MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_011004	GAT	2	6	561396	561401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288944
14502	NC_011004	CGG	2	6	561406	561411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944
14503	NC_011004	TTC	2	6	561474	561479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288944
14504	NC_011004	GGC	2	6	561527	561532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944
14505	NC_011004	GCT	2	6	561533	561538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288944
14506	NC_011004	CGG	2	6	561632	561637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944
14507	NC_011004	GATC	2	8	561641	561648	25 %	25 %	25 %	25 %	192288944
14508	NC_011004	CGG	2	6	561659	561664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944
14509	NC_011004	GTCGA	2	10	561666	561675	20 %	20 %	40 %	20 %	192288944
14510	NC_011004	CG	3	6	561719	561724	0 %	0 %	50 %	50 %	192288944
14511	NC_011004	TCA	2	6	561763	561768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288944
14512	NC_011004	TGA	2	6	561775	561780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288944
14513	NC_011004	GAA	2	6	561831	561836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288944
14514	NC_011004	CAGC	2	8	561878	561885	25 %	0 %	25 %	50 %	192288944
14515	NC_011004	GC	3	6	561887	561892	0 %	0 %	50 %	50 %	192288944
14516	NC_011004	CGGCG	2	10	561893	561902	0 %	0 %	60 %	40 %	192288944
14517	NC_011004	CGGC	2	8	561907	561914	0 %	0 %	50 %	50 %	192288944
14518	NC_011004	GAG	2	6	561924	561929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288944
14519	NC_011004	GGCC	2	8	561959	561966	0 %	0 %	50 %	50 %	192288944
14520	NC_011004	GCT	2	6	562103	562108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288944
14521	NC_011004	GAA	2	6	562130	562135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288944
14522	NC_011004	CGC	2	6	562147	562152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288944
14523	NC_011004	GC	3	6	562151	562156	0 %	0 %	50 %	50 %	192288944
14524	NC_011004	GCCTC	2	10	562168	562177	0 %	20 %	20 %	60 %	192288944
14525	NC_011004	GGC	2	6	562178	562183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944
14526	NC_011004	GCC	2	6	562187	562192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288944
14527	NC_011004	GCCT	2	8	562311	562318	0 %	25 %	25 %	50 %	192288944
14528	NC_011004	CGA	2	6	562337	562342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288944
14529	NC_011004	CGG	2	6	562364	562369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944
14530	NC_011004	GCG	2	6	562402	562407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944
14531	NC_011004	GCG	2	6	562447	562452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944
14532	NC_011004	GCTGGC	2	12	562457	562468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288944
14533	NC_011004	GCGTCG	2	12	562477	562488	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288944
14534	NC_011004	AACT	2	8	562521	562528	50 %	25 %	0 %	25 %	192288944
14535	NC_011004	GC	3	6	562593	562598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14536	NC_011004	CG	4	8	562601	562608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14537	NC_011004	CGC	2	6	562638	562643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14538	NC_011004	GGC	2	6	562651	562656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_011004	GA	3	6	562690	562695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_011004	CCG	2	6	562729	562734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
14541	NC_011004	TTGC	2	8	562745	562752	0 %	50 %	25 %	25 %	192288945
14542	NC_011004	GCC	2	6	562758	562763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
14543	NC_011004	GAT	3	9	562775	562783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
14544	NC_011004	CCG	2	6	562795	562800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
14545	NC_011004	CGG	2	6	562801	562806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288945
14546	NC_011004	GAT	2	6	562844	562849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
14547	NC_011004	CAT	2	6	562877	562882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288945
14548	NC_011004	GGT	3	9	562892	562900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288945
14549	NC_011004	GATC	2	8	562906	562913	25 %	25 %	25 %	25 %	192288945
14550	NC_011004	GTT	2	6	562943	562948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288945
14551	NC_011004	GTG	3	9	562986	562994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288945
14552	NC_011004	CGA	2	6	562997	563002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
14553	NC_011004	CAC	2	6	563015	563020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288945
14554	NC_011004	CCGA	2	8	563028	563035	25 %	0 %	25 %	50 %	192288945
14555	NC_011004	CCGAAG	2	12	563139	563150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
14556	NC_011004	GAT	2	6	563156	563161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
14557	NC_011004	CAC	3	9	563168	563176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288945
14558	NC_011004	TCA	2	6	563209	563214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288945
14559	NC_011004	CGA	2	6	563290	563295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
14560	NC_011004	TCA	2	6	563296	563301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288945
14561	NC_011004	CG	3	6	563323	563328	0 %	0 %	50 %	50 %	192288945
14562	NC_011004	CAG	3	9	563333	563341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
14563	NC_011004	CGG	2	6	563344	563349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288945
14564	NC_011004	CGA	2	6	563387	563392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
14565	NC_011004	TGG	2	6	563401	563406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288945
14566	NC_011004	AGAAC	2	10	563407	563416	60 %	0 %	20 %	20 %	192288945
14567	NC_011004	CGC	2	6	563443	563448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
14568	NC_011004	CGA	2	6	563449	563454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
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14570	NC_011004	GAA	2	6	563516	563521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288945
14571	NC_011004	GTA	2	6	563522	563527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
14572	NC_011004	ACC	2	6	563535	563540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288945
14573	NC_011004	GAT	3	9	563555	563563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
14574	NC_011004	CGC	2	6	563593	563598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
14575	NC_011004	GAA	2	6	563744	563749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288945
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14577	NC_011004	CGAG	2	8	563788	563795	25 %	0 %	50 %	25 %	192288945
14578	NC_011004	CAT	2	6	563813	563818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288945
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14580	NC_011004	GCG	2	6	563907	563912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288945
14581	NC_011004	AGC	2	6	563928	563933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
14582	NC_011004	ACC	2	6	563940	563945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288945
14583	NC_011004	GAT	2	6	564008	564013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
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14585	NC_011004	CGA	2	6	564079	564084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
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14588	NC_011004	CGCC	2	8	564259	564266	0 %	0 %	25 %	75 %	192288945
14589	NC_011004	GCG	2	6	564297	564302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288946
14590	NC_011004	GGCC	2	8	564319	564326	0 %	0 %	50 %	50 %	192288946
14591	NC_011004	AACG	2	8	564327	564334	50 %	0 %	25 %	25 %	192288946
14592	NC_011004	GGT	2	6	564337	564342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288946
14593	NC_011004	ATC	2	6	564390	564395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288946
14594	NC_011004	TCG	2	6	564405	564410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
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14596	NC_011004	GCA	2	6	564475	564480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
14597	NC_011004	GC	3	6	564490	564495	0 %	0 %	50 %	50 %	192288946
14598	NC_011004	CGA	2	6	564512	564517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
14599	NC_011004	TGA	2	6	564534	564539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288946
14600	NC_011004	GTG	2	6	564633	564638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288946
14601	NC_011004	CGG	2	6	564664	564669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288946
14602	NC_011004	CGA	2	6	564670	564675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
14603	NC_011004	TGT	2	6	564691	564696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288946
14604	NC_011004	CGT	2	6	564760	564765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
14605	NC_011004	GCC	2	6	564771	564776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288946
14606	NC_011004	CTG	3	9	564851	564859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
14607	NC_011004	AGCTGC	2	12	564867	564878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288946
14608	NC_011004	GCG	2	6	564897	564902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288946
14609	NC_011004	GTCGAG	2	12	564911	564922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288946
14610	NC_011004	GCT	2	6	564973	564978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
14611	NC_011004	GGCCTG	2	12	565076	565087	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288946
14612	NC_011004	GATC	2	8	565114	565121	25 %	25 %	25 %	25 %	192288946
14613	NC_011004	CCTT	2	8	565155	565162	0 %	50 %	0 %	50 %	192288946
14614	NC_011004	CGA	2	6	565174	565179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
14615	NC_011004	CGT	2	6	565231	565236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
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14617	NC_011004	GCC	2	6	565253	565258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288946
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14735	NC_011004	CCGCG	2	10	569785	569794	0 %	0 %	40 %	60 %	192288951
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14980	NC_011004	ATC	2	6	578643	578648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288960
14981	NC_011004	TGG	3	9	578661	578669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288960
14982	NC_011004	GCG	2	6	578681	578686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288960
14983	NC_011004	ACC	2	6	578723	578728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288960
14984	NC_011004	TGG	2	6	578741	578746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288960
14985	NC_011004	TCG	2	6	578799	578804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288960
14986	NC_011004	TGA	2	6	578836	578841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288960
14987	NC_011004	CGA	2	6	578893	578898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288960
14988	NC_011004	GC	4	8	578932	578939	0 %	0 %	50 %	50 %	192288960
14989	NC_011004	CG	3	6	579005	579010	0 %	0 %	50 %	50 %	192288960
14990	NC_011004	TGAT	2	8	579024	579031	25 %	50 %	25 %	0 %	192288960
14991	NC_011004	GC	3	6	579035	579040	0 %	0 %	50 %	50 %	192288960
14992	NC_011004	GAC	2	6	579077	579082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288960
14993	NC_011004	GGC	2	6	579129	579134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288960
14994	NC_011004	CAG	2	6	579152	579157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288960
14995	NC_011004	CGC	2	6	579172	579177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288960
14996	NC_011004	GC	3	6	579188	579193	0 %	0 %	50 %	50 %	192288960
14997	NC_011004	GA	3	6	579225	579230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14998	NC_011004	GGCC	2	8	579253	579260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14999	NC_011004	GTC	2	6	579282	579287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15000	NC_011004	AGC	2	6	579331	579336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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