MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_011004	GC	3	6	733205	733210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19002	NC_011004	ACG	2	6	733270	733275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289126
19003	NC_011004	GC	3	6	733322	733327	0 %	0 %	50 %	50 %	192289126
19004	NC_011004	CGG	2	6	733389	733394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289126
19005	NC_011004	GCC	2	6	733436	733441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289126
19006	NC_011004	TGC	2	6	733451	733456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289126
19007	NC_011004	T	6	6	733479	733484	0 %	100 %	0 %	0 %	192289126
19008	NC_011004	CGG	2	6	733530	733535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289126
19009	NC_011004	AGA	2	6	733538	733543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289126
19010	NC_011004	CGAT	2	8	733553	733560	25 %	25 %	25 %	25 %	192289126
19011	NC_011004	CCT	2	6	733579	733584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289127
19012	NC_011004	AGCG	2	8	733653	733660	25 %	0 %	50 %	25 %	192289127
19013	NC_011004	CGG	2	6	733661	733666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289127
19014	NC_011004	GGC	2	6	733703	733708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289127
19015	NC_011004	CAC	2	6	733733	733738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289127
19016	NC_011004	CCG	2	6	733749	733754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289127
19017	NC_011004	GGT	2	6	733781	733786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289127
19018	NC_011004	TCA	2	6	733872	733877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289128
19019	NC_011004	CGA	2	6	733903	733908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289128
19020	NC_011004	GAC	2	6	733910	733915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289128
19021	NC_011004	GAC	2	6	733934	733939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289128
19022	NC_011004	GGC	2	6	733944	733949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19023	NC_011004	GGA	3	9	733963	733971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289128
19024	NC_011004	CTG	2	6	733976	733981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289128
19025	NC_011004	GAT	2	6	734017	734022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289128
19026	NC_011004	CG	3	6	734089	734094	0 %	0 %	50 %	50 %	192289128
19027	NC_011004	GGC	2	6	734095	734100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19028	NC_011004	CGG	2	6	734125	734130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19029	NC_011004	GGC	2	6	734185	734190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19030	NC_011004	TGCGC	2	10	734242	734251	0 %	20 %	40 %	40 %	192289128
19031	NC_011004	CGG	2	6	734299	734304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19032	NC_011004	CGG	2	6	734317	734322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19033	NC_011004	GCTG	2	8	734329	734336	0 %	25 %	50 %	25 %	192289128
19034	NC_011004	CGG	2	6	734368	734373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19035	NC_011004	GCT	2	6	734406	734411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289128
19036	NC_011004	GCT	2	6	734539	734544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289128
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19038	NC_011004	GC	3	6	734575	734580	0 %	0 %	50 %	50 %	192289128
19039	NC_011004	GGC	2	6	734621	734626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19040	NC_011004	CGAGC	2	10	734644	734653	20 %	0 %	40 %	40 %	192289128
19041	NC_011004	CGGC	2	8	734658	734665	0 %	0 %	50 %	50 %	192289128
19042	NC_011004	ATCG	2	8	734722	734729	25 %	25 %	25 %	25 %	192289128
19043	NC_011004	CGG	2	6	734809	734814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19044	NC_011004	GCA	2	6	734835	734840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289128
19045	NC_011004	CGG	2	6	734842	734847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289128
19046	NC_011004	GGA	2	6	734887	734892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19047	NC_011004	GGC	2	6	734953	734958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289129
19048	NC_011004	AAG	2	6	735011	735016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289129
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19050	NC_011004	GCC	2	6	735122	735127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289129
19051	NC_011004	CTGC	2	8	735133	735140	0 %	25 %	25 %	50 %	192289129
19052	NC_011004	GGC	2	6	735170	735175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289129
19053	NC_011004	GTG	3	9	735182	735190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289129
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19055	NC_011004	CGC	2	6	735272	735277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289129
19056	NC_011004	GTCGGC	2	12	735278	735289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289129
19057	NC_011004	CGC	2	6	735378	735383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289130
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19060	NC_011004	CGT	2	6	735487	735492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289130
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19062	NC_011004	GC	3	6	735522	735527	0 %	0 %	50 %	50 %	192289130
19063	NC_011004	ATCGA	2	10	735532	735541	40 %	20 %	20 %	20 %	192289130
19064	NC_011004	TCG	2	6	735542	735547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289130
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19068	NC_011004	GCC	2	6	735747	735752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19069	NC_011004	GCG	3	9	735774	735782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19070	NC_011004	GCT	2	6	735842	735847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19071	NC_011004	CGGC	2	8	735856	735863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19072	NC_011004	CGC	2	6	735872	735877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19073	NC_011004	GCC	2	6	735895	735900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19074	NC_011004	GCA	2	6	735907	735912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19080	NC_011004	CGGT	2	8	736440	736447	0 %	25 %	50 %	25 %	192289131
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19085	NC_011004	GGC	2	6	736716	736721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19086	NC_011004	CCGGC	2	10	736737	736746	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19087	NC_011004	GCC	2	6	736763	736768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289132
19088	NC_011004	ACC	2	6	736806	736811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289132
19089	NC_011004	CTG	2	6	736859	736864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289132
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19092	NC_011004	GC	3	6	737056	737061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19093	NC_011004	TGC	2	6	737120	737125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289133
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19097	NC_011004	CCT	2	6	737333	737338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289133
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19102	NC_011004	GCT	2	6	737489	737494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289133
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19105	NC_011004	TCG	2	6	737578	737583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289133
19106	NC_011004	GGC	2	6	737586	737591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289133
19107	NC_011004	TGG	2	6	737626	737631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19108	NC_011004	GAA	2	6	737699	737704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289134
19109	NC_011004	GCC	2	6	737760	737765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289134
19110	NC_011004	CG	4	8	737770	737777	0 %	0 %	50 %	50 %	192289134
19111	NC_011004	GCCG	2	8	737818	737825	0 %	0 %	50 %	50 %	192289134
19112	NC_011004	TCG	2	6	737854	737859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289134
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19118	NC_011004	GCG	2	6	737993	737998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289134
19119	NC_011004	CG	3	6	737997	738002	0 %	0 %	50 %	50 %	192289134
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19121	NC_011004	GC	3	6	738142	738147	0 %	0 %	50 %	50 %	192289134
19122	NC_011004	CGG	2	6	738199	738204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289134
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19241	NC_011004	CGT	2	6	742732	742737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19243	NC_011004	GCG	2	6	742757	742762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19244	NC_011004	CGG	2	6	742815	742820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289137
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19479	NC_011004	CCG	2	6	751531	751536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289146
19480	NC_011004	CGA	2	6	751556	751561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289146
19481	NC_011004	CGTC	2	8	751570	751577	0 %	25 %	25 %	50 %	192289146
19482	NC_011004	TGC	2	6	751651	751656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289146
19483	NC_011004	TCC	2	6	751683	751688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289146
19484	NC_011004	TGACC	2	10	751838	751847	20 %	20 %	20 %	40 %	192289146
19485	NC_011004	GCT	2	6	751860	751865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289146
19486	NC_011004	CCG	2	6	751870	751875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289146
19487	NC_011004	CGT	2	6	751906	751911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289146
19488	NC_011004	GC	3	6	752006	752011	0 %	0 %	50 %	50 %	192289147
19489	NC_011004	CGGAG	2	10	752152	752161	20 %	0 %	60 %	20 %	192289147
19490	NC_011004	CGC	2	6	752164	752169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289147
19491	NC_011004	GTG	2	6	752174	752179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289147
19492	NC_011004	GTC	2	6	752209	752214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289147
19493	NC_011004	CGA	2	6	752217	752222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289147
19494	NC_011004	GACCA	2	10	752230	752239	40 %	0 %	20 %	40 %	192289147
19495	NC_011004	CG	4	8	752311	752318	0 %	0 %	50 %	50 %	192289147
19496	NC_011004	GCA	2	6	752346	752351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289147
19497	NC_011004	GCC	3	9	752431	752439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289147
19498	NC_011004	TGA	2	6	752508	752513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289147
19499	NC_011004	TGC	2	6	752545	752550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289147
19500	NC_011004	GCCG	2	8	752569	752576	0 %	0 %	50 %	50 %	192289147

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