MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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135002	NC_011004	CATT	2	8	5227372	5227379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135003	NC_011004	GCC	2	6	5227431	5227436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293221
135004	NC_011004	CAG	2	6	5227443	5227448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293221
135005	NC_011004	GCC	2	6	5227461	5227466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293221
135006	NC_011004	G	6	6	5227478	5227483	0 %	0 %	100 %	0 %	192293221
135007	NC_011004	CAC	2	6	5227497	5227502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293221
135008	NC_011004	GAT	2	6	5227551	5227556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293221
135009	NC_011004	CCG	3	9	5227561	5227569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293221
135010	NC_011004	CGT	2	6	5227577	5227582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293221
135011	NC_011004	CCGG	2	8	5227595	5227602	0 %	0 %	50 %	50 %	192293221
135012	NC_011004	CGG	2	6	5227621	5227626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293221
135013	NC_011004	GGC	2	6	5227629	5227634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293221
135014	NC_011004	CG	3	6	5227637	5227642	0 %	0 %	50 %	50 %	192293221
135015	NC_011004	GGT	2	6	5227643	5227648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293221
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135017	NC_011004	ATG	2	6	5227708	5227713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293221
135018	NC_011004	TGT	2	6	5227763	5227768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293221
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135022	NC_011004	CAG	2	6	5227836	5227841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293221
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135024	NC_011004	TCG	2	6	5227912	5227917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293221
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135026	NC_011004	CGCC	2	8	5227952	5227959	0 %	0 %	25 %	75 %	192293221
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135029	NC_011004	CG	3	6	5228036	5228041	0 %	0 %	50 %	50 %	192293222
135030	NC_011004	GCGG	2	8	5228045	5228052	0 %	0 %	75 %	25 %	192293222
135031	NC_011004	GTC	3	9	5228054	5228062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293222
135032	NC_011004	TCG	2	6	5228103	5228108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293222
135033	NC_011004	CGAACA	2	12	5228167	5228178	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	192293222
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135036	NC_011004	GCG	2	6	5228213	5228218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293222
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135053	NC_011004	TCG	2	6	5228925	5228930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293222
135054	NC_011004	AGG	2	6	5228977	5228982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135055	NC_011004	CG	4	8	5229005	5229012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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135100	NC_011004	GCC	2	6	5230581	5230586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293225
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135116	NC_011004	TCG	2	6	5231291	5231296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293226
135117	NC_011004	GCT	2	6	5231316	5231321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293226
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135219	NC_011004	GAG	2	6	5235073	5235078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135220	NC_011004	GCG	2	6	5235113	5235118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293230
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135227	NC_011004	GCT	2	6	5235655	5235660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293230
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135229	NC_011004	CCG	2	6	5235696	5235701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293230
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135231	NC_011004	CAC	2	6	5235715	5235720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293230
135232	NC_011004	CAA	2	6	5235736	5235741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293230
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135234	NC_011004	GCC	2	6	5235771	5235776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293230
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135345	NC_011004	CG	4	8	5240259	5240266	0 %	0 %	50 %	50 %	192293233
135346	NC_011004	CCG	2	6	5240361	5240366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293233
135347	NC_011004	ACG	2	6	5240378	5240383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135348	NC_011004	GGC	2	6	5240442	5240447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135349	NC_011004	GCG	2	6	5240472	5240477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135350	NC_011004	CTGCCG	2	12	5240535	5240546	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192293234
135351	NC_011004	GC	4	8	5240579	5240586	0 %	0 %	50 %	50 %	192293234
135352	NC_011004	GGC	2	6	5240602	5240607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293234
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135354	NC_011004	GCA	2	6	5240669	5240674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293234
135355	NC_011004	ACG	2	6	5240800	5240805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293234
135356	NC_011004	GCG	2	6	5240860	5240865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293234
135357	NC_011004	ATC	2	6	5240916	5240921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293234
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135361	NC_011004	GC	3	6	5240974	5240979	0 %	0 %	50 %	50 %	192293234
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135367	NC_011004	TGC	2	6	5241142	5241147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293234
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135387	NC_011004	CCA	2	6	5242097	5242102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135388	NC_011004	C	6	6	5242116	5242121	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135389	NC_011004	ACG	2	6	5242126	5242131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135390	NC_011004	GGC	2	6	5242134	5242139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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135392	NC_011004	GCG	2	6	5242206	5242211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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135398	NC_011004	CTT	2	6	5242468	5242473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135399	NC_011004	GTGTT	2	10	5242498	5242507	0 %	60 %	40 %	0 %	192293237
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135402	NC_011004	CA	3	6	5242593	5242598	50 %	0 %	0 %	50 %	192293237
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135444	NC_011004	GA	3	6	5244182	5244187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135445	NC_011004	AGA	2	6	5244203	5244208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135446	NC_011004	CGAA	2	8	5244224	5244231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135447	NC_011004	A	6	6	5244345	5244350	100 %	0 %	0 %	0 %	192293238
135448	NC_011004	CCG	2	6	5244371	5244376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293238
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135450	NC_011004	CTG	2	6	5244489	5244494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293238
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135455	NC_011004	GC	3	6	5244696	5244701	0 %	0 %	50 %	50 %	192293238
135456	NC_011004	TGG	2	6	5244715	5244720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293238
135457	NC_011004	ATT	2	6	5244805	5244810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192293238
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135461	NC_011004	ACCGCC	2	12	5244970	5244981	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	192293238
135462	NC_011004	GGC	2	6	5245062	5245067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293238
135463	NC_011004	CGG	2	6	5245094	5245099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293238
135464	NC_011004	GCG	2	6	5245115	5245120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293238
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135494	NC_011004	TTCA	2	8	5246190	5246197	25 %	50 %	0 %	25 %	192293239
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