MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_011004	TGC	2	6	655640	655645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289030
17002	NC_011004	GC	3	6	655644	655649	0 %	0 %	50 %	50 %	192289030
17003	NC_011004	GCAGC	2	10	655660	655669	20 %	0 %	40 %	40 %	192289030
17004	NC_011004	GGT	2	6	655675	655680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289030
17005	NC_011004	ACCGT	2	10	655697	655706	20 %	20 %	20 %	40 %	192289030
17006	NC_011004	GCG	2	6	655797	655802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289030
17007	NC_011004	T	6	6	655895	655900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_011004	CCGGC	2	10	655901	655910	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17009	NC_011004	GGC	2	6	656005	656010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289031
17010	NC_011004	GCT	2	6	656017	656022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289031
17011	NC_011004	CG	3	6	656050	656055	0 %	0 %	50 %	50 %	192289031
17012	NC_011004	GGC	2	6	656061	656066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289031
17013	NC_011004	CCCGGC	2	12	656209	656220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289031
17014	NC_011004	CCG	2	6	656248	656253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289031
17015	NC_011004	CCGCGC	2	12	656262	656273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289031
17016	NC_011004	ACG	2	6	656285	656290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289031
17017	NC_011004	GCCGAT	2	12	656392	656403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192289031
17018	NC_011004	CTG	2	6	656404	656409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289031
17019	NC_011004	GTGCCG	2	12	656410	656421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289031
17020	NC_011004	GC	3	6	656465	656470	0 %	0 %	50 %	50 %	192289031
17021	NC_011004	AGCG	2	8	656566	656573	25 %	0 %	50 %	25 %	192289031
17022	NC_011004	GCC	2	6	656575	656580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289031
17023	NC_011004	CGG	2	6	656635	656640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289031
17024	NC_011004	GAC	2	6	656653	656658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289031
17025	NC_011004	CG	3	6	656695	656700	0 %	0 %	50 %	50 %	192289031
17026	NC_011004	GGC	2	6	656715	656720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289031
17027	NC_011004	CG	3	6	656742	656747	0 %	0 %	50 %	50 %	192289031
17028	NC_011004	GCC	2	6	656872	656877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289032
17029	NC_011004	CTC	2	6	656884	656889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289032
17030	NC_011004	AAG	2	6	656896	656901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289032
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17032	NC_011004	GC	3	6	656961	656966	0 %	0 %	50 %	50 %	192289032
17033	NC_011004	CGG	2	6	657015	657020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289032
17034	NC_011004	TGA	2	6	657024	657029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289032
17035	NC_011004	GCT	2	6	657066	657071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289032
17036	NC_011004	CGA	2	6	657075	657080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289032
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17038	NC_011004	GCC	2	6	657117	657122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289033
17039	NC_011004	ATG	2	6	657240	657245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289033
17040	NC_011004	GAC	2	6	657288	657293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289033
17041	NC_011004	CATC	2	8	657338	657345	25 %	25 %	0 %	50 %	192289033
17042	NC_011004	GC	3	6	657368	657373	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
17043	NC_011004	CG	3	6	657597	657602	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
17044	NC_011004	CGT	2	6	657619	657624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289033
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17046	NC_011004	TGC	3	9	657679	657687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289033
17047	NC_011004	GC	3	6	657686	657691	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
17048	NC_011004	GCT	2	6	657709	657714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289033
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17051	NC_011004	GGC	2	6	657813	657818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289033
17052	NC_011004	GATC	2	8	657845	657852	25 %	25 %	25 %	25 %	192289033
17053	NC_011004	GC	3	6	657870	657875	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
17054	NC_011004	GCA	2	6	657893	657898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289033
17055	NC_011004	CGGC	2	8	657899	657906	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
17056	NC_011004	CCGGCC	2	12	657931	657942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289033
17057	NC_011004	CTGCG	2	10	657980	657989	0 %	20 %	40 %	40 %	192289034
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17059	NC_011004	TCG	2	6	658119	658124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289034
17060	NC_011004	GGCCGC	2	12	658133	658144	0 %	0 %	50 %	50 %	192289034
17061	NC_011004	GC	3	6	658143	658148	0 %	0 %	50 %	50 %	192289034
17062	NC_011004	GCC	2	6	658160	658165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289034
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17064	NC_011004	CGG	2	6	658188	658193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289034
17065	NC_011004	CGC	2	6	658218	658223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289034
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17069	NC_011004	CCGA	2	8	658382	658389	25 %	0 %	25 %	50 %	192289034
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17072	NC_011004	GC	3	6	658505	658510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17073	NC_011004	CGC	2	6	658534	658539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17074	NC_011004	GGC	2	6	658559	658564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17075	NC_011004	CG	3	6	658619	658624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17076	NC_011004	ACG	2	6	658632	658637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17086	NC_011004	CGGCC	2	10	658965	658974	0 %	0 %	40 %	60 %	192289035
17087	NC_011004	TGG	2	6	658979	658984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289035
17088	NC_011004	GTG	2	6	659005	659010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289035
17089	NC_011004	GGATCG	2	12	659066	659077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192289035
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17092	NC_011004	CG	3	6	659175	659180	0 %	0 %	50 %	50 %	192289036
17093	NC_011004	GCT	2	6	659190	659195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289036
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17100	NC_011004	CGG	2	6	659445	659450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289036
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17102	NC_011004	CGC	2	6	659484	659489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289036
17103	NC_011004	CCG	2	6	659499	659504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289036
17104	NC_011004	GCT	2	6	659516	659521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289036
17105	NC_011004	GCG	2	6	659522	659527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289036
17106	NC_011004	AGC	2	6	659537	659542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289036
17107	NC_011004	GCG	2	6	659570	659575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289036
17108	NC_011004	GAC	3	9	659593	659601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289036
17109	NC_011004	CCA	2	6	659625	659630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289036
17110	NC_011004	GGT	2	6	659710	659715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289036
17111	NC_011004	ACGA	2	8	659720	659727	50 %	0 %	25 %	25 %	192289036
17112	NC_011004	CGTT	2	8	659729	659736	0 %	50 %	25 %	25 %	192289036
17113	NC_011004	CAT	2	6	659749	659754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289036
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17115	NC_011004	GC	3	6	659778	659783	0 %	0 %	50 %	50 %	192289036
17116	NC_011004	AGC	3	9	659786	659794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289036
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17120	NC_011004	AGCG	2	8	659933	659940	25 %	0 %	50 %	25 %	192289036
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17238	NC_011004	GTC	2	6	664984	664989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17241	NC_011004	CGA	2	6	665181	665186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289040
17242	NC_011004	CGA	2	6	665199	665204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289040
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17320	NC_011004	GCG	2	6	668056	668061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289042
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17356	NC_011004	CG	3	6	669477	669482	0 %	0 %	50 %	50 %	192289044
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17358	NC_011004	GCT	2	6	669624	669629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289044
17359	NC_011004	CGA	2	6	669648	669653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289044
17360	NC_011004	CGC	2	6	669726	669731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289044
17361	NC_011004	CGA	2	6	669782	669787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289044
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17364	NC_011004	GTCG	2	8	669846	669853	0 %	25 %	50 %	25 %	192289044
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17377	NC_011004	GGA	2	6	670387	670392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17479	NC_011004	GC	3	6	674106	674111	0 %	0 %	50 %	50 %	192289049
17480	NC_011004	GCC	2	6	674124	674129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289049
17481	NC_011004	GTC	2	6	674172	674177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289049
17482	NC_011004	CCA	2	6	674293	674298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289049
17483	NC_011004	TGC	2	6	674335	674340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289049
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