MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011004	CGA	2	6	522087	522092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288913
13502	NC_011004	CCG	2	6	522106	522111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288913
13503	NC_011004	GGC	2	6	522129	522134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
13504	NC_011004	CCGGC	2	10	522175	522184	0 %	0 %	40 %	60 %	192288913
13505	NC_011004	CGG	2	6	522197	522202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
13506	NC_011004	TAC	2	6	522250	522255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288913
13507	NC_011004	AAG	2	6	522280	522285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288913
13508	NC_011004	ATC	2	6	522289	522294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288913
13509	NC_011004	GCG	2	6	522295	522300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
13510	NC_011004	CGG	3	9	522318	522326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
13511	NC_011004	CGG	2	6	522344	522349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
13512	NC_011004	AAC	2	6	522457	522462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288913
13513	NC_011004	CGC	2	6	522487	522492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288913
13514	NC_011004	GC	3	6	522577	522582	0 %	0 %	50 %	50 %	192288913
13515	NC_011004	CGC	2	6	522599	522604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288913
13516	NC_011004	TCT	2	6	522609	522614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288913
13517	NC_011004	CCA	2	6	522626	522631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288913
13518	NC_011004	GC	3	6	522633	522638	0 %	0 %	50 %	50 %	192288913
13519	NC_011004	CCA	2	6	522665	522670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288913
13520	NC_011004	GC	3	6	522699	522704	0 %	0 %	50 %	50 %	192288913
13521	NC_011004	AAGG	2	8	522718	522725	50 %	0 %	50 %	0 %	192288913
13522	NC_011004	GAA	2	6	522739	522744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288913
13523	NC_011004	CGC	2	6	522745	522750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288913
13524	NC_011004	ACT	2	6	522782	522787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_011004	CGT	2	6	522799	522804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_011004	GC	3	6	522814	522819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13527	NC_011004	TTG	2	6	522845	522850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_011004	TCGC	2	8	522883	522890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13529	NC_011004	GGT	2	6	522922	522927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288914
13530	NC_011004	CTGCGC	2	12	522982	522993	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288914
13531	NC_011004	TCGC	2	8	523049	523056	0 %	25 %	25 %	50 %	192288914
13532	NC_011004	GCG	2	6	523154	523159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288914
13533	NC_011004	GTG	2	6	523208	523213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288914
13534	NC_011004	GCCG	2	8	523243	523250	0 %	0 %	50 %	50 %	192288914
13535	NC_011004	TGT	2	6	523269	523274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288914
13536	NC_011004	CTGC	2	8	523277	523284	0 %	25 %	25 %	50 %	192288914
13537	NC_011004	CG	3	6	523320	523325	0 %	0 %	50 %	50 %	192288914
13538	NC_011004	TCG	2	6	523418	523423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288914
13539	NC_011004	AGA	2	6	523428	523433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288914
13540	NC_011004	GCC	2	6	523444	523449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288914
13541	NC_011004	TCT	2	6	523461	523466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288914
13542	NC_011004	CGGC	2	8	523475	523482	0 %	0 %	50 %	50 %	192288914
13543	NC_011004	GCA	2	6	523536	523541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288914
13544	NC_011004	TCG	2	6	523605	523610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288914
13545	NC_011004	GGC	2	6	523621	523626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288914
13546	NC_011004	GC	4	8	523706	523713	0 %	0 %	50 %	50 %	192288915
13547	NC_011004	CGA	2	6	523718	523723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288915
13548	NC_011004	GGC	2	6	523725	523730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288915
13549	NC_011004	CAGCG	2	10	523757	523766	20 %	0 %	40 %	40 %	192288915
13550	NC_011004	GTT	2	6	523821	523826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288915
13551	NC_011004	CG	3	6	523889	523894	0 %	0 %	50 %	50 %	192288915
13552	NC_011004	CAC	2	6	523920	523925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288915
13553	NC_011004	GCGCCT	2	12	523943	523954	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288915
13554	NC_011004	CGG	2	6	523958	523963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288915
13555	NC_011004	GCC	2	6	524034	524039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288915
13556	NC_011004	GTG	2	6	524074	524079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288915
13557	NC_011004	CCA	2	6	524165	524170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288915
13558	NC_011004	GCA	2	6	524189	524194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288915
13559	NC_011004	CGG	2	6	524215	524220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288915
13560	NC_011004	GCG	3	9	524243	524251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288915
13561	NC_011004	GCC	2	6	524263	524268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288915
13562	NC_011004	CGC	2	6	524282	524287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288915
13563	NC_011004	CCG	2	6	524302	524307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288915
13564	NC_011004	CAA	2	6	524313	524318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288915
13565	NC_011004	CG	3	6	524322	524327	0 %	0 %	50 %	50 %	192288915
13566	NC_011004	GCC	2	6	524356	524361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288915
13567	NC_011004	CCA	2	6	524363	524368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288915
13568	NC_011004	TTG	2	6	524481	524486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_011004	GAG	2	6	524522	524527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_011004	AGGCGA	2	12	524569	524580	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13571	NC_011004	TCG	2	6	524615	524620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13572	NC_011004	CCT	2	6	524627	524632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13573	NC_011004	CTT	2	6	524651	524656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288916
13574	NC_011004	GCGA	2	8	524679	524686	25 %	0 %	50 %	25 %	192288916
13575	NC_011004	AGC	2	6	524718	524723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288916
13576	NC_011004	CTT	2	6	524759	524764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288916
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13578	NC_011004	TCT	2	6	524857	524862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288916
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13580	NC_011004	GCCG	2	8	524888	524895	0 %	0 %	50 %	50 %	192288916
13581	NC_011004	GTAG	2	8	524908	524915	25 %	25 %	50 %	0 %	192288916
13582	NC_011004	CG	3	6	524993	524998	0 %	0 %	50 %	50 %	192288916
13583	NC_011004	TCG	2	6	525003	525008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288916
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13588	NC_011004	GCA	2	6	525217	525222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288916
13589	NC_011004	GAG	2	6	525228	525233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288916
13590	NC_011004	GCC	2	6	525278	525283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288916
13591	NC_011004	TGA	2	6	525292	525297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288916
13592	NC_011004	TGG	2	6	525301	525306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288916
13593	NC_011004	GAA	2	6	525350	525355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288916
13594	NC_011004	GGT	2	6	525392	525397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288916
13595	NC_011004	ATG	2	6	525489	525494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288916
13596	NC_011004	TTG	2	6	525498	525503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288916
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13598	NC_011004	GAT	2	6	525557	525562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288916
13599	NC_011004	TTG	2	6	525621	525626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288916
13600	NC_011004	CGG	2	6	525634	525639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288916
13601	NC_011004	GAT	2	6	525641	525646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288916
13602	NC_011004	GCC	2	6	525671	525676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288916
13603	NC_011004	TCC	2	6	525681	525686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288916
13604	NC_011004	GCG	2	6	525795	525800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288916
13605	NC_011004	CGC	2	6	525806	525811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288916
13606	NC_011004	GTG	2	6	525834	525839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288916
13607	NC_011004	TCC	2	6	525858	525863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13608	NC_011004	TGA	2	6	525896	525901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_011004	TGC	2	6	525926	525931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_011004	GAATG	2	10	525957	525966	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_011004	TAC	2	6	525990	525995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_011004	TAG	2	6	526017	526022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_011004	GCGATC	2	12	526027	526038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_011004	TGC	2	6	526041	526046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_011004	GC	3	6	526057	526062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13616	NC_011004	GATC	2	8	526121	526128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13617	NC_011004	GCG	2	6	526177	526182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_011004	CGG	2	6	526196	526201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13619	NC_011004	ACG	2	6	526223	526228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288917
13620	NC_011004	GGT	2	6	526252	526257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288917
13621	NC_011004	GCTGC	2	10	526258	526267	0 %	20 %	40 %	40 %	192288917
13622	NC_011004	GGC	2	6	526290	526295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288917
13623	NC_011004	GATC	2	8	526344	526351	25 %	25 %	25 %	25 %	192288917
13624	NC_011004	GCCC	2	8	526404	526411	0 %	0 %	25 %	75 %	192288917
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13742	NC_011004	GTC	2	6	531206	531211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288922
13743	NC_011004	TCGC	2	8	531215	531222	0 %	25 %	25 %	50 %	192288922
13744	NC_011004	TCGC	2	8	531230	531237	0 %	25 %	25 %	50 %	192288922
13745	NC_011004	GCT	2	6	531249	531254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288922
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13833	NC_011004	CTGCG	2	10	535340	535349	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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13845	NC_011004	CGG	2	6	535805	535810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13847	NC_011004	CTGGC	2	10	535846	535855	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13848	NC_011004	TTCG	2	8	535935	535942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13849	NC_011004	TCG	2	6	535997	536002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13975	NC_011004	GCC	2	6	540612	540617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
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13978	NC_011004	TAG	2	6	540655	540660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288927
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13981	NC_011004	GAT	2	6	540726	540731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288927
13982	NC_011004	GTC	2	6	540783	540788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
13983	NC_011004	ATC	3	9	540808	540816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288927
13984	NC_011004	GCT	2	6	540827	540832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
13985	NC_011004	GGC	2	6	540836	540841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288927
13986	NC_011004	CAT	2	6	540909	540914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288927
13987	NC_011004	CCG	2	6	540953	540958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
13988	NC_011004	GAT	2	6	540966	540971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288927
13989	NC_011004	GGC	2	6	540989	540994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288927
13990	NC_011004	CGG	2	6	541013	541018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288927
13991	NC_011004	CG	3	6	541031	541036	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
13992	NC_011004	GC	3	6	541054	541059	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
13993	NC_011004	GTG	2	6	541060	541065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288927
13994	NC_011004	CGC	2	6	541088	541093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
13995	NC_011004	CGC	2	6	541131	541136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
13996	NC_011004	AGC	3	9	541177	541185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288927
13997	NC_011004	CTTC	2	8	541211	541218	0 %	50 %	0 %	50 %	192288927
13998	NC_011004	GATC	2	8	541247	541254	25 %	25 %	25 %	25 %	192288927
13999	NC_011004	GC	3	6	541269	541274	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
14000	NC_011004	CTT	2	6	541289	541294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288927

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