MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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142009	NC_011004	GGTGA	2	10	5495931	5495940	20 %	20 %	60 %	0 %	192293472
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142116	NC_011004	TGT	2	6	5500494	5500499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293476
142117	NC_011004	GAT	2	6	5500528	5500533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293476
142118	NC_011004	GCA	2	6	5500542	5500547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293476
142119	NC_011004	CGA	2	6	5500566	5500571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293476
142120	NC_011004	ACG	3	9	5500614	5500622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293476
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142122	NC_011004	GAC	2	6	5500648	5500653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293476
142123	NC_011004	GC	3	6	5500669	5500674	0 %	0 %	50 %	50 %	192293476
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142127	NC_011004	ATC	2	6	5500948	5500953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142135	NC_011004	TC	3	6	5501317	5501322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142136	NC_011004	GAG	2	6	5501326	5501331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142137	NC_011004	CGGCG	2	10	5501417	5501426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142138	NC_011004	CG	3	6	5501434	5501439	0 %	0 %	50 %	50 %	192293478
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142230	NC_011004	GTCG	2	8	5505070	5505077	0 %	25 %	50 %	25 %	192293479
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142236	NC_011004	CG	3	6	5505224	5505229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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142240	NC_011004	AG	4	8	5505393	5505400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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142345	NC_011004	CG	3	6	5509058	5509063	0 %	0 %	50 %	50 %	192293483
142346	NC_011004	GACG	2	8	5509135	5509142	25 %	0 %	50 %	25 %	192293483
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142404	NC_011004	TTCCAA	2	12	5511611	5511622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142405	NC_011004	GA	3	6	5511627	5511632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142406	NC_011004	CGG	2	6	5511657	5511662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293485
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142433	NC_011004	ATG	2	6	5512668	5512673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293485
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142435	NC_011004	TA	3	6	5512791	5512796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142436	NC_011004	GCC	2	6	5512801	5512806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142437	NC_011004	TATT	2	8	5512813	5512820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142438	NC_011004	CGG	2	6	5512831	5512836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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142440	NC_011004	CCG	2	6	5512869	5512874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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142443	NC_011004	AGC	2	6	5512954	5512959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142445	NC_011004	GCC	2	6	5513113	5513118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142446	NC_011004	GCGTTC	2	12	5513171	5513182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293486
142447	NC_011004	CGG	2	6	5513185	5513190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293486
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142450	NC_011004	GCT	2	6	5513374	5513379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293486
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142456	NC_011004	CCGC	2	8	5513667	5513674	0 %	0 %	25 %	75 %	192293486
142457	NC_011004	GC	3	6	5513673	5513678	0 %	0 %	50 %	50 %	192293486
142458	NC_011004	TGC	2	6	5513679	5513684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293486
142459	NC_011004	CG	3	6	5513718	5513723	0 %	0 %	50 %	50 %	192293486
142460	NC_011004	CGACAA	2	12	5513830	5513841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	192293486
142461	NC_011004	CAGCGG	2	12	5513895	5513906	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142462	NC_011004	CGCTC	2	10	5513979	5513988	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
142463	NC_011004	GGAGC	2	10	5513999	5514008	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
142464	NC_011004	GAT	2	6	5514166	5514171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293487
142465	NC_011004	CGCAGG	2	12	5514174	5514185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192293487
142466	NC_011004	GCA	2	6	5514213	5514218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293487
142467	NC_011004	CTC	2	6	5514265	5514270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293487
142468	NC_011004	GTG	2	6	5514275	5514280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293487
142469	NC_011004	TCG	2	6	5514332	5514337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293487
142470	NC_011004	GGCG	2	8	5514379	5514386	0 %	0 %	75 %	25 %	192293487
142471	NC_011004	CG	3	6	5514385	5514390	0 %	0 %	50 %	50 %	192293487
142472	NC_011004	GCCG	2	8	5514518	5514525	0 %	0 %	50 %	50 %	192293487
142473	NC_011004	CG	3	6	5514524	5514529	0 %	0 %	50 %	50 %	192293487
142474	NC_011004	TGG	2	6	5514582	5514587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293487
142475	NC_011004	GCG	2	6	5514606	5514611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293487
142476	NC_011004	CAG	2	6	5514649	5514654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293487
142477	NC_011004	CG	3	6	5514708	5514713	0 %	0 %	50 %	50 %	192293487
142478	NC_011004	TGA	2	6	5514756	5514761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293487
142479	NC_011004	GGC	2	6	5514778	5514783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142480	NC_011004	TTG	2	6	5514798	5514803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142481	NC_011004	TTC	2	6	5514894	5514899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293488
142482	NC_011004	TGG	2	6	5514902	5514907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293488
142483	NC_011004	CCG	2	6	5514914	5514919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293488
142484	NC_011004	CG	3	6	5514994	5514999	0 %	0 %	50 %	50 %	192293488
142485	NC_011004	CGC	2	6	5515014	5515019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293488
142486	NC_011004	GCGCG	2	10	5515070	5515079	0 %	0 %	60 %	40 %	192293488
142487	NC_011004	CAG	2	6	5515101	5515106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293488
142488	NC_011004	GC	3	6	5515130	5515135	0 %	0 %	50 %	50 %	192293488
142489	NC_011004	GC	3	6	5515196	5515201	0 %	0 %	50 %	50 %	192293488
142490	NC_011004	GCG	2	6	5515274	5515279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293488
142491	NC_011004	GCG	2	6	5515285	5515290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293488
142492	NC_011004	CCA	2	6	5515296	5515301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293488
142493	NC_011004	CAC	2	6	5515305	5515310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293488
142494	NC_011004	CTT	2	6	5515332	5515337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293488
142495	NC_011004	CGG	2	6	5515438	5515443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293488
142496	NC_011004	CTT	2	6	5515452	5515457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293488
142497	NC_011004	TTG	2	6	5515513	5515518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293488
142498	NC_011004	CTT	2	6	5515557	5515562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293488
142499	NC_011004	CGC	2	6	5515584	5515589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293488
142500	NC_011004	GCA	2	6	5515641	5515646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293488

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