MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
144501	NC_011004	AGC	2	6	5594669	5594674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144502	NC_011004	CGA	2	6	5594813	5594818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293551
144503	NC_011004	TCG	2	6	5594872	5594877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293551
144504	NC_011004	GCGCC	2	10	5594958	5594967	0 %	0 %	40 %	60 %	192293551
144505	NC_011004	AGCGT	2	10	5594974	5594983	20 %	20 %	40 %	20 %	192293551
144506	NC_011004	AGA	2	6	5595047	5595052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293551
144507	NC_011004	CGA	2	6	5595066	5595071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293551
144508	NC_011004	AGC	2	6	5595131	5595136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293551
144509	NC_011004	GCGCCA	2	12	5595152	5595163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192293551
144510	NC_011004	GCCT	2	8	5595184	5595191	0 %	25 %	25 %	50 %	192293551
144511	NC_011004	TTC	2	6	5595199	5595204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293551
144512	NC_011004	GGC	2	6	5595332	5595337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293551
144513	NC_011004	GCC	2	6	5595361	5595366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293551
144514	NC_011004	CG	4	8	5595447	5595454	0 %	0 %	50 %	50 %	192293551
144515	NC_011004	CAGAT	2	10	5595484	5595493	40 %	20 %	20 %	20 %	192293551
144516	NC_011004	CCA	2	6	5595572	5595577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293551
144517	NC_011004	GCC	2	6	5595610	5595615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293551
144518	NC_011004	CCG	2	6	5595633	5595638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293551
144519	NC_011004	CGA	2	6	5595722	5595727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293551
144520	NC_011004	GC	3	6	5595734	5595739	0 %	0 %	50 %	50 %	192293551
144521	NC_011004	TCG	2	6	5595766	5595771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293551
144522	NC_011004	CAGC	2	8	5595813	5595820	25 %	0 %	25 %	50 %	192293551
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144526	NC_011004	CGGC	2	8	5595928	5595935	0 %	0 %	50 %	50 %	192293551
144527	NC_011004	CGG	2	6	5595945	5595950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293551
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144532	NC_011004	GCT	2	6	5596046	5596051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293551
144533	NC_011004	GC	3	6	5596128	5596133	0 %	0 %	50 %	50 %	192293551
144534	NC_011004	CGCGAT	2	12	5596175	5596186	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293551
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144537	NC_011004	GC	3	6	5596317	5596322	0 %	0 %	50 %	50 %	192293551
144538	NC_011004	CG	3	6	5596328	5596333	0 %	0 %	50 %	50 %	192293551
144539	NC_011004	CGA	2	6	5596349	5596354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293551
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144542	NC_011004	AGC	2	6	5596423	5596428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293551
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144545	NC_011004	CGAT	2	8	5596538	5596545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144546	NC_011004	CGG	2	6	5596685	5596690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144547	NC_011004	CGGG	2	8	5596697	5596704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144548	NC_011004	CCA	2	6	5596734	5596739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293552
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144550	NC_011004	GC	3	6	5596832	5596837	0 %	0 %	50 %	50 %	192293552
144551	NC_011004	GCC	2	6	5596861	5596866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293552
144552	NC_011004	GC	3	6	5596869	5596874	0 %	0 %	50 %	50 %	192293552
144553	NC_011004	CGA	2	6	5596878	5596883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293552
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144598	NC_011004	AGAGA	2	10	5598337	5598346	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144599	NC_011004	CGT	2	6	5598374	5598379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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144603	NC_011004	CAC	2	6	5598540	5598545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293554
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144613	NC_011004	CAG	2	6	5599047	5599052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293554
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