MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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143002	NC_011004	CGC	2	6	5537238	5537243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293501
143003	NC_011004	GCGAA	2	10	5537246	5537255	40 %	0 %	40 %	20 %	192293501
143004	NC_011004	GAA	3	9	5537253	5537261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293501
143005	NC_011004	CAG	2	6	5537334	5537339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293501
143006	NC_011004	CGG	2	6	5537377	5537382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293501
143007	NC_011004	AAC	2	6	5537395	5537400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293501
143008	NC_011004	AGC	3	9	5537407	5537415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293501
143009	NC_011004	GAA	2	6	5537481	5537486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293501
143010	NC_011004	GAA	2	6	5537511	5537516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293501
143011	NC_011004	AGA	2	6	5537528	5537533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293501
143012	NC_011004	TCA	2	6	5537546	5537551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293501
143013	NC_011004	AGCG	2	8	5537566	5537573	25 %	0 %	50 %	25 %	192293501
143014	NC_011004	AGC	2	6	5537611	5537616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293501
143015	NC_011004	GCA	2	6	5537651	5537656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293501
143016	NC_011004	CG	3	6	5537657	5537662	0 %	0 %	50 %	50 %	192293501
143017	NC_011004	CG	3	6	5537680	5537685	0 %	0 %	50 %	50 %	192293501
143018	NC_011004	CGA	2	6	5537702	5537707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293501
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143020	NC_011004	ATC	2	6	5537737	5537742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293501
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143022	NC_011004	AGCC	2	8	5537817	5537824	25 %	0 %	25 %	50 %	192293501
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143024	NC_011004	GATC	2	8	5537840	5537847	25 %	25 %	25 %	25 %	192293501
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143034	NC_011004	GC	3	6	5538146	5538151	0 %	0 %	50 %	50 %	192293501
143035	NC_011004	CCAG	2	8	5538163	5538170	25 %	0 %	25 %	50 %	192293501
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143041	NC_011004	GC	3	6	5538597	5538602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143042	NC_011004	GGC	2	6	5538622	5538627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293502
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143050	NC_011004	GAG	2	6	5538953	5538958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293502
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143100	NC_011004	GAACC	2	10	5540693	5540702	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143101	NC_011004	GCA	2	6	5540720	5540725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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143105	NC_011004	CG	3	6	5541012	5541017	0 %	0 %	50 %	50 %	192293503
143106	NC_011004	CGAG	2	8	5541025	5541032	25 %	0 %	50 %	25 %	192293503
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143109	NC_011004	CGAG	2	8	5541072	5541079	25 %	0 %	50 %	25 %	192293503
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143114	NC_011004	CAG	2	6	5541290	5541295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293503
143115	NC_011004	CCG	2	6	5541343	5541348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293503
143116	NC_011004	CGG	2	6	5541368	5541373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293503
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143118	NC_011004	CGG	2	6	5541456	5541461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293503
143119	NC_011004	GAT	2	6	5541534	5541539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143120	NC_011004	CGA	2	6	5541547	5541552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143121	NC_011004	TGAT	2	8	5541553	5541560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143122	NC_011004	CG	3	6	5541566	5541571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143123	NC_011004	AG	3	6	5541601	5541606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143124	NC_011004	CGG	2	6	5541692	5541697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143125	NC_011004	GC	3	6	5541719	5541724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143126	NC_011004	CGAC	2	8	5541744	5541751	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143127	NC_011004	GGC	2	6	5541805	5541810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143128	NC_011004	TCC	2	6	5541839	5541844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143129	NC_011004	GC	3	6	5541845	5541850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143130	NC_011004	GAA	2	6	5541870	5541875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293504
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143182	NC_011004	GC	4	8	5544446	5544453	0 %	0 %	50 %	50 %	192293506
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143227	NC_011004	CGGCCT	2	12	5545788	5545799	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192293506
143228	NC_011004	GCTC	2	8	5545847	5545854	0 %	25 %	25 %	50 %	192293506
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143230	NC_011004	GCCAAG	2	12	5546122	5546133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293506
143231	NC_011004	CGC	2	6	5546244	5546249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293506
143232	NC_011004	CGGC	2	8	5546333	5546340	0 %	0 %	50 %	50 %	192293506
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143235	NC_011004	CGA	2	6	5546409	5546414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293506
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143250	NC_011004	GAT	2	6	5546883	5546888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143280	NC_011004	CG	3	6	5547724	5547729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143281	NC_011004	TGT	2	6	5547736	5547741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143327	NC_011004	ACT	2	6	5549114	5549119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293509
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143343	NC_011004	CCG	2	6	5549813	5549818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293509
143344	NC_011004	CGG	2	6	5549820	5549825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293509
143345	NC_011004	CG	3	6	5549837	5549842	0 %	0 %	50 %	50 %	192293509
143346	NC_011004	ACC	2	6	5549866	5549871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293509
143347	NC_011004	GCA	2	6	5549921	5549926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143348	NC_011004	TGG	2	6	5549963	5549968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293509
143349	NC_011004	CGA	2	6	5549979	5549984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143350	NC_011004	GCA	2	6	5550044	5550049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143351	NC_011004	GC	3	6	5550058	5550063	0 %	0 %	50 %	50 %	192293509
143352	NC_011004	AGC	2	6	5550103	5550108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143353	NC_011004	GC	3	6	5550107	5550112	0 %	0 %	50 %	50 %	192293509
143354	NC_011004	TGC	2	6	5550128	5550133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143355	NC_011004	CGA	2	6	5550171	5550176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143356	NC_011004	AGC	2	6	5550205	5550210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143357	NC_011004	GCA	2	6	5550221	5550226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293509
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143359	NC_011004	TCG	2	6	5550280	5550285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143360	NC_011004	CGA	2	6	5550347	5550352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293509
143361	NC_011004	GAG	2	6	5550384	5550389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143362	NC_011004	CGG	2	6	5550419	5550424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143363	NC_011004	GC	3	6	5550459	5550464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143364	NC_011004	GC	3	6	5550466	5550471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143365	NC_011004	GGGGT	2	10	5550489	5550498	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
143366	NC_011004	CG	3	6	5550503	5550508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143367	NC_011004	CCACC	2	10	5550529	5550538	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
143368	NC_011004	CGCT	2	8	5550540	5550547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143369	NC_011004	CCCTCC	2	12	5550559	5550570	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
143370	NC_011004	CAT	2	6	5550668	5550673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143371	NC_011004	CCGGC	2	10	5550694	5550703	0 %	0 %	40 %	60 %	192293510
143372	NC_011004	GCG	2	6	5550707	5550712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293510
143373	NC_011004	GCTTCG	2	12	5550734	5550745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293510
143374	NC_011004	GCG	2	6	5550787	5550792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293510
143375	NC_011004	CGC	2	6	5550889	5550894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293510
143376	NC_011004	TCG	2	6	5550941	5550946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293510
143377	NC_011004	GC	4	8	5551037	5551044	0 %	0 %	50 %	50 %	192293510
143378	NC_011004	GCA	2	6	5551059	5551064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293510
143379	NC_011004	CGG	2	6	5551066	5551071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293510
143380	NC_011004	GAT	2	6	5551099	5551104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293510
143381	NC_011004	CCGG	2	8	5551157	5551164	0 %	0 %	50 %	50 %	192293510
143382	NC_011004	GAT	2	6	5551231	5551236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293510
143383	NC_011004	TTC	2	6	5551238	5551243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293510
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143386	NC_011004	CGT	2	6	5551308	5551313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293510
143387	NC_011004	CAG	2	6	5551369	5551374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293511
143388	NC_011004	GCA	2	6	5551535	5551540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293511
143389	NC_011004	TGT	2	6	5551544	5551549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293511
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143392	NC_011004	ATG	2	6	5551627	5551632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293511
143393	NC_011004	CGG	2	6	5551647	5551652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293511
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143401	NC_011004	GCC	2	6	5552019	5552024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293511
143402	NC_011004	CG	3	6	5552045	5552050	0 %	0 %	50 %	50 %	192293511
143403	NC_011004	CG	3	6	5552087	5552092	0 %	0 %	50 %	50 %	192293511
143404	NC_011004	CGGC	2	8	5552108	5552115	0 %	0 %	50 %	50 %	192293511
143405	NC_011004	TGA	2	6	5552123	5552128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293511
143406	NC_011004	CTG	2	6	5552160	5552165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293511
143407	NC_011004	CAT	2	6	5552175	5552180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293511
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143409	NC_011004	GCCG	2	8	5552271	5552278	0 %	0 %	50 %	50 %	192293511
143410	NC_011004	CGG	3	9	5552328	5552336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293511
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143412	NC_011004	CG	3	6	5552477	5552482	0 %	0 %	50 %	50 %	192293511
143413	NC_011004	GCG	2	6	5552540	5552545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293511
143414	NC_011004	CGAA	2	8	5552588	5552595	50 %	0 %	25 %	25 %	192293511
143415	NC_011004	GTC	2	6	5552677	5552682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143416	NC_011004	GCC	2	6	5552735	5552740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293512
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143419	NC_011004	TCG	2	6	5552793	5552798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293512
143420	NC_011004	TCG	2	6	5552811	5552816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293512
143421	NC_011004	CG	4	8	5552819	5552826	0 %	0 %	50 %	50 %	192293512
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143428	NC_011004	CGA	2	6	5553178	5553183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293512
143429	NC_011004	CTG	2	6	5553350	5553355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293512
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143434	NC_011004	CGA	2	6	5553565	5553570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293512
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143438	NC_011004	GGTC	2	8	5553655	5553662	0 %	25 %	50 %	25 %	192293512
143439	NC_011004	GC	3	6	5553724	5553729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143440	NC_011004	GTC	2	6	5553742	5553747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143441	NC_011004	AGCG	2	8	5553766	5553773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143442	NC_011004	CCG	2	6	5553801	5553806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143443	NC_011004	GC	3	6	5553848	5553853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143444	NC_011004	GTCA	2	8	5553907	5553914	25 %	25 %	25 %	25 %	192293513
143445	NC_011004	TCAC	2	8	5553928	5553935	25 %	25 %	0 %	50 %	192293513
143446	NC_011004	GCA	2	6	5553968	5553973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293513
143447	NC_011004	GCG	2	6	5554027	5554032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293513
143448	NC_011004	TCG	2	6	5554039	5554044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293513
143449	NC_011004	GCG	2	6	5554081	5554086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293513
143450	NC_011004	GA	3	6	5554114	5554119	50 %	0 %	50 %	0 %	192293513
143451	NC_011004	CCCCT	2	10	5554137	5554146	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
143452	NC_011004	TCG	2	6	5554260	5554265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143453	NC_011004	GACC	2	8	5554302	5554309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143454	NC_011004	CGTG	2	8	5554338	5554345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143455	NC_011004	ATC	2	6	5554407	5554412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143456	NC_011004	CGG	2	6	5554455	5554460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293514
143457	NC_011004	CG	3	6	5554481	5554486	0 %	0 %	50 %	50 %	192293514
143458	NC_011004	GCGG	2	8	5554540	5554547	0 %	0 %	75 %	25 %	192293514
143459	NC_011004	TCG	2	6	5554562	5554567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143460	NC_011004	GCG	2	6	5554572	5554577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293514
143461	NC_011004	CCG	2	6	5554583	5554588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293514
143462	NC_011004	GCC	2	6	5554622	5554627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293514
143463	NC_011004	CAG	2	6	5554645	5554650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143464	NC_011004	GCC	2	6	5554657	5554662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293514
143465	NC_011004	GCC	2	6	5554709	5554714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293514
143466	NC_011004	GCG	2	6	5554719	5554724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293514
143467	NC_011004	CAT	2	6	5554773	5554778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293514
143468	NC_011004	CGGC	2	8	5554820	5554827	0 %	0 %	50 %	50 %	192293514
143469	NC_011004	GCGCCA	2	12	5554860	5554871	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192293514
143470	NC_011004	GCG	2	6	5554908	5554913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293514
143471	NC_011004	TGT	2	6	5554947	5554952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293514
143472	NC_011004	GCC	2	6	5554958	5554963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293514
143473	NC_011004	TCC	2	6	5555054	5555059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293514
143474	NC_011004	CGCGC	2	10	5555071	5555080	0 %	0 %	40 %	60 %	192293514
143475	NC_011004	GC	4	8	5555077	5555084	0 %	0 %	50 %	50 %	192293514
143476	NC_011004	CCG	2	6	5555152	5555157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293514
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143478	NC_011004	TCG	2	6	5555303	5555308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143479	NC_011004	GCA	2	6	5555319	5555324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143480	NC_011004	CGG	2	6	5555347	5555352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293514
143481	NC_011004	CCG	2	6	5555385	5555390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293514
143482	NC_011004	GCC	2	6	5555504	5555509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293514
143483	NC_011004	TTG	2	6	5555582	5555587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293514
143484	NC_011004	GATC	2	8	5555598	5555605	25 %	25 %	25 %	25 %	192293514
143485	NC_011004	TGC	2	6	5555615	5555620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143486	NC_011004	GTA	2	6	5555647	5555652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293514
143487	NC_011004	CTG	2	6	5555653	5555658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143488	NC_011004	TGA	2	6	5555664	5555669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293514
143489	NC_011004	GCA	2	6	5555697	5555702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143490	NC_011004	TCG	2	6	5555723	5555728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143491	NC_011004	GC	4	8	5555811	5555818	0 %	0 %	50 %	50 %	192293514
143492	NC_011004	AGC	2	6	5555870	5555875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293514
143493	NC_011004	GATC	2	8	5555901	5555908	25 %	25 %	25 %	25 %	192293514
143494	NC_011004	GACCG	2	10	5555923	5555932	20 %	0 %	40 %	40 %	192293514
143495	NC_011004	ACC	2	6	5555945	5555950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293514
143496	NC_011004	GC	3	6	5555956	5555961	0 %	0 %	50 %	50 %	192293514
143497	NC_011004	CCCGT	2	10	5556046	5556055	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143498	NC_011004	TCC	2	6	5556076	5556081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143499	NC_011004	GTC	2	6	5556118	5556123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143500	NC_011004	T	7	7	5556149	5556155	0 %	100 %	0 %	0 %	192293515

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