MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
146001	NC_011004	GC	3	6	5649633	5649638	0 %	0 %	50 %	50 %	192293597
146002	NC_011004	GTG	2	6	5649647	5649652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293597
146003	NC_011004	TGG	2	6	5649654	5649659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293597
146004	NC_011004	CGTA	2	8	5649703	5649710	25 %	25 %	25 %	25 %	192293597
146005	NC_011004	TGG	2	6	5649739	5649744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293597
146006	NC_011004	CCG	2	6	5649748	5649753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293597
146007	NC_011004	CTG	2	6	5649758	5649763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293597
146008	NC_011004	CG	3	6	5649814	5649819	0 %	0 %	50 %	50 %	192293597
146009	NC_011004	GAT	2	6	5649824	5649829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293597
146010	NC_011004	GTC	3	9	5649851	5649859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293597
146011	NC_011004	GGT	2	6	5649896	5649901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146012	NC_011004	GCGTG	2	10	5650044	5650053	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146013	NC_011004	CGGC	2	8	5650083	5650090	0 %	0 %	50 %	50 %	192293598
146014	NC_011004	CGCGG	2	10	5650123	5650132	0 %	0 %	60 %	40 %	192293598
146015	NC_011004	CGAT	2	8	5650158	5650165	25 %	25 %	25 %	25 %	192293598
146016	NC_011004	CGAGG	2	10	5650174	5650183	20 %	0 %	60 %	20 %	192293598
146017	NC_011004	ACGGC	3	15	5650217	5650231	20 %	0 %	40 %	40 %	192293598
146018	NC_011004	CGAGCG	2	12	5650281	5650292	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192293598
146019	NC_011004	GC	3	6	5650311	5650316	0 %	0 %	50 %	50 %	192293598
146020	NC_011004	TCA	2	6	5650344	5650349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293598
146021	NC_011004	GCC	2	6	5650403	5650408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293598
146022	NC_011004	TGG	2	6	5650416	5650421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293598
146023	NC_011004	CACGGC	2	12	5650538	5650549	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192293598
146024	NC_011004	TTCGG	2	10	5650640	5650649	0 %	40 %	40 %	20 %	192293598
146025	NC_011004	GC	3	6	5650653	5650658	0 %	0 %	50 %	50 %	192293598
146026	NC_011004	GCT	2	6	5650732	5650737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293598
146027	NC_011004	CGC	2	6	5650777	5650782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293598
146028	NC_011004	TGC	2	6	5650848	5650853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293598
146029	NC_011004	CGAC	2	8	5650923	5650930	25 %	0 %	25 %	50 %	192293598
146030	NC_011004	GC	3	6	5650942	5650947	0 %	0 %	50 %	50 %	192293598
146031	NC_011004	GCTC	2	8	5650977	5650984	0 %	25 %	25 %	50 %	192293598
146032	NC_011004	CCGA	2	8	5650988	5650995	25 %	0 %	25 %	50 %	192293598
146033	NC_011004	CGG	2	6	5650996	5651001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293598
146034	NC_011004	TCG	2	6	5651087	5651092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293598
146035	NC_011004	ACA	2	6	5651103	5651108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293598
146036	NC_011004	CGA	2	6	5651125	5651130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293598
146037	NC_011004	CGC	2	6	5651165	5651170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293598
146038	NC_011004	CAA	2	6	5651281	5651286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293598
146039	NC_011004	CGA	2	6	5651323	5651328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293598
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146041	NC_011004	T	6	6	5651416	5651421	0 %	100 %	0 %	0 %	192293598
146042	NC_011004	CCGG	2	8	5651424	5651431	0 %	0 %	50 %	50 %	192293598
146043	NC_011004	AC	3	6	5651442	5651447	50 %	0 %	0 %	50 %	192293598
146044	NC_011004	CGG	2	6	5651469	5651474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293598
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146048	NC_011004	CTCG	2	8	5651692	5651699	0 %	25 %	25 %	50 %	192293598
146049	NC_011004	TCGATT	2	12	5651712	5651723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	192293598
146050	NC_011004	GCT	2	6	5651728	5651733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293598
146051	NC_011004	TCG	2	6	5651736	5651741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293598
146052	NC_011004	CAC	2	6	5651752	5651757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293598
146053	NC_011004	GCCG	2	8	5651766	5651773	0 %	0 %	50 %	50 %	192293598
146054	NC_011004	GCC	2	6	5651775	5651780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293598
146055	NC_011004	GCGTCG	2	12	5651781	5651792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192293598
146056	NC_011004	CCAG	2	8	5651799	5651806	25 %	0 %	25 %	50 %	192293598
146057	NC_011004	CTGG	2	8	5651821	5651828	0 %	25 %	50 %	25 %	192293598
146058	NC_011004	CCGG	2	8	5651879	5651886	0 %	0 %	50 %	50 %	192293598
146059	NC_011004	AGC	2	6	5651943	5651948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293598
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146061	NC_011004	GAC	2	6	5652005	5652010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293598
146062	NC_011004	GTC	2	6	5652025	5652030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293598
146063	NC_011004	TAC	3	9	5652131	5652139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293598
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146065	NC_011004	CGTT	2	8	5652273	5652280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146066	NC_011004	ACG	2	6	5652317	5652322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146067	NC_011004	CG	3	6	5652325	5652330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146068	NC_011004	CG	3	6	5652349	5652354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146069	NC_011004	TCAG	2	8	5652460	5652467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146070	NC_011004	CCT	2	6	5652526	5652531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146071	NC_011004	GTT	2	6	5652535	5652540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146072	NC_011004	AG	3	6	5652549	5652554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146073	NC_011004	ACGA	2	8	5652558	5652565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146074	NC_011004	TTC	2	6	5652566	5652571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146075	NC_011004	TCGA	2	8	5652750	5652757	25 %	25 %	25 %	25 %	192293599
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146083	NC_011004	TAC	2	6	5652987	5652992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293599
146084	NC_011004	CG	3	6	5653040	5653045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146085	NC_011004	TCC	2	6	5653067	5653072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293600
146086	NC_011004	CGA	2	6	5653083	5653088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293600
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146096	NC_011004	TTC	2	6	5653526	5653531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293600
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146099	NC_011004	GCCG	2	8	5653720	5653727	0 %	0 %	50 %	50 %	192293600
146100	NC_011004	CGAT	2	8	5653745	5653752	25 %	25 %	25 %	25 %	192293600
146101	NC_011004	CAG	2	6	5653789	5653794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293600
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146103	NC_011004	GCTCC	2	10	5653827	5653836	0 %	20 %	20 %	60 %	192293600
146104	NC_011004	AGAT	2	8	5653865	5653872	50 %	25 %	25 %	0 %	192293600
146105	NC_011004	CAG	2	6	5653882	5653887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293600
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146107	NC_011004	TCG	2	6	5653901	5653906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293600
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146111	NC_011004	GTC	2	6	5654035	5654040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293600
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146116	NC_011004	TCG	2	6	5654244	5654249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293600
146117	NC_011004	CCG	2	6	5654255	5654260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293600
146118	NC_011004	CGA	2	6	5654311	5654316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293600
146119	NC_011004	CGA	2	6	5654325	5654330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293600
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146155	NC_011004	T	6	6	5655937	5655942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146347	NC_011004	GGA	2	6	5662998	5663003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146348	NC_011004	GTG	2	6	5663024	5663029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146349	NC_011004	GCCG	2	8	5663036	5663043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146350	NC_011004	T	7	7	5663123	5663129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146383	NC_011004	CGT	2	6	5664454	5664459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146384	NC_011004	CGA	2	6	5664480	5664485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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146454	NC_011004	GCA	3	9	5667023	5667031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293611
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146457	NC_011004	CGC	3	9	5667201	5667209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293611
146458	NC_011004	ACG	2	6	5667211	5667216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293611
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