MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_011004	GC	3	6	1058508	1058513	0 %	0 %	50 %	50 %	192289419
27502	NC_011004	CGA	2	6	1058557	1058562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289419
27503	NC_011004	TCTGT	2	10	1058619	1058628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27504	NC_011004	GGAA	2	8	1058680	1058687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27505	NC_011004	CG	3	6	1058712	1058717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27506	NC_011004	TCGAA	2	10	1058727	1058736	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27507	NC_011004	ACG	2	6	1058785	1058790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27508	NC_011004	GAT	2	6	1058795	1058800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289420
27509	NC_011004	GGCG	2	8	1058858	1058865	0 %	0 %	75 %	25 %	192289420
27510	NC_011004	GTG	2	6	1058871	1058876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289420
27511	NC_011004	CAG	2	6	1058877	1058882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289420
27512	NC_011004	CGGTG	2	10	1058939	1058948	0 %	20 %	60 %	20 %	192289420
27513	NC_011004	TCG	2	6	1058949	1058954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289420
27514	NC_011004	CG	3	6	1058984	1058989	0 %	0 %	50 %	50 %	192289420
27515	NC_011004	TGG	2	6	1058998	1059003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289420
27516	NC_011004	TGG	2	6	1059010	1059015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289420
27517	NC_011004	CGGCT	2	10	1059030	1059039	0 %	20 %	40 %	40 %	192289420
27518	NC_011004	CGC	2	6	1059047	1059052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289420
27519	NC_011004	CGA	2	6	1059071	1059076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289420
27520	NC_011004	CGC	2	6	1059086	1059091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289420
27521	NC_011004	GCG	2	6	1059096	1059101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289420
27522	NC_011004	TTC	3	9	1059132	1059140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289420
27523	NC_011004	TCG	2	6	1059187	1059192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289420
27524	NC_011004	GCCG	2	8	1059203	1059210	0 %	0 %	50 %	50 %	192289420
27525	NC_011004	CTGATC	2	12	1059243	1059254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192289420
27526	NC_011004	GGT	2	6	1059352	1059357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289420
27527	NC_011004	ACT	2	6	1059370	1059375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289420
27528	NC_011004	GGCT	2	8	1059390	1059397	0 %	25 %	50 %	25 %	192289420
27529	NC_011004	GCT	2	6	1059461	1059466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289420
27530	NC_011004	CCG	2	6	1059513	1059518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289420
27531	NC_011004	GAG	2	6	1059522	1059527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289420
27532	NC_011004	CG	3	6	1059541	1059546	0 %	0 %	50 %	50 %	192289420
27533	NC_011004	CGCCA	2	10	1059611	1059620	20 %	0 %	20 %	60 %	192289420
27534	NC_011004	CTCGC	2	10	1059629	1059638	0 %	20 %	20 %	60 %	192289421
27535	NC_011004	CCG	2	6	1059714	1059719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289421
27536	NC_011004	CGC	2	6	1059739	1059744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289421
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27538	NC_011004	GC	3	6	1059776	1059781	0 %	0 %	50 %	50 %	192289421
27539	NC_011004	CGG	2	6	1059831	1059836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289421
27540	NC_011004	CGGCTG	2	12	1059988	1059999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289421
27541	NC_011004	TCGCTG	2	12	1060004	1060015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289421
27542	NC_011004	GCG	2	6	1060105	1060110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289421
27543	NC_011004	TGA	2	6	1060113	1060118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289421
27544	NC_011004	CGT	2	6	1060126	1060131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289421
27545	NC_011004	GGT	2	6	1060177	1060182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289421
27546	NC_011004	ATG	2	6	1060205	1060210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289421
27547	NC_011004	TGA	2	6	1060224	1060229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289421
27548	NC_011004	GGCT	2	8	1060241	1060248	0 %	25 %	50 %	25 %	192289421
27549	NC_011004	CGGG	2	8	1060254	1060261	0 %	0 %	75 %	25 %	192289421
27550	NC_011004	TTC	2	6	1060265	1060270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289421
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27552	NC_011004	CGG	2	6	1060354	1060359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289421
27553	NC_011004	CGA	2	6	1060411	1060416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289421
27554	NC_011004	CGA	2	6	1060489	1060494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289421
27555	NC_011004	CGA	2	6	1060525	1060530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289421
27556	NC_011004	GCG	2	6	1060546	1060551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289421
27557	NC_011004	TTC	2	6	1060562	1060567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289421
27558	NC_011004	CGA	2	6	1060603	1060608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289421
27559	NC_011004	GTCA	2	8	1060616	1060623	25 %	25 %	25 %	25 %	192289421
27560	NC_011004	TGC	2	6	1060687	1060692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27561	NC_011004	GC	4	8	1060706	1060713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27562	NC_011004	CCT	2	6	1060725	1060730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27563	NC_011004	TAA	2	6	1060798	1060803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27564	NC_011004	CTT	2	6	1060829	1060834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27565	NC_011004	CGA	2	6	1060906	1060911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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27567	NC_011004	GTT	2	6	1060957	1060962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289422
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27570	NC_011004	GCG	2	6	1061089	1061094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289422
27571	NC_011004	CCG	2	6	1061158	1061163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27572	NC_011004	TTG	2	6	1061214	1061219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289423
27573	NC_011004	TGG	2	6	1061262	1061267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289423
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27578	NC_011004	GGC	2	6	1061361	1061366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289423
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27582	NC_011004	ATCGCC	2	12	1061701	1061712	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192289424
27583	NC_011004	TCG	2	6	1061731	1061736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289425
27584	NC_011004	GCCGC	2	10	1061741	1061750	0 %	0 %	40 %	60 %	192289425
27585	NC_011004	CCG	2	6	1061762	1061767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289425
27586	NC_011004	CCA	2	6	1061774	1061779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289425
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27588	NC_011004	CGA	2	6	1061789	1061794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289425
27589	NC_011004	CAG	2	6	1061832	1061837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289425
27590	NC_011004	G	6	6	1061847	1061852	0 %	0 %	100 %	0 %	192289425
27591	NC_011004	AGGT	2	8	1061941	1061948	25 %	25 %	50 %	0 %	192289425
27592	NC_011004	GCT	2	6	1061950	1061955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289425
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27595	NC_011004	TGA	3	9	1062044	1062052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289425
27596	NC_011004	GCC	2	6	1062055	1062060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289425
27597	NC_011004	CAG	3	9	1062117	1062125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289425
27598	NC_011004	TCCAT	2	10	1062200	1062209	20 %	40 %	0 %	40 %	192289425
27599	NC_011004	CG	4	8	1062210	1062217	0 %	0 %	50 %	50 %	192289425
27600	NC_011004	TGG	2	6	1062233	1062238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289425
27601	NC_011004	CCG	2	6	1062239	1062244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289425
27602	NC_011004	TTGCA	2	10	1062282	1062291	20 %	40 %	20 %	20 %	192289425
27603	NC_011004	CAT	2	6	1062298	1062303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27604	NC_011004	ATC	2	6	1062340	1062345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27605	NC_011004	TGC	2	6	1062392	1062397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289426
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27608	NC_011004	GCA	2	6	1062480	1062485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289426
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27614	NC_011004	GGC	2	6	1062731	1062736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289426
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