MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
136001	NC_011004	CG	3	6	5264901	5264906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136002	NC_011004	TGC	2	6	5264959	5264964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293256
136003	NC_011004	AGA	2	6	5265031	5265036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293256
136004	NC_011004	TG	3	6	5265051	5265056	0 %	50 %	50 %	0 %	192293256
136005	NC_011004	ACC	2	6	5265057	5265062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293256
136006	NC_011004	GC	3	6	5265126	5265131	0 %	0 %	50 %	50 %	192293256
136007	NC_011004	AGAA	2	8	5265163	5265170	75 %	0 %	25 %	0 %	192293256
136008	NC_011004	GCC	2	6	5265174	5265179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293256
136009	NC_011004	CCG	2	6	5265297	5265302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136010	NC_011004	TGC	2	6	5265319	5265324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136011	NC_011004	CG	3	6	5265463	5265468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136012	NC_011004	CCT	2	6	5265522	5265527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136013	NC_011004	TGAA	2	8	5265534	5265541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136014	NC_011004	ACG	2	6	5265585	5265590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136015	NC_011004	AC	3	6	5265736	5265741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136016	NC_011004	TC	3	6	5265759	5265764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136017	NC_011004	CGC	2	6	5265820	5265825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136018	NC_011004	TGG	2	6	5266036	5266041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293257
136019	NC_011004	AG	3	6	5266064	5266069	50 %	0 %	50 %	0 %	192293257
136020	NC_011004	ACGA	2	8	5266105	5266112	50 %	0 %	25 %	25 %	192293257
136021	NC_011004	CCG	2	6	5266184	5266189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136022	NC_011004	CCT	2	6	5266288	5266293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136023	NC_011004	TGC	2	6	5266367	5266372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136024	NC_011004	GAT	2	6	5266489	5266494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136025	NC_011004	ATC	2	6	5266542	5266547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136026	NC_011004	ACT	2	6	5266561	5266566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136027	NC_011004	CCG	2	6	5266575	5266580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136028	NC_011004	CA	3	6	5266590	5266595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136029	NC_011004	CGC	2	6	5266727	5266732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293258
136030	NC_011004	GCCG	2	8	5266733	5266740	0 %	0 %	50 %	50 %	192293258
136031	NC_011004	GC	3	6	5266741	5266746	0 %	0 %	50 %	50 %	192293258
136032	NC_011004	GAT	2	6	5266875	5266880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293258
136033	NC_011004	CGG	2	6	5266926	5266931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293258
136034	NC_011004	CGAG	2	8	5266967	5266974	25 %	0 %	50 %	25 %	192293258
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136036	NC_011004	GGA	2	6	5267103	5267108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293258
136037	NC_011004	GCG	2	6	5267120	5267125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293258
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136039	NC_011004	GAA	2	6	5267145	5267150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293258
136040	NC_011004	ATG	2	6	5267221	5267226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293258
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136042	NC_011004	GC	3	6	5267322	5267327	0 %	0 %	50 %	50 %	192293259
136043	NC_011004	CGGC	2	8	5267328	5267335	0 %	0 %	50 %	50 %	192293259
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136052	NC_011004	TCC	2	6	5267568	5267573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293259
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136085	NC_011004	CGC	2	6	5268642	5268647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293260
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136098	NC_011004	CG	3	6	5269185	5269190	0 %	0 %	50 %	50 %	192293260
136099	NC_011004	CGA	2	6	5269206	5269211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293260
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136101	NC_011004	CGT	2	6	5269314	5269319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293260
136102	NC_011004	CAG	2	6	5269324	5269329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293260
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136116	NC_011004	CAT	2	6	5269846	5269851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293260
136117	NC_011004	GAT	2	6	5269861	5269866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293260
136118	NC_011004	CGT	2	6	5269869	5269874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293260
136119	NC_011004	GAT	2	6	5269894	5269899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293260
136120	NC_011004	GATC	2	8	5269926	5269933	25 %	25 %	25 %	25 %	192293260
136121	NC_011004	CCA	2	6	5269989	5269994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293260
136122	NC_011004	CGA	2	6	5270055	5270060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293260
136123	NC_011004	CAC	2	6	5270092	5270097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293260
136124	NC_011004	CTCGAT	2	12	5270119	5270130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192293260
136125	NC_011004	ACG	2	6	5270154	5270159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293260
136126	NC_011004	CGATGC	2	12	5270217	5270228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293260
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136129	NC_011004	GC	3	6	5270370	5270375	0 %	0 %	50 %	50 %	192293260
136130	NC_011004	CGA	2	6	5270401	5270406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293260
136131	NC_011004	GCCG	2	8	5270419	5270426	0 %	0 %	50 %	50 %	192293260
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136144	NC_011004	CGG	2	6	5270770	5270775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293260
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136146	NC_011004	CTT	2	6	5270863	5270868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293260
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136151	NC_011004	CGC	2	6	5271079	5271084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136152	NC_011004	ACC	2	6	5271119	5271124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293261
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136228	NC_011004	ATGCCG	2	12	5273930	5273941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293263
136229	NC_011004	GTGGC	2	10	5273966	5273975	0 %	20 %	60 %	20 %	192293263
136230	NC_011004	AGC	2	6	5274056	5274061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293263
136231	NC_011004	CG	3	6	5274166	5274171	0 %	0 %	50 %	50 %	192293263
136232	NC_011004	GTG	2	6	5274188	5274193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293263
136233	NC_011004	GCCG	2	8	5274222	5274229	0 %	0 %	50 %	50 %	192293263
136234	NC_011004	GCA	2	6	5274270	5274275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293263
136235	NC_011004	GTC	2	6	5274277	5274282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293263
136236	NC_011004	GTG	2	6	5274299	5274304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293263
136237	NC_011004	TGC	2	6	5274314	5274319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293263
136238	NC_011004	TCA	2	6	5274396	5274401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293263
136239	NC_011004	TCGGCC	2	12	5274431	5274442	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192293263
136240	NC_011004	GC	3	6	5274449	5274454	0 %	0 %	50 %	50 %	192293263
136241	NC_011004	CGC	2	6	5274480	5274485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293263
136242	NC_011004	CGG	2	6	5274504	5274509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293263
136243	NC_011004	GCC	2	6	5274553	5274558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293263
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136248	NC_011004	CAG	2	6	5274685	5274690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293263
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136250	NC_011004	CGA	2	6	5274714	5274719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293263
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136253	NC_011004	GTTCGA	2	12	5274828	5274839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192293263
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136273	NC_011004	CT	3	6	5275543	5275548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136274	NC_011004	GTC	2	6	5275568	5275573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136275	NC_011004	GCC	2	6	5275608	5275613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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136278	NC_011004	GCG	2	6	5275704	5275709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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136280	NC_011004	GCC	2	6	5275758	5275763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136281	NC_011004	TAA	2	6	5275769	5275774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136282	NC_011004	AGT	2	6	5275805	5275810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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136284	NC_011004	ACC	2	6	5275854	5275859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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136286	NC_011004	CAG	2	6	5276060	5276065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293264
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136327	NC_011004	GTTGG	2	10	5277844	5277853	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
136328	NC_011004	CGC	2	6	5277857	5277862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136329	NC_011004	GCC	2	6	5277896	5277901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136330	NC_011004	CGC	2	6	5277912	5277917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136331	NC_011004	GGCGCT	2	12	5277965	5277976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136332	NC_011004	CCG	2	6	5277995	5278000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136333	NC_011004	CG	3	6	5277999	5278004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136334	NC_011004	GCCG	2	8	5278037	5278044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136335	NC_011004	GACGA	2	10	5278142	5278151	40 %	0 %	40 %	20 %	192293266
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136337	NC_011004	AGC	2	6	5278250	5278255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293266
136338	NC_011004	CGC	2	6	5278281	5278286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293266
136339	NC_011004	ATT	2	6	5278287	5278292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192293266
136340	NC_011004	GAGG	2	8	5278293	5278300	25 %	0 %	75 %	0 %	192293266
136341	NC_011004	GC	3	6	5278347	5278352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136342	NC_011004	CGT	2	6	5278373	5278378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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136344	NC_011004	CAC	2	6	5278536	5278541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293267
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