MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_011004	GTT	2	6	1142043	1142048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29502	NC_011004	CGA	2	6	1142054	1142059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29503	NC_011004	TCG	2	6	1142165	1142170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29504	NC_011004	GGTA	2	8	1142192	1142199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29505	NC_011004	CTT	2	6	1142209	1142214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29506	NC_011004	TCC	2	6	1142250	1142255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29507	NC_011004	CCG	2	6	1142286	1142291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29508	NC_011004	CCG	2	6	1142371	1142376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29509	NC_011004	GGC	2	6	1142403	1142408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29510	NC_011004	CAG	2	6	1142568	1142573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289496
29511	NC_011004	GAC	2	6	1142644	1142649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289496
29512	NC_011004	TTC	2	6	1142699	1142704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289496
29513	NC_011004	AAC	2	6	1142729	1142734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289496
29514	NC_011004	GCC	2	6	1142752	1142757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289496
29515	NC_011004	CGA	2	6	1142766	1142771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289496
29516	NC_011004	GC	3	6	1142780	1142785	0 %	0 %	50 %	50 %	192289496
29517	NC_011004	AGT	2	6	1142814	1142819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289496
29518	NC_011004	CGGTT	2	10	1142852	1142861	0 %	40 %	40 %	20 %	192289496
29519	NC_011004	GC	3	6	1142901	1142906	0 %	0 %	50 %	50 %	192289496
29520	NC_011004	CGT	2	6	1142910	1142915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289496
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29523	NC_011004	GCC	2	6	1142983	1142988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289496
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29527	NC_011004	GGGT	2	8	1143263	1143270	0 %	25 %	75 %	0 %	192289496
29528	NC_011004	ACA	2	6	1143302	1143307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29529	NC_011004	TGC	2	6	1143322	1143327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29530	NC_011004	GCGAA	2	10	1143462	1143471	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29531	NC_011004	GCG	2	6	1143490	1143495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29532	NC_011004	AAC	2	6	1143505	1143510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29533	NC_011004	GGGAT	2	10	1143519	1143528	20 %	20 %	60 %	0 %	192289497
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29536	NC_011004	GAGCCC	2	12	1143636	1143647	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192289497
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29538	NC_011004	GCCG	2	8	1143682	1143689	0 %	0 %	50 %	50 %	192289497
29539	NC_011004	GC	3	6	1143735	1143740	0 %	0 %	50 %	50 %	192289497
29540	NC_011004	CAGG	2	8	1143754	1143761	25 %	0 %	50 %	25 %	192289497
29541	NC_011004	TGC	3	9	1143813	1143821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289497
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29544	NC_011004	GGC	2	6	1143925	1143930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289497
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29551	NC_011004	GTC	2	6	1144208	1144213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289497
29552	NC_011004	ACG	2	6	1144217	1144222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289497
29553	NC_011004	GTC	2	6	1144241	1144246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289497
29554	NC_011004	TAC	2	6	1144286	1144291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289497
29555	NC_011004	CGCA	2	8	1144294	1144301	25 %	0 %	25 %	50 %	192289497
29556	NC_011004	CGGC	2	8	1144308	1144315	0 %	0 %	50 %	50 %	192289497
29557	NC_011004	GCGA	2	8	1144364	1144371	25 %	0 %	50 %	25 %	192289497
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29567	NC_011004	CGA	2	6	1144916	1144921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29569	NC_011004	CGTC	2	8	1144986	1144993	0 %	25 %	25 %	50 %	192289498
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29571	NC_011004	GCC	2	6	1145020	1145025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289498
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29589	NC_011004	ATG	2	6	1145706	1145711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289499
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29591	NC_011004	CGA	2	6	1145815	1145820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289499
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29594	NC_011004	AG	3	6	1145954	1145959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29595	NC_011004	GCGA	2	8	1146051	1146058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29596	NC_011004	GAG	2	6	1146073	1146078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29597	NC_011004	CG	3	6	1146105	1146110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29598	NC_011004	ACG	2	6	1146285	1146290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29600	NC_011004	CTG	3	9	1146444	1146452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29601	NC_011004	TC	3	6	1146480	1146485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29602	NC_011004	CTCAT	2	10	1146503	1146512	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29603	NC_011004	CTG	2	6	1146571	1146576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29606	NC_011004	GTC	2	6	1146713	1146718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29609	NC_011004	CATTC	2	10	1146938	1146947	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29610	NC_011004	TCG	2	6	1147030	1147035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29614	NC_011004	TCG	2	6	1147234	1147239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29615	NC_011004	CTA	2	6	1147241	1147246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29616	NC_011004	TCC	2	6	1147281	1147286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29617	NC_011004	TGC	2	6	1147347	1147352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29618	NC_011004	GCG	2	6	1147493	1147498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289500
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29620	NC_011004	GAC	2	6	1147549	1147554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289500
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29724	NC_011004	CGTGC	2	10	1152412	1152421	0 %	20 %	40 %	40 %	192289503
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29728	NC_011004	CAG	2	6	1152747	1152752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289504
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29730	NC_011004	CCTT	2	8	1152833	1152840	0 %	50 %	0 %	50 %	192289504
29731	NC_011004	GTC	4	12	1152907	1152918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289504
29732	NC_011004	TAC	2	6	1152937	1152942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289504
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29854	NC_011004	GAT	2	6	1159152	1159157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289510
29855	NC_011004	GGCC	2	8	1159195	1159202	0 %	0 %	50 %	50 %	192289510
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29865	NC_011004	GAT	2	6	1159573	1159578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289511
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