MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_011004	CAGC	2	8	694431	694438	25 %	0 %	25 %	50 %	192289071
18002	NC_011004	GCCG	2	8	694477	694484	0 %	0 %	50 %	50 %	192289071
18003	NC_011004	AAG	2	6	694489	694494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289071
18004	NC_011004	CG	3	6	694519	694524	0 %	0 %	50 %	50 %	192289071
18005	NC_011004	GAACG	2	10	694543	694552	40 %	0 %	40 %	20 %	192289071
18006	NC_011004	TGC	2	6	694670	694675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289071
18007	NC_011004	TTGA	2	8	694775	694782	25 %	50 %	25 %	0 %	192289071
18008	NC_011004	GA	3	6	694865	694870	50 %	0 %	50 %	0 %	192289071
18009	NC_011004	CTG	2	6	694874	694879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289071
18010	NC_011004	CTT	2	6	694888	694893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289071
18011	NC_011004	CAG	2	6	694962	694967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289071
18012	NC_011004	AGG	2	6	695082	695087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_011004	TGGT	2	8	695088	695095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_011004	CGA	2	6	695100	695105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289072
18015	NC_011004	AG	3	6	695189	695194	50 %	0 %	50 %	0 %	192289072
18016	NC_011004	TGCA	2	8	695195	695202	25 %	25 %	25 %	25 %	192289072
18017	NC_011004	ACG	2	6	695213	695218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289072
18018	NC_011004	GCG	2	6	695230	695235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289072
18019	NC_011004	TCC	2	6	695298	695303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289072
18020	NC_011004	CGC	2	6	695316	695321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289072
18021	NC_011004	ACG	2	6	695359	695364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289072
18022	NC_011004	G	7	7	695379	695385	0 %	0 %	100 %	0 %	192289072
18023	NC_011004	CCG	2	6	695435	695440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289073
18024	NC_011004	TGG	2	6	695484	695489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289073
18025	NC_011004	GGC	2	6	695521	695526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289073
18026	NC_011004	CG	3	6	695542	695547	0 %	0 %	50 %	50 %	192289073
18027	NC_011004	GC	3	6	695606	695611	0 %	0 %	50 %	50 %	192289073
18028	NC_011004	GTG	2	6	695624	695629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289073
18029	NC_011004	CTC	2	6	695641	695646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289073
18030	NC_011004	TCC	2	6	695651	695656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289073
18031	NC_011004	TGAC	2	8	695659	695666	25 %	25 %	25 %	25 %	192289073
18032	NC_011004	CCG	2	6	695695	695700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18033	NC_011004	ACC	2	6	695766	695771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289074
18034	NC_011004	CGC	2	6	695804	695809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289074
18035	NC_011004	TGC	2	6	695839	695844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289074
18036	NC_011004	CGG	2	6	695894	695899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289074
18037	NC_011004	CAG	2	6	695919	695924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289074
18038	NC_011004	CGC	2	6	695954	695959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289074
18039	NC_011004	CGA	3	9	695969	695977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289074
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18041	NC_011004	CGGC	2	8	696108	696115	0 %	0 %	50 %	50 %	192289074
18042	NC_011004	GCT	2	6	696171	696176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289074
18043	NC_011004	TCGA	2	8	696231	696238	25 %	25 %	25 %	25 %	192289074
18044	NC_011004	GTG	2	6	696243	696248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289074
18045	NC_011004	GCT	2	6	696293	696298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289074
18046	NC_011004	GCGCG	2	10	696316	696325	0 %	0 %	60 %	40 %	192289074
18047	NC_011004	GCT	2	6	696347	696352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289074
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18051	NC_011004	CGC	3	9	696559	696567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289075
18052	NC_011004	CGAT	2	8	696578	696585	25 %	25 %	25 %	25 %	192289075
18053	NC_011004	GGT	2	6	696612	696617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289075
18054	NC_011004	GGA	2	6	696633	696638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289075
18055	NC_011004	GCGCG	2	10	696653	696662	0 %	0 %	60 %	40 %	192289075
18056	NC_011004	AGC	2	6	696734	696739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289075
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18059	NC_011004	GCT	2	6	696912	696917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289075
18060	NC_011004	AGCGCG	2	12	696920	696931	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192289075
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18062	NC_011004	CG	4	8	697016	697023	0 %	0 %	50 %	50 %	192289076
18063	NC_011004	GC	3	6	697066	697071	0 %	0 %	50 %	50 %	192289076
18064	NC_011004	GGT	2	6	697140	697145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289076
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18067	NC_011004	GC	3	6	697182	697187	0 %	0 %	50 %	50 %	192289076
18068	NC_011004	GCAGC	2	10	697248	697257	20 %	0 %	40 %	40 %	192289076
18069	NC_011004	GC	3	6	697277	697282	0 %	0 %	50 %	50 %	192289076
18070	NC_011004	GC	3	6	697299	697304	0 %	0 %	50 %	50 %	192289076
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18121	NC_011004	GA	3	6	699387	699392	50 %	0 %	50 %	0 %	192289077
18122	NC_011004	CGA	2	6	699437	699442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289077
18123	NC_011004	CGA	2	6	699496	699501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289077
18124	NC_011004	GCC	2	6	699507	699512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289077
18125	NC_011004	TCG	2	6	699519	699524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289077
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18129	NC_011004	GCC	2	6	699777	699782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289077
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18133	NC_011004	GCC	2	6	699932	699937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289077
18134	NC_011004	ATC	2	6	699975	699980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289078
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18150	NC_011004	CG	3	6	700694	700699	0 %	0 %	50 %	50 %	192289079
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18166	NC_011004	CGA	3	9	701241	701249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289080
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18185	NC_011004	GCCG	2	8	701739	701746	0 %	0 %	50 %	50 %	192289081
18186	NC_011004	GGCGA	2	10	701780	701789	20 %	0 %	60 %	20 %	192289081
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18201	NC_011004	CGT	2	6	702226	702231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289082
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18204	NC_011004	CCGCG	2	10	702308	702317	0 %	0 %	40 %	60 %	192289082
18205	NC_011004	CGA	3	9	702344	702352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289082
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18209	NC_011004	GC	3	6	702447	702452	0 %	0 %	50 %	50 %	192289082
18210	NC_011004	GGC	3	9	702476	702484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289082
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18213	NC_011004	CGG	2	6	702691	702696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18214	NC_011004	ATG	2	6	702726	702731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18216	NC_011004	TTC	2	6	702834	702839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18217	NC_011004	GAC	2	6	702873	702878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18220	NC_011004	CGC	2	6	703167	703172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289083
18221	NC_011004	CCG	2	6	703216	703221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289083
18222	NC_011004	CGA	2	6	703307	703312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289083
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18228	NC_011004	GTG	2	6	703459	703464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289084
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18231	NC_011004	TCGA	2	8	703572	703579	25 %	25 %	25 %	25 %	192289085
18232	NC_011004	CTG	2	6	703650	703655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289085
18233	NC_011004	CAG	2	6	703665	703670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289085
18234	NC_011004	GC	3	6	703675	703680	0 %	0 %	50 %	50 %	192289085
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18236	NC_011004	TCA	2	6	703789	703794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289086
18237	NC_011004	ATC	2	6	703820	703825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289086
18238	NC_011004	GCG	2	6	703831	703836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289086
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18240	NC_011004	CGC	2	6	703960	703965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289086
18241	NC_011004	CGG	2	6	703978	703983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289086
18242	NC_011004	TCC	2	6	703989	703994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289086
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18347	NC_011004	TCG	2	6	707809	707814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289092
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18356	NC_011004	TCG	2	6	708028	708033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289093
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18479	NC_011004	TC	3	6	712786	712791	0 %	50 %	0 %	50 %	192289101
18480	NC_011004	CGAGC	2	10	712792	712801	20 %	0 %	40 %	40 %	192289101
18481	NC_011004	GCG	2	6	712859	712864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289101
18482	NC_011004	GAA	2	6	712873	712878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289101
18483	NC_011004	CG	3	6	712882	712887	0 %	0 %	50 %	50 %	192289101
18484	NC_011004	GCG	2	6	712920	712925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289101
18485	NC_011004	TGA	2	6	712969	712974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289101
18486	NC_011004	CGATG	2	10	712993	713002	20 %	20 %	40 %	20 %	192289101
18487	NC_011004	GGA	2	6	713011	713016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289101
18488	NC_011004	GCT	2	6	713029	713034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289101
18489	NC_011004	CGA	2	6	713074	713079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289101
18490	NC_011004	CTG	2	6	713081	713086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289101
18491	NC_011004	GAT	2	6	713089	713094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289101
18492	NC_011004	GCC	2	6	713105	713110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289101
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18497	NC_011004	ACT	2	6	713282	713287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289102
18498	NC_011004	GGCG	2	8	713364	713371	0 %	0 %	75 %	25 %	192289102
18499	NC_011004	AGG	2	6	713402	713407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289102
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