MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_011004	GCT	2	6	1229263	1229268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289568
31502	NC_011004	GCG	2	6	1229274	1229279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289568
31503	NC_011004	CGG	2	6	1229310	1229315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289568
31504	NC_011004	GAT	2	6	1229323	1229328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289568
31505	NC_011004	GCC	2	6	1229393	1229398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289568
31506	NC_011004	GCG	2	6	1229399	1229404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289568
31507	NC_011004	GCTT	2	8	1229470	1229477	0 %	50 %	25 %	25 %	192289568
31508	NC_011004	TCG	2	6	1229490	1229495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289568
31509	NC_011004	GCT	2	6	1229506	1229511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289568
31510	NC_011004	GCGCCG	2	12	1229555	1229566	0 %	0 %	50 %	50 %	192289568
31511	NC_011004	CGG	2	6	1229581	1229586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289568
31512	NC_011004	CGG	2	6	1229595	1229600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289568
31513	NC_011004	TCGCGC	2	12	1229607	1229618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192289568
31514	NC_011004	TGC	2	6	1229644	1229649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31515	NC_011004	TG	4	8	1229703	1229710	0 %	50 %	50 %	0 %	192289569
31516	NC_011004	CGC	2	6	1229711	1229716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289569
31517	NC_011004	GTC	2	6	1229756	1229761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289569
31518	NC_011004	CCG	2	6	1229800	1229805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289569
31519	NC_011004	CGA	2	6	1229833	1229838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289569
31520	NC_011004	CGC	3	9	1229854	1229862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289569
31521	NC_011004	TGAT	2	8	1229901	1229908	25 %	50 %	25 %	0 %	192289569
31522	NC_011004	AGT	2	6	1229949	1229954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289569
31523	NC_011004	CTA	2	6	1230012	1230017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31524	NC_011004	TGC	2	6	1230081	1230086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31525	NC_011004	ACA	2	6	1230142	1230147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31526	NC_011004	GGA	2	6	1230165	1230170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31527	NC_011004	TCGC	2	8	1230183	1230190	0 %	25 %	25 %	50 %	192289570
31528	NC_011004	GC	4	8	1230189	1230196	0 %	0 %	50 %	50 %	192289570
31529	NC_011004	TGG	2	6	1230223	1230228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289570
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31531	NC_011004	CGA	2	6	1230242	1230247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289570
31532	NC_011004	TCG	2	6	1230271	1230276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289570
31533	NC_011004	GGC	2	6	1230314	1230319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289570
31534	NC_011004	GTG	2	6	1230330	1230335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289570
31535	NC_011004	CGC	2	6	1230374	1230379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289570
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31538	NC_011004	GAC	2	6	1230605	1230610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289571
31539	NC_011004	GCT	2	6	1230622	1230627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289571
31540	NC_011004	CCGGCG	2	12	1230666	1230677	0 %	0 %	50 %	50 %	192289571
31541	NC_011004	CGG	2	6	1230700	1230705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289571
31542	NC_011004	CGC	2	6	1230769	1230774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289571
31543	NC_011004	TGT	2	6	1230801	1230806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289571
31544	NC_011004	CGAT	2	8	1230807	1230814	25 %	25 %	25 %	25 %	192289571
31545	NC_011004	CGA	2	6	1230844	1230849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289571
31546	NC_011004	TCG	2	6	1230879	1230884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289571
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31548	NC_011004	GC	3	6	1230974	1230979	0 %	0 %	50 %	50 %	192289571
31549	NC_011004	CGC	2	6	1231062	1231067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289571
31550	NC_011004	CGGC	2	8	1231068	1231075	0 %	0 %	50 %	50 %	192289571
31551	NC_011004	GCTG	2	8	1231096	1231103	0 %	25 %	50 %	25 %	192289571
31552	NC_011004	GGC	2	6	1231120	1231125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289571
31553	NC_011004	GTC	2	6	1231141	1231146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289571
31554	NC_011004	GCT	2	6	1231165	1231170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289571
31555	NC_011004	CGC	2	6	1231201	1231206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289571
31556	NC_011004	CG	3	6	1231239	1231244	0 %	0 %	50 %	50 %	192289571
31557	NC_011004	GC	3	6	1231275	1231280	0 %	0 %	50 %	50 %	192289571
31558	NC_011004	GATG	2	8	1231312	1231319	25 %	25 %	50 %	0 %	192289571
31559	NC_011004	GCCG	2	8	1231354	1231361	0 %	0 %	50 %	50 %	192289571
31560	NC_011004	CGTG	2	8	1231363	1231370	0 %	25 %	50 %	25 %	192289571
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31569	NC_011004	AGGCG	2	10	1231684	1231693	20 %	0 %	60 %	20 %	192289573
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31579	NC_011004	TGC	2	6	1231899	1231904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289573
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31584	NC_011004	AGACG	2	10	1232065	1232074	40 %	0 %	40 %	20 %	192289573
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31588	NC_011004	GCG	2	6	1232149	1232154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289573
31589	NC_011004	CGCC	2	8	1232199	1232206	0 %	0 %	25 %	75 %	192289574
31590	NC_011004	GCG	2	6	1232207	1232212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289574
31591	NC_011004	CGT	2	6	1232217	1232222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289574
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31593	NC_011004	ATCGGC	2	12	1232251	1232262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192289574
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31599	NC_011004	TGA	2	6	1232516	1232521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289574
31600	NC_011004	CG	3	6	1232526	1232531	0 %	0 %	50 %	50 %	192289574
31601	NC_011004	CGG	2	6	1232543	1232548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289574
31602	NC_011004	CGA	3	9	1232556	1232564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289574
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31604	NC_011004	GGCTC	2	10	1232648	1232657	0 %	20 %	40 %	40 %	192289574
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31606	NC_011004	CGCT	2	8	1232687	1232694	0 %	25 %	25 %	50 %	192289574
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31611	NC_011004	CTGGG	2	10	1232771	1232780	0 %	20 %	60 %	20 %	192289574
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31617	NC_011004	CG	3	6	1232941	1232946	0 %	0 %	50 %	50 %	192289574
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31734	NC_011004	TAC	2	6	1236646	1236651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289577
31735	NC_011004	CGG	3	9	1236661	1236669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289577
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31739	NC_011004	GGC	2	6	1236767	1236772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289577
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31742	NC_011004	GGT	2	6	1236915	1236920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289578
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31744	NC_011004	GCT	2	6	1237026	1237031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289578
31745	NC_011004	CGG	2	6	1237114	1237119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289579
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31751	NC_011004	GC	3	6	1237382	1237387	0 %	0 %	50 %	50 %	192289579
31752	NC_011004	GGC	2	6	1237391	1237396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289579
31753	NC_011004	GCGATC	2	12	1237434	1237445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192289579
31754	NC_011004	GGT	2	6	1237469	1237474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289579
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31758	NC_011004	GCC	2	6	1237536	1237541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289579
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31761	NC_011004	GGT	3	9	1237733	1237741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289579
31762	NC_011004	GCA	2	6	1237790	1237795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289579
31763	NC_011004	GCC	2	6	1237807	1237812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289579
31764	NC_011004	CGT	2	6	1237814	1237819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289579
31765	NC_011004	CG	3	6	1237836	1237841	0 %	0 %	50 %	50 %	192289579
31766	NC_011004	G	6	6	1237850	1237855	0 %	0 %	100 %	0 %	192289579
31767	NC_011004	CCG	3	9	1238011	1238019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289579
31768	NC_011004	GCG	2	6	1238038	1238043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289579
31769	NC_011004	CCGA	2	8	1238067	1238074	25 %	0 %	25 %	50 %	192289579
31770	NC_011004	GCGCA	2	10	1238149	1238158	20 %	0 %	40 %	40 %	192289579
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31773	NC_011004	CG	3	6	1238279	1238284	0 %	0 %	50 %	50 %	192289580
31774	NC_011004	CGC	2	6	1238314	1238319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289580
31775	NC_011004	TGC	2	6	1238334	1238339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289580
31776	NC_011004	GC	3	6	1238338	1238343	0 %	0 %	50 %	50 %	192289580
31777	NC_011004	GGC	2	6	1238356	1238361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289580
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31780	NC_011004	GTG	2	6	1238408	1238413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289580
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31787	NC_011004	CGGC	2	8	1238511	1238518	0 %	0 %	50 %	50 %	192289580
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31790	NC_011004	GGC	3	9	1238575	1238583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289580
31791	NC_011004	CG	4	8	1238586	1238593	0 %	0 %	50 %	50 %	192289580
31792	NC_011004	GGT	2	6	1238626	1238631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289580
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31794	NC_011004	ACG	2	6	1238666	1238671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289580
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31800	NC_011004	TGG	2	6	1238856	1238861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289580
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31802	NC_011004	CGC	2	6	1238914	1238919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289580
31803	NC_011004	GCA	2	6	1238938	1238943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289580
31804	NC_011004	CGGTGC	2	12	1238976	1238987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289580
31805	NC_011004	GGC	3	9	1238998	1239006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289580
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31808	NC_011004	CGC	2	6	1239097	1239102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289580
31809	NC_011004	TGC	2	6	1239130	1239135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289580
31810	NC_011004	ATC	2	6	1239137	1239142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289580
31811	NC_011004	CGA	3	9	1239154	1239162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289580
31812	NC_011004	TCA	2	6	1239163	1239168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289580
31813	NC_011004	CGG	3	9	1239193	1239201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289580
31814	NC_011004	TCG	2	6	1239207	1239212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289580
31815	NC_011004	TGGC	2	8	1239215	1239222	0 %	25 %	50 %	25 %	192289580
31816	NC_011004	TTG	2	6	1239244	1239249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289580
31817	NC_011004	GAC	2	6	1239281	1239286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31818	NC_011004	TGG	2	6	1239313	1239318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289581
31819	NC_011004	CGA	3	9	1239320	1239328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31820	NC_011004	CGA	2	6	1239365	1239370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31821	NC_011004	GC	4	8	1239385	1239392	0 %	0 %	50 %	50 %	192289581
31822	NC_011004	GCG	2	6	1239407	1239412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289581
31823	NC_011004	GAT	2	6	1239524	1239529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289581
31824	NC_011004	CAT	2	6	1239557	1239562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289581
31825	NC_011004	GCT	2	6	1239623	1239628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31826	NC_011004	CGCGG	2	10	1239639	1239648	0 %	0 %	60 %	40 %	192289581
31827	NC_011004	TGC	2	6	1239661	1239666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31828	NC_011004	CCG	2	6	1239682	1239687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289581
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31830	NC_011004	GC	3	6	1239827	1239832	0 %	0 %	50 %	50 %	192289581
31831	NC_011004	GCT	2	6	1239887	1239892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31832	NC_011004	CGGCT	2	10	1239911	1239920	0 %	20 %	40 %	40 %	192289581
31833	NC_011004	GCG	2	6	1239952	1239957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289581
31834	NC_011004	GGC	2	6	1240059	1240064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289581
31835	NC_011004	CGA	2	6	1240076	1240081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31836	NC_011004	GCT	2	6	1240115	1240120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31837	NC_011004	TGC	2	6	1240126	1240131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31838	NC_011004	TCCG	2	8	1240144	1240151	0 %	25 %	25 %	50 %	192289581
31839	NC_011004	GC	3	6	1240156	1240161	0 %	0 %	50 %	50 %	192289581
31840	NC_011004	GTC	2	6	1240188	1240193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289581
31841	NC_011004	GCG	2	6	1240194	1240199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289581
31842	NC_011004	TAC	2	6	1240254	1240259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289581
31843	NC_011004	GATG	2	8	1240307	1240314	25 %	25 %	50 %	0 %	192289581
31844	NC_011004	CGC	2	6	1240325	1240330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289581
31845	NC_011004	TGG	2	6	1240462	1240467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289581
31846	NC_011004	CGC	2	6	1240507	1240512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289581
31847	NC_011004	GGC	2	6	1240632	1240637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289581
31848	NC_011004	CG	3	6	1240672	1240677	0 %	0 %	50 %	50 %	192289581
31849	NC_011004	CAA	2	6	1240688	1240693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289581
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31856	NC_011004	GCT	2	6	1241013	1241018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289582
31857	NC_011004	GCT	2	6	1241037	1241042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289582
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31879	NC_011004	CGG	2	6	1242009	1242014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289582
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31884	NC_011004	GGC	2	6	1242179	1242184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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31962	NC_011004	CGT	2	6	1245023	1245028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289584
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31964	NC_011004	CG	3	6	1245149	1245154	0 %	0 %	50 %	50 %	192289584
31965	NC_011004	GTC	2	6	1245174	1245179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289584
31966	NC_011004	GCT	2	6	1245180	1245185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289584
31967	NC_011004	CAG	2	6	1245210	1245215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289584
31968	NC_011004	CG	3	6	1245231	1245236	0 %	0 %	50 %	50 %	192289584
31969	NC_011004	AGGC	2	8	1245237	1245244	25 %	0 %	50 %	25 %	192289584
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