MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_011004	CGG	2	6	942887	942892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289312
24503	NC_011004	CTG	2	6	942904	942909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289312
24504	NC_011004	GGT	2	6	942936	942941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289312
24505	NC_011004	CGG	2	6	943005	943010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289312
24506	NC_011004	CAT	2	6	943107	943112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289312
24507	NC_011004	CGA	2	6	943122	943127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289312
24508	NC_011004	CTG	2	6	943180	943185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289312
24509	NC_011004	GCA	2	6	943212	943217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289312
24510	NC_011004	GTT	2	6	943264	943269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24511	NC_011004	GGC	2	6	943273	943278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24512	NC_011004	GA	3	6	943304	943309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24513	NC_011004	GAA	2	6	943339	943344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289313
24514	NC_011004	ACG	2	6	943361	943366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289313
24515	NC_011004	ACA	2	6	943385	943390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289313
24516	NC_011004	ATC	2	6	943435	943440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289313
24517	NC_011004	GGC	2	6	943446	943451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289313
24518	NC_011004	TGC	2	6	943469	943474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289313
24519	NC_011004	CGGT	2	8	943487	943494	0 %	25 %	50 %	25 %	192289313
24520	NC_011004	GAC	2	6	943519	943524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289313
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24522	NC_011004	GTC	2	6	943596	943601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289313
24523	NC_011004	GCCG	2	8	943602	943609	0 %	0 %	50 %	50 %	192289313
24524	NC_011004	GGC	2	6	943615	943620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289313
24525	NC_011004	CGG	2	6	943718	943723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289313
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24528	NC_011004	CATC	2	8	943941	943948	25 %	25 %	0 %	50 %	192289313
24529	NC_011004	GC	3	6	943970	943975	0 %	0 %	50 %	50 %	192289313
24530	NC_011004	CGGC	2	8	943976	943983	0 %	0 %	50 %	50 %	192289313
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24532	NC_011004	TCGA	2	8	944071	944078	25 %	25 %	25 %	25 %	192289313
24533	NC_011004	ACG	2	6	944123	944128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289313
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24537	NC_011004	CCGAT	2	10	944324	944333	20 %	20 %	20 %	40 %	192289313
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24541	NC_011004	GGC	2	6	944388	944393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289313
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24552	NC_011004	CGG	2	6	944748	944753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289313
24553	NC_011004	CGA	2	6	944754	944759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289313
24554	NC_011004	CTCG	2	8	944793	944800	0 %	25 %	25 %	50 %	192289313
24555	NC_011004	CCA	2	6	944816	944821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289313
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24558	NC_011004	CCGG	2	8	944999	945006	0 %	0 %	50 %	50 %	192289313
24559	NC_011004	TTC	2	6	945007	945012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289313
24560	NC_011004	TGC	2	6	945023	945028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289313
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24564	NC_011004	GCGA	2	8	945133	945140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24565	NC_011004	CG	3	6	945313	945318	0 %	0 %	50 %	50 %	192289314
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24597	NC_011004	CTCC	2	8	946527	946534	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24598	NC_011004	C	6	6	946533	946538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24599	NC_011004	AAC	3	9	946558	946566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24600	NC_011004	CGC	2	6	946567	946572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24601	NC_011004	GCT	2	6	946582	946587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24602	NC_011004	CCGACG	2	12	946637	946648	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192289315
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24606	NC_011004	GCGCCG	2	12	946799	946810	0 %	0 %	50 %	50 %	192289315
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24615	NC_011004	GATCA	2	10	947158	947167	40 %	20 %	20 %	20 %	192289315
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24857	NC_011004	ACA	2	6	956691	956696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24980	NC_011004	TCT	2	6	960871	960876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289329
24981	NC_011004	CGT	2	6	960878	960883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289329
24982	NC_011004	CGG	2	6	960932	960937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289329
24983	NC_011004	CGC	2	6	960938	960943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289329
24984	NC_011004	CCG	2	6	960954	960959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289329
24985	NC_011004	GTG	2	6	960960	960965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289329
24986	NC_011004	CTG	2	6	961008	961013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289329
24987	NC_011004	ATC	2	6	961020	961025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289329
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24993	NC_011004	GTC	2	6	961110	961115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289329
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24995	NC_011004	TGGCG	2	10	961217	961226	0 %	20 %	60 %	20 %	192289329
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24999	NC_011004	TGC	2	6	961390	961395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289329
25000	NC_011004	CGC	2	6	961440	961445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289330

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