MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_011004	CG	3	6	618017	618022	0 %	0 %	50 %	50 %	192288998
16002	NC_011004	CGC	2	6	618087	618092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288998
16003	NC_011004	CGGCGC	2	12	618094	618105	0 %	0 %	50 %	50 %	192288998
16004	NC_011004	CGA	2	6	618109	618114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288998
16005	NC_011004	TCG	2	6	618158	618163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288998
16006	NC_011004	CGGC	2	8	618242	618249	0 %	0 %	50 %	50 %	192288998
16007	NC_011004	ATG	2	6	618252	618257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288998
16008	NC_011004	GCG	2	6	618332	618337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288998
16009	NC_011004	CCG	2	6	618338	618343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288998
16010	NC_011004	CGGTG	2	10	618367	618376	0 %	20 %	60 %	20 %	192288998
16011	NC_011004	TGA	2	6	618405	618410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288998
16012	NC_011004	GGC	2	6	618415	618420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288998
16013	NC_011004	GTC	3	9	618458	618466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_011004	TCG	2	6	618571	618576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288999
16015	NC_011004	CGC	2	6	618587	618592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288999
16016	NC_011004	CGCCCA	2	12	618602	618613	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	192288999
16017	NC_011004	GTG	2	6	618637	618642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288999
16018	NC_011004	GTC	2	6	618681	618686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288999
16019	NC_011004	CGT	2	6	618704	618709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288999
16020	NC_011004	GTGGC	2	10	618712	618721	0 %	20 %	60 %	20 %	192288999
16021	NC_011004	CGA	2	6	618737	618742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288999
16022	NC_011004	CCGC	2	8	618743	618750	0 %	0 %	25 %	75 %	192288999
16023	NC_011004	CGT	2	6	618764	618769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288999
16024	NC_011004	CGT	2	6	618784	618789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288999
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16026	NC_011004	ATC	2	6	618951	618956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288999
16027	NC_011004	CG	4	8	619046	619053	0 %	0 %	50 %	50 %	192289000
16028	NC_011004	GTG	2	6	619154	619159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289000
16029	NC_011004	CAG	2	6	619177	619182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289000
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16031	NC_011004	AT	3	6	619334	619339	50 %	50 %	0 %	0 %	192289000
16032	NC_011004	CAG	2	6	619429	619434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289000
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16034	NC_011004	GGC	2	6	619469	619474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289000
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16042	NC_011004	TGC	2	6	619869	619874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289000
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16044	NC_011004	GCG	2	6	619889	619894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289000
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16049	NC_011004	G	6	6	620073	620078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_011004	AGC	2	6	620127	620132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_011004	GC	3	6	620131	620136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16052	NC_011004	TGG	2	6	620169	620174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_011004	CCGG	2	8	620216	620223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16054	NC_011004	GGC	2	6	620269	620274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_011004	CGT	2	6	620360	620365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289001
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16068	NC_011004	T	6	6	620783	620788	0 %	100 %	0 %	0 %	192289001
16069	NC_011004	CGC	2	6	620816	620821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289001
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16073	NC_011004	CGGC	2	8	621016	621023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16074	NC_011004	ACG	2	6	621079	621084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289002
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16081	NC_011004	GC	4	8	621223	621230	0 %	0 %	50 %	50 %	192289002
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16094	NC_011004	CG	3	6	621597	621602	0 %	0 %	50 %	50 %	192289002
16095	NC_011004	CGCC	2	8	621616	621623	0 %	0 %	25 %	75 %	192289002
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16102	NC_011004	CGC	4	12	621817	621828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289002
16103	NC_011004	GC	3	6	621827	621832	0 %	0 %	50 %	50 %	192289002
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16111	NC_011004	GAA	2	6	622213	622218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_011004	GCC	2	6	622222	622227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16113	NC_011004	CG	3	6	622337	622342	0 %	0 %	50 %	50 %	192289003
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16121	NC_011004	CGG	2	6	622688	622693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289003
16122	NC_011004	TGA	2	6	622706	622711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289003
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16127	NC_011004	TCG	2	6	622842	622847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16129	NC_011004	ATC	2	6	622902	622907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16234	NC_011004	GCC	2	6	626716	626721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16235	NC_011004	GACAC	2	10	626751	626760	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16236	NC_011004	CGCC	2	8	626789	626796	0 %	0 %	25 %	75 %	192289008
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16241	NC_011004	CGA	2	6	627025	627030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16242	NC_011004	GCT	2	6	627151	627156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16243	NC_011004	GCT	2	6	627190	627195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16244	NC_011004	GCC	2	6	627275	627280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289008
16245	NC_011004	CGA	2	6	627295	627300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16246	NC_011004	TGC	2	6	627324	627329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16247	NC_011004	GGC	2	6	627338	627343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289008
16248	NC_011004	CGGTGC	2	12	627375	627386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289008
16249	NC_011004	CGAA	2	8	627411	627418	50 %	0 %	25 %	25 %	192289008
16250	NC_011004	GGT	2	6	627452	627457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289008
16251	NC_011004	CGC	2	6	627470	627475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289008
16252	NC_011004	CAG	2	6	627483	627488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16253	NC_011004	AAC	2	6	627491	627496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289008
16254	NC_011004	TCA	2	6	627537	627542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289008
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16256	NC_011004	GGCGAC	2	12	627677	627688	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192289008
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16259	NC_011004	TGA	2	6	627861	627866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289008
16260	NC_011004	ACG	2	6	627882	627887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16261	NC_011004	TCG	2	6	627932	627937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16262	NC_011004	GT	3	6	627990	627995	0 %	50 %	50 %	0 %	192289008
16263	NC_011004	CGT	2	6	628050	628055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16264	NC_011004	CGA	2	6	628056	628061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289008
16265	NC_011004	GC	4	8	628073	628080	0 %	0 %	50 %	50 %	192289008
16266	NC_011004	TAC	2	6	628092	628097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16267	NC_011004	CGT	3	9	628099	628107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16268	NC_011004	TGA	2	6	628139	628144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16269	NC_011004	TGA	2	6	628177	628182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16270	NC_011004	AGT	2	6	628227	628232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16271	NC_011004	GAG	2	6	628233	628238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16272	NC_011004	GGC	2	6	628378	628383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16273	NC_011004	CTT	2	6	628407	628412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16274	NC_011004	TTC	2	6	628500	628505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289009
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16280	NC_011004	GGC	2	6	628676	628681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289009
16281	NC_011004	CCTG	2	8	628688	628695	0 %	25 %	25 %	50 %	192289009
16282	NC_011004	GC	3	6	628857	628862	0 %	0 %	50 %	50 %	192289009
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16286	NC_011004	GC	3	6	629324	629329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16287	NC_011004	TG	3	6	629330	629335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16288	NC_011004	GCG	2	6	629357	629362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16289	NC_011004	GA	3	6	629382	629387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16290	NC_011004	GGGGT	2	10	629388	629397	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16291	NC_011004	CTA	2	6	629424	629429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16292	NC_011004	ACG	2	6	629445	629450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16293	NC_011004	CCAT	2	8	629480	629487	25 %	25 %	0 %	50 %	192289010
16294	NC_011004	CGG	2	6	629528	629533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289010
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16301	NC_011004	CCG	3	9	629766	629774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289010
16302	NC_011004	CTT	2	6	629780	629785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289010
16303	NC_011004	GTC	2	6	629798	629803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289010
16304	NC_011004	CTGG	2	8	629870	629877	0 %	25 %	50 %	25 %	192289010
16305	NC_011004	GCCG	2	8	629888	629895	0 %	0 %	50 %	50 %	192289010
16306	NC_011004	CAT	2	6	629951	629956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289010
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16321	NC_011004	CGAC	2	8	630592	630599	25 %	0 %	25 %	50 %	192289010
16322	NC_011004	GATC	2	8	630610	630617	25 %	25 %	25 %	25 %	192289010
16323	NC_011004	CGA	2	6	630625	630630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289010
16324	NC_011004	ATC	2	6	630659	630664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289010
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16332	NC_011004	CGG	2	6	631209	631214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289010
16333	NC_011004	GGTA	2	8	631239	631246	25 %	25 %	50 %	0 %	192289010
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16339	NC_011004	CGG	2	6	631370	631375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289010
16340	NC_011004	GC	3	6	631381	631386	0 %	0 %	50 %	50 %	192289010
16341	NC_011004	GCTTGC	2	12	631501	631512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289010
16342	NC_011004	GC	3	6	631514	631519	0 %	0 %	50 %	50 %	192289010
16343	NC_011004	CCG	3	9	631521	631529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289010
16344	NC_011004	CTT	3	9	631544	631552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289010
16345	NC_011004	GTC	2	6	631559	631564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289010
16346	NC_011004	GCG	2	6	631585	631590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289010
16347	NC_011004	GCGA	2	8	631605	631612	25 %	0 %	50 %	25 %	192289010
16348	NC_011004	T	6	6	631652	631657	0 %	100 %	0 %	0 %	192289010
16349	NC_011004	CATCG	2	10	631670	631679	20 %	20 %	20 %	40 %	192289010
16350	NC_011004	CGAT	2	8	631813	631820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16351	NC_011004	GCG	2	6	631821	631826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16352	NC_011004	ATG	2	6	631852	631857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289011
16353	NC_011004	GGA	2	6	631878	631883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289011
16354	NC_011004	CTG	3	9	631894	631902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289011
16355	NC_011004	GATCCG	2	12	631944	631955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192289011
16356	NC_011004	CGA	2	6	631971	631976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289011
16357	NC_011004	GCT	2	6	632172	632177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16358	NC_011004	GCG	2	6	632214	632219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289012
16359	NC_011004	CAGC	2	8	632247	632254	25 %	0 %	25 %	50 %	192289012
16360	NC_011004	TCG	2	6	632302	632307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289012
16361	NC_011004	CTC	2	6	632310	632315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289012
16362	NC_011004	GCCG	2	8	632316	632323	0 %	0 %	50 %	50 %	192289012
16363	NC_011004	CGC	2	6	632331	632336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289012
16364	NC_011004	CTC	2	6	632361	632366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289012
16365	NC_011004	GCT	2	6	632369	632374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289012
16366	NC_011004	CCG	3	9	632421	632429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16367	NC_011004	CTGT	2	8	632499	632506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16368	NC_011004	CGGTTG	2	12	632614	632625	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16369	NC_011004	GCG	2	6	632699	632704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16370	NC_011004	CGC	2	6	632712	632717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289013
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16372	NC_011004	TCA	2	6	632768	632773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289013
16373	NC_011004	GCT	2	6	632780	632785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289013
16374	NC_011004	GTCG	2	8	632799	632806	0 %	25 %	50 %	25 %	192289013
16375	NC_011004	CGA	2	6	632846	632851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289013
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16379	NC_011004	CAG	2	6	632928	632933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289013
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16383	NC_011004	CTT	2	6	633183	633188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289013
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16410	NC_011004	TGCC	2	8	633967	633974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16411	NC_011004	CGT	2	6	634030	634035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16430	NC_011004	TTCC	2	8	635023	635030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16431	NC_011004	TCGA	2	8	635038	635045	25 %	25 %	25 %	25 %	192289016
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16477	NC_011004	CGC	2	6	636772	636777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289016
16478	NC_011004	CTG	2	6	636824	636829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289016
16479	NC_011004	AGC	2	6	636843	636848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289016
16480	NC_011004	GCA	2	6	636861	636866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289016
16481	NC_011004	GCT	2	6	636901	636906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289016
16482	NC_011004	CGGC	2	8	636962	636969	0 %	0 %	50 %	50 %	192289016
16483	NC_011004	GC	3	6	636996	637001	0 %	0 %	50 %	50 %	192289016
16484	NC_011004	CGATG	2	10	637027	637036	20 %	20 %	40 %	20 %	192289016
16485	NC_011004	GCT	3	9	637051	637059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289016
16486	NC_011004	TCGACC	2	12	637074	637085	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192289016
16487	NC_011004	GCG	2	6	637094	637099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289016
16488	NC_011004	ACG	2	6	637104	637109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289016
16489	NC_011004	GTGA	2	8	637142	637149	25 %	25 %	50 %	0 %	192289016
16490	NC_011004	TTC	2	6	637199	637204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289016
16491	NC_011004	ACC	2	6	637205	637210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289016
16492	NC_011004	CGGGCT	2	12	637231	637242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289016
16493	NC_011004	CGG	2	6	637273	637278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289016
16494	NC_011004	GAG	2	6	637298	637303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289016
16495	NC_011004	CAC	2	6	637312	637317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289016
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16497	NC_011004	GGCG	2	8	637394	637401	0 %	0 %	75 %	25 %	192289016
16498	NC_011004	TGG	3	9	637413	637421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289016
16499	NC_011004	GAC	2	6	637424	637429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289016
16500	NC_011004	TGA	2	6	637449	637454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289016

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