MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011004	GCT	2	6	502634	502639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288897
13002	NC_011004	CGG	2	6	502718	502723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288897
13003	NC_011004	GCA	2	6	502744	502749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288897
13004	NC_011004	TCG	2	6	502785	502790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288897
13005	NC_011004	TCC	2	6	502815	502820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288897
13006	NC_011004	CGA	2	6	502849	502854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288897
13007	NC_011004	GC	3	6	502857	502862	0 %	0 %	50 %	50 %	192288897
13008	NC_011004	GTA	2	6	502868	502873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288897
13009	NC_011004	TCA	2	6	502951	502956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288897
13010	NC_011004	TGC	2	6	502976	502981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288897
13011	NC_011004	CG	3	6	503061	503066	0 %	0 %	50 %	50 %	192288897
13012	NC_011004	CCGG	2	8	503136	503143	0 %	0 %	50 %	50 %	192288897
13013	NC_011004	CTG	2	6	503156	503161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288897
13014	NC_011004	CGG	2	6	503165	503170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288897
13015	NC_011004	CGG	2	6	503219	503224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288897
13016	NC_011004	GCG	2	6	503242	503247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288897
13017	NC_011004	CCG	2	6	503290	503295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288897
13018	NC_011004	GAT	2	6	503318	503323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288897
13019	NC_011004	GAT	2	6	503327	503332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288897
13020	NC_011004	CGC	2	6	503374	503379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288897
13021	NC_011004	GTG	2	6	503424	503429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288897
13022	NC_011004	GGCGA	2	10	503439	503448	20 %	0 %	60 %	20 %	192288897
13023	NC_011004	GCA	2	6	503476	503481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288897
13024	NC_011004	GTA	2	6	503483	503488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288897
13025	NC_011004	CAC	2	6	503513	503518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288897
13026	NC_011004	CG	3	6	503527	503532	0 %	0 %	50 %	50 %	192288897
13027	NC_011004	CCG	2	6	503596	503601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288897
13028	NC_011004	TTGC	2	8	503678	503685	0 %	50 %	25 %	25 %	192288897
13029	NC_011004	TCG	2	6	503754	503759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288897
13030	NC_011004	CG	3	6	503781	503786	0 %	0 %	50 %	50 %	192288897
13031	NC_011004	TCA	2	6	503794	503799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288897
13032	NC_011004	GCC	2	6	503820	503825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288897
13033	NC_011004	ACC	2	6	503839	503844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288897
13034	NC_011004	TCC	2	6	503859	503864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_011004	CAGG	2	8	503889	503896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13036	NC_011004	GCA	2	6	503999	504004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288898
13037	NC_011004	GTC	2	6	504051	504056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288898
13038	NC_011004	CAG	2	6	504093	504098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288898
13039	NC_011004	GCC	2	6	504116	504121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288898
13040	NC_011004	TCG	2	6	504125	504130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288898
13041	NC_011004	GGC	2	6	504230	504235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288898
13042	NC_011004	ATC	2	6	504265	504270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288898
13043	NC_011004	CGG	2	6	504398	504403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288898
13044	NC_011004	CGA	2	6	504443	504448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288898
13045	NC_011004	GGC	2	6	504510	504515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288898
13046	NC_011004	ACG	2	6	504535	504540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288898
13047	NC_011004	TGC	2	6	504548	504553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288898
13048	NC_011004	GGT	2	6	504558	504563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288898
13049	NC_011004	CTT	2	6	504591	504596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288898
13050	NC_011004	AGC	2	6	504634	504639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288898
13051	NC_011004	CG	3	6	504663	504668	0 %	0 %	50 %	50 %	192288898
13052	NC_011004	GCG	2	6	504715	504720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288899
13053	NC_011004	CAC	2	6	504782	504787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288899
13054	NC_011004	GCCGA	2	10	504792	504801	20 %	0 %	40 %	40 %	192288899
13055	NC_011004	GCA	2	6	504808	504813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288899
13056	NC_011004	CG	3	6	504830	504835	0 %	0 %	50 %	50 %	192288899
13057	NC_011004	CGGT	2	8	504850	504857	0 %	25 %	50 %	25 %	192288899
13058	NC_011004	TCG	2	6	504927	504932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288899
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13060	NC_011004	CAC	2	6	504959	504964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288899
13061	NC_011004	CG	3	6	504967	504972	0 %	0 %	50 %	50 %	192288899
13062	NC_011004	GGT	2	6	505013	505018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288899
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13064	NC_011004	CAC	2	6	505037	505042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288899
13065	NC_011004	CCT	2	6	505054	505059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288899
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13068	NC_011004	CGG	2	6	505155	505160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288899
13069	NC_011004	CAG	2	6	505307	505312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288899
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13071	NC_011004	GAT	2	6	505367	505372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288899
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13074	NC_011004	TGC	2	6	505463	505468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288899
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13077	NC_011004	GC	3	6	505548	505553	0 %	0 %	50 %	50 %	192288899
13078	NC_011004	GCA	2	6	505564	505569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288899
13079	NC_011004	GCCG	2	8	505574	505581	0 %	0 %	50 %	50 %	192288899
13080	NC_011004	CCT	2	6	505600	505605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288899
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13090	NC_011004	GCC	2	6	505912	505917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288900
13091	NC_011004	CGGC	2	8	505935	505942	0 %	0 %	50 %	50 %	192288900
13092	NC_011004	AGC	2	6	505955	505960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288900
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13100	NC_011004	GCC	2	6	506221	506226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288900
13101	NC_011004	CGG	2	6	506232	506237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288900
13102	NC_011004	CGA	2	6	506238	506243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288900
13103	NC_011004	GGT	2	6	506254	506259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288900
13104	NC_011004	CAG	2	6	506272	506277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288900
13105	NC_011004	GCA	2	6	506337	506342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288900
13106	NC_011004	CGA	2	6	506385	506390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288900
13107	NC_011004	GAT	2	6	506407	506412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288900
13108	NC_011004	TGGGC	2	10	506472	506481	0 %	20 %	60 %	20 %	192288900
13109	NC_011004	GC	4	8	506534	506541	0 %	0 %	50 %	50 %	192288901
13110	NC_011004	GGC	2	6	506625	506630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288901
13111	NC_011004	CCGG	2	8	506634	506641	0 %	0 %	50 %	50 %	192288901
13112	NC_011004	GCG	2	6	506645	506650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288901
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13114	NC_011004	CCA	2	6	506657	506662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288901
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13116	NC_011004	CAG	2	6	506742	506747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288901
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13118	NC_011004	TCG	2	6	506776	506781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288901
13119	NC_011004	GCG	2	6	506785	506790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288901
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13124	NC_011004	TCG	2	6	506926	506931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288901
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13223	NC_011004	CCGCG	2	10	511069	511078	0 %	0 %	40 %	60 %	192288904
13224	NC_011004	CTCGGC	2	12	511135	511146	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288904
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13226	NC_011004	GCT	2	6	511245	511250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288904
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13230	NC_011004	GCTGGA	2	12	511484	511495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288904
13231	NC_011004	ACG	2	6	511496	511501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288904
13232	NC_011004	CAG	2	6	511536	511541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288904
13233	NC_011004	GCG	2	6	511550	511555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288904
13234	NC_011004	GAC	2	6	511588	511593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288904
13235	NC_011004	GC	3	6	511610	511615	0 %	0 %	50 %	50 %	192288904
13236	NC_011004	CG	3	6	511628	511633	0 %	0 %	50 %	50 %	192288904
13237	NC_011004	ATC	2	6	511634	511639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288904
13238	NC_011004	CGC	2	6	511650	511655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288904
13239	NC_011004	CGG	2	6	511656	511661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288904
13240	NC_011004	CGC	2	6	511699	511704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288904
13241	NC_011004	GT	3	6	511709	511714	0 %	50 %	50 %	0 %	192288904
13242	NC_011004	TAC	2	6	511723	511728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288904
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13360	NC_011004	GAT	2	6	516774	516779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288907
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13480	NC_011004	CG	3	6	521584	521589	0 %	0 %	50 %	50 %	192288912
13481	NC_011004	CG	3	6	521609	521614	0 %	0 %	50 %	50 %	192288912
13482	NC_011004	TGG	2	6	521636	521641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288912
13483	NC_011004	GCG	2	6	521658	521663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288912
13484	NC_011004	TGTCGG	2	12	521666	521677	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	192288912
13485	NC_011004	TGC	2	6	521687	521692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288912
13486	NC_011004	GGT	2	6	521709	521714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288912
13487	NC_011004	AGC	2	6	521753	521758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288912
13488	NC_011004	CGC	2	6	521784	521789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288912
13489	NC_011004	TCG	2	6	521792	521797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288912
13490	NC_011004	CGA	2	6	521826	521831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288912
13491	NC_011004	CCA	2	6	521846	521851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288912
13492	NC_011004	CAC	2	6	521883	521888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288912
13493	NC_011004	TGC	2	6	521894	521899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288912
13494	NC_011004	CAT	2	6	521904	521909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288912
13495	NC_011004	CGC	3	9	521935	521943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13496	NC_011004	ATCA	2	8	521961	521968	50 %	25 %	0 %	25 %	192288913
13497	NC_011004	AGC	2	6	521971	521976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288913
13498	NC_011004	CCA	2	6	522014	522019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288913
13499	NC_011004	GCC	2	6	522033	522038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288913
13500	NC_011004	CTT	2	6	522045	522050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288913

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