MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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144002	NC_011004	GGCGA	2	10	5575867	5575876	20 %	0 %	60 %	20 %	192293530
144003	NC_011004	GAA	2	6	5575878	5575883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293530
144004	NC_011004	CCG	2	6	5575889	5575894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293530
144005	NC_011004	GCT	2	6	5575905	5575910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293530
144006	NC_011004	CGC	2	6	5575911	5575916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293530
144007	NC_011004	TGGA	2	8	5575990	5575997	25 %	25 %	50 %	0 %	192293530
144008	NC_011004	GAC	2	6	5576037	5576042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293530
144009	NC_011004	CGA	2	6	5576067	5576072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293530
144010	NC_011004	GCA	2	6	5576091	5576096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293530
144011	NC_011004	CG	3	6	5576127	5576132	0 %	0 %	50 %	50 %	192293530
144012	NC_011004	AGC	2	6	5576144	5576149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293530
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144014	NC_011004	CAT	2	6	5576172	5576177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293530
144015	NC_011004	CG	3	6	5576208	5576213	0 %	0 %	50 %	50 %	192293530
144016	NC_011004	CCG	2	6	5576253	5576258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293530
144017	NC_011004	CGGCGA	2	12	5576262	5576273	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192293530
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144019	NC_011004	GC	4	8	5576326	5576333	0 %	0 %	50 %	50 %	192293530
144020	NC_011004	GAG	2	6	5576359	5576364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293530
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144052	NC_011004	TGA	2	6	5577290	5577295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144053	NC_011004	GC	3	6	5577312	5577317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144054	NC_011004	GACG	2	8	5577358	5577365	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144055	NC_011004	GCG	2	6	5577386	5577391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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144115	NC_011004	GGC	2	6	5579560	5579565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293533
144116	NC_011004	CGC	2	6	5579568	5579573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293533
144117	NC_011004	GC	3	6	5579575	5579580	0 %	0 %	50 %	50 %	192293533
144118	NC_011004	TCA	2	6	5579590	5579595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293533
144119	NC_011004	ACG	2	6	5579608	5579613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293533
144120	NC_011004	TGT	2	6	5579621	5579626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293533
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144124	NC_011004	GCA	2	6	5579828	5579833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293533
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144128	NC_011004	CTG	2	6	5579926	5579931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293533
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144132	NC_011004	GC	3	6	5580140	5580145	0 %	0 %	50 %	50 %	192293533
144133	NC_011004	AAG	3	9	5580187	5580195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293533
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144136	NC_011004	GC	3	6	5580276	5580281	0 %	0 %	50 %	50 %	192293533
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144143	NC_011004	CAT	2	6	5580729	5580734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293534
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144159	NC_011004	GCC	2	6	5581324	5581329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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144161	NC_011004	CCTG	2	8	5581382	5581389	0 %	25 %	25 %	50 %	192293535
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144182	NC_011004	AAAC	2	8	5582536	5582543	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144183	NC_011004	CATC	2	8	5582574	5582581	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144184	NC_011004	CGC	2	6	5582611	5582616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144185	NC_011004	CGA	2	6	5582687	5582692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293536
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144190	NC_011004	GC	3	6	5582829	5582834	0 %	0 %	50 %	50 %	192293536
144191	NC_011004	ATC	2	6	5582839	5582844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293536
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144198	NC_011004	TGG	2	6	5583194	5583199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293536
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144202	NC_011004	ACC	2	6	5583286	5583291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293536
144203	NC_011004	CGG	3	9	5583360	5583368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293536
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144219	NC_011004	GAT	2	6	5583938	5583943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293537
144220	NC_011004	CCG	2	6	5583997	5584002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293537
144221	NC_011004	CTT	2	6	5584016	5584021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293537
144222	NC_011004	CCA	2	6	5584036	5584041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293537
144223	NC_011004	GC	3	6	5584057	5584062	0 %	0 %	50 %	50 %	192293537
144224	NC_011004	ATC	2	6	5584071	5584076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293537
144225	NC_011004	GGTC	2	8	5584174	5584181	0 %	25 %	50 %	25 %	192293537
144226	NC_011004	GGT	2	6	5584190	5584195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293537
144227	NC_011004	GCC	2	6	5584197	5584202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293537
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144229	NC_011004	CGT	2	6	5584250	5584255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293537
144230	NC_011004	GTG	2	6	5584257	5584262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293537
144231	NC_011004	GC	3	6	5584328	5584333	0 %	0 %	50 %	50 %	192293537
144232	NC_011004	TCG	2	6	5584452	5584457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293538
144233	NC_011004	GC	4	8	5584495	5584502	0 %	0 %	50 %	50 %	192293538
144234	NC_011004	ATG	2	6	5584524	5584529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293538
144235	NC_011004	CGA	2	6	5584540	5584545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293538
144236	NC_011004	CGG	2	6	5584549	5584554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293538
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144238	NC_011004	ACG	2	6	5584581	5584586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293538
144239	NC_011004	GAC	2	6	5584594	5584599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293538
144240	NC_011004	TCA	2	6	5584632	5584637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293538
144241	NC_011004	CGG	2	6	5584641	5584646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293538
144242	NC_011004	AGC	2	6	5584746	5584751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293538
144243	NC_011004	GC	3	6	5584750	5584755	0 %	0 %	50 %	50 %	192293538
144244	NC_011004	TGA	2	6	5584803	5584808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293538
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144264	NC_011004	CG	3	6	5585275	5585280	0 %	0 %	50 %	50 %	192293538
144265	NC_011004	CGGA	2	8	5585294	5585301	25 %	0 %	50 %	25 %	192293538
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144289	NC_011004	CCTC	2	8	5586538	5586545	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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144292	NC_011004	TAAC	2	8	5586586	5586593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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144342	NC_011004	CGTC	2	8	5588750	5588757	0 %	25 %	25 %	50 %	192293542
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144344	NC_011004	TGC	2	6	5588783	5588788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293542
144345	NC_011004	CCG	2	6	5588908	5588913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144346	NC_011004	AC	3	6	5588986	5588991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144347	NC_011004	GGA	2	6	5589002	5589007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144348	NC_011004	GTC	2	6	5589036	5589041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293543
144349	NC_011004	GGC	2	6	5589043	5589048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293543
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144353	NC_011004	GC	4	8	5589182	5589189	0 %	0 %	50 %	50 %	192293543
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144357	NC_011004	TCG	2	6	5589245	5589250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293543
144358	NC_011004	TCG	2	6	5589254	5589259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293543
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144360	NC_011004	CTA	3	9	5589321	5589329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293543
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144362	NC_011004	TTA	2	6	5589345	5589350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192293543
144363	NC_011004	G	6	6	5589352	5589357	0 %	0 %	100 %	0 %	192293543
144364	NC_011004	TAT	2	6	5589364	5589369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192293543
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144367	NC_011004	GGC	2	6	5589555	5589560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293544
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144380	NC_011004	CGT	2	6	5590214	5590219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293545
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144388	NC_011004	GCCGC	2	10	5590686	5590695	0 %	0 %	40 %	60 %	192293546
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144414	NC_011004	CGC	2	6	5591419	5591424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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144450	NC_011004	CTC	2	6	5592449	5592454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144451	NC_011004	ACG	2	6	5592484	5592489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144452	NC_011004	GCTTC	2	10	5592524	5592533	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
144453	NC_011004	CCAGC	2	10	5592564	5592573	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
144454	NC_011004	CGA	2	6	5592660	5592665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293548
144455	NC_011004	GCA	2	6	5592667	5592672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293548
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144460	NC_011004	GGC	2	6	5593034	5593039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293548
144461	NC_011004	GC	3	6	5593120	5593125	0 %	0 %	50 %	50 %	192293548
144462	NC_011004	GGT	2	6	5593126	5593131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293548
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144464	NC_011004	TCG	2	6	5593157	5593162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293548
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