MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_011004	ACGGCA	2	12	1120380	1120391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289475
29003	NC_011004	TCG	2	6	1120436	1120441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289475
29004	NC_011004	GCG	2	6	1120461	1120466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289475
29005	NC_011004	CG	3	6	1120480	1120485	0 %	0 %	50 %	50 %	192289475
29006	NC_011004	CG	3	6	1120490	1120495	0 %	0 %	50 %	50 %	192289475
29007	NC_011004	CCA	2	6	1120535	1120540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289475
29008	NC_011004	CCG	2	6	1120596	1120601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289475
29009	NC_011004	GCC	2	6	1120630	1120635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289475
29010	NC_011004	CCG	2	6	1120665	1120670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289475
29011	NC_011004	GCC	3	9	1120801	1120809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289475
29012	NC_011004	GGC	2	6	1120828	1120833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289475
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29015	NC_011004	CAG	2	6	1120906	1120911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289475
29016	NC_011004	CGC	2	6	1120930	1120935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289475
29017	NC_011004	TGCT	2	8	1120937	1120944	0 %	50 %	25 %	25 %	192289475
29018	NC_011004	GTC	2	6	1120948	1120953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289475
29019	NC_011004	CGA	2	6	1121047	1121052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289475
29020	NC_011004	ACG	2	6	1121060	1121065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289475
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29022	NC_011004	GCG	2	6	1121113	1121118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289475
29023	NC_011004	TCT	2	6	1121130	1121135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289475
29024	NC_011004	T	6	6	1121172	1121177	0 %	100 %	0 %	0 %	192289475
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29028	NC_011004	GCGG	2	8	1121391	1121398	0 %	0 %	75 %	25 %	192289475
29029	NC_011004	CGA	2	6	1121409	1121414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289475
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29035	NC_011004	CTGGCG	2	12	1121690	1121701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289475
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29042	NC_011004	GCA	2	6	1122010	1122015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289476
29043	NC_011004	GGCG	2	8	1122055	1122062	0 %	0 %	75 %	25 %	192289476
29044	NC_011004	TGCT	2	8	1122113	1122120	0 %	50 %	25 %	25 %	192289476
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29048	NC_011004	GC	3	6	1122273	1122278	0 %	0 %	50 %	50 %	192289476
29049	NC_011004	GCT	2	6	1122364	1122369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289476
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29116	NC_011004	CGA	3	9	1124824	1124832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289482
29117	NC_011004	GCC	2	6	1124867	1124872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289482
29118	NC_011004	AGCG	2	8	1124873	1124880	25 %	0 %	50 %	25 %	192289482
29119	NC_011004	TTG	2	6	1124916	1124921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289482
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29121	NC_011004	CGG	2	6	1124979	1124984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289482
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29132	NC_011004	CG	3	6	1125643	1125648	0 %	0 %	50 %	50 %	192289482
29133	NC_011004	CCG	2	6	1125651	1125656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289482
29134	NC_011004	GC	3	6	1125661	1125666	0 %	0 %	50 %	50 %	192289482
29135	NC_011004	TGC	2	6	1125693	1125698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289482
29136	NC_011004	CGA	2	6	1125762	1125767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289482
29137	NC_011004	CGG	2	6	1125784	1125789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289482
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29142	NC_011004	GGTT	2	8	1125931	1125938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29143	NC_011004	TCAGGC	2	12	1125958	1125969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29144	NC_011004	GCCGC	2	10	1126137	1126146	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29145	NC_011004	CTGA	2	8	1126190	1126197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29146	NC_011004	GCA	2	6	1126231	1126236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29147	NC_011004	CCG	2	6	1126255	1126260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29148	NC_011004	AAC	2	6	1126287	1126292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29150	NC_011004	GCCG	2	8	1126331	1126338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29151	NC_011004	CG	3	6	1126368	1126373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29152	NC_011004	CGGG	2	8	1126435	1126442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29153	NC_011004	ATGA	2	8	1126447	1126454	50 %	25 %	25 %	0 %	192289483
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29159	NC_011004	CG	3	6	1126689	1126694	0 %	0 %	50 %	50 %	192289483
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29187	NC_011004	GCG	2	6	1127742	1127747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29188	NC_011004	GTA	2	6	1127755	1127760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289485
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29197	NC_011004	ATT	2	6	1128118	1128123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29203	NC_011004	CAT	2	6	1128240	1128245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29204	NC_011004	CGG	2	6	1128355	1128360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29205	NC_011004	CG	3	6	1128361	1128366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29206	NC_011004	CGT	2	6	1128400	1128405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29210	NC_011004	TCA	2	6	1128608	1128613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29220	NC_011004	A	7	7	1128901	1128907	100 %	0 %	0 %	0 %	192289486
29221	NC_011004	GTA	2	6	1128908	1128913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289486
29222	NC_011004	ACT	2	6	1128926	1128931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29223	NC_011004	AAC	2	6	1128949	1128954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29224	NC_011004	TAA	2	6	1128978	1128983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29225	NC_011004	GTT	2	6	1129020	1129025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29226	NC_011004	CGG	2	6	1129040	1129045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29227	NC_011004	GCA	2	6	1129055	1129060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29228	NC_011004	TGACGT	2	12	1129110	1129121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29229	NC_011004	GCG	2	6	1129252	1129257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29230	NC_011004	GCA	2	6	1129263	1129268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29231	NC_011004	GCA	2	6	1129325	1129330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29232	NC_011004	GCCGC	2	10	1129397	1129406	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29233	NC_011004	AAT	2	6	1129437	1129442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29234	NC_011004	GCG	2	6	1129456	1129461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29235	NC_011004	TCT	2	6	1129496	1129501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29244	NC_011004	TGGT	2	8	1129855	1129862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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29355	NC_011004	CTG	2	6	1135296	1135301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289490
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29358	NC_011004	ATC	2	6	1135482	1135487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289490
29359	NC_011004	ATC	2	6	1135551	1135556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289490
29360	NC_011004	CCGA	2	8	1135578	1135585	25 %	0 %	25 %	50 %	192289490
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29362	NC_011004	CCG	2	6	1135660	1135665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289490
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29466	NC_011004	CAAC	2	8	1140571	1140578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29467	NC_011004	TCAC	2	8	1140584	1140591	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29468	NC_011004	TGG	2	6	1140715	1140720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29471	NC_011004	CTC	2	6	1140881	1140886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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29475	NC_011004	CG	3	6	1141015	1141020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29476	NC_011004	CTG	2	6	1141038	1141043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29477	NC_011004	GCC	2	6	1141076	1141081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29478	NC_011004	TGG	3	9	1141156	1141164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29479	NC_011004	ACG	2	6	1141185	1141190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29480	NC_011004	CGT	3	9	1141193	1141201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29481	NC_011004	GCTG	2	8	1141202	1141209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29482	NC_011004	TCG	2	6	1141258	1141263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29483	NC_011004	GGC	2	6	1141337	1141342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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29487	NC_011004	GCC	2	6	1141503	1141508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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29489	NC_011004	GGC	2	6	1141562	1141567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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29491	NC_011004	CTG	2	6	1141613	1141618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29492	NC_011004	ATC	2	6	1141659	1141664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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