MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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142502	NC_011004	AGGTC	2	10	5515682	5515691	20 %	20 %	40 %	20 %	192293488
142503	NC_011004	GAC	2	6	5515758	5515763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293488
142504	NC_011004	GCGCA	2	10	5515806	5515815	20 %	0 %	40 %	40 %	192293488
142505	NC_011004	GCC	3	9	5515824	5515832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293488
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142508	NC_011004	GTC	2	6	5515973	5515978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293489
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142514	NC_011004	TCG	2	6	5516161	5516166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293489
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142596	NC_011004	GCA	2	6	5519067	5519072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142598	NC_011004	GCGA	2	8	5519168	5519175	25 %	0 %	50 %	25 %	192293491
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142615	NC_011004	CCG	2	6	5519919	5519924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293491
142616	NC_011004	CGA	2	6	5519946	5519951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293491
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142619	NC_011004	TGC	3	9	5520083	5520091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293492
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142642	NC_011004	GCTG	3	12	5520951	5520962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142643	NC_011004	GCG	2	6	5520994	5520999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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142645	NC_011004	CCG	2	6	5521058	5521063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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142666	NC_011004	CGG	2	6	5522034	5522039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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142670	NC_011004	TGC	2	6	5522156	5522161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142678	NC_011004	TCGG	2	8	5522663	5522670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142679	NC_011004	GCC	2	6	5522695	5522700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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142682	NC_011004	TGC	2	6	5522754	5522759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142730	NC_011004	CG	4	8	5524801	5524808	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
142731	NC_011004	GC	3	6	5524817	5524822	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
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142733	NC_011004	TGC	2	6	5524869	5524874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
142734	NC_011004	CGG	2	6	5524879	5524884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293495
142735	NC_011004	GCT	2	6	5524894	5524899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
142736	NC_011004	CTG	2	6	5524928	5524933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
142737	NC_011004	ACG	2	6	5524961	5524966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
142738	NC_011004	GC	3	6	5524982	5524987	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
142739	NC_011004	CGCTGC	2	12	5524995	5525006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192293495
142740	NC_011004	CTT	2	6	5525032	5525037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293495
142741	NC_011004	CGA	2	6	5525050	5525055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
142742	NC_011004	CGA	2	6	5525077	5525082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
142743	NC_011004	GTTC	2	8	5525154	5525161	0 %	50 %	25 %	25 %	192293495
142744	NC_011004	TGA	2	6	5525163	5525168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293495
142745	NC_011004	CG	3	6	5525169	5525174	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
142746	NC_011004	CGTG	2	8	5525212	5525219	0 %	25 %	50 %	25 %	192293495
142747	NC_011004	GCG	2	6	5525232	5525237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293495
142748	NC_011004	TCG	2	6	5525325	5525330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
142749	NC_011004	GAG	2	6	5525369	5525374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293495
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142752	NC_011004	TCAT	2	8	5525463	5525470	25 %	50 %	0 %	25 %	192293496
142753	NC_011004	AGCC	2	8	5525495	5525502	25 %	0 %	25 %	50 %	192293496
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142756	NC_011004	AGC	2	6	5525614	5525619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293496
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142759	NC_011004	CGA	2	6	5525759	5525764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293496
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142777	NC_011004	GGT	2	6	5526412	5526417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293497
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142779	NC_011004	GAT	2	6	5526430	5526435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293497
142780	NC_011004	GC	3	6	5526560	5526565	0 %	0 %	50 %	50 %	192293497
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142782	NC_011004	CG	3	6	5526607	5526612	0 %	0 %	50 %	50 %	192293497
142783	NC_011004	GGCGAT	2	12	5526616	5526627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192293497
142784	NC_011004	GCG	2	6	5526726	5526731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293497
142785	NC_011004	CCGG	2	8	5526789	5526796	0 %	0 %	50 %	50 %	192293497
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142792	NC_011004	CGG	2	6	5526988	5526993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293497
142793	NC_011004	CGT	2	6	5527005	5527010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293497
142794	NC_011004	GCT	2	6	5527042	5527047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293497
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142797	NC_011004	GGT	2	6	5527216	5527221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293497
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142800	NC_011004	CGA	2	6	5527327	5527332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293498
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142816	NC_011004	CGT	2	6	5527849	5527854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142817	NC_011004	GCG	2	6	5527870	5527875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142818	NC_011004	CG	3	6	5527874	5527879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142819	NC_011004	GCTG	2	8	5527880	5527887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142820	NC_011004	AGC	2	6	5527899	5527904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142824	NC_011004	GGC	2	6	5527992	5527997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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142826	NC_011004	GT	3	6	5528020	5528025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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142828	NC_011004	GAG	2	6	5528104	5528109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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142830	NC_011004	ACC	2	6	5528158	5528163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142831	NC_011004	CAA	2	6	5528191	5528196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142832	NC_011004	TGGT	2	8	5528198	5528205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142833	NC_011004	ACT	2	6	5528207	5528212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142835	NC_011004	TGC	2	6	5528282	5528287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142836	NC_011004	GTC	2	6	5528314	5528319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142837	NC_011004	CCGT	2	8	5528388	5528395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142838	NC_011004	TGC	2	6	5528405	5528410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142839	NC_011004	ACA	2	6	5528426	5528431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142840	NC_011004	CCA	2	6	5528435	5528440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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142842	NC_011004	TGA	2	6	5528608	5528613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142843	NC_011004	ACG	2	6	5528633	5528638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142844	NC_011004	TCA	2	6	5528662	5528667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142845	NC_011004	ACC	2	6	5528723	5528728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142846	NC_011004	TTG	2	6	5528763	5528768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142847	NC_011004	CAGG	2	8	5528779	5528786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142848	NC_011004	CGA	2	6	5528803	5528808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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