MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_011004	AGCG	2	8	599067	599074	25 %	0 %	50 %	25 %	192288978
15503	NC_011004	CG	3	6	599154	599159	0 %	0 %	50 %	50 %	192288978
15504	NC_011004	CGG	2	6	599192	599197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288978
15505	NC_011004	TCG	2	6	599272	599277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288978
15506	NC_011004	AAG	2	6	599295	599300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288978
15507	NC_011004	CGG	2	6	599313	599318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288978
15508	NC_011004	GC	3	6	599328	599333	0 %	0 %	50 %	50 %	192288978
15509	NC_011004	GCA	2	6	599360	599365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288978
15510	NC_011004	GCG	2	6	599366	599371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288978
15511	NC_011004	GCA	2	6	599372	599377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288978
15512	NC_011004	GTC	2	6	599388	599393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288978
15513	NC_011004	CATCC	2	10	599409	599418	20 %	20 %	0 %	60 %	192288978
15514	NC_011004	TCTG	2	8	599429	599436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15515	NC_011004	GAG	2	6	599541	599546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_011004	CGG	2	6	599555	599560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15517	NC_011004	TTC	2	6	599615	599620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288979
15518	NC_011004	TTC	2	6	599622	599627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288979
15519	NC_011004	TGG	2	6	599631	599636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288979
15520	NC_011004	CGC	2	6	599718	599723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288979
15521	NC_011004	ATC	2	6	599789	599794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288979
15522	NC_011004	TGC	3	9	599805	599813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288979
15523	NC_011004	GCT	2	6	599821	599826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288979
15524	NC_011004	CGGC	2	8	599850	599857	0 %	0 %	50 %	50 %	192288979
15525	NC_011004	CTG	2	6	599891	599896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288979
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15528	NC_011004	CTG	2	6	600098	600103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288979
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15530	NC_011004	CTG	2	6	600110	600115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288979
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15543	NC_011004	CGT	2	6	600511	600516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288979
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15553	NC_011004	CGTC	2	8	600870	600877	0 %	25 %	25 %	50 %	192288980
15554	NC_011004	CGC	2	6	600893	600898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288980
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15556	NC_011004	GCA	2	6	600996	601001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288980
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15585	NC_011004	GGGC	2	8	601959	601966	0 %	0 %	75 %	25 %	192288981
15586	NC_011004	GAC	2	6	601992	601997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15588	NC_011004	GGCGA	2	10	602074	602083	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15589	NC_011004	GC	3	6	602090	602095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15590	NC_011004	AGT	2	6	602121	602126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_011004	CG	4	8	602138	602145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15592	NC_011004	GAA	2	6	602165	602170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_011004	AGC	2	6	602176	602181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15594	NC_011004	GCCG	2	8	602221	602228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15595	NC_011004	GCG	2	6	602265	602270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15596	NC_011004	GCC	2	6	602334	602339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15601	NC_011004	CGCT	2	8	602446	602453	0 %	25 %	25 %	50 %	192288982
15602	NC_011004	CGG	2	6	602552	602557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_011004	GTT	2	6	602676	602681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288983
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15605	NC_011004	GTC	2	6	602689	602694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288983
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15608	NC_011004	CTG	2	6	602801	602806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288983
15609	NC_011004	CG	3	6	602852	602857	0 %	0 %	50 %	50 %	192288983
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15611	NC_011004	CGCCA	2	10	603016	603025	20 %	0 %	20 %	60 %	192288983
15612	NC_011004	GCG	2	6	603050	603055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288983
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15617	NC_011004	CTGA	2	8	603399	603406	25 %	25 %	25 %	25 %	192288983
15618	NC_011004	CGG	2	6	603434	603439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288983
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15621	NC_011004	CAG	2	6	603562	603567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_011004	GGT	2	6	603638	603643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288984
15623	NC_011004	GTC	3	9	603663	603671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288984
15624	NC_011004	TCA	2	6	603724	603729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288984
15625	NC_011004	CGT	3	9	603767	603775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288984
15626	NC_011004	TCG	2	6	603784	603789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288984
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15730	NC_011004	AGC	2	6	607682	607687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15733	NC_011004	GCA	2	6	607788	607793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15857	NC_011004	CGC	2	6	612484	612489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15859	NC_011004	TGCG	2	8	612605	612612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15860	NC_011004	CCG	3	9	612620	612628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15861	NC_011004	CGG	2	6	612647	612652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288993
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15981	NC_011004	ACG	2	6	617022	617027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288997
15982	NC_011004	CAG	2	6	617035	617040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288997
15983	NC_011004	GAT	2	6	617090	617095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15984	NC_011004	CGC	2	6	617100	617105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15985	NC_011004	GCGG	2	8	617137	617144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15986	NC_011004	GCA	2	6	617180	617185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15987	NC_011004	G	6	6	617298	617303	0 %	0 %	100 %	0 %	192288998
15988	NC_011004	TCGT	2	8	617375	617382	0 %	50 %	25 %	25 %	192288998
15989	NC_011004	TGG	2	6	617412	617417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288998
15990	NC_011004	GCC	3	9	617444	617452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288998
15991	NC_011004	CAA	2	6	617530	617535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288998
15992	NC_011004	GAC	2	6	617567	617572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288998
15993	NC_011004	CCA	2	6	617605	617610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288998
15994	NC_011004	GAT	2	6	617611	617616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288998
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15996	NC_011004	GATC	2	8	617641	617648	25 %	25 %	25 %	25 %	192288998
15997	NC_011004	GCGG	2	8	617678	617685	0 %	0 %	75 %	25 %	192288998
15998	NC_011004	GCT	2	6	617701	617706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288998
15999	NC_011004	GGT	2	6	617732	617737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288998
16000	NC_011004	CGC	2	6	617811	617816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288998

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