MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011004	CTG	2	6	541320	541325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14002	NC_011004	GGCG	2	8	541358	541365	0 %	0 %	75 %	25 %	192288927
14003	NC_011004	TCG	2	6	541423	541428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14004	NC_011004	CGG	2	6	541445	541450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288927
14005	NC_011004	CGA	2	6	541451	541456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14006	NC_011004	TCG	2	6	541459	541464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14007	NC_011004	CG	3	6	541496	541501	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
14008	NC_011004	TCG	2	6	541570	541575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14009	NC_011004	TCG	2	6	541627	541632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14010	NC_011004	TCG	2	6	541747	541752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14011	NC_011004	ATC	2	6	541767	541772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288927
14012	NC_011004	GCC	2	6	541886	541891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
14013	NC_011004	GCC	2	6	541912	541917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
14014	NC_011004	GCG	2	6	541922	541927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288927
14015	NC_011004	GCG	2	6	541976	541981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288927
14016	NC_011004	CG	3	6	541986	541991	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
14017	NC_011004	TCG	2	6	542002	542007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14018	NC_011004	TCG	2	6	542029	542034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
14019	NC_011004	CGCC	2	8	542060	542067	0 %	0 %	25 %	75 %	192288927
14020	NC_011004	CCG	2	6	542070	542075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
14021	NC_011004	CG	3	6	542074	542079	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
14022	NC_011004	CG	3	6	542093	542098	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
14023	NC_011004	CGC	2	6	542120	542125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
14024	NC_011004	GC	3	6	542244	542249	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
14025	NC_011004	GC	3	6	542335	542340	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
14026	NC_011004	GC	3	6	542356	542361	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
14027	NC_011004	TCGG	2	8	542371	542378	0 %	25 %	50 %	25 %	192288927
14028	NC_011004	CTTC	2	8	542381	542388	0 %	50 %	0 %	50 %	192288927
14029	NC_011004	GTG	2	6	542416	542421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288927
14030	NC_011004	CGA	2	6	542677	542682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288928
14031	NC_011004	CGA	2	6	542689	542694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288928
14032	NC_011004	TGT	2	6	542758	542763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288928
14033	NC_011004	CTT	2	6	542789	542794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288928
14034	NC_011004	AGC	2	6	542885	542890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288929
14035	NC_011004	CCA	2	6	542906	542911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288929
14036	NC_011004	TCG	2	6	542926	542931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
14037	NC_011004	TTG	2	6	542935	542940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288929
14038	NC_011004	TCA	2	6	543020	543025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288929
14039	NC_011004	TTG	2	6	543085	543090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288929
14040	NC_011004	CTTGGC	2	12	543123	543134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
14041	NC_011004	GAT	2	6	543138	543143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288929
14042	NC_011004	TCG	2	6	543154	543159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
14043	NC_011004	GTG	2	6	543178	543183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288929
14044	NC_011004	CTG	2	6	543219	543224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
14045	NC_011004	TGA	2	6	543305	543310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288929
14046	NC_011004	AGC	2	6	543325	543330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288929
14047	NC_011004	GCCG	2	8	543335	543342	0 %	0 %	50 %	50 %	192288929
14048	NC_011004	CGGC	2	8	543385	543392	0 %	0 %	50 %	50 %	192288929
14049	NC_011004	TCG	2	6	543400	543405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
14050	NC_011004	CA	3	6	543546	543551	50 %	0 %	0 %	50 %	192288929
14051	NC_011004	CGC	2	6	543567	543572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288929
14052	NC_011004	TG	3	6	543584	543589	0 %	50 %	50 %	0 %	192288929
14053	NC_011004	GTG	2	6	543664	543669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288929
14054	NC_011004	GGT	2	6	543813	543818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288929
14055	NC_011004	GCG	2	6	543823	543828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288929
14056	NC_011004	TCA	2	6	543830	543835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288929
14057	NC_011004	TCC	2	6	543837	543842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_011004	TGG	2	6	543877	543882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_011004	AG	3	6	543912	543917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_011004	CGC	2	6	543936	543941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14061	NC_011004	CCGA	2	8	544081	544088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14062	NC_011004	GAG	2	6	544096	544101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_011004	CGC	2	6	544145	544150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288930
14064	NC_011004	GGC	2	6	544187	544192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288930
14065	NC_011004	GCT	2	6	544193	544198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288930
14066	NC_011004	GGT	2	6	544211	544216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288930
14067	NC_011004	CTGG	2	8	544287	544294	0 %	25 %	50 %	25 %	192288930
14068	NC_011004	GC	3	6	544318	544323	0 %	0 %	50 %	50 %	192288930
14069	NC_011004	GCG	2	6	544338	544343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288930
14070	NC_011004	CG	3	6	544359	544364	0 %	0 %	50 %	50 %	192288930
14071	NC_011004	GCA	2	6	544369	544374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288930
14072	NC_011004	TTC	2	6	544431	544436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288930
14073	NC_011004	GTT	2	6	544460	544465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288930
14074	NC_011004	CCG	2	6	544479	544484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288930
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14077	NC_011004	TTC	2	6	544539	544544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288930
14078	NC_011004	CTG	2	6	544566	544571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288930
14079	NC_011004	TGC	2	6	544588	544593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288930
14080	NC_011004	CAC	2	6	544641	544646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288930
14081	NC_011004	GCT	3	9	544679	544687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288930
14082	NC_011004	TCAA	2	8	544733	544740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14083	NC_011004	ACG	2	6	544746	544751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_011004	GCC	2	6	544781	544786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14085	NC_011004	CAC	2	6	544804	544809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288931
14086	NC_011004	TGA	2	6	544833	544838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288931
14087	NC_011004	CGC	2	6	544869	544874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288931
14088	NC_011004	TGC	2	6	544892	544897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288931
14089	NC_011004	GC	4	8	545006	545013	0 %	0 %	50 %	50 %	192288931
14090	NC_011004	TCG	2	6	545015	545020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288931
14091	NC_011004	CGC	2	6	545039	545044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288931
14092	NC_011004	CGG	2	6	545045	545050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288931
14093	NC_011004	CGG	2	6	545085	545090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288931
14094	NC_011004	GAA	2	6	545218	545223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288931
14095	NC_011004	GC	3	6	545301	545306	0 %	0 %	50 %	50 %	192288931
14096	NC_011004	GCG	2	6	545312	545317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288931
14097	NC_011004	CG	3	6	545370	545375	0 %	0 %	50 %	50 %	192288931
14098	NC_011004	CGG	2	6	545382	545387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288931
14099	NC_011004	GAA	2	6	545413	545418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288931
14100	NC_011004	GGAC	2	8	545440	545447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14101	NC_011004	AGC	2	6	545490	545495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_011004	CGA	2	6	545628	545633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288932
14103	NC_011004	CTG	2	6	545758	545763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288932
14104	NC_011004	GCG	2	6	545780	545785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288932
14105	NC_011004	CAAGGC	2	12	545802	545813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288932
14106	NC_011004	TCT	2	6	545842	545847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288933
14107	NC_011004	CTT	2	6	545877	545882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288933
14108	NC_011004	GATCA	2	10	545886	545895	40 %	20 %	20 %	20 %	192288933
14109	NC_011004	CG	3	6	545906	545911	0 %	0 %	50 %	50 %	192288933
14110	NC_011004	CGGAAG	2	12	545965	545976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	192288933
14111	NC_011004	TGG	2	6	546047	546052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288933
14112	NC_011004	TCG	2	6	546058	546063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288933
14113	NC_011004	ACC	3	9	546118	546126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288933
14114	NC_011004	CCA	3	9	546155	546163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288933
14115	NC_011004	CGT	2	6	546164	546169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288933
14116	NC_011004	TCG	2	6	546172	546177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288933
14117	NC_011004	CGA	2	6	546188	546193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288933
14118	NC_011004	TCG	2	6	546244	546249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288933
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14120	NC_011004	GCG	2	6	546379	546384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288933
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14238	NC_011004	GGC	2	6	551135	551140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14239	NC_011004	TCC	2	6	551158	551163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14240	NC_011004	CGA	2	6	551246	551251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288939
14241	NC_011004	GAG	2	6	551307	551312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288939
14242	NC_011004	GCA	2	6	551318	551323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288939
14243	NC_011004	GCG	2	6	551343	551348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288939
14244	NC_011004	AGA	2	6	551362	551367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288939
14245	NC_011004	CG	3	6	551375	551380	0 %	0 %	50 %	50 %	192288939
14246	NC_011004	GGCG	2	8	551444	551451	0 %	0 %	75 %	25 %	192288939
14247	NC_011004	CGA	3	9	551465	551473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288939
14248	NC_011004	CGG	2	6	551483	551488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288939
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14251	NC_011004	CGAC	2	8	551728	551735	25 %	0 %	25 %	50 %	192288939
14252	NC_011004	GCCT	2	8	551736	551743	0 %	25 %	25 %	50 %	192288939
14253	NC_011004	CGG	2	6	551792	551797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288939
14254	NC_011004	CAA	2	6	551819	551824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288939
14255	NC_011004	GCG	2	6	551871	551876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288939
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14259	NC_011004	GCG	2	6	551995	552000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288939
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14262	NC_011004	GCCCC	2	10	552147	552156	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14263	NC_011004	GGC	2	6	552165	552170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14264	NC_011004	CGC	2	6	552235	552240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14265	NC_011004	CCGCC	2	10	552280	552289	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14266	NC_011004	CCG	2	6	552407	552412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14267	NC_011004	CG	3	6	552443	552448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14268	NC_011004	GTC	2	6	552495	552500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14269	NC_011004	GTG	2	6	552512	552517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288940
14270	NC_011004	CG	3	6	552536	552541	0 %	0 %	50 %	50 %	192288940
14271	NC_011004	CGA	2	6	552564	552569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288940
14272	NC_011004	CCA	2	6	552612	552617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288940
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14274	NC_011004	GCT	2	6	552766	552771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288940
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14278	NC_011004	CGA	2	6	553009	553014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288940
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14282	NC_011004	CAA	2	6	553129	553134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288940
14283	NC_011004	GAAG	2	8	553162	553169	50 %	0 %	50 %	0 %	192288940
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14304	NC_011004	GGC	2	6	553953	553958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14306	NC_011004	TCT	2	6	553963	553968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14307	NC_011004	CAC	2	6	554042	554047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14340	NC_011004	GCGG	2	8	555594	555601	0 %	0 %	75 %	25 %	192288941
14341	NC_011004	TTC	2	6	555658	555663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288941
14342	NC_011004	TCGA	2	8	555694	555701	25 %	25 %	25 %	25 %	192288941
14343	NC_011004	TTG	2	6	555733	555738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288941
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14346	NC_011004	TCG	2	6	555805	555810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288941
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14348	NC_011004	TCG	2	6	555874	555879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288941
14349	NC_011004	AGT	2	6	555932	555937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288941
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14355	NC_011004	GTG	2	6	556146	556151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288941
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14360	NC_011004	GCT	2	6	556262	556267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288941
14361	NC_011004	TCG	2	6	556270	556275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288941
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14479	NC_011004	CGG	2	6	560443	560448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288943
14480	NC_011004	GCG	2	6	560476	560481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288943
14481	NC_011004	CGG	2	6	560485	560490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288943
14482	NC_011004	TTCG	2	8	560552	560559	0 %	50 %	25 %	25 %	192288943
14483	NC_011004	GCCG	2	8	560663	560670	0 %	0 %	50 %	50 %	192288943
14484	NC_011004	GC	4	8	560679	560686	0 %	0 %	50 %	50 %	192288943
14485	NC_011004	CAG	2	6	560693	560698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288943
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14488	NC_011004	CGC	2	6	560772	560777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288943
14489	NC_011004	GC	4	8	560793	560800	0 %	0 %	50 %	50 %	192288943
14490	NC_011004	CA	3	6	560826	560831	50 %	0 %	0 %	50 %	192288943
14491	NC_011004	GTC	2	6	560870	560875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288943
14492	NC_011004	GC	3	6	560953	560958	0 %	0 %	50 %	50 %	192288943
14493	NC_011004	GAA	2	6	560981	560986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288943
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14495	NC_011004	CAT	2	6	561062	561067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288943
14496	NC_011004	GGCG	2	8	561080	561087	0 %	0 %	75 %	25 %	192288943
14497	NC_011004	GCG	2	6	561102	561107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288943
14498	NC_011004	CGG	2	6	561183	561188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14499	NC_011004	CTG	2	6	561241	561246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14500	NC_011004	CGG	2	6	561368	561373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288944

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