	2	8	225354	225361	0 %	25 %	25 %	50 %	209546197
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5448	NC_011366	GCT	2	6	225981	225986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546197
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5457	NC_011366	GAG	2	6	226240	226245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5472	NC_011366	GC	3	6	226897	226902	0 %	0 %	50 %	50 %	209546198
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5477	NC_011366	ATCC	2	8	227161	227168	25 %	25 %	0 %	50 %	209546199
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5480	NC_011366	GCG	2	6	227273	227278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546199
5481	NC_011366	GCCG	2	8	227308	227315	0 %	0 %	50 %	50 %	209546199
5482	NC_011366	GC	3	6	227327	227332	0 %	0 %	50 %	50 %	209546199
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5484	NC_011366	GGCAC	2	10	227427	227436	20 %	0 %	40 %	40 %	209546199
5485	NC_011366	CAA	2	6	227464	227469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546199
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5488	NC_011366	CGG	2	6	227536	227541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546199
5489	NC_011366	GC	3	6	227551	227556	0 %	0 %	50 %	50 %	209546199
5490	NC_011366	ATG	2	6	227567	227572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546199
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