MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_011004	GAT	2	6	925595	925600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289300
24003	NC_011004	GCC	2	6	925701	925706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289300
24004	NC_011004	GCT	2	6	925739	925744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289300
24005	NC_011004	CG	3	6	925754	925759	0 %	0 %	50 %	50 %	192289300
24006	NC_011004	TGC	2	6	925762	925767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289300
24007	NC_011004	GGC	2	6	925773	925778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289300
24008	NC_011004	GTG	2	6	925818	925823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289300
24009	NC_011004	GCGG	2	8	925865	925872	0 %	0 %	75 %	25 %	192289300
24010	NC_011004	CTG	2	6	925902	925907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289300
24011	NC_011004	TCG	2	6	925960	925965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289300
24012	NC_011004	GAG	2	6	925998	926003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24013	NC_011004	CGA	2	6	926009	926014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24014	NC_011004	TTCGT	2	10	926050	926059	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24015	NC_011004	CAAA	2	8	926080	926087	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24016	NC_011004	ACC	2	6	926150	926155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289301
24017	NC_011004	TGG	2	6	926208	926213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289301
24018	NC_011004	GCC	2	6	926227	926232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289301
24019	NC_011004	GGT	2	6	926242	926247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289301
24020	NC_011004	GCCGGC	2	12	926332	926343	0 %	0 %	50 %	50 %	192289301
24021	NC_011004	ACC	2	6	926350	926355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289301
24022	NC_011004	TGG	2	6	926358	926363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289301
24023	NC_011004	CGG	2	6	926427	926432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289301
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24025	NC_011004	TAG	2	6	926510	926515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289301
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24040	NC_011004	TGG	2	6	927120	927125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289301
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24042	NC_011004	CGAGC	2	10	927211	927220	20 %	0 %	40 %	40 %	192289301
24043	NC_011004	GCC	2	6	927241	927246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289301
24044	NC_011004	AGGT	2	8	927269	927276	25 %	25 %	50 %	0 %	192289301
24045	NC_011004	GCC	2	6	927292	927297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289301
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24050	NC_011004	GCCA	2	8	927451	927458	25 %	0 %	25 %	50 %	192289301
24051	NC_011004	ACG	2	6	927461	927466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289301
24052	NC_011004	GCG	2	6	927528	927533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24053	NC_011004	GTC	2	6	927538	927543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24054	NC_011004	GGC	2	6	927552	927557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24055	NC_011004	CCG	2	6	927563	927568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24056	NC_011004	ATTG	2	8	927586	927593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24057	NC_011004	GCG	2	6	927628	927633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24058	NC_011004	CGC	2	6	927655	927660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24059	NC_011004	TGC	2	6	927678	927683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24061	NC_011004	GA	3	6	927818	927823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24062	NC_011004	TCCG	2	8	927848	927855	0 %	25 %	25 %	50 %	192289302
24063	NC_011004	GGC	2	6	927865	927870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289302
24064	NC_011004	GAT	2	6	927880	927885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289302
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24087	NC_011004	CGC	2	6	928657	928662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289302
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24090	NC_011004	ACA	2	6	928797	928802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289302
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24092	NC_011004	GAC	2	6	928964	928969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289302
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24094	NC_011004	GGC	2	6	929152	929157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24095	NC_011004	CCG	2	6	929195	929200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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24097	NC_011004	CTG	2	6	929253	929258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289303
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24100	NC_011004	ATC	2	6	929308	929313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289303
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24103	NC_011004	CTGG	2	8	929388	929395	0 %	25 %	50 %	25 %	192289303
24104	NC_011004	TCC	2	6	929398	929403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289303
24105	NC_011004	TGG	2	6	929410	929415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289303
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24107	NC_011004	G	8	8	929495	929502	0 %	0 %	100 %	0 %	192289303
24108	NC_011004	CCT	2	6	929544	929549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289303
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24117	NC_011004	CGA	2	6	929837	929842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289303
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24119	NC_011004	GCG	2	6	929914	929919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289303
24120	NC_011004	CGA	2	6	930005	930010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289303
24121	NC_011004	GGGAGA	2	12	930059	930070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289303
24122	NC_011004	TCG	3	9	930097	930105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289303
24123	NC_011004	GCGCC	2	10	930112	930121	0 %	0 %	40 %	60 %	192289303
24124	NC_011004	GC	3	6	930177	930182	0 %	0 %	50 %	50 %	192289303
24125	NC_011004	ACG	2	6	930225	930230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289303
24126	NC_011004	ACG	2	6	930292	930297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289303
24127	NC_011004	GCTC	2	8	930325	930332	0 %	25 %	25 %	50 %	192289303
24128	NC_011004	GGC	2	6	930368	930373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289303
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24131	NC_011004	CGT	2	6	930400	930405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289303
24132	NC_011004	GTC	2	6	930444	930449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289303
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24137	NC_011004	CGC	2	6	930575	930580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289303
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24142	NC_011004	GAT	2	6	930693	930698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289303
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24144	NC_011004	CGA	2	6	930755	930760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289303
24145	NC_011004	TCG	2	6	930772	930777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289303
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24150	NC_011004	GCG	2	6	930955	930960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289303
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24153	NC_011004	GCGG	2	8	930985	930992	0 %	0 %	75 %	25 %	192289303
24154	NC_011004	CGG	2	6	931055	931060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289303
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24158	NC_011004	CG	3	6	931127	931132	0 %	0 %	50 %	50 %	192289303
24159	NC_011004	ACCT	2	8	931170	931177	25 %	25 %	0 %	50 %	192289303
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24161	NC_011004	GCCGG	2	10	931280	931289	0 %	0 %	60 %	40 %	192289303
24162	NC_011004	GCC	2	6	931320	931325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289303
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24209	NC_011004	CGC	2	6	932887	932892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289305
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24236	NC_011004	GCA	2	6	933726	933731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289305
24237	NC_011004	GAT	2	6	933775	933780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24238	NC_011004	CGCC	2	8	933856	933863	0 %	0 %	25 %	75 %	192289306
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24480	NC_011004	CGG	3	9	942157	942165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289311
24481	NC_011004	CG	3	6	942194	942199	0 %	0 %	50 %	50 %	192289311
24482	NC_011004	TCA	2	6	942232	942237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289311
24483	NC_011004	CGA	2	6	942259	942264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289311
24484	NC_011004	CGC	2	6	942266	942271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289311
24485	NC_011004	GCA	2	6	942319	942324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289311
24486	NC_011004	GTCG	2	8	942338	942345	0 %	25 %	50 %	25 %	192289311
24487	NC_011004	CG	3	6	942373	942378	0 %	0 %	50 %	50 %	192289311
24488	NC_011004	CGG	2	6	942391	942396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289311
24489	NC_011004	GTGCC	2	10	942423	942432	0 %	20 %	40 %	40 %	192289311
24490	NC_011004	CCGC	2	8	942466	942473	0 %	0 %	25 %	75 %	192289311
24491	NC_011004	GTATCC	2	12	942489	942500	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192289311
24492	NC_011004	GAT	2	6	942573	942578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24493	NC_011004	GCT	2	6	942586	942591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24494	NC_011004	TGC	2	6	942593	942598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24495	NC_011004	ATC	2	6	942610	942615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24496	NC_011004	GGA	2	6	942621	942626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24497	NC_011004	GC	3	6	942727	942732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24498	NC_011004	GAT	2	6	942763	942768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24499	NC_011004	CCGCC	2	10	942779	942788	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24500	NC_011004	TCG	2	6	942797	942802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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