MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
141001	NC_011004	GGC	2	6	5456442	5456447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293428
141002	NC_011004	GC	3	6	5456459	5456464	0 %	0 %	50 %	50 %	192293428
141003	NC_011004	TTC	2	6	5456472	5456477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293428
141004	NC_011004	GGC	2	6	5456513	5456518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293428
141005	NC_011004	GCT	2	6	5456546	5456551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293428
141006	NC_011004	GCGCA	2	10	5456555	5456564	20 %	0 %	40 %	40 %	192293428
141007	NC_011004	CGG	2	6	5456641	5456646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293428
141008	NC_011004	AGC	2	6	5456736	5456741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293429
141009	NC_011004	CGA	2	6	5456841	5456846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293429
141010	NC_011004	CGG	2	6	5456912	5456917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293429
141011	NC_011004	TCG	2	6	5456928	5456933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293429
141012	NC_011004	CCAG	2	8	5456940	5456947	25 %	0 %	25 %	50 %	192293429
141013	NC_011004	CGAC	2	8	5456952	5456959	25 %	0 %	25 %	50 %	192293429
141014	NC_011004	GCG	2	6	5457096	5457101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293429
141015	NC_011004	ATC	2	6	5457164	5457169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293429
141016	NC_011004	CGG	2	6	5457262	5457267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293429
141017	NC_011004	GCG	2	6	5457273	5457278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293429
141018	NC_011004	TCG	2	6	5457292	5457297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293429
141019	NC_011004	CCA	2	6	5457322	5457327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293429
141020	NC_011004	CGG	2	6	5457330	5457335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293429
141021	NC_011004	TCG	2	6	5457354	5457359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293429
141022	NC_011004	GCC	2	6	5457366	5457371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293429
141023	NC_011004	GGC	2	6	5457415	5457420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293429
141024	NC_011004	GCC	2	6	5457468	5457473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293429
141025	NC_011004	AGCGC	2	10	5457487	5457496	20 %	0 %	40 %	40 %	192293429
141026	NC_011004	CGC	2	6	5457516	5457521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293429
141027	NC_011004	GCA	2	6	5457538	5457543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293429
141028	NC_011004	CG	3	6	5457546	5457551	0 %	0 %	50 %	50 %	192293429
141029	NC_011004	CG	3	6	5457566	5457571	0 %	0 %	50 %	50 %	192293429
141030	NC_011004	TTG	2	6	5457591	5457596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293429
141031	NC_011004	TCG	2	6	5457651	5457656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293429
141032	NC_011004	GCC	3	9	5457741	5457749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293430
141033	NC_011004	GAT	2	6	5457800	5457805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293430
141034	NC_011004	GCT	3	9	5457868	5457876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293430
141035	NC_011004	GGT	2	6	5457896	5457901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293430
141036	NC_011004	CGA	2	6	5458025	5458030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293430
141037	NC_011004	CG	3	6	5458031	5458036	0 %	0 %	50 %	50 %	192293430
141038	NC_011004	ATA	2	6	5458064	5458069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192293430
141039	NC_011004	CG	3	6	5458108	5458113	0 %	0 %	50 %	50 %	192293430
141040	NC_011004	TCG	2	6	5458116	5458121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293430
141041	NC_011004	GCA	3	9	5458195	5458203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293430
141042	NC_011004	ACA	2	6	5458222	5458227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293430
141043	NC_011004	CG	4	8	5458257	5458264	0 %	0 %	50 %	50 %	192293430
141044	NC_011004	CGA	2	6	5458384	5458389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293430
141045	NC_011004	GCC	2	6	5458394	5458399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293430
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141048	NC_011004	CGA	2	6	5458504	5458509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293430
141049	NC_011004	GCCG	2	8	5458568	5458575	0 %	0 %	50 %	50 %	192293430
141050	NC_011004	GTC	2	6	5458634	5458639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293430
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141052	NC_011004	GTG	2	6	5458710	5458715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293430
141053	NC_011004	GCC	2	6	5458745	5458750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293430
141054	NC_011004	GCC	2	6	5458785	5458790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293430
141055	NC_011004	CGC	2	6	5458819	5458824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293430
141056	NC_011004	AAC	2	6	5458911	5458916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293430
141057	NC_011004	ACCGCA	2	12	5458971	5458982	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	192293430
141058	NC_011004	GGT	2	6	5458985	5458990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293430
141059	NC_011004	CTC	2	6	5459042	5459047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141060	NC_011004	CGC	2	6	5459052	5459057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141061	NC_011004	CA	5	10	5459068	5459077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141062	NC_011004	ACA	2	6	5459121	5459126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141063	NC_011004	GAC	3	9	5459136	5459144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141064	NC_011004	CAA	2	6	5459234	5459239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141065	NC_011004	GCAG	2	8	5459312	5459319	25 %	0 %	50 %	25 %	192293431
141066	NC_011004	GCG	2	6	5459343	5459348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293431
141067	NC_011004	GCTG	2	8	5459374	5459381	0 %	25 %	50 %	25 %	192293431
141068	NC_011004	ATT	2	6	5459480	5459485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192293431
141069	NC_011004	CGA	2	6	5459523	5459528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293431
141070	NC_011004	ACGC	2	8	5459539	5459546	25 %	0 %	25 %	50 %	192293431
141071	NC_011004	GCT	2	6	5459588	5459593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293431
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141074	NC_011004	GCT	2	6	5459660	5459665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293431
141075	NC_011004	AC	3	6	5459668	5459673	50 %	0 %	0 %	50 %	192293431
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141082	NC_011004	CTG	2	6	5459913	5459918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293431
141083	NC_011004	CAC	2	6	5459933	5459938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293431
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141086	NC_011004	TGA	2	6	5459977	5459982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293431
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141091	NC_011004	AT	3	6	5460185	5460190	50 %	50 %	0 %	0 %	192293431
141092	NC_011004	CGAA	2	8	5460232	5460239	50 %	0 %	25 %	25 %	192293431
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141099	NC_011004	TGC	2	6	5460664	5460669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293431
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141101	NC_011004	TCG	2	6	5460694	5460699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293431
141102	NC_011004	AGCG	2	8	5460743	5460750	25 %	0 %	50 %	25 %	192293431
141103	NC_011004	ACG	2	6	5460823	5460828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293431
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141107	NC_011004	GTCG	2	8	5461013	5461020	0 %	25 %	50 %	25 %	192293431
141108	NC_011004	GGC	2	6	5461056	5461061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293431
141109	NC_011004	C	6	6	5461078	5461083	0 %	0 %	0 %	100 %	192293431
141110	NC_011004	CG	4	8	5461097	5461104	0 %	0 %	50 %	50 %	192293431
141111	NC_011004	CGA	3	9	5461128	5461136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293432
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141113	NC_011004	CTT	2	6	5461177	5461182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293432
141114	NC_011004	CGCA	3	12	5461226	5461237	25 %	0 %	25 %	50 %	192293432
141115	NC_011004	GGCTC	2	10	5461242	5461251	0 %	20 %	40 %	40 %	192293432
141116	NC_011004	GC	5	10	5461266	5461275	0 %	0 %	50 %	50 %	192293432
141117	NC_011004	TGG	2	6	5461356	5461361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293432
141118	NC_011004	CTTGG	3	15	5461371	5461385	0 %	40 %	40 %	20 %	192293432
141119	NC_011004	GGC	3	9	5461463	5461471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293432
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141122	NC_011004	CCG	2	6	5461578	5461583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293432
141123	NC_011004	ATG	2	6	5461640	5461645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293432
141124	NC_011004	CTGC	2	8	5461672	5461679	0 %	25 %	25 %	50 %	192293432
141125	NC_011004	CGG	2	6	5461758	5461763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293432
141126	NC_011004	GCT	2	6	5461810	5461815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293432
141127	NC_011004	GCG	2	6	5461818	5461823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293432
141128	NC_011004	CCG	2	6	5461872	5461877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293432
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141132	NC_011004	GC	3	6	5461970	5461975	0 %	0 %	50 %	50 %	192293432
141133	NC_011004	GCG	2	6	5462005	5462010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293432
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141150	NC_011004	CGG	3	9	5462809	5462817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293433
141151	NC_011004	CG	3	6	5462828	5462833	0 %	0 %	50 %	50 %	192293433
141152	NC_011004	CAG	2	6	5462835	5462840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293433
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141154	NC_011004	GCA	2	6	5463042	5463047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293434
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141183	NC_011004	TCG	2	6	5464275	5464280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293435
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141217	NC_011004	CG	3	6	5465427	5465432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141218	NC_011004	AG	3	6	5465434	5465439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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