MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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140002	NC_011004	ACGG	2	8	5417880	5417887	25 %	0 %	50 %	25 %	192293394
140003	NC_011004	TCAGCG	2	12	5417958	5417969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293394
140004	NC_011004	AGG	2	6	5418033	5418038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140005	NC_011004	GCG	2	6	5418059	5418064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293395
140006	NC_011004	CTTG	2	8	5418099	5418106	0 %	50 %	25 %	25 %	192293395
140007	NC_011004	TGG	2	6	5418174	5418179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293395
140008	NC_011004	GATCG	2	10	5418187	5418196	20 %	20 %	40 %	20 %	192293395
140009	NC_011004	GCT	2	6	5418219	5418224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293395
140010	NC_011004	GCT	2	6	5418237	5418242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293395
140011	NC_011004	AC	3	6	5418259	5418264	50 %	0 %	0 %	50 %	192293395
140012	NC_011004	CTT	2	6	5418288	5418293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293395
140013	NC_011004	CTT	2	6	5418301	5418306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293395
140014	NC_011004	CGT	2	6	5418309	5418314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293395
140015	NC_011004	CGCT	2	8	5418335	5418342	0 %	25 %	25 %	50 %	192293395
140016	NC_011004	CGA	2	6	5418354	5418359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293395
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140028	NC_011004	TCG	2	6	5418732	5418737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293395
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140032	NC_011004	CGT	2	6	5418918	5418923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293395
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140035	NC_011004	CCGC	2	8	5419087	5419094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140036	NC_011004	AGC	2	6	5419095	5419100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140037	NC_011004	TACA	2	8	5419140	5419147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140038	NC_011004	T	6	6	5419154	5419159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140039	NC_011004	ATG	2	6	5419167	5419172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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140041	NC_011004	T	6	6	5419227	5419232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140042	NC_011004	CG	3	6	5419266	5419271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140043	NC_011004	GACCT	2	10	5419302	5419311	20 %	20 %	20 %	40 %	192293396
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140099	NC_011004	TGA	2	6	5421851	5421856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293399
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140117	NC_011004	GCA	2	6	5422551	5422556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293399
140118	NC_011004	TCG	2	6	5422559	5422564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293399
140119	NC_011004	CG	3	6	5422573	5422578	0 %	0 %	50 %	50 %	192293399
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140121	NC_011004	AGC	2	6	5422622	5422627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140122	NC_011004	CGA	2	6	5422632	5422637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140123	NC_011004	TCGC	2	8	5422675	5422682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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140146	NC_011004	TTGG	2	8	5423812	5423819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140147	NC_011004	CGG	2	6	5423885	5423890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293401
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140181	NC_011004	CCGG	2	8	5425529	5425536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140182	NC_011004	GCA	2	6	5425575	5425580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140217	NC_011004	TGG	2	6	5426799	5426804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293404
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140232	NC_011004	CGG	2	6	5427362	5427367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293404
140233	NC_011004	CTCGAT	2	12	5427440	5427451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192293404
140234	NC_011004	TTC	2	6	5427452	5427457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293404
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140236	NC_011004	CGGC	2	8	5427486	5427493	0 %	0 %	50 %	50 %	192293404
140237	NC_011004	TCG	2	6	5427510	5427515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293404
140238	NC_011004	CGA	2	6	5427541	5427546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293404
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140254	NC_011004	CGCC	2	8	5427924	5427931	0 %	0 %	25 %	75 %	192293405
140255	NC_011004	GCC	2	6	5427940	5427945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293405
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140285	NC_011004	CGT	3	9	5428909	5428917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293405
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140293	NC_011004	GCG	3	9	5429136	5429144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293406
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140300	NC_011004	GATC	2	8	5429568	5429575	25 %	25 %	25 %	25 %	192293406
140301	NC_011004	GAT	2	6	5429584	5429589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293406
140302	NC_011004	AGCG	2	8	5429602	5429609	25 %	0 %	50 %	25 %	192293406
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140304	NC_011004	CAG	2	6	5429641	5429646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293406
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140315	NC_011004	GCA	3	9	5430075	5430083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293406
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140320	NC_011004	TTC	2	6	5430200	5430205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293406
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140322	NC_011004	AGC	2	6	5430242	5430247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293406
140323	NC_011004	CCGGGC	2	12	5430290	5430301	0 %	0 %	50 %	50 %	192293406
140324	NC_011004	GCCCC	2	10	5430332	5430341	0 %	0 %	20 %	80 %	192293406
140325	NC_011004	CCA	2	6	5430354	5430359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293406
140326	NC_011004	CGC	2	6	5430388	5430393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293406
140327	NC_011004	TCA	2	6	5430497	5430502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293406
140328	NC_011004	CAT	2	6	5430526	5430531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293406
140329	NC_011004	TC	3	6	5430533	5430538	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140330	NC_011004	CAGC	2	8	5430539	5430546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140331	NC_011004	CG	3	6	5430607	5430612	0 %	0 %	50 %	50 %	192293407
140332	NC_011004	GGC	2	6	5430630	5430635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293407
140333	NC_011004	TCG	2	6	5430706	5430711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293407
140334	NC_011004	CG	3	6	5430715	5430720	0 %	0 %	50 %	50 %	192293407
140335	NC_011004	GC	3	6	5430733	5430738	0 %	0 %	50 %	50 %	192293407
140336	NC_011004	TCA	2	6	5430740	5430745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293407
140337	NC_011004	GCC	2	6	5430826	5430831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293407
140338	NC_011004	ACC	2	6	5430862	5430867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293407
140339	NC_011004	GCAG	2	8	5430896	5430903	25 %	0 %	50 %	25 %	192293407
140340	NC_011004	CCG	2	6	5430904	5430909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293407
140341	NC_011004	CCATCG	2	12	5430968	5430979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192293407
140342	NC_011004	CGA	2	6	5431001	5431006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293407
140343	NC_011004	CTTC	2	8	5431022	5431029	0 %	50 %	0 %	50 %	192293407
140344	NC_011004	GCA	2	6	5431049	5431054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293407
140345	NC_011004	CAC	2	6	5431134	5431139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293407
140346	NC_011004	CG	5	10	5431236	5431245	0 %	0 %	50 %	50 %	192293407
140347	NC_011004	CGA	2	6	5431280	5431285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293407
140348	NC_011004	CTT	2	6	5431293	5431298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293407
140349	NC_011004	TCA	2	6	5431340	5431345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140350	NC_011004	CCG	2	6	5431369	5431374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140351	NC_011004	CTTCA	2	10	5431394	5431403	20 %	40 %	0 %	40 %	192293408
140352	NC_011004	CGGG	2	8	5431439	5431446	0 %	0 %	75 %	25 %	192293408
140353	NC_011004	GTC	2	6	5431606	5431611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293408
140354	NC_011004	GCA	2	6	5431637	5431642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293408
140355	NC_011004	TTC	2	6	5431655	5431660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293408
140356	NC_011004	TCG	2	6	5431667	5431672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293408
140357	NC_011004	GGA	2	6	5431716	5431721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293408
140358	NC_011004	TGC	2	6	5431757	5431762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293408
140359	NC_011004	GTA	2	6	5431882	5431887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293408
140360	NC_011004	GGT	2	6	5431933	5431938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293408
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140365	NC_011004	TGG	2	6	5432196	5432201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293408
140366	NC_011004	CCGG	2	8	5432297	5432304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140367	NC_011004	CGC	2	6	5432307	5432312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140368	NC_011004	CGG	2	6	5432315	5432320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140369	NC_011004	CGG	2	6	5432351	5432356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140370	NC_011004	CCA	2	6	5432362	5432367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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140372	NC_011004	TCA	2	6	5432403	5432408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140373	NC_011004	GGC	2	6	5432517	5432522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140374	NC_011004	GCC	2	6	5432564	5432569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140375	NC_011004	CGC	2	6	5432676	5432681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293409
140376	NC_011004	GC	3	6	5432686	5432691	0 %	0 %	50 %	50 %	192293409
140377	NC_011004	CGCGG	2	10	5432700	5432709	0 %	0 %	60 %	40 %	192293409
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140382	NC_011004	CCT	2	6	5432840	5432845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293409
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140419	NC_011004	CG	3	6	5434076	5434081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140420	NC_011004	CGC	2	6	5434240	5434245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293410
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140462	NC_011004	GCC	2	6	5435623	5435628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293411
140463	NC_011004	GTC	2	6	5435749	5435754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293411
140464	NC_011004	CGA	2	6	5435760	5435765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293411
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